一種選擇性提取dna的方法
【專利摘要】本發(fā)明的一種選擇性提取DNA的方法屬于生物技術(shù)的【技術(shù)領(lǐng)域】。步驟有,將表面修飾后的固相介質(zhì)和DNA樣品的溶液混合,加入中性鹽并使混合溶液中鹽濃度為0.4~0.5mol/L,調(diào)節(jié)混合溶液pH至4~5,震蕩20~30分鐘,離心分離;再將吸附上清液的pH值調(diào)至3~4加入表面修飾后的固相介質(zhì),并震蕩20~30分鐘,離心分離;將每次分離出來的吸附了DNA分子的固相介質(zhì)分別分散在pH為8.0~11.0的水溶液中,震蕩20~30分鐘;離心分離,即可分別獲得不同長度的DNA溶液。本發(fā)明的方法可選擇性提取DNA分子,具有選擇提取效率高、原料簡單廉價易得、操作快速便捷等優(yōu)點。
【專利說明】一種選擇性提取DNA的方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明屬于生物技術(shù)的【技術(shù)領(lǐng)域】,特別涉及一種基于鹽屏蔽作用的利用固相介質(zhì)選擇性提取不同片段DNA的方法。
【背景技術(shù)】
[0002]DNA提取是分子生物學(xué)、生物化學(xué)、醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域的一項基礎(chǔ)工作。隨著DNA分子技術(shù)在臨床疾病診斷、進出口檢驗檢疫、法醫(yī)學(xué)檢驗、血液質(zhì)量控制等領(lǐng)域基礎(chǔ)與應(yīng)用研宄的逐漸深入。對DNA分子進行選擇性以及目的性提取特別是對小片段DNA的選擇性提取已經(jīng)成為了 DNA分析技術(shù)應(yīng)用推廣的一個難題。
[0003]1979年,以二氧化硅為基質(zhì)的固相提取DNA方法第一次被提出。目前商業(yè)上應(yīng)用的提取DNA試劑盒主要是磁珠法、玻璃珠法等以二氧化硅為基質(zhì),采用向體系中加入高濃度的鹽,通過鹽橋建立的靜電相互作用實現(xiàn)DNA的吸附和脫附,從而達到提取純化DNA的目的。然而由于該種方法依靠的是間接的靜電相互作用力,它的提取效率只有70%左右,并且它對DNA的吸附?jīng)]有選擇性,另外對小片段DNA分子的吸附效果甚微。近年來,細胞外血漿中游離小片段DNA(CfDNA)越來越多的引起人們的重視,它的成功純化富集對非侵入性產(chǎn)前診測、惡性腫瘤早期診斷、癌癥治療過程檢測等臨床疾病診療過程具有重要意義。此外,受第二代測序技術(shù)對目標DNA片段長度的限制(通常要求在一個合適的范圍內(nèi)如?200bp),因此急需一種高效選擇性提取小片段DNA的方法。目前,選擇性提取不同長度片段DNA通常是采用凝膠電泳回收法,這種方法不僅費時費力,且存在易污染、回收效率低等諸多弊端。因此,尋求一種便捷,高效,安全無污染的選擇性提取不同片段DNA分子尤其是提取小片段DNA分子具有十分重要的意義。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0004]本發(fā)明要解決的技術(shù)問題是,克服現(xiàn)有技術(shù)提取DNA分子的缺點,提供一種可高效選擇性提取不同片段DNA分子的方法。
[0005]具體的技術(shù)方案如下。
[0006]一種選擇性提取DNA的方法,具體步驟為:(I)將用硅烷偶聯(lián)試劑進行表面修飾的固相介質(zhì)和DNA樣品的溶液混合,表面修飾后的固相介質(zhì)的用量是全部DNA樣品質(zhì)量的100?200倍,加入中性鹽并使混合溶液中鹽濃度為0.4?0.5mol/L,調(diào)節(jié)混合溶液pH至4?5,將混合溶液震蕩20?30分鐘以完成長片段DNA分子與固相介質(zhì)之間的靜電吸附,所述的長片段DNA是指片段長度大于或等于400bp的DNA ;采用離心分離的方式,分離吸附了長片段DNA的固相介質(zhì)和含短片段DNA的吸附上清液;然后,將含短片段DNA的吸附上清液的PH值調(diào)至3?4再加入固相介質(zhì)并震蕩20?30分鐘,以完成短片段DNA分子與固相介質(zhì)之間的靜電吸附,所述的短片段DNA是指片段長度小于或等于200bp的DNA ;固相介質(zhì)的用量大于或等于剩余DNA樣品質(zhì)量的300倍,采用離心分離方式,分離出吸附了短片段DNA的固相介質(zhì);
[0007](2)將兩次分離出來的吸附了 DNA的固相介質(zhì)分別分散在pH為8.0?11.0的水溶液中,震蕩20?30分鐘以完成DNA分子與固相介質(zhì)之間的靜電脫附;采用離心分離的方式,分離出固相介質(zhì),分別獲得長片段DNA溶液和短片段DNA溶液。
[0008]當長片段DNA樣品包含兩種不同長度的長片段DNA時,還能夠?qū)煞N不同長度的長片段DNA分離開,具體過程是:將步驟(2)得到的長片段DNA溶液的pH值調(diào)節(jié)至4.0?5.0,長片段DNA溶液中鹽濃度調(diào)節(jié)至0.6?0.8mol/L,加入表面修飾后的固相介質(zhì),震蕩20?30分鐘以完成最長片段DNA分子與固相介質(zhì)之間的靜電吸附,表面修飾后的固相介質(zhì)的用量為長片段DNA樣品總質(zhì)量的100?200倍,所述的最長片段DNA是指片段長度大于或等于100bp的DNA ;離心分離吸附了最長片段DNA的固相介質(zhì)和含次長片段DNA的吸附上清液;然后調(diào)節(jié)含次長片段DNA的吸附上清液pH值至3?4,加入表面修飾后的固相介質(zhì),震蕩20?30分鐘以完成次長片段DNA分子與固相介質(zhì)之間的靜電吸附,表面修飾后的固相介質(zhì)的用量為大于或等于次長片段DNA樣品質(zhì)量的300倍,所述的次長片段DNA是指片段長度大于或等于400bp且比最長片段DNA的片段長度短250bp或250bp以上的DNA ;尚心分尚出吸附了次長片段DNA的固相介質(zhì);將分尚出來的吸附了最長片段DNA的固相介質(zhì)和吸附了次長片段DNA的固相介質(zhì)分別分散在pH為8.0?11.0的水溶液中,震蕩20?30分鐘以完成DNA分子與固相介質(zhì)之間的靜電脫附;采用離心分離的方式,分離出固相介質(zhì),分別獲得最長片段DNA溶液和次長片段DNA溶液。
[0009]本發(fā)明步驟(I)中所述的中性鹽,優(yōu)選NaCl或KC1。
[0010]本發(fā)明步驟(I)中所述的固相介質(zhì)優(yōu)選尺寸在微米區(qū)間的硅藻土、尺寸在毫米區(qū)間的玻璃珠、尺寸范圍在50 μπι?10nm的無定形的氧化娃微粒、尺寸范圍在50 μπι?10nm的介孔氧化娃微粒、尺寸范圍在50 μπι?10nm的無定形氧化娃包覆磁性內(nèi)核微?;虺叽绶秶?0 μπι?10nm的介孔氧化娃包覆磁性內(nèi)核微粒,所述的磁性內(nèi)核為Fe,Co,Ni,F(xiàn)e3O4, Fe2O3或其混合物。
[0011]本發(fā)明步驟(I)中所述的用硅烷偶聯(lián)試劑進行表面修飾的固相介質(zhì),可用現(xiàn)有方法得到,也可按下述方法得到:
[0012]將氨基酸溶于水中,調(diào)節(jié)溶液pH值至11,將溶液置于冰水浴中,緩慢加入與氨基酸等摩爾量的3-環(huán)氧基丙基三甲氧基硅烷,將反應(yīng)溶液升溫至65°C,攪拌反應(yīng)4小時,再加入與氨基酸等摩爾量的3-環(huán)氧基丙基三甲氧基硅烷繼續(xù)攪拌反應(yīng)4小時,獲得末端帶有氨基酸衍生基團的硅烷偶聯(lián)劑;
[0013]取固相介質(zhì)并分散在水中,加入末端帶有氨基酸衍生基團的硅烷偶聯(lián)劑,硅烷偶聯(lián)劑的用量為每克固相介質(zhì)使用130ml,調(diào)整溶液pH值至3.0,在60°C反應(yīng)3小時,將固相介質(zhì)用離心或磁吸分離出再用水和乙醇分別洗滌兩次,即得到表面修飾后的固相介質(zhì)。
[0014]本發(fā)明的方法有以下有益效果:
[0015]1、對DNA同時具有高的吸附效率和脫附效率,總提取效率高。
[0016]2、可以選擇性分離不同片段長度尤其是兩種或兩種以上片段長度相差300bp以上的小片段DNA,從而對DNA進行選擇性提取。
[0017]3、選擇性提取效率高,尤其對短片段DNA的選擇性提取效率在90%以上。
[0018]4、原料簡單廉價易得,操作快速便捷。
【專利附圖】
【附圖說明】
[0019]圖1是實施例3、4、6的相關(guān)瓊脂糖凝膠電泳圖。
[0020]圖2是實施例9的相關(guān)瓊脂糖凝膠電泳圖。
【具體實施方式】
[0021]借助以下實施例對本發(fā)明做進一步描述,應(yīng)理解,以下實施例是示范性的,而不是限制性的,可根據(jù)上述發(fā)明的技術(shù)方案和實際情況,來確定具體的實施方法。
[0022]本發(fā)明中所述的DNA吸附率,是固相介質(zhì)吸附的DNA質(zhì)量與原溶液中該DNA總質(zhì)量的比值。不同長度片段DNA選擇性吸附效率是通過瓊脂糖凝膠電泳圖像軟件定量得到。選擇性提取效率是指經(jīng)過吸附和脫附后最終提取出的全部DNA中,指定片段長度的DNA所占的質(zhì)量百分比。
[0023]實施例1
[0024]將0.5mg表面賴氨酸修飾的硅藻土微粒分散在100 μ I含有2000bp質(zhì)粒DNA和10bp線性雙鏈DNA分子(濃度均為25ng/ μ I)的水溶液中,用NaCl調(diào)節(jié)體系中Na+濃度為0.4mol/Lo調(diào)節(jié)溶液pH值為5.0,混勻后搖床震蕩20分鐘。用6000rpm離心分出吸附了 DNA的硅藻土粒子。另取0.75mg表面賴氨酸修飾的硅藻土微粒分散在上述吸附上清中,溶液PH值調(diào)節(jié)為4.0?;靹蚝髶u床震蕩20分鐘,用6000rpm離心分出第二次吸附了 DNA的娃藻土微粒。
[0025]將兩次離心分離出的吸附了 DNA的硅藻土微粒分別分散在pH = 8.0的水溶液中,混勻后搖床震蕩20分鐘。用6000rpm離心分離出硅藻土微粒。測量兩次脫附上清中DNA量,可得選擇性提取效率達到97%。
[0026]實施例2
[0027]將1.0mg表面賴氨酸修飾的硅藻土微粒分散在100 μ I含有2000bp質(zhì)粒DNA和10bp線性雙鏈DNA分子(濃度均為25ng/ μ I)的水溶液中,用KCl調(diào)節(jié)體系中K+濃度為0.5mol/Lo調(diào)節(jié)溶液pH值為4.0,混勻后搖床震蕩30分鐘。用6000rpm離心分出吸附了DNA的娃藻土粒子。另取1.0mg表面賴氨酸修飾的娃藻土微粒分散在上述吸附上清中,溶液pH值調(diào)節(jié)為3.0o混勻后搖床震蕩20分鐘,用6000rpm離心分出第二次吸附了 DNA的硅藻土微粒。
[0028]將兩次離心分離出的吸附了 DNA的硅藻土微粒分別分散在pH = 11.0的水溶液中,混勻后搖床震蕩30分鐘。用6000rpm離心分離出硅藻土微粒。測量兩次脫附上清中DNA量,可得選擇性提取效率達到95%。
[0029]實施例3
[0030]將0.5mg表面賴氨酸修飾的硅藻土微粒分散在100 μ I含有100bp和10bp線性雙鏈DNA分子(濃度各為25ng/ μ I)的水溶液中,調(diào)節(jié)體系中鹽濃度為0.4mol/L,調(diào)節(jié)溶液pH值為5.0,混勻后搖床震蕩20分鐘。用6000rpm離心分出吸附了 DNA的硅藻土微粒。另取1.0mg表面賴氨酸修飾的娃藻土微粒分散在上述吸附上清中,溶液pH值調(diào)節(jié)為4.0o混勻后搖床震蕩20分鐘,用6000rpm離心分出第二次吸附了 DNA的硅藻土微粒。
[0031]將兩次離心分離出的吸附了 DNA的硅藻土微粒分散在pH = 10.0的水溶液中,混勻后搖床震蕩20分鐘。用6000rpm離心分離出硅藻土微粒。測量兩次脫附上清中DNA量,并進行瓊脂糖凝膠電泳定性及定量觀察選擇性分離100bp和10bp DNA情況,如圖1中的2a、2d所示。從瓊脂糖凝膠電泳圖中可以看到硅藻土兩次吸附的DNA分子分別為100bp和lOObp,采用定量軟件計算得到選擇性提取效率為95%,圖中的S1、Ia和Id是對照組,SI為空白對照、Ia和Id是OM鹽濃度下吸附上清和脫附上清的對照。從對照組可以看出,在不使用鹽的情況下是不能將100bp和10bp兩種片段長度的DNA進行分離的。
[0032]實施例4
[0033]將0.5mg表面賴氨酸修飾的娃藻土微粒分散在100 μ I含有750bp和10bp線性雙鏈DNA分子(濃度各為25ng/ μ I)的水溶液中,調(diào)節(jié)體系中鹽濃度為0.4mol/L,調(diào)節(jié)溶液pH值為5.0,混勻后搖床震蕩20分鐘。用6000rpm離心分出吸附了 DNA的硅藻土微粒。另取1.0mg表面賴氨酸修飾的娃藻土粒子分散在上述吸附上清中,溶液pH值調(diào)節(jié)為4.0o混勻后搖床震蕩20分鐘,用6000rpm離心分出第二次吸附了 DNA的硅藻土微粒。
[0034]將兩次離心分離出的吸附了 DNA的硅藻土微粒分別分散在pH = 10.0的水溶液中,混勻后搖床震蕩20分鐘。用6000rpm離心分離出硅藻土微粒。測量兩次脫附上清中DNA量,并進行瓊脂糖凝膠電泳定性及定量觀察選擇性分離750bp和10bp DNA情況,如圖1中的4a、4d所示。從瓊脂糖凝膠電泳圖中可以看到硅藻土兩次吸附的DNA分子分別為750bp和lOObp,采用定量軟件計算得到選擇性提取效率為93 %。圖中的S3、3a和3d是對照組,S3為空白對照、3a和3d是OM鹽濃度下吸附上清和脫附上清的對照。從對照組可以看出,在不使用鹽的情況下是不能將750bp和10bp兩種片段長度的DNA進行分離的。
[0035]實施例5
[0036]將0.5mg表面賴氨酸修飾的娃藻土微粒分散在100 μ I含有500bp和10bp線性雙鏈DNA分子(濃度各為25ng/ μ I)的水溶液中,調(diào)節(jié)體系中鹽濃度為0.4mol/L,調(diào)節(jié)溶液pH值為5.0,混勻后搖床震蕩20分鐘。用6000rpm離心分出吸附了 DNA的硅藻土微粒。另取1.0mg表面賴氨酸修飾的娃藻土粒子分散在上述吸附上清中,溶液pH值調(diào)節(jié)為4.0o混勻后搖床震蕩20分鐘,用6000rpm離心分出第二次吸附了 DNA的硅藻土粒子。
[0037]將兩次離心分離出的吸附了 DNA的硅藻土微粒分別分散在pH = 10.0的水溶液中,混勻后搖床震蕩20分鐘。用6000rpm離心分離出硅藻土微粒。測量兩次脫附上清中DNA量,可得提取效率為94%。
[0038]實施例6
[0039]將0.5mg表面賴氨酸修飾的娃藻土微粒分散在100 μ I含有400bp和10bp線性雙鏈DNA分子(濃度各為25ng/ μ I)的水溶液中,調(diào)節(jié)體系中鹽濃度為0.4mol/L,調(diào)節(jié)溶液pH值為5.0,混勻后搖床震蕩20分鐘。用6000rpm離心分出吸附了 DNA的硅藻土微粒。另取1.0mg表面賴氨酸修飾的娃藻土粒子分散在上述吸附上清中,溶液pH值調(diào)節(jié)為4.0o混勻后搖床震蕩20分鐘,用6000rpm離心分出第二次吸附了 DNA的硅藻土粒子。
[0040]將兩次離心分離出的吸附了 DNA的硅藻土微粒分別分散在pH = 10.0的水溶液中,混勻后搖床震蕩20分鐘。用6000rpm離心分離出硅藻土微粒。測量兩次脫附上清中DNA量,并進行瓊脂糖凝膠電泳定性及定量觀察選擇性分離400bp和10bp DNA情況,如圖1中的6a和6d所示。從瓊脂糖凝膠電泳圖中可以看到硅藻土兩次吸附的DNA分子分別為400bp和100bp,采用定量軟件計算得到選擇性提取效率為92%。圖中的S5、5a和5d是對照組,S5為空白對照、5a和5d是OM鹽濃度下吸附上清和脫附上清的對照。從對照組可以看出,在不使用鹽的情況下是不能將400bp和10bp兩種片段長度的DNA進行分離的。
[0041]實施例7
[0042]將0.5mg表面賴氨酸修飾的硅藻土微粒分散在100 μ I含有100bp和200bp線性雙鏈DNA分子(濃度各為25ng/ μ I)的水溶液中,調(diào)節(jié)體系中鹽濃度為0.4mol/L,調(diào)節(jié)溶液pH值為5.0,混勻后搖床震蕩20分鐘。用6000rpm離心分出吸附了 DNA的硅藻土微粒。另取1.0mg表面賴氨酸修飾的娃藻土粒子分散在上述吸附上清中,溶液pH值調(diào)節(jié)為4.0o混勻后搖床震蕩20分鐘,用6000rpm離心分出第二次吸附了 DNA的硅藻土粒子。
[0043]將兩次離心分離出的吸附了 DNA的硅藻土微粒分別分散在pH = 10.0的水溶液中,混勻后搖床震蕩20分鐘。用6000rpm離心分離出硅藻土微粒。測量兩次脫附上清中DNA量,可得選擇性提取效率為90%。
[0044]實施例8
[0045]將0.8mg表面賴氨酸修飾的硅藻土微粒分散在100 μ I含有100bp、750bp和10bp三種片段長度DNA分子(濃度各為25ι^/μ1)的水溶液中,調(diào)節(jié)體系中鹽濃度為0.4mol/L,調(diào)節(jié)溶液pH值為5.0,混勻后搖床震蕩20分鐘。用6000rpm離心分離出第一次吸附了 DNA的硅藻土微粒。再取1.0mg表面賴氨酸修飾的硅藻土微粒分散在吸附后上清中,溶液PH值調(diào)節(jié)為4.0?;靹蚝髶u床震蕩20分鐘,用6000rpm離心分出第二次吸附了 DNA的娃藻土微粒。
[0046]將第一次吸附了 DNA的硅藻土微粒分散在pH = 10.0的水溶液中,混勻后搖床震蕩20分鐘進行靜電脫附。用6000rpm離心分離出娃藻土微粒。取0.5mg表面賴氨酸修飾的娃藻土微粒分散在上述脫附上清中,溶液pH值調(diào)節(jié)為5.0,加入鹽濃度至0.8mol/Lo混勻后搖床震蕩20分鐘,用6000rpm離心分出第三次吸附了 DNA的硅藻土微粒,再取1.0mg表面賴氨酸修飾的硅藻土微粒分散在上述第三次吸附上清中,溶液pH值調(diào)節(jié)為4.0,混勻后搖床震蕩20分鐘,用6000rpm離心分出第四次吸附了 DNA的硅藻土微粒。
[0047]將第三次、第四次、第二次離心分離出的吸附了 DNA的硅藻土微粒分別分散在pH=10.0的水溶液中,混勻后搖床震蕩20分鐘。用6000rpm離心分離出硅藻土微粒。測量各脫附上清中DNA量,并進行瓊脂糖凝膠電泳定性及定量觀察選擇性分離1000bp、750bp、10bp DNA情況及效率,如圖2中的2a、3a、3d所示。從瓊脂糖凝膠電泳圖中可以看到三次脫附得到的DNA分子依次為1000bp、750bp和lOObp,采用定量軟件計算得到10bp DNA選擇性提取效率為95 %,750bp DNA的選擇性提取效率為88 %,100bp DNA的選擇性提取效率為80%。圖中的S、la、ld分別為空白對照,OM鹽吸附上清和OM鹽脫附上清對照實驗。
[0048]實施例9
[0049]將實施例6中的固相介質(zhì)由表面賴氨酸修飾的硅藻土微粒改為表面賴氨酸修飾的300nm無定型二氧化娃納米粒子,其余條件不變,也能將400bp和10bp的DNA分離,選擇性提取效率為93%。
[0050]實施例10
[0051]將實施例6中的固相介質(zhì)由表面賴氨酸修飾的硅藻土微粒改為表面賴氨酸修飾的300nm介孔二氧化娃包覆Fe3O4納米粒子,其余條件不變,也能將400bp和10bp的DNA分離,選擇性提取效率為90 %。
[0052]實施例11
[0053]將實施例6中的固相介質(zhì)由表面賴氨酸修飾的娃藻土微粒改為表面精氨酸修飾的硅藻土微粒,其余條件不變,也能將400bp和10bp的DNA分離,選擇性提取效率為90%。
[0054]實施例12
[0055]將實施例5中的固相介質(zhì)由表面賴氨酸修飾的娃藻土微粒改為表面組氨酸修飾的硅藻土微粒,其余條件不變,也能將500bp和10bp的DNA分離,選擇性提取效率為94%。
【權(quán)利要求】
1.一種選擇性提取DNA的方法,具體步驟為:(I)將用硅烷偶聯(lián)試劑進行表面修飾的固相介質(zhì)和DNA樣品的溶液混合,表面修飾的固相介質(zhì)的用量是全部DNA樣品質(zhì)量的100?200倍,加入中性鹽并使混合溶液中鹽濃度為0.4?0.5mol/L,調(diào)節(jié)混合溶液pH至4?5,將混合溶液震蕩20?30分鐘以完成長片段DNA分子與固相介質(zhì)之間的靜電吸附,所述的長片段DNA是指片段長度大于或等于400bp的DNA ;采用離心分離的方式,分離吸附了長片段DNA的固相介質(zhì)和含短片段DNA的吸附上清液;然后,將含短片段DNA的吸附上清液的pH值調(diào)至3?4,再加入表面修飾后的固相介質(zhì)并震蕩20?30分鐘,以完成短片段DNA分子與固相介質(zhì)之間的靜電吸附,所述的短片段DNA是指片段長度小于或等于200bp的DNA ;固相介質(zhì)的用量大于或等于剩余DNA樣品質(zhì)量的300倍,采用離心分離方式,分離出吸附了短片段DNA的固相介質(zhì); (2)將兩次分離出來的吸附了 DNA的固相介質(zhì)分別分散在pH為8.0?11.0的水溶液中,震蕩20?30分鐘以完成DNA分子與固相介質(zhì)之間的靜電脫附;采用離心分離的方式,分離出固相介質(zhì),分別獲得長片段DNA溶液和短片段DNA溶液。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種選擇性提取DNA的方法,其特征在于,當長片段DNA樣品包含兩種不同長度的長片段DNA時,還能夠?qū)煞N不同長度的長片段DNA分離開,具體過程是:將步驟(2)得到的長片段DNA溶液的pH值調(diào)節(jié)至4.0?5.0,長片段DNA溶液中鹽濃度調(diào)節(jié)至0.6?0.8mol/L,加入表面修飾后的固相介質(zhì),震蕩20?30分鐘以完成最長片段DNA分子與固相介質(zhì)之間的靜電吸附,表面修飾后的固相介質(zhì)的用量為長片段DNA樣品總質(zhì)量的100?200倍,所述的最長片段DNA是指片段長度大于或等于100bp的DNA ;離心分離吸附了最長片段DNA的固相介質(zhì)和含次長片段DNA的吸附上清液;然后調(diào)節(jié)含次長片段DNA的吸附上清液pH值至3?4,加入表面修飾后的固相介質(zhì),震蕩20?30分鐘以完成次長片段DNA分子與固相介質(zhì)之間的靜電吸附,表面修飾后的固相介質(zhì)的用量為大于或等于次長片段DNA樣品質(zhì)量的300倍,所述的次長片段DNA是指片段長度大于或等于400bp且比最長片段DNA的片段長度短250bp或250bp以上的DNA ;離心分離出吸附了次長片段DNA的固相介質(zhì);將分離出來的吸附了最長片段DNA的固相介質(zhì)和吸附了次長片段DNA的固相介質(zhì)分別分散在pH為8.0?11.0的水溶液中,震蕩20?30分鐘以完成DNA分子與固相介質(zhì)之間的靜電脫附;采用離心分離的方式,分離出固相介質(zhì),分別獲得最長片段DNA溶液和次長片段DNA溶液。
3.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的一種選擇性提取DNA的方法,其特征在于,步驟(I)中所述的中性鹽,是NaCl或KCl。
4.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的一種選擇性提取DNA的方法,其特征在于,步驟(I)中所述的固相介質(zhì)是尺寸在微米區(qū)間的硅藻土、尺寸在毫米區(qū)間的玻璃珠、尺寸范圍在50 μπι?10nm的無定形的氧化娃微粒、尺寸范圍在50 μπι?10nm的介孔氧化娃微粒、尺寸范圍在50 μπι?10nm的無定形氧化娃包覆磁性內(nèi)核微?;虺叽绶秶?0 μπι?10nm的介孔氧化娃包覆磁性內(nèi)核微粒,所述的磁性內(nèi)核為Fe,Co,Ni,F(xiàn)e3O4, Fe2O3或其混合物。
5.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的一種選擇性提取DNA的方法,其特征在于,步驟(I)中所述的用硅烷偶聯(lián)試劑進行表面修飾的固相介質(zhì),是按下述方法得到的:將氨基酸溶于水中,調(diào)節(jié)溶液PH值至11,將溶液置于冰水浴中,加入與氨基酸等摩爾量的3-環(huán)氧基丙基三甲氧基硅烷,將反應(yīng)溶液升溫至65°C,攪拌反應(yīng)4小時,再加入與氨基酸等摩爾量的3-環(huán)氧基丙基三甲氧基硅烷繼續(xù)攪拌反應(yīng)4小時,獲得末端帶有氨基酸衍生基團的硅烷偶聯(lián)劑; 取固相介質(zhì)并分散在水中,加入末端帶有氨基酸衍生基團的硅烷偶聯(lián)劑,硅烷偶聯(lián)劑的用量為每克固相介質(zhì)使用130ml,調(diào)整溶液pH值至3.0,在60°C反應(yīng)3小時,將固相介質(zhì)用離心或磁吸分離出再用水和乙醇分別洗滌兩次,即得到表面修飾后的固相介質(zhì)。
【文檔編號】C12N15/10GK104513819SQ201410789081
【公開日】2015年4月15日 申請日期:2014年12月17日 優(yōu)先權(quán)日:2014年12月17日
【發(fā)明者】劉玲玲, 莊家騏, 楊文勝 申請人:吉林大學(xué)