專利名稱：基于odc1基因型的癌診斷與治療的制作方法
基于0DC1基因型的癌診斷與治療
本申請要求于2009年6月3日提出的美國臨時申請?zhí)?1/217682，于2009年6 月3日提出的美國臨時申請?zhí)?1/217,679和于2009年5月14日提出的美國臨時申請?zhí)?61/216，216的優(yōu)先權(quán)，每一文獻的全部內(nèi)容以引用的方式并入本文。
本發(fā)明是在來自國立健康研究院(the National Institute of Health)的基金 CA72008 (EffG)、CA78134 (HAC)、CA78285 (HAC)和 CA95O6O (EffG)，來自國立癌癥研究所(the National Cancer Institute)的合同 N01-PC-35136、N01-PC_35139 和 N01-PC-54404 以及來自疾病控帝!j與預(yù)防中；已、(the Centers for Disease Control and Prevention)的辦議 1U58DP00807-01的政府支持下做出的。政府享有本發(fā)明中的某些權(quán)利。技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明一般涉及癌癥生物學(xué)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域。更加具體而言，其涉及用于診斷、預(yù)防和治療癌及其風(fēng)險因素的方法。
背景技術(shù)：
將癌癥化學(xué)預(yù)防研究轉(zhuǎn)化成臨床實踐的主要障礙是邊緣試劑功效和超過獲益的毒性(Psaty和Potter，2006 ;Lippman，2006)。例如，最近證明在結(jié)直腸腺瘤(CRA)患者當中進行長期的每日口服D，L-α-二氟甲基鳥氨酸(DFM0，依氟鳥氨酸(ef lornithine))和舒林酸(sulindac)的多胺-抑制性組合具有明顯的功效(Meyskens等人，2008)，然而，治療伴隨有適度的亞臨床耳毒性(McLaren等人，2008)，并且在具有高基線心血管風(fēng)險的患者中出現(xiàn)更大數(shù)量的心血管事件Gell等人，2009)。對辨別患者對特定預(yù)防性或治療性治療方案的適合性的遺傳特征的鑒定將具有較大益處。
例如，仍然需要用于治療和預(yù)防結(jié)直腸癌和其它癌的有效且毒性小的方法。根據(jù)國立癌癥研究所的估計，2009年美國大約有147，000個新發(fā)病例并且50，000人死于結(jié)直腸癌。當前的治療方案，特別是用于結(jié)腸癌和息肉的那些治療方案包括腫瘤切除術(shù)、化學(xué)療法和放射療法。人ODCl基因內(nèi)含子-1中的單核苷酸多態(tài)性(SNP)影響ODCl轉(zhuǎn)錄(Guo 等人，2000)，并且已經(jīng)作為結(jié)直腸腺瘤(CRA)風(fēng)險的遺傳標記進行了研究(Martinez等人， 2003 ；Barry等人，2006 ；Hubner等人，2008)。所報導(dǎo)的次要A-等位基因頻率為大約25% 并且盡管在人種/種族之間存在差異，但是在每一人種內(nèi)ODCl基因型分布處于哈代-溫伯格平衡(Hardy-ffeinberg equilibrium)中(0，Brien 等人，2004 ;Zell 等人，2009)。與具有主要G-等位基因的個體相比，ODCl次要A-等位基因純合個體的腺瘤復(fù)發(fā)風(fēng)險降低 (Martinez等人，2003 ;Hubner等人，2008)。此外，0DC1A-等位基因(AA或GA基因型，但不是GG基因型)和所報導(dǎo)的阿司匹林使用已經(jīng)與降低的結(jié)腸息肉復(fù)發(fā)相關(guān)(Martinez等人，2003 ；Barry等人，2006 ；Hubner等人，2008)，并且在統(tǒng)計學(xué)意義上降低晚期腺瘤風(fēng)險達 50% (Barry等人，2006)。ODCl基因型是否差異性地影響腺瘤復(fù)發(fā)、組織多胺反應(yīng)、毒性特性以及它是如何用于確定預(yù)防性和治療性治療的適合性的將具有較大的優(yōu)勢。發(fā)明內(nèi)容
因此，根據(jù)本發(fā)明，提供治療、預(yù)防和/或診斷方法，涉及鑒定患者的至少一個 ODCl啟動子基因等位基因+316位置上的基因型。
在一個方面中，提供了用于預(yù)防性或治療性治療患者中癌的方法，包含
a)從確定患者的至少一個ODCl啟動子基因等位基因+316位置上的基因型的測試中得到結(jié)果；和
b)如果結(jié)果表明患者的ODCl啟動子基因的至少一個等位基因+316位置上的基因型是G，則向患者施用有效量的包含下列的藥物療法
(i)抑制患者內(nèi)鳥氨酸脫羧酶(ODC)的第一試劑；和
(ii)當與第一試劑組合時調(diào)節(jié)多胺途徑以減少患者內(nèi)總體多胺含量的第二試劑。
在一些實施方案中，第二試劑還提高患者內(nèi)亞精胺/精胺N1-乙酰轉(zhuǎn)移酶的表達。 在一些實施方案中，結(jié)果通過接收包含所述基因型的報告或者獲取顯示結(jié)果的患者病史得到。在一些實施方案中，測試確定患者ODCl啟動子基因的一個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。在一些實施方案中，測試確定患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。在一些實施方案中，結(jié)果表明患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316 位置上的基因型是GG。在一些實施方案中，結(jié)果表明患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因 +316位置上的基因型是GA。
在一些實施方案中，如果在得到測試結(jié)果之前，患者正在用藥物療法但以較低的劑量進行治療，則藥物療法還包含增加第一試劑或第二試劑的劑量。在一些實施方案中，如果在得到測試結(jié)果之前，患者正在用藥物療法但以較低的劑量進行治療，則藥物療法還包含增加第一試劑和第二試劑的劑量。在一些實施方案中，第一試劑是α-二氟甲基鳥氨酸 (DFMO)。在一些實施方案中，第二試劑是包含非類固醇抗炎藥(NSAID)的非阿司匹林。在一些實施方案中，包含NSAID的非阿司匹林是選擇性C0X-2抑制劑。在一些實施方案中，包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸或塞來昔布(celecoxib)。在一些實施方案中，包含NSAID 的非阿司匹林是舒林酸。
在另一方面中，提供了治療患者中結(jié)直腸癌風(fēng)險因素的方法，包含
a)從確定患者的至少一個ODCl啟動子基因等位基因+316位置上的基因型的測試中得到結(jié)果；和
b)如果結(jié)果表明患者的ODCl啟動子基因的至少一個等位基因+316位置上的基因型是G，則向患者施用有效量的包含下列的藥物療法
(i)抑制患者內(nèi)鳥氨酸脫羧酶(ODC)的第一試劑；和
(ii)當與第一試劑組合時調(diào)節(jié)多胺途徑以減少患者內(nèi)總體多胺含量的第二試劑，
其中所述方法預(yù)防患者內(nèi)新的變異結(jié)腸腺窩病灶、新的腺瘤性息肉或者新的發(fā)育異常腺瘤的形成。
在一些實施方案中，第二試劑也增加患者內(nèi)亞精胺/精胺N1-乙酰轉(zhuǎn)移酶的表達。 在一些實施方案中，方法預(yù)防患者中新的變異結(jié)腸腺窩病灶的形成。在一些實施方案中，方法預(yù)防患者中新的腺瘤性息肉的形成。在一些實施方案中，方法預(yù)防患者中新的發(fā)育異常腺瘤的形成。在一些實施方案中，結(jié)果通過接收包含所述基因型的報告或者獲取顯示結(jié)果的患者病史得到。在一些實施方案中，測試確定患者ODCl啟動子基因的一個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。在一些實施方案中，測試確定患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因 +316位置上的核苷酸堿基。在一些實施方案中，結(jié)果表明患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的基因型是GG。在一些實施方案中，結(jié)果表明患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的基因型是GA0
在一些實施方案中，如果在得到測試結(jié)果之前，患者正在用藥物療法但以較低的劑量進行治療，則藥物療法還包含增加第一試劑或第二試劑的劑量。在一些實施方案中，如果在得到測試結(jié)果之前，患者正在用藥物療法但以較低的劑量進行治療，則藥物療法還包含增加第一試劑和第二試劑的劑量。在一些實施方案中，第一試劑是α-二氟甲基鳥氨酸 (DFMO)。在一些實施方案中，第二試劑是包含非類固醇抗炎藥(NSAID)的非阿司匹林。在一些實施方案中，包含NSAID的非阿司匹林是選擇性C0X-2抑制劑。在一些實施方案中，包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸或塞來昔布。在一些實施方案中，包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸。
在另一方面中，提供了用于評價患者對預(yù)防性或治療性治療癌的適合性的方法， 包含
a)從確定患者的至少一個ODCl啟動子基因等位基因+316位置上的基因型的測試中得到結(jié)果；和
b)如果結(jié)果表明患者的ODCl啟動子基因的至少一個等位基因+316位置上的基因型是G，則鑒定為患者適合通過藥物療法進行治療，所述療法包含組合有效量的抑制患者內(nèi)鳥氨酸脫羧酶(ODC)的第一試劑；和當與第一試劑組合時調(diào)節(jié)多胺途徑以減少患者內(nèi)總體多胺含量的第二試劑。
在一些實施方案中，第二試劑還增加患者中亞精胺/精胺N1-乙酰轉(zhuǎn)移酶的表達。 在一些實施方案中，結(jié)果通過接收包含所述基因型的報告或者獲取顯示結(jié)果的患者病史得到。在一些實施方案中，測試確定患者ODCl啟動子基因的一個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。在一些實施方案中，測試確定患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。在一些實施方案中，結(jié)果表明患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316 位置上的基因型是GG。在一些實施方案中，結(jié)果表明患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因 +316位置上的基因型是GA。在一些實施方案中，如果在得到測試結(jié)果之前，患者正在用藥物療法但以較低的劑量進行治療，則藥物療法還包含增加第一試劑或第二試劑的劑量。
在一些實施方案中，如果在得到測試結(jié)果之前，患者正在用藥物療法但以較低的劑量進行治療，則藥物療法還包含增加第一試劑和第二試劑的劑量。在一些實施方案中，第一試劑是α-二氟甲基鳥氨酸(DFMO)。在一些實施方案中，第二試劑是包含非類固醇抗炎藥(NSAID)的非阿司匹林。在一些實施方案中，包含NSAID的非阿司匹林是選擇性C0X-2 抑制劑。在一些實施方案中，包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸或塞來昔布。在一些實施方案中，包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸。
在另一方面中，提供了使患者中的癌腫瘤可切除的方法，包含
a)從確定患者的至少一個ODCl啟動子基因等位基因+316位置上的基因型的測試中得到結(jié)果；和
b)如果結(jié)果表明患者的ODCl啟動子基因的至少一個等位基因+316位置上的基因型是G，則向患者施用有效量的包含下列的藥物療法
⑴抑制患者內(nèi)鳥氨酸脫羧酶(ODC)的第一試劑；和
(ii)增加患者內(nèi)亞精胺/精胺N1-乙酰轉(zhuǎn)移酶表達的第二試劑。
在一些實施方案中，結(jié)果通過接收包含所述基因型的報告或者獲取顯示結(jié)果的患者病史得到。在一些實施方案中，測試確定患者ODCl啟動子基因的一個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。在一些實施方案中，測試確定患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316 位置上的核苷酸堿基。在一些實施方案中，結(jié)果表明患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因 +316位置上的基因型是GG。在一些實施方案中，結(jié)果表明患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的基因型是GA。
在一些實施方案中，如果在得到測試結(jié)果之前，患者正在用藥物療法但以較低的劑量進行治療，則藥物療法還包含增加第一試劑或第二試劑的劑量。在一些實施方案中，如果在得到測試結(jié)果之前，患者正在用藥物療法但以較低的劑量進行治療，則藥物療法還包含增加第一試劑和第二試劑的劑量。
在一些實施方案中，第一試劑是α - 二氟甲基鳥氨酸(DFMO)。
在一些實施方案中，第二試劑是包含非類固醇抗炎藥(NSAID)的非阿司匹林。在一些實施方案中，包含NSAID的非阿司匹林是選擇性C0X-2抑制劑。在一些實施方案中，包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸或塞來昔布。在一些實施方案中，包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸。
在另一方面中，提供了用于預(yù)防處于風(fēng)險中的患者中癌發(fā)展或復(fù)發(fā)的方法，包含
a)從確定患者的至少一個ODCl啟動子基因等位基因+316位置上的基因型的測試中得到結(jié)果；和
b)如果結(jié)果表明患者的ODCl啟動子基因的至少一個等位基因+316位置上的基因型是G，則向患者施用組合有效量的α-二氟甲基鳥氨酸(DFMO)和包含非類固醇抗炎藥 (NSAID)的非阿司匹林。
在一些實施方案中，結(jié)果通過接收包含所述基因型的報告或者獲取顯示結(jié)果的患者病史得到。在一些實施方案中，測試確定患者ODCl啟動子基因的一個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。在一些實施方案中，測試確定患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316 位置上的核苷酸堿基。在一些實施方案中，結(jié)果表明患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因 +316位置上的基因型是GG。在一些實施方案中，結(jié)果表明患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的基因型是GA。
在另一方面中，提供了用于以α-二氟甲基鳥氨酸(DFMO)和包含非類固醇抗炎藥 (NSAID)的非阿司匹林治療處于癌發(fā)展或復(fù)發(fā)風(fēng)險的患者的方法，包含向患者施用有效量的α-二氟甲基鳥氨酸(DFMO)和包含非類固醇抗炎藥(NSAID)的非阿司匹林，其中患者已經(jīng)被鑒定為至少一個ODCl啟動子基因等位基因+316位置上具有G。
在一些實施方案中，在患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上鑒定的基因型是GG。在一些實施方案中，在患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上鑒定的基因型是GA。
在另一方面中，提供了用于治療患者中癌的方法，包含
a)從確定患者的至少一個ODCl啟動子基因等位基因+316位置上的基因型的測試中得到結(jié)果；和
b)如果結(jié)果表明患者的ODCl啟動子基因的至少一個等位基因+316位置上的基因型是G，則向患者施用組合有效量的α-二氟甲基鳥氨酸(DFMO)和包含非類固醇抗炎藥 (NSAID)的非阿司匹林。
在一些實施方案中，結(jié)果通過接收包含所述基因型的報告或者獲取顯示結(jié)果的患者病史得到。在一些實施方案中，測試確定患者ODCl啟動子基因的一個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。在一些實施方案中，測試確定患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316 位置上的核苷酸堿基。在一些實施方案中，結(jié)果表明患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因 +316位置上的基因型是GG。在一些實施方案中，結(jié)果表明患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的基因型是GA。
在任何上述實施方案的變異實施方案中，包含NSAID的非阿司匹林是選擇性 C0X-2抑制劑。在一些實施方案中，包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸或塞來昔布。在一些實施方案中，包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸。在一些實施方案中，DFMO和舒林酸全身性施用。在一些實施方案中，DFMO和舒林酸通過不同的途徑施用。在一些實施方案中，DFMO 或包含NSAID的非阿司匹林經(jīng)口、動脈內(nèi)或靜脈內(nèi)施用。在一些實施方案中，DFMO經(jīng)口施用。在一些實施方案中，有效量的DFMO是500mg/天。在一些實施方案中，DFMO靜脈內(nèi)施用。在一些實施方案中，有效量的DFMO是從大約0.05至大約5. Og/m2/天。在一些實施方案中，DFMO和包含NSAID的非阿司匹林被配制成用于口服施用。在一些實施方案中，DFMO 和包含NSAID的非阿司匹林被配制成為硬或軟膠囊或者片劑。在一些實施方案中，DFMO和包含NSAID的非阿司匹林每12小時施用一次。在一些實施方案中，DFMO和包含NSAID的非阿司匹林每M小時施用一次。在一些實施方案中，有效量的舒林酸是從大約10至大約 1500mg/天。在一些實施方案中，有效量的舒林酸是從大約10至大約400mg/天。在一些實施方案中，有效量的舒林酸是150mg/天。在一些實施方案中，DFMO在舒林酸之前施用。在一些實施方案中，DFMO在舒林酸之后施用。在一些實施方案中，DFMO在舒林酸之前和之后施用。在一些實施方案中，DFMO與舒林酸并行施用。在一些實施方案中，DFMO施用至少兩次。在一些實施方案中，舒林酸施用至少兩次。
在任何上述實施方案的變異實施方案中，患者具有實體腫瘤，并且所述方法還包含所述實體腫瘤的切除。在一些實施方案中，DFMO和舒林酸在所述切除之前施用。在一些實施方案中，DFMO和舒林酸在所述切除之后施用。
在任何上述實施方案的變異實施方案中，癌是結(jié)直腸癌、乳腺癌、胰腺癌、腦癌、肺癌、胃癌、血癌、皮膚癌、睪丸癌、前列腺癌、卵巢癌、肝癌或食管癌、宮頸癌、頭頸癌、非黑素瘤皮膚癌、神經(jīng)母細胞瘤和成膠質(zhì)細胞瘤。在一些實施方案中，癌是結(jié)直腸癌。在一些實施方案中，結(jié)直腸癌是I期。在一些實施方案中，結(jié)直腸癌是II期。在一些實施方案中，結(jié)直腸癌是III期。在一些實施方案中，結(jié)直腸癌是IV期。
在任何上述實施方案的變異實施方案中，方法預(yù)防患者中新的晚期結(jié)直腸腫瘤的形成。在一些實施方案中，方法預(yù)防患者中的耳毒性或其風(fēng)險。在一些實施方案中，方法預(yù)防新的右側(cè)晚期結(jié)直腸腫瘤的形成。在一些實施方案中，方法預(yù)防新的左側(cè)晚期結(jié)直腸腫瘤的形成。
在任何上述實施方案的變異實施方案中，患者已經(jīng)被鑒定為在結(jié)腸、直腸或盲腸中具有一個或更多個腺瘤性息肉。在一些實施方案中，患者已經(jīng)被鑒定為具有一個或更多個晚期結(jié)直腸腫瘤。在一些實施方案中，患者已經(jīng)被鑒定為具有一個或更多個左側(cè)晚期結(jié)直腸腫瘤。在一些實施方案中，患者已經(jīng)被鑒定為具有一個或更多個右側(cè)晚期結(jié)直腸腫瘤。 在一些實施方案中，患者已經(jīng)被診斷為具有家族性腺瘤性息肉病。在一些實施方案中，患者已經(jīng)被診斷為具有林奇綜合征(Lynch syndrome)。在一些實施方案中，患者已經(jīng)被診斷為具有家族性X型結(jié)直腸癌。在一些實施方案中，患者滿足阿姆斯特丹標準或者阿姆斯特丹標準II。在一些實施方案中，患者具有一個或更多個結(jié)直腸腺瘤切除史。在一些實施方案中，患者具有與ODC活動過度相關(guān)的上皮內(nèi)瘤變或者癌前病變。在一些實施方案中，患者具有上皮內(nèi)瘤變或者癌前病變和升高的細胞多胺水平。
在任何上述實施方案的變異實施方案中，患者是人。
當詞語“一”在權(quán)利要求書和/或說明書中與術(shù)語“包含”一起使用時意思是指“一個”，但是它還具有“一個或更多個”、“至少一個”和“一個或多于一個”的含義。
在本申請的通篇中，術(shù)語“大約”用于指數(shù)值包含用來確定數(shù)值的設(shè)備和方法的固有誤差變異，或者所研究受試者當中存在的變異。
術(shù)語“包含”、“具有”和“包括”是開放性的系動詞。一個或更多個這些動詞的任何形式或時態(tài)，例如“包含”、“包含有”、“具有”、“具有著”、“包括”和“包括有”也是開放性的。 例如，“包含”、“具有”或“包括” 一個或更多個步驟的任何方法不限于僅擁有這些一個或更多個步驟，并且還涵蓋其它未列出的步驟。
如在說明書和/或權(quán)利要求書中所使用，術(shù)語“有效的”意思是指足以實現(xiàn)渴望的、期望的或者預(yù)期的結(jié)果。
如本文所使用，術(shù)語“ IC5tl”指得到最大反應(yīng)的50 %的抑制性劑量。
如本文所使用，術(shù)語“患者”或者“受試者”指活的哺乳動物有機體，例如人、猴、奶牛、綿羊、山羊、狗、貓、小鼠、大鼠、豚鼠或其轉(zhuǎn)基因種。在某些實施方案中，患者或受試者是靈長類。人受試者的非限定性實例是成人、少年、嬰兒和胎兒。
“藥學(xué)上可接受”意思是指可用于制備通常安全的、無毒的且在生物學(xué)和其它方面都不會不合需要的藥物組合物，包括可接受用于獸醫(yī)用途以及人藥物用途的那些藥物組合物。
“預(yù)防”包括(1)抑制處于可能疾病風(fēng)險中和/或易患疾病但尚未經(jīng)歷或者表現(xiàn)出任何或全部的疾病病理或癥狀的受試者或者患者中的疾病發(fā)作，和/或( 減慢可能處于疾病風(fēng)險中和/或易患疾病的但尚未經(jīng)歷或者表現(xiàn)出任何或全部的疾病病理或癥狀的受試者或者患者中的疾病病理或癥狀發(fā)作。
“有效量”、“治療有效量”或者“藥物有效量”意思是指當向受試者或者患者施用以治療疾病時，足以實現(xiàn)對疾病的所述治療的量。
“治療”包括(1)抑制經(jīng)歷著或者表現(xiàn)出疾病病理或癥狀的受試者或者患者中的疾病(例如阻止病理和/或癥狀進一步發(fā)展)，( 改善經(jīng)歷著或者表現(xiàn)出疾病病理或癥狀的受試者或者患者中的疾病(例如逆轉(zhuǎn)病理和/或癥狀)，和/或C3)實現(xiàn)經(jīng)歷著或者表現(xiàn)出疾病病理或癥狀的受試者或者患者中疾病的任何可測量的下降。
上述定義代替以引用的方式并入本文的任何參考文獻中的任何有沖突的定義。然而，某些術(shù)語被定義的事實不應(yīng)該認為預(yù)示著未定義的任何術(shù)語是不明確的。而是，所使用1的所有術(shù)語被認為是清楚地描述本發(fā)明以致于普通技術(shù)人員可理解本發(fā)明的范圍和實施本發(fā)明。
根據(jù)下面的詳細描述，本公開書的其它目的、特征和優(yōu)勢將變得顯而易見。然而， 應(yīng)當理解，詳細描述和特定的實施例在表明本發(fā)明特定實施方案的同時，僅以例證形式給出，因為根據(jù)所述詳細描述，處于本發(fā)明精神和范圍內(nèi)的諸多改變和修飾對本領(lǐng)域技術(shù)人員而言將變得顯而易見。請注意，特定化合物歸于一個特定通式并不意味著它不能夠?qū)儆诹硪煌ㄊ健?br>

下列附圖構(gòu)成本說明書的部分，并且被包含在內(nèi)以用于進一步例證本公開書的某些方面。通過參考這些附圖之一并結(jié)合本文所呈現(xiàn)的特定實施方案的詳細描述，可以更好地理解本發(fā)明。
圖I-MADl和c_MYC對多胺調(diào)節(jié)的不同作用.方案描述所提出的MADl和c_MYC在 0DC1+316次要A-等位基因上對多胺調(diào)節(jié)的不同作用。還顯示了 ODC抑制劑DFMO( 二氟甲基鳥氨酸)的作用。
圖2-結(jié)直腸癌特異性存活率估計.該圖顯示III期結(jié)直腸癌病例的 Kaplan-Meier結(jié)直腸癌特異性存活率估計，所述結(jié)直腸癌病例由0DC1+316基因型層化。包含了來自加利福尼亞大學(xué)歐文分校的家族性結(jié)直腸癌基因-環(huán)境研究的在1994-1996期間確診并且隨訪至2008年3月的病例0DC1 GG (64例，15例結(jié)直腸癌特異性死亡)，ODCl GA/ AA (62例，25例結(jié)直腸癌特異性死亡)。
圖3A和B-ODCl啟動子SNP的定位和分析.圖A顯示ODCl啟動子SNP的定位。在此項研究中研究的SNP是ODCl轉(zhuǎn)錄起始位點3'的316位的核苷酸O。該SNP位于由加下劃線序列所示的兩個共有序列E-盒之間，并且影響I^stI限制性位點(盒)(SEQ ID NO 5)。圖:3B顯示0DC1SNP的限制性片段長度多態(tài)性分析。從兩種細胞類型中得到DNA，并且將ODCl SNP位點周圍的區(qū)域測序。發(fā)現(xiàn)在ODCl SNP基因座上，結(jié)腸來源的細胞是雜合的GA，而HCTl 16細胞是純合的GG。從每一細胞類型得到該區(qū)域的350_bp PCR產(chǎn)物并用 PstI消化。通過< 350bp的限制性產(chǎn)物表明存在A-等位基因的證據(jù)。
圖4A和B-E-盒表達和免疫沉淀分析.ODCl啟動子SNP的定位.圖4A顯示結(jié)腸來源的細胞中的E-盒蛋白質(zhì)表達。待評價與+3160DC1SNP的結(jié)合的蛋白質(zhì)的表達通過Wfestern印跡分析來評價。使用Η ^9和HCT116兩種細胞的提取物評價c_MYC、MADl和 MAD4 ； β -肌動蛋白用作上樣對照。圖4Β顯示通過染色質(zhì)免疫沉淀分析獲得的關(guān)于等位基因特異性轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的資料，所述染色質(zhì)免疫沉淀分析如下面實施例部分所述進行。 ΗΤ29細胞是ODClA-等位基因的來源，因為這些細胞的該位點是雜合的GA。HCTl 16細胞用作ODClG-等位基因的來源。
圖5Α和B-c-MYC和MADl表達對ODCl活性的影響.圖5Α顯示Η ^9結(jié)腸來源的細胞中c-MYC表達對ODCl等位基因特異性啟動子活性的影響。在以O(shè)DCl啟動子報告基因質(zhì)粒與pcDNA 3. 0質(zhì)?；蛘逤MV-MYC表達載體共轉(zhuǎn)染后測量啟動子活性。啟動子構(gòu)建體的差別在于位于-485至-480bp內(nèi)的第一個E-盒元件的存在(對于野生型序列為“wt E-盒 1”或者對于突變體序列為“mut E-盒1”)。構(gòu)建體不同之處還在于0DC1+316SNP( “+316G”或者“+316A”)。*，對于與使用pcDNA 3. 0共轉(zhuǎn)染的啟動子活性進行的4種比較中每一種比較P < 0. 013。圖5B顯示Η ^9結(jié)腸腫瘤來源細胞中MADl表達對ODCl等位基因特異性啟動子活性的影響。在用ODCl啟動子報告基因質(zhì)粒與pcDNA 3. 1質(zhì)粒或者與pcDNA-MADl 質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染后測量啟動子活性。所使用的啟動子構(gòu)建體描述在該圖A組的圖例中。*，P = 0. 027，與使用pcDNA 3. 1共轉(zhuǎn)染的啟動子活性相比具有統(tǒng)計學(xué)顯著性。
圖6-腺瘤性息肉的減少.該圖顯示與用安慰劑治療相比，用DFMO和舒林酸治療的患者的腺瘤性息肉復(fù)發(fā)百分比。在總的腺瘤中減少70%，在晚期腺瘤中減少92%，并且在多發(fā)性腺瘤中減少95%。
圖7-基于+3160DC1基因型的藥物基因組學(xué)收益/風(fēng)險分析.該圖比較了 3年結(jié)束時相對于安慰劑的腺瘤復(fù)發(fā)百分比的減少，與治療組和安慰劑組的耳毒性百分比，它們作為患者+3160DC1基因型的函數(shù)。使用聽力測試試驗確定耳毒性。
圖8A-C-基于+3160DC1基因型的藥物基因組學(xué)收益/風(fēng)險分析.該圖比較了治療組與安慰劑組的收益，即3年結(jié)束時腺瘤復(fù)發(fā)百分比的減少，和風(fēng)險，即耳毒性百分比， 它們作為患者+3160DC1基因型的函數(shù)。使用聽力測試試驗確定耳毒性。
圖9-Min/+小鼠結(jié)腸中通過大小區(qū)分的腫瘤平均數(shù)量.該圖顯示與未治療對照相比，三個治療組的結(jié)腸中通過大小區(qū)分的腫瘤平均數(shù)量。購自Jackson實驗室(Bar Harbor, Me.)的小鼠通過C57BL/6J-ApcMin/+雄鼠和C57/BL6雌鼠雜交繁育。雜合子Min小鼠(ApcmVApc+)(對于Apc密碼子850上的無義突變?yōu)殡s合的)通過使用尾尖DNA的等位基因特異性PCR測定的斷奶期基因分型鑒定。純合的(Apc+Apc+)的一窩雄鼠用作對照。 一種治療是由在研究的第8天向飲用水添加2% DFMO (Merre 11 Dow Research Inst.)組成。在另一治療中，在研究的第21天向AIN-93G小鼠食物中加入167ppm的舒林酸(Harlen Teklad) 0第三種治療是DFMO和舒林酸的組合。在114天后，通過CO2窒息處死小鼠。從小鼠中取出小腸和結(jié)腸段并且縱向切開、放置并在70%乙醇中固定，并置于4°C用于腫瘤評分。還獲取代表性的組織用于組織病理學(xué)評價。
圖IO-Min/+小鼠小腸中通過大小區(qū)分的腫瘤平均數(shù)量.該圖顯示與未治療對照相比，三個治療組的小腸中通過大小區(qū)分的腫瘤平均數(shù)量。對于實驗細節(jié)參見上面的圖9 描述。
圖Il-Min/+小鼠中作為治療函數(shù)的高分級腺瘤的數(shù)量.該圖顯示高分級腺瘤數(shù)量如何取決于治療類型而變化。對于實驗細節(jié)參見上面的圖9描述。
具體實施方式
在數(shù)個方面中，提供了包含至少部分基于患者ODCl啟動子基因型，預(yù)測包含鳥氨酸脫羧酶(ODC)抑制劑和亞精胺/精胺N1-乙酰轉(zhuǎn)移酶表達激動劑的抗癌組合治療的適合性、功效、毒性和/或劑量的方法。
本發(fā)明還包含向表現(xiàn)出癌前癥狀的個體遞送治療化合物以預(yù)防癌癥的發(fā)作和/ 或預(yù)防癌癥風(fēng)險因素的發(fā)作，例如新的變異結(jié)腸腺窩病灶的形成，新的腺瘤性息肉或新的發(fā)育異常腺瘤的形成。該類別單元包括息肉和其它癌前病變、初癌、腫瘤發(fā)生前或者表明可能進展成癌狀態(tài)的其它異常表型，至少部分地基于患者的ODCl啟動子基因型。
I.多胺代謝
過量的多胺形成長期涉及到上皮癌發(fā)生，特別是結(jié)直腸癌發(fā)生。多胺是參與多種過程的小的遍在分子，包括轉(zhuǎn)錄、RNA穩(wěn)定、離子通道閘門和其它(Wallace，2000)。鳥氨酸脫羧酶(ODC)是多胺合成中的第一個酶，其對于哺乳動物的正常發(fā)育和組織修復(fù)是必需的，但是在大多數(shù)成年組織中下調(diào)(Gerner和Meyskens，2004)。對多胺代謝和運輸?shù)目刂频亩嘀禺惓?dǎo)致多胺水平提高，這會促進多種組織內(nèi)的腫瘤形成(Thomas和Thomas， 2003)。
在患有家族性腺瘤性息肉病(FAP)的人的腸上皮組織中多胺代謝被上調(diào) (Giardiello等人，1997)，F(xiàn)AP是一種與結(jié)腸癌和其它癌癥高風(fēng)險有關(guān)的綜合征。
FAP可以由腺瘤性結(jié)腸息肉病(APC)腫瘤抑制基因中的突變引起，并且已經(jīng)證明在兩種人細胞(Fultz和Gerner，2002)和FAP小鼠模型(Erdman等人，1999)中APC信號可調(diào)節(jié)ODC表達。
野生型APC表達導(dǎo)致ODC表達降低，而突變體APC導(dǎo)致ODC表達增加。ODC 的APC-依賴性調(diào)節(jié)機制涉及E-盒轉(zhuǎn)錄因子，包括轉(zhuǎn)錄激活劑c-MYC和轉(zhuǎn)錄阻抑物 MADl (Fultz 和 Gerner，2002 ；Martinez 等人，2003)。他人已經(jīng)證明 c_MYC 調(diào)節(jié) ODC 轉(zhuǎn)錄 (Bellofernandez等人，1993)。多胺代謝中涉及的數(shù)個基因是大多數(shù)生物最佳生長所必需的基因，并且在非增殖的和/或成體細胞和組織中被下調(diào)(Gerner和Meyskens，2004)。多胺部分地通過影響基因表達模式而影響特異性的細胞表型，如別處所綜述(Childs等人， 2003)。
如下面所述，已經(jīng)證明，包括抑制ODC活性(即多胺合成的限速酶)和/或降低細胞多胺水平的策略在預(yù)防人結(jié)直腸息肉復(fù)發(fā)中具有驚人的功效。來自此項研究的流行病學(xué)和實驗結(jié)果證明多胺穩(wěn)態(tài)由ODC中的遺傳多態(tài)性進行條件性調(diào)節(jié)，并且提出了 +3160DC SNP會對結(jié)腸腺瘤復(fù)發(fā)具有保護性并且對結(jié)腸癌診斷后的存活有害的模式。該信息可用于確定結(jié)腸癌預(yù)后。通過鑒定癌癥進展/復(fù)發(fā)風(fēng)險提高的患者，可創(chuàng)立三級預(yù)防管理策略的早期實現(xiàn)。此外，此項研究可用于鑒定具有高風(fēng)險但在其它方面經(jīng)歷最佳治療的局部結(jié)直腸癌的患者，這些患者將從三級癌癥預(yù)防治療中受益。
取決于患者的飲食，過量的多胺問題難以解決，因為多胺，例如腐胺存在于許多普通食物中，例如橙汁中，其包含大約400ppm的腐胺。在這一點上，禁忌高多胺飲食，并且對于本文提供的實施方案中的一些實施方案，避免此類飲食。參見由Kavitha P. Raj、Jason A. Zell、Christine Ε. McLaren、Eugene W. Gerner、Frank L. Meyskens 禾口 Jeffrey Jacob 于2010年5月14日提出的，題目為“基于飲食多胺含量的癌癥預(yù)防與治療方法(Cancer Prevention and Treatment Methods Based on Dietary Polyamine Content)，，的美國臨時專利申請，其全文以引用的方式并入本文。
II.家族性腺瘤性息肉病
家族性腺瘤性息肉病(FAP)是一種遺傳性息肉病綜合征，它是腺瘤性結(jié)腸息肉病 (APC)腫瘤抑制基因的種系突變的結(jié)果(Su等人，199 。這種表達變異的常染色體顯性病與許許多多結(jié)腸腺瘤的發(fā)展有關(guān)，結(jié)腸腺瘤一致性地到40歲時進展成腺癌，這比散發(fā)性結(jié)腸癌的平均診斷年齡早20年(Bussey，1990)。在先前對具有FAP的癥狀發(fā)生前個體的研究中，在表觀正常結(jié)直腸活檢中已經(jīng)檢測到與正常家族成員對照相比，多胺亞精胺和精胺以及它們的二胺前體腐胺水平增加(Giardiello等人，1997)。哺乳動物多胺合成中的第一個且為限速的酶鳥氨酸脫羧酶(ODC)的活性在來自FAP患者的表觀正常的結(jié)腸粘膜活檢中也提高(Giardiello等人，1997 ；Luk和Baylin, 1984)。這些發(fā)現(xiàn)很受人關(guān)注，因為多胺是最佳的細胞增殖所必需的(Pegg，1986)。此外，使用酶激活的不可逆性抑制劑DFMO抑制ODC 活性則抑制致癌劑處理的嚙齒類動物中的結(jié)腸癌發(fā)生(Kingsnorth等人，1983 ；Tempero等人，1989)。
如下面更加詳細地討論，與FAP共有突變的APC/apc基因型的Min(多發(fā)性腸瘤形成)小鼠充當人FAP患者的有用的實驗動物模型(Lipkin，1997)。Min小鼠在120天的生命中在整個胃腸道中可發(fā)生多于100個胃腸道腺瘤/腺癌，這導(dǎo)致GI出血、梗阻和死亡。DFMO和舒林酸的組合治療顯示在減少這些小鼠中的腺瘤方面是有效的(美國專利號 6，258，845 ；Gerner和Meyskens，2004)。用單獨的DFM0、單獨的舒林酸或者DFMO和舒林酸的組合治療Min小鼠后結(jié)腸或者小腸中的腫瘤形成結(jié)果示于圖9-11中。
III.鳥氨酸脫羧酶-I多態(tài)性
多胺合成中的第一個酶鳥氨酸脫羧酶(ODC)的活性是正常生長所必需的，并且在許多癌癥中，包括結(jié)直腸癌中提高。鑒于此，檢查了結(jié)直腸癌病例當中+3160DC單核苷酸多態(tài)性(SNP)與結(jié)直腸癌(CRC)特異性存活之間的關(guān)聯(lián)，并且研究了其在結(jié)腸癌細胞中的功言旨意義。
人ODCl基因內(nèi)含子-1中的單核苷酸多態(tài)性(SNP)影響ODCl轉(zhuǎn)錄(Guo等人， 2000)，并且已經(jīng)作為結(jié)直腸腺瘤(CRA)風(fēng)險的遺傳標記進行了研究(Martinez等人，2003 ； Barry等人，2006 ；Hubner等人，2008)。所報導(dǎo)的次要A-等位基因頻率大約為25%，并且盡管在人種/種族之間存在差異，但是在每一人種內(nèi)ODCl基因型分布處于哈代-溫伯格平衡中(O'Brien等人，2004 Jell等人，2009)。與帶有主要G-等位基因的個體相比，ODCl次要 A-等位基因純合的個體腺瘤復(fù)發(fā)的風(fēng)險降低(Martinez等人，2003 ；Hubner等人，2008)。此外，ODCl A-等位基因(AA或GA基因型，但不是GG基因型)和所報導(dǎo)的阿司匹林使用已經(jīng)與降低的結(jié)腸息肉復(fù)發(fā)相關(guān)(Martinez等人，2003 ；Barry等人，2006 ；Hubner等人，2008)， 并且在統(tǒng)計學(xué)意義上降低晚期腺瘤風(fēng)險達50% (Barry等人，2006)。
研究了 E-盒轉(zhuǎn)錄因子對ODC等位基因的特異性結(jié)合，并且評價了位于兩個E-盒之間的+3160DC SNP的功能意義(E-盒2和3，如圖2A中所述)。每一細胞系基因型影響該區(qū)域內(nèi)的共有序列I3StI限制性位點。圖2B顯示從人結(jié)腸HD9細胞產(chǎn)生的聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)產(chǎn)物對I3StI切割部分地敏感，表明這些細胞包含至少一個ODC A-等位基因。使用相同的引物從人結(jié)腸HCT116細胞產(chǎn)生的PCR產(chǎn)物對I^stI作用不敏感，暗示著這些細胞僅包含ODC G-等位基因。該結(jié)果通過直接的DNa測序得到證實。
通過Wfestern印跡確立了 Η ^9和HCTl 16細胞中特異性E-盒結(jié)合蛋白，包括轉(zhuǎn)錄激活劑c-MYC和數(shù)個轉(zhuǎn)錄阻抑物(例如MADl和MAD4)的表達(圖3Α)。使用針對這些蛋白質(zhì)的抗體進行了 ODC啟動子+316周圍區(qū)域的染色質(zhì)免疫沉淀(CHIP)分析。如圖中所示，從使用針對c-MYC、MADl或MAD4的抗體進行染色質(zhì)免疫沉淀后得到的HD9DNA合成ODC 啟動子特異性PCR產(chǎn)物。與從HD9DNA合成的那些PCR產(chǎn)物相比，從相似染色質(zhì)免疫沉淀后的HCT116DNA合成的PCR產(chǎn)物相當大地減少。這些結(jié)果量化后表明，與僅包含ODC-G等位基因的HCTl 16細胞相比，在包含一個ODC-A等位基因的Η ^9細胞中，結(jié)合至ODC SNP區(qū)的 c-MYC、MADl 和 MAD4 多 4-14 倍。
評價了 ODC等位基因特異性啟動子活性。如下測試了 +3160DC SNP以依賴于E-盒激活劑和阻抑物表達的方式影響ODC表達的假設(shè)。用ODC等位基因特異性啟動子構(gòu)建體與表達轉(zhuǎn)錄激活劑c-MYC或者阻抑物MADl的載體相組合實現(xiàn)對結(jié)腸癌來源HD9細胞的瞬時共轉(zhuǎn)染(圖4A和B)。所示的標準誤差線反映出已經(jīng)重復(fù)實驗的一個代表性實驗內(nèi)的三個測量值的差異性。在包括所有三個E-盒的這些實驗中使用的等位基因特異性啟動子報告基因示于圖2A中。如圖4A中所示，c-MYC表達對包含三個共有序列E-盒和ODC-A等位基因的啟動子具有最大的刺激性作用(wtE-盒1+316A，P = 0.0014)。上游E-盒缺失使啟動子活性降低，但是c-MYC表達持續(xù)刺激該活性(mut E-盒1+316A, P = O. 0013)。+316SNP 位置由G替代A降低了 c-MYC刺激啟動子活性的能力，甚至是使用完整的5'側(cè)翼共有序列E-盒時也如此。5'側(cè)翼共有序列E-盒的突變與ODC-G等位基因組合進一步降低了啟動子活性。
當MADl，而不是c-MYC，與ODC等位基因特異性啟動子報告基因共轉(zhuǎn)染時(圖4B)， 阻抑物僅能夠降低包含所有三個E-盒和野生型+316A-等位基因的ODC啟動子的活性(P =0. 027)。上游E-盒缺失(mutE-盒1+316A)顯著降低MADl對ODC啟動子活性的影響。 +316位置由G取代A使得包含兩個或者三個E-盒的啟動子對MADl阻抑無反應(yīng)。
IV. 二氟甲基鳥氨酸(DFMO)
DFMO也稱作依氟鳥氨酸，具有以下化學(xué)名稱；2_( 二氟甲基)-dl-鳥氨酸。它是多胺生物合成途徑限速酶鳥氨酸脫羧酶(ODC)的酶激活不可逆性抑制劑。作為該種多胺合成抑制的結(jié)果，所述化合物有效地預(yù)防了許多器官系統(tǒng)內(nèi)的癌癥形成、抑制了癌癥生長并且縮小了腫瘤大小。它還與其它抗腫瘤藥具有協(xié)同作用。
已經(jīng)證明DFMO降低小鼠中的APC-依賴性的腸腫瘤發(fā)生(Erdman等人，1999)。人每日口服施用DFMO可抑制許多上皮組織內(nèi)的ODC酶活性和多胺含量(Love等人，1993 ； Gerner 等人，1994 ；Meyskens 等人，1994 ；Meyskens 等人，1998 ；Simoneau 等人，2001 ； Simoneau等人，2008)。最近，發(fā)明人報導(dǎo)了，與隨機臨床試驗中的安慰劑相比，DFMO與非類固醇抗炎藥(NSAID)舒林酸組合明顯降低了具有結(jié)腸腺瘤個體當中的腺瘤復(fù)發(fā)率 (Meyskens 等人，2008)。
DFMO最初由斯特拉斯堡的Centre de Recherche Merrell合成；當前FDA的批準包括
非洲昏睡病。高劑量的全身性IV劑型一未投放市場(Sanofi/WHO)
多毛癥(雄激素誘導(dǎo)的毛發(fā)生長過度)局部劑型
當前沒有批準口服制劑。
DFMO及其在治療良性前列腺肥大中的用途描述于美國專利號4，413，141和 4，330，559兩個專利中。美國專利號4，413，141描述了 DFMO作為ODC的體外和體內(nèi)強效抑制劑。施用DFMO引起其中通?；钴S產(chǎn)生腐胺和亞精胺的細胞內(nèi)這些多胺濃度降低。此外， 當在標準腫瘤模型中測試時顯示DFMO能夠減慢腫瘤細胞的增殖。美國專利號4，330，559 描述了 DFMO和DFMO衍生物用于治療良性前列腺肥大的用途。良性前列腺肥大與許多以快速細胞增殖為特征的疾病狀態(tài)一樣，伴隨著多胺濃度的異常升高。在該文獻中描述的治療劑可以經(jīng)口或者腸胃外向患者施用。
DFMO可以連續(xù)施用而具有明顯的抗腫瘤作用。該藥物在0. 4g/m2/天的低劑量下對人相對無毒，與此同時產(chǎn)生對腫瘤內(nèi)腐胺合成的抑制。在大鼠腫瘤模型中的研究證明DFMO 輸注可引起腫瘤腐胺水平降低90%，而沒有抑制外周血小板計數(shù)。
使用DFMO觀察到的副作用包括在4g/M2/天的高劑量時對聽覺的影響，當停藥后影響消退。當以0.4g/M2/天的較低劑量施用長達一年時沒有觀察到這種對聽覺的影響 (Meyskens等人，1994)。此外觀察到頭昏/眩暈的少數(shù)病例，但當停藥時頭昏/眩暈消失。 主要在使用高“治療”劑量DFM0(> 1.0g/m2/天)的研究中報導(dǎo)了血小板減少癥，并且主要在先前進行化學(xué)治療的癌癥患者中或者骨髓免疫力缺乏的患者中進行了報導(dǎo)。雖然DFMO 治療伴隨的毒性通常不如其它類型化學(xué)療法嚴重，但是還是在有限的臨床試驗中發(fā)現(xiàn)其促進劑量相關(guān)性血小板減少癥。此外，在大鼠中的研究表明，與對照相比，連續(xù)輸注DFMO 12 天明顯減少血小板計數(shù)。其它研究得到相似的觀察結(jié)果，其中血小板減少癥是連續(xù)靜脈內(nèi) DFMO治療的主要毒性。這些發(fā)現(xiàn)表明，DFMO將顯著抑制骨髓巨核細胞前體的ODC活性。 DFMO會抑制增殖修復(fù)過程，例如上皮傷口愈合。
在III期臨床試驗中，評價用二氟甲基鳥氨酸(DFMO)加舒林酸或者配對安慰劑治療36個月后腺瘤性息肉的復(fù)發(fā)。暫時性耳聾是用DFMO治療的已知的毒性，因此開發(fā)綜合方法以分析系列的氣導(dǎo)聽力圖。廣義估計方程方法估計治療組之間關(guān)于氣導(dǎo)純音閾值變化的平均差異，同時解釋由于各種頻率下重復(fù)測量所引起的受試者內(nèi)相關(guān)性?；?90個受試者，在對于基線數(shù)值、年齡和頻率調(diào)整后，與用安慰劑治療的那些受試者相比，用DFMO加舒林酸治療的受試者之間具有0. 50dB的平均差異(95%置信區(qū)間，-0. 64至1. 63dB ；P = 0. 39)。在500至3，OOOHz的正常語音范圍內(nèi)，檢測到0. 99dB的估計差異(-0. 17至2. 14dB ； P = 0.09)。劑量強度對模型沒有增加信息。在DFMO加舒林酸組中的151個中有14個 (9.3%)并且在安慰劑組中的139個中有4個經(jīng)歷了在所測試的整個范圍內(nèi)的2 個或更多個連續(xù)頻率中聽力從基線值降低至少15dB(P = 0. 02)。在治療結(jié)束后進行的至少 6個月的隨訪氣導(dǎo)測試顯示，在治療組之間的聽力閾值的校正平均差異為1.08dB(-0.81至 2. 96dB ；P = 0. 26)。與安慰劑組相比，DFMO加舒林酸組中經(jīng)歷臨床上明顯耳聾的受試者比例沒有顯著差異。來自接觸藥物的估計的耳毒性歸因風(fēng)險是8. 4% (95%置信區(qū)間，-2.0% 至18. 8% ；P = 0.12)。與使用安慰劑治療的患者相比，使用DFMO加舒林酸治療的患者的平均閾值差異是< 2dB。此項研究的結(jié)果在McLaren等人，2008中更詳細地討論，該文獻的全文以引用的方式并入本文。本文提供降低和/或預(yù)防用試劑如DFMO和舒林酸治療的患者中的耳毒性的方法。
V. NSAID
NSAID是非類固醇的抗炎劑。它們除了具有抗炎癥作用外，還具有鎮(zhèn)痛、解熱和血小板抑制性作用。它們主要用于治療慢性關(guān)節(jié)炎和與疼痛和炎癥有關(guān)的某些軟組織病。它們通過抑制環(huán)加氧酶從而阻斷前列腺素的合成而起作用，其中環(huán)加氧酶將花生四烯酸轉(zhuǎn)變成環(huán)狀的內(nèi)過氧化物，即前列腺素的前體。對前列腺素合成的抑制解釋了它們的鎮(zhèn)痛、解熱和血小板抑制性作用；其它機制將促成它們的抗炎癥作用。某些NSAID還可抑制脂氧合酶或者磷脂酶C或者可以調(diào)節(jié)T細胞功能(ΑΜΑ Drug Evaluations Annual，1814-5，1994)。
包括阿司匹林、布洛芬(ibuprofen)、吡羅昔康(piroxicam) (Reddy等人，1990 ； Singh 等人，1994)、吲哚美辛(indomethacin) (Narisawa, 1981)和舒林酸(Piazza 等人， 1997 ；Rao等人，1995)在內(nèi)的非類固醇抗炎藥(NSAID)有效地抑制AOM-處理大鼠模型中的結(jié)腸癌發(fā)生。NSAID還抑制包含活化的Ki-ras的腫瘤的發(fā)展(Singh和Reddy，1995)。NSAID 似乎通過誘導(dǎo)腫瘤細胞的凋亡而抑制癌發(fā)生(Bedi等人，1995 ；Lupulescu, 1996 ；Piazza等人，1995 ；Piazza等人，1997b)。大量研究表明，NSAID的化學(xué)預(yù)防特性，包括誘導(dǎo)凋亡，是它們具有抑制前列腺素合成的能力的作用(綜述于DuBois等人，1996 ；Lupulescu, 1996 ； Vane和Botting，1997中)。然而，研究表明NSAID可通過前列腺素依賴性和前列腺素不依賴性兩種機制起作用(Alberts等人，1995 ；Piazza等人，1997a ；Thompson等人，1995 ； Hanif，1996)。舒林砜(sulindac sulfone)是NSAID舒林酸的代謝物，它缺乏COX-抑制活性，但誘導(dǎo)腫瘤細胞的凋亡(Piazza等人，1995 ；Piazza等人，1997b)并且在癌發(fā)生的數(shù)個嚙齒動物模型中抑制腫瘤發(fā)展(Thompson等人，1995 ；Piazza等人，1995，1997a)。
已經(jīng)檢查了數(shù)個NSAID在人臨床試驗中的作用。完成了布洛芬的IIa期試驗(一個月)，并且甚至在300mg/天的劑量下，觀察到扁平粘膜中前列腺素E2 (PGE2)水平顯著降低。300mg的布洛芬劑量是非常低的(治療劑量范圍為1200-3000mg/天或者更高)，并且不太可能觀察到毒性，甚至長期使用也是如此。然而，在動物的化學(xué)預(yù)防模型中，布洛芬比其它的NSAID效果差。
A.舒林酸及其主要代謝物，舒林砜和硫化舒林酸
舒林酸是非類固醇的抗炎癥的茚衍生物，具有下列化學(xué)名稱；(Z)-5_氟-2-甲基-1-((4(甲基亞硫?；?苯基)亞甲基)IH-茚-3-乙酸(Physician's Desk Reference, 1999)。亞硫酰基部分在體內(nèi)通過可逆性還原作用被轉(zhuǎn)變成硫化物代謝物并且通過不可逆的氧化作用轉(zhuǎn)變成砜代謝物(依昔舒林(exisulind))。參見美國專利6，258，845，其全文以引用的方式并入本文。還抑制Ki-ras活化的舒林酸被代謝成兩種不同的分子，它們抑制 COX的能力不同，但是兩者均能夠通過誘導(dǎo)凋亡施加化學(xué)預(yù)防作用。舒林砜缺乏COX-抑制性活性，并且最有可能以前列腺素合成不依賴方式促進凋亡的誘導(dǎo)?？捎玫淖C據(jù)表明，硫化物衍生物是生物活性化合物中的至少一個。基于此，舒林酸可以認為是前藥。
舒林酸(Clinoril )是可以獲得的，例如作為150mg和200mg的片劑。對于成年人最常用的劑量是150至200mg，每天兩次，其中最大日劑量是400mg。在口服施用后，大約90%的藥物被吸收。峰值血漿水平在禁食患者中在大約2小時內(nèi)達到，當與食物一起施用時在3至4小時達到。舒林酸的平均半衰期是7. 8小時硫化物代謝物的平均半衰期是 16. 4小時。美國專利號3，647，858和3，654，349保護舒林酸制劑，兩篇文獻的全文以引用的方式并入本文。
舒林酸主治骨性關(guān)節(jié)炎、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、強直性脊柱炎、急性痛風(fēng)和急性痛肩體征和癥狀的急性和長期緩解。舒林酸(每天400mg)的鎮(zhèn)痛和抗炎癥效果與阿司匹林(每天 4g)、布洛芬(每天1200mg)、吲哚美辛(每天125mg)和苯基保泰松(phenylbutazone)(每天400至600mg)所實現(xiàn)的鎮(zhèn)痛和抗炎癥效果具有可比性。舒林酸的副作用包括在近20% 的患者中的輕微胃腸道影響，其中腹痛和惡心是最常見的主訴。在高達10%的患者中觀察到CNS副作用，其中最常見的報告是嗜睡、頭痛和神經(jīng)過敏。在5%的患者中出現(xiàn)皮疹和瘙癢。使用舒林酸進行慢性治療會產(chǎn)生嚴重的胃腸道毒性，例如出血、潰瘍和穿孔。
已經(jīng)深入研究了舒林酸用于癌癥，并且特別是結(jié)直腸息肉的化學(xué)預(yù)防的潛在用途。兩個最新的美國專利號5，814，625和5，843，929詳述了舒林酸在人中的潛在化學(xué)預(yù)防用途。兩個專利的全文以引用的方式并入本文。美國專利號5，814，625中要求保護的舒林酸的劑量范圍為每天從IOmg至1500mg，其中優(yōu)選的劑量為每天50mg至500mg。然而，在更高劑量時，使用舒林酸作為化學(xué)預(yù)防的單一試劑的最大的問題是其眾所周知的毒性和適度高的不耐性風(fēng)險。老人似乎特別容易受傷，因為在超過60歲的人中副作用的發(fā)病率更高。 值得注意的是，該年齡組最有可能發(fā)生結(jié)直腸癌，并且因此最有可能從化學(xué)預(yù)防中受益。
在臨床上已經(jīng)測試并持續(xù)測試舒林酸及其砜代謝物依昔舒林用于預(yù)防和治療數(shù)種癌癥類型。美國國立衛(wèi)生研究院數(shù)據(jù)庫Clinical Trials, gov提供下列截至2010年5 月10日的綜述。
權(quán)利要求
1.一種用于預(yù)防性或治療性治療患者中癌的方法，包含a)從確定所述患者的至少一個ODCl啟動子基因等位基因+316位置上的基因型的測試中得到結(jié)果；和b)如果所述結(jié)果表明所述患者的ODCl啟動子基因的至少一個等位基因+316位置上的基因型是G，則向所述患者施用有效量的包含下列的藥物療法(i)抑制所述患者內(nèi)鳥氨酸脫羧酶(ODC)的第一試劑；和( )當與所述第一試劑組合時調(diào)節(jié)多胺途徑以減少所述患者內(nèi)總體多胺含量的第二試齊LU
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述第二試劑還增加所述患者內(nèi)亞精胺/精胺 N1-乙酰轉(zhuǎn)移酶的表達。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述結(jié)果通過接收包含所述基因型的報告或者獲取顯示所述結(jié)果的患者病史得到。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述測試確定所述患者ODCl啟動子基因的一個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述測試確定所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的方法，其中所述結(jié)果表明所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的基因型是GG。
7.根據(jù)權(quán)利要求5所述的方法，其中所述結(jié)果表明所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的基因型是GA。
8.根據(jù)權(quán)利要求1-7任意一項所述的方法，其中如果在得到所述測試結(jié)果之前，所述患者正在用所述藥物療法但以較低的劑量進行治療，則所述藥物療法還包含增加所述第一試劑或所述第二試劑的劑量。
9.根據(jù)權(quán)利要求1-7任意一項所述的方法，其中如果在得到所述測試結(jié)果之前，所述患者正在用所述藥物療法但以較低的劑量進行治療，則所述藥物療法還包含增加所述第一試劑和所述第二試劑的劑量。
10.根據(jù)權(quán)利要求1-9任意一項所述的方法，其中所述第一試劑是α-二氟甲基鳥氨酸 (DFMO)。
11.根據(jù)權(quán)利要求1-9任意一項所述的方法，其中所述第二試劑是包含非類固醇抗炎藥(NSAID)的非阿司匹林。
12.根據(jù)權(quán)利要求11所述的方法，其中所述包含NSAID的非阿司匹林是選擇性C0X-2 抑制劑。
13.根據(jù)權(quán)利要求11所述的方法，其中所述包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸 (sulindac)或塞來昔布(celecoxib)。
14.根據(jù)權(quán)利要求13所述的方法，其中所述包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸。
15.一種用于治療患者中結(jié)直腸癌風(fēng)險因素的方法，包含a)從確定所述患者的至少一個ODCl啟動子基因等位基因+316位置上的基因型的測試中得到結(jié)果；和b)如果所述結(jié)果表明所述患者的ODCl啟動子基因的至少一個等位基因+316位置上的基因型是G，則向所述患者施用有效量的包含下列的藥物療法 (i)抑制所述患者內(nèi)鳥氨酸脫羧酶(ODC)的第一試劑；和( )當與所述第一試劑組合時調(diào)節(jié)多胺途徑以減少所述患者內(nèi)總體多胺含量的第二試劑，其中所述方法預(yù)防所述患者內(nèi)新的變異結(jié)腸腺窩病灶、新的腺瘤性息肉或者新的發(fā)育異常腺瘤的形成。
16.根據(jù)權(quán)利要求15所述的方法，其中所述第二試劑還增加所述患者內(nèi)亞精胺/精胺 N1-乙酰轉(zhuǎn)移酶的表達。
17.根據(jù)權(quán)利要求15所述的方法，其中所述方法預(yù)防所述患者中新的變異結(jié)腸腺窩病灶的形成。
18.根據(jù)權(quán)利要求15所述的方法，其中所述方法預(yù)防所述患者中新的腺瘤性息肉的形成。
19.根據(jù)權(quán)利要求15所述的方法，其中所述方法預(yù)防所述患者中新的發(fā)育異常腺瘤的形成。
20.根據(jù)權(quán)利要求15所述的方法，其中所述結(jié)果通過接收包含所述基因型的報告或者獲取顯示所述結(jié)果的患者病史得到。
21.根據(jù)權(quán)利要求15所述的方法，其中所述測試確定所述患者ODCl啟動子基因的一個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。
22.根據(jù)權(quán)利要求15所述的方法，其中所述測試確定所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。
23.根據(jù)權(quán)利要求22所述的方法，其中所述結(jié)果表明所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的基因型是GG。
24.根據(jù)權(quán)利要求22所述的方法，其中所述結(jié)果表明所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的基因型是GA。
25.根據(jù)權(quán)利要求15-M任意一項所述的方法，其中如果在得到所述測試結(jié)果之前，所述患者正在用所述藥物療法但以較低的劑量進行治療，則所述藥物療法還包含增加所述第一試劑或所述第二試劑的劑量。
26.根據(jù)權(quán)利要求15-M任意一項所述的方法，其中如果在得到所述測試結(jié)果之前，所述患者正在用所述藥物療法但以較低的劑量進行治療，則所述藥物療法還包含增加所述第一試劑和所述第二試劑的劑量。
27.根據(jù)權(quán)利要求1546任意一項所述的方法，其中所述第一試劑是α-二氟甲基鳥氨酸(DFMO)。
28.根據(jù)權(quán)利要求1516任意一項所述的方法，其中所述第二試劑是包含非類固醇抗炎藥(NSAID)的非阿司匹林。
29.根據(jù)權(quán)利要求觀所述的方法，其中所述包含NSAID的非阿司匹林是選擇性C0X-2 抑制劑。
30.根據(jù)權(quán)利要求觀所述的方法，其中所述包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸或塞來曰沖。
31.根據(jù)權(quán)利要求30所述的方法，其中所述包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸。
32.一種用于評價患者對預(yù)防性或治療性治療癌的適合性的方法，包含a)從確定所述患者的至少一個ODCl啟動子基因等位基因+316位置上的基因型的測試中得到結(jié)果；和b)如果所述結(jié)果表明所述患者的ODCl啟動子基因的至少一個等位基因+316位置上的基因型是G，則鑒定為所述患者適合通過藥物療法進行治療，所述療法包含組合有效量的抑制所述患者內(nèi)鳥氨酸脫羧酶(ODC)的第一試劑；和當與所述第一試劑組合時調(diào)節(jié)多胺途徑以減少所述患者內(nèi)總體多胺含量的第二試劑。
33.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述第二試劑還增加所述患者內(nèi)的亞精胺/精胺 N1-乙酰轉(zhuǎn)移酶表達。
34.根據(jù)權(quán)利要求32所述的方法，其中所述結(jié)果通過接收包含所述基因型的報告或者獲取顯示所述結(jié)果的患者病史得到。
35.根據(jù)權(quán)利要求32所述的方法，其中所述測試確定所述患者ODCl啟動子基因的一個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。
36.根據(jù)權(quán)利要求32所述的方法，其中所述測試確定所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。
37.根據(jù)權(quán)利要求36所述的方法，其中所述結(jié)果表明所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的基因型是GG。
38.根據(jù)權(quán)利要求36所述的方法，其中所述結(jié)果表明所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的基因型是GA。
39.根據(jù)權(quán)利要求32-38任意一項所述的方法，其中如果在得到所述測試結(jié)果之前，所述患者正在用所述藥物療法但以較低的劑量進行治療，則所述藥物療法還包含增加所述第一試劑或所述第二試劑的劑量。
40.根據(jù)權(quán)利要求32-38任意一項所述的方法，其中如果在得到所述測試結(jié)果之前，所述患者正在用所述藥物療法但以較低的劑量進行治療，則所述藥物療法還包含增加所述第一試劑和所述第二試劑的劑量。
41.根據(jù)權(quán)利要求32-40任意一項所述的方法，其中所述第一試劑是α-二氟甲基鳥氨酸(DFMO)。
42.根據(jù)權(quán)利要求32-40任意一項所述的方法，其中所述第二試劑是包含非類固醇抗炎藥(NSAID)的非阿司匹林。
43.根據(jù)權(quán)利要求42所述的方法，其中所述包含NSAID的非阿司匹林是選擇性C0X-2 抑制劑。
44.根據(jù)權(quán)利要求42所述的方法，其中所述包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸或塞來曰沖ο
45.根據(jù)權(quán)利要求42所述的方法，其中所述包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸。
46.一種使患者中的癌腫瘤可切除的方法，包含a)從確定所述患者的至少一個ODCl啟動子基因等位基因+316位置上的基因型的測試中得到結(jié)果；和b)如果所述結(jié)果表明所述患者的ODCl啟動子基因的至少一個等位基因+316位置上的基因型是G，則向所述患者施用有效量的包含下列的藥物療法(i)抑制所述患者內(nèi)鳥氨酸脫羧酶(ODC)的第一試劑；和( )增加所述患者內(nèi)亞精胺/精胺W-乙酰轉(zhuǎn)移酶表達的第二試劑。
47.根據(jù)權(quán)利要求46所述的方法，其中所述結(jié)果通過接收包含所述基因型的報告或者獲取顯示所述結(jié)果的患者病史得到。
48.根據(jù)權(quán)利要求46所述的方法，其中所述測試確定所述患者ODCl啟動子基因的一個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。
49.根據(jù)權(quán)利要求46所述的方法，其中所述測試確定所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。
50.根據(jù)權(quán)利要求49所述的方法，其中所述結(jié)果表明所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的基因型是GG。
51.根據(jù)權(quán)利要求49所述的方法，其中所述結(jié)果表明所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的基因型是GA。
52.根據(jù)權(quán)利要求46-51任意一項所述的方法，其中如果在得到所述測試結(jié)果之前，所述患者正在用所述藥物療法但以較低的劑量進行治療，則所述藥物療法還包含增加所述第一試劑或所述第二試劑的劑量。
53.根據(jù)權(quán)利要求46-51任意一項所述的方法，其中如果在得到所述測試結(jié)果之前，所述患者正在用所述藥物療法但以較低的劑量進行治療，則所述藥物療法還包含增加所述第一試劑和所述第二試劑的劑量。
54.根據(jù)權(quán)利要求46-53任意一項所述的方法，其中所述第一試劑是α-二氟甲基鳥氨酸(DFMO)。
55.根據(jù)權(quán)利要求46-53任意一項所述的方法，其中所述第二試劑是包含非類固醇抗炎藥(NSAID)的非阿司匹林。
56.根據(jù)權(quán)利要求55所述的方法，其中所述包含NSAID的非阿司匹林是選擇性C0X-2 抑制劑。
57.根據(jù)權(quán)利要求55所述的方法，其中所述包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸或塞來昔布。
58.根據(jù)權(quán)利要求57所述的方法，其中所述包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸。
59.一種用于預(yù)防處于風(fēng)險中的患者中癌發(fā)展或復(fù)發(fā)的方法，包含a)從確定所述患者的至少一個ODCl啟動子基因等位基因+316位置上的基因型的測試中得到結(jié)果；和b)如果所述結(jié)果表明所述患者的ODCl啟動子基因的至少一個等位基因+316位置上的基因型是G，則向所述患者施用組合有效量的α-二氟甲基鳥氨酸(DFMO)和包含非類固醇抗炎藥(NSAID)的非阿司匹林。
60.根據(jù)權(quán)利要求59所述的方法，其中所述結(jié)果通過接收包含所述基因型的報告或者獲取顯示所述結(jié)果的患者病史得到。
61.根據(jù)權(quán)利要求59所述的方法，其中所述測試確定所述患者ODCl啟動子基因的一個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。
62.根據(jù)權(quán)利要求59所述的方法，其中所述測試確定所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。
63.根據(jù)權(quán)利要求62所述的方法，其中所述結(jié)果表明所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的基因型是GG。
64.根據(jù)權(quán)利要求62所述的方法，其中所述結(jié)果表明所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的基因型是GA。
65.一種用于以α-二氟甲基鳥氨酸(DFMO)和包含非類固醇抗炎藥(NSAID)的非阿司匹林治療處于癌發(fā)展或復(fù)發(fā)風(fēng)險的患者的方法，包含向所述患者施用有效量的α-二氟甲基鳥氨酸(DFMO)和包含非類固醇抗炎藥(NSAID)的非阿司匹林，其中所述患者已經(jīng)被鑒定為至少一個ODCl啟動子基因等位基因+316位置上具有G。
66.根據(jù)權(quán)利要求65所述的方法，其中在所述患者的ODCl啟動子基因的兩個等位基因 +316位置上鑒定的基因型是GG。
67.權(quán)利要求65的方法，其中在所述患者的ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上鑒定的基因型是GA。
68.一種用于治療患者中癌的方法，包含a)從確定所述患者的至少一個ODCl啟動子基因等位基因+316位置上的基因型的測試中得到結(jié)果；和b)如果所述結(jié)果表明所述患者的ODCl啟動子基因的至少一個等位基因+316位置上的基因型是G，則向患者施用組合有效量的α-二氟甲基鳥氨酸(DFMO)和包含非類固醇抗炎藥(NSAID)的非阿司匹林。
69.根據(jù)權(quán)利要求68所述的方法，其中所述結(jié)果通過接收包含所述基因型的報告或者獲取顯示所述結(jié)果的患者病史得到。
70.根據(jù)權(quán)利要求68所述的方法，其中所述測試確定所述患者ODCl啟動子基因的一個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。
71.根據(jù)權(quán)利要求70所述的方法，其中所述測試確定所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的核苷酸堿基。
72.根據(jù)權(quán)利要求68所述的方法，其中所述結(jié)果表明所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的基因型是GG。
73.根據(jù)權(quán)利要求68所述的方法，其中所述結(jié)果表明所述患者ODCl啟動子基因的兩個等位基因+316位置上的基因型是GA。
74.根據(jù)權(quán)利要求11、28、42、55和59-73任意一項所述的方法，其中所述包含NSAID的非阿司匹林是選擇性C0X-2抑制劑。
75.根據(jù)權(quán)利要求11、28、42、55和59-73任意一項所述的方法，其中所述包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸或塞來昔布。
76.根據(jù)權(quán)利要求11、28、42、55和59-73任意一項所述的方法，其中所述包含NSAID的非阿司匹林是舒林酸。
77.根據(jù)權(quán)利要求76所述的方法，其中DFMO和舒林酸全身性施用。
78.根據(jù)權(quán)利要求76所述的方法，其中DFMO和舒林酸通過不同的途徑施用。
79.根據(jù)權(quán)利要求76所述的方法，其中所述DFMO或所述包含NSAID的非阿司匹林經(jīng)口、動脈內(nèi)或靜脈內(nèi)施用。
80.根據(jù)權(quán)利要求79所述的方法，其中所述DFMO經(jīng)口施用。
81.根據(jù)權(quán)利要求80所述的方法，其中所述有效量的DFMO是500mg/天。
82.根據(jù)權(quán)利要求79所述的方法，其中所述DFMO靜脈內(nèi)施用。
83.根據(jù)權(quán)利要求82所述的方法，其中所述有效量的DFMO是從大約0.05至大約5. Og/m2/天。
84.根據(jù)權(quán)利要求79所述的方法，其中所述DFMO和所述包含NSAID的非阿司匹林被配制成用于口服施用。
85.根據(jù)權(quán)利要求84所述的方法，其中所述DFMO和所述包含NSAID的非阿司匹林被配制成為硬或軟膠囊或者片劑。
86.根據(jù)權(quán)利要求76所述的方法，其中所述DFMO和所述包含NSAID的非阿司匹林每 12小時施用一次。
87.根據(jù)權(quán)利要求76所述的方法，其中所述DFMO和所述包含NSAID的非阿司匹林每 24小時施用一次。
88.根據(jù)權(quán)利要求76所述的方法，其中所述有效量的舒林酸是從大約10至大約 1500mg/天。
89.根據(jù)權(quán)利要求88所述的方法，其中所述有效量的舒林酸是從大約10至大約 400mg/天。
90.根據(jù)權(quán)利要求88所述的方法，其中所述有效量的舒林酸是150mg/天。
91.根據(jù)權(quán)利要求76所述的方法，其中DFMO在舒林酸之前施用。
92.根據(jù)權(quán)利要求76所述的方法，其中DFMO在舒林酸之后施用。
93.根據(jù)權(quán)利要求76所述的方法，其中DFMO在舒林酸之前和之后施用。
94.根據(jù)權(quán)利要求76所述的方法，其中DFMO與舒林酸并行施用。
95.根據(jù)權(quán)利要求76所述的方法，其中DFMO施用至少兩次。
96.根據(jù)權(quán)利要求76所述的方法，其中舒林酸施用至少兩次。
97.根據(jù)權(quán)利要求76所述的方法，其中所述患者具有實體腫瘤，并且所述方法還包含所述實體腫瘤的切除。
98.根據(jù)權(quán)利要求97所述的方法，其中DFMO和舒林酸在所述切除之前施用。
99.根據(jù)權(quán)利要求97所述的方法，其中DFMO和舒林酸在所述切除之后施用。
100.根據(jù)權(quán)利要求1-99任意一項所述的方法，其中所述癌是結(jié)直腸癌、乳腺癌、胰腺癌、腦癌、肺癌、胃癌、血癌、皮膚癌、睪丸癌、前列腺癌、卵巢癌、肝癌或食管癌、宮頸癌、頭頸癌、非黑素瘤皮膚癌、神經(jīng)母細胞瘤和成膠質(zhì)細胞瘤。
101.根據(jù)權(quán)利要求100所述的方法，其中所述癌是結(jié)直腸癌。
102.根據(jù)權(quán)利要求101所述的方法，其中所述結(jié)直腸癌是I期。
103.根據(jù)權(quán)利要求101所述的方法，其中所述結(jié)直腸癌是II期。
104.根據(jù)權(quán)利要求101所述的方法，其中所述結(jié)直腸癌是III期。
105.根據(jù)權(quán)利要求101所述的方法，其中所述結(jié)直腸癌是IV期。
106.根據(jù)權(quán)利要求1-31和59-105任意一項所述的方法，其中所述方法預(yù)防所述患者中新的晚期結(jié)直腸腫瘤的形成。
107.根據(jù)權(quán)利要求1-31和59-105任意一項所述的方法，其中所述方法預(yù)防所述患者中的耳毒性或其風(fēng)險。
108.根據(jù)權(quán)利要求106所述的方法，其中所述方法預(yù)防新的右側(cè)晚期結(jié)直腸腫瘤的形成。
109.根據(jù)權(quán)利要求106所述的方法，其中所述方法預(yù)防新的左側(cè)晚期結(jié)直腸腫瘤的形成。
110.根據(jù)權(quán)利要求1-109任意一項所述的方法，其中所述患者已經(jīng)被鑒定為在結(jié)腸、 直腸或盲腸中具有一個或更多個腺瘤性息肉。
111.根據(jù)權(quán)利要求1-109任意一項所述的方法，其中所述患者已經(jīng)被鑒定為具有一個或更多個晚期結(jié)直腸腫瘤。
112.根據(jù)權(quán)利要求1-109任意一項所述的方法，其中所述患者已經(jīng)被鑒定為具有一個或更多個左側(cè)晚期結(jié)直腸腫瘤。
113.根據(jù)權(quán)利要求1-109任意一項所述的方法，其中所述患者已經(jīng)被鑒定為具有一個或更多個右側(cè)晚期結(jié)直腸腫瘤。
114.根據(jù)權(quán)利要求1-109任意一項所述的方法，其中所述患者已經(jīng)被診斷為具有家族性腺瘤性息肉病。
115.根據(jù)權(quán)利要求1-109任意一項所述的方法，其中所述患者已經(jīng)被診斷為具有林奇綜合征。
116.根據(jù)權(quán)利要求1-109任意一項所述的方法，其中所述患者已經(jīng)被診斷為具有家族性X型結(jié)直腸癌。
117.根據(jù)權(quán)利要求1-109任意一項所述的方法，其中所述患者滿足阿姆斯特丹標準或阿姆斯特丹標準II。
118.根據(jù)權(quán)利要求1-117任意一項所述的方法，其中所述患者具有一個或更多個結(jié)直腸腺瘤切除史。
119.根據(jù)權(quán)利要求1-118任意一項所述的方法，其中所述患者具有與ODC活動過度相關(guān)的上皮內(nèi)瘤變或者癌前病變。
120.根據(jù)權(quán)利要求1-118任意一項所述的方法，其中所述患者具有上皮內(nèi)瘤變或者癌前病變和升高的細胞多胺水平。
121.根據(jù)權(quán)利要求1-120任意一項所述的方法，其中所述患者是人。
全文摘要
本發(fā)明提供方法和試劑盒，用于a)預(yù)測結(jié)直腸癌患者存活，以及具有其它侵入性癌癥的患者的存活，在所述癌癥中細胞增殖和癌發(fā)生與高水平ODC活性和增加的細胞多胺含量部分地關(guān)聯(lián)，和b)用于基于等位基因核苷酸序列或者ODC1啟動子基因+316位置上的SNP選擇對于此類患者的相應(yīng)治療選項，以及每一病例中的癌癥治療方法，這包括確定ODC1啟動子+316位置上的基因型，作為工具指導(dǎo)治療選擇。
文檔編號G01N33/574GK102483415SQ201080031983
公開日2012年5月30日 申請日期2010年5月14日 優(yōu)先權(quán)日2009年5月14日
發(fā)明者C·麥克拉倫, F·麥斯金斯, H·安東卡爾弗, J·澤爾, P·A·湯普森, 尤金·格爾納 申請人:代表亞利桑那大學(xué)的亞利桑那校董會, 加利福尼亞大學(xué)董事會，加利福尼亞法人