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一種基于光二極管誘導(dǎo)化學(xué)發(fā)光測(cè)定Ago2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性的方法

文檔序號(hào):9320797閱讀:685來(lái)源:國(guó)知局
一種基于光二極管誘導(dǎo)化學(xué)發(fā)光測(cè)定Ago2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性的方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明屬于化學(xué)發(fā)光技術(shù)領(lǐng)域,涉及一種基于光二極管誘導(dǎo)化學(xué)發(fā)光測(cè)定Ag〇2 蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性的方法。
【背景技術(shù)】
[0002] 在哺乳動(dòng)物中Ago蛋白家族包含8個(gè)成員,其中的4個(gè)(Agol~Ag〇4)在很多細(xì) 胞中是緊密相關(guān)的。然而,只有Ag〇2蛋白被賦予了核酸內(nèi)切酶的活性,這就使得它在引導(dǎo) 目標(biāo)mRNA切割反應(yīng)中扮演著一個(gè)特殊的角色。到目前為止,已經(jīng)研制出來(lái)幾種方法用于 分析檢測(cè)Ag〇2蛋白的核酸內(nèi)切酶活性,例如熒光法(F. Li,M. Chen,X. Sun,X. Wang,P. Li,A novel graphene oxide-based fluorescence assay for RNA endonuclease activity of mammalian Argonaute2 protein.Sensors and Actuators B 182(2013) 156-160 ;F. Li, P. Li,L. M. Yang, B. Tang, Simple and sensitive fluorescence detection of the RNA endonuclease activity of mammalian argonaute2protein based on an RNA molecular beacon,Chemical Communications 48(2012) 12192-12194);電化學(xué)法(N. Yang,Y Cao,P. Han, X Zhu, L Sun,G Li,Tools for investigation of the RNA endonuclease activity of mammalian Argonaute2 protein, Analytical Chemistry (2012) 84 (5) : 2492-2497)等。 這些方法各有其缺點(diǎn)。
[0003] 本發(fā)明建立了一種基于光二極管誘導(dǎo)化學(xué)發(fā)光檢測(cè)Ag〇2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶 活性的新方法。光二極管誘導(dǎo)化學(xué)發(fā)光具有高靈敏度和操作簡(jiǎn)便等優(yōu)點(diǎn),結(jié)合Ag〇2蛋白切 割核酸循環(huán)利用的特點(diǎn),建立了一種新穎、簡(jiǎn)單、靈敏的方法來(lái)檢測(cè)Ag〇2蛋白的RNA核酸內(nèi) 切酶活性。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0004] 本發(fā)明目的是提供一種Ag〇2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性的測(cè)定方法,利用光二極 管誘導(dǎo)化學(xué)發(fā)光方法,以標(biāo)記異硫氰酸熒光素的核酸P-FITC為探針,實(shí)現(xiàn)了 Ag〇2蛋白的 RNA核酸內(nèi)切酶活性的測(cè)定。
[0005] 技術(shù)方案
[0006] -種基于光二極管誘導(dǎo)化學(xué)發(fā)光測(cè)定Ag〇2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性的方法,其 特征是利用光二極管誘導(dǎo)化學(xué)發(fā)光方法,以標(biāo)記異硫氰酸熒光素的核酸P-FITC為探針,建 立了一種Ago2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性測(cè)定的方法,其特征為:
[0007] (a)首先,制備M〇S2單層膜,將MoS 2粉體分散到得到DMF中,得到MoS 2的DMF溶 液,將該溶液在室溫下超聲,然后離心,得到黑色沉淀,最后,收集沉淀物,經(jīng)過(guò)水洗滌,然后 再分散于水中,形成溶液;
[0008] (b) P-FITC修飾MoS2的制備,將(a)步驟中制得的MoS 2與P-FITC混合均勻,然后 加入一定量的Tris-HCl緩沖液,反應(yīng)一段時(shí)間,然后離心,收集沉淀物,經(jīng)過(guò)水洗滌,然后 再分散于水中,得P-FITC修飾此&的溶液;
[0009] (c) Ago2-RNA復(fù)合物制備,將Ago2樣品溶液與RNA的Tris-HCl-RNasin緩沖液混 合,孵化,使得RNA與Ag 〇2蛋白充分結(jié)合,得Ag〇2-RNA復(fù)合物;
[0010] (d)隨后,再將(C)步驟所得的Ago2-RNA復(fù)合物加入到(b)步驟的P-FITC修飾 MoSj^溶液中,反應(yīng);
[0011] (e)將(d)步驟所得的溶液經(jīng)過(guò)離心之后,取部分上層清夜置于小燒杯中,再加入 魯米諾溶液,打開(kāi)光二極管電源,照射后關(guān)閉電源,然后測(cè)定化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度,根據(jù)化學(xué)發(fā)光 強(qiáng)度實(shí)現(xiàn)Ag 〇2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性測(cè)定。
[0012] 測(cè)定具體步驟如下:
[0013] (l)M〇S2單層膜制備。將MoS 2粉體分散到得到DMF中,得到MoS 2的DMF溶液。將 該溶液在室溫下超聲4~24小時(shí)。然后在3000~16000轉(zhuǎn)/分鐘的條件下,離心10min 得到黑色沉淀。最后,收集沉淀物,經(jīng)過(guò)水洗滌后,再分散于水中,形成0. 5mg/mL的溶液。
[0014] (2) P-FITC 修飾 MoS2的制備。將 300 y L 濃度為 200 y g/mL MoS 2的溶液與 6. 0 y L 4. 0 yM P-FITC的溶液混合均勻,然后加入一定量的Tris-HCl緩沖液,使得P-FITC的最終 濃度為80nM,在37°C下反應(yīng)30min,得P-FITC修飾MoS2。
[0015] (3)Ago2-RNA復(fù)合物制備。將300 y L的Ago2樣品溶液與300 y L RNA的 Tris-HCl-RNasin緩沖液混合,在37 °C下孵化30min,使得RNA與Ago2蛋白充分結(jié)合,得 Ago2-RNA復(fù)合物。
[0016] (4)隨后,再將上述所得的Ag〇2-RNA復(fù)合物加入到P-FITC修飾M 〇S2的溶液中, 37°C條件下反應(yīng)30min。
[0017] (5)經(jīng)過(guò)離心之后,取部分上層清夜于2mL玻璃燒杯中,并加入20 yL pH 11. 30的 4mM的魯米諾溶液。打開(kāi)光二極管電源,照射一段時(shí)間后關(guān)閉電源,然后測(cè)定化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度, 根據(jù)化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度實(shí)現(xiàn)Ag 〇2的RNA核酸內(nèi)切酶活性的測(cè)定。
[0018] 本發(fā)明的化學(xué)試劑優(yōu)選分析純?cè)噭?,所有溶液均用二次蒸餾水配置。
[0019] 本發(fā)明的 Tris-HCl 緩沖液由 pH 7. 4 的 20mM Tris-HCl,50mM KC1,1. 5mM MgCl2, 1%。DEPC 組成。
[0020] 本發(fā)明的 Tris-HCl-RNasin 緩沖液由 pH 7. 4 的 20mM Tris-HCl,1 y nit/ y L RNasin,50mM KC1,1. 5mM MgCl2,1%。DEPC 組成。
[0021] 本發(fā)明的化學(xué)發(fā)光測(cè)定選用MPI-E型化學(xué)發(fā)光分析系統(tǒng)(西安瑞邁分析儀器有限 責(zé)任公司)。
[0022] 本發(fā)明的振蕩孵育選用THZ-82A氣浴恒溫振蕩器(全壇市醫(yī)療儀器廠)。
[0023] 本發(fā)明的離心機(jī)選用Anke-TGL_16C飛翁牌高速離心機(jī)(上海市安亭科學(xué)儀器 廠)。
[0024] 本發(fā)明的pH測(cè)量選用PHS-3D型酸度計(jì)(上海雷磁儀器廠)。
[0025] 本發(fā)明的顯著效果
[0026] 本發(fā)明研究了不同濃度Ago2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性與發(fā)光強(qiáng)度之間的關(guān)系, 得到了檢測(cè)Ag 〇2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性的標(biāo)準(zhǔn)曲線,線性范圍及線性方程。
[0027] 當(dāng)Ag〇2的濃度在0. 5nM-90nM之間時(shí),隨著Ag〇2濃度的變化,化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度 有明顯變化。經(jīng)計(jì)算得到檢測(cè)Ag〇2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性線性回歸方程是I a = 5. 4207x+4. 6628 (Ia是體系的化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度;x是Ag〇2的濃度,nM ;n = 12, n表示同一濃 度測(cè)定次數(shù)),線性相關(guān)系數(shù)R = 0. 9991,檢測(cè)限是0. 3nM。
[0028] 該測(cè)定方法的精密度通過(guò)對(duì)濃度為3. OnM的Ago2進(jìn)行11次平行測(cè)定而計(jì)算得 出,相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差為3. 8%,表明本發(fā)明的測(cè)定方法有較好的重現(xiàn)性。
【附圖說(shuō)明】
[0029] 圖1.測(cè)定Ago2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性方法原理圖。
[0030] 圖2. Ago2標(biāo)準(zhǔn)曲線,橫坐標(biāo)是Ago2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性,單位是nM,縱坐 標(biāo)la是體系的化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度。
[0031] 圖3?方法檢測(cè)Ago2,Thrombin,BSA,Hemoglobin和IgG的化學(xué)發(fā)光信號(hào)比較。其 中 Thrombin,BSA,Hemoglobin 和 IgG 濃度為 5 yM,Ago2 濃度為 50nM。
【具體實(shí)施方式】
[0032] 按照技術(shù)方案的步驟(1)至(5)得到Ag〇2標(biāo)準(zhǔn)曲線見(jiàn)圖2,其中Ag 〇2蛋白是從北 京義翹神州有限公司(北京)購(gòu)買。核酸酶抑制劑RNasin從Promega(美國(guó))購(gòu)買。焦炭 酸二乙酯DEPC從Amrcsco(美國(guó))購(gòu)買。人血色素,牛血清蛋白,實(shí)驗(yàn)所用其他試劑均為分 析純,并且不用對(duì)其進(jìn)一步純化可以直接使用。
[0033] 所用人工合成RNA序列(購(gòu)自北京賽百盛生物工程有限公司)如下。
[0034] RNA :5' -UUG UCU CUG ⑶C CUU AC-3,。
[0035] P-FITC ^'-CCC ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG TAG TAG TAG TAA AAA CAGAGA CCA GGA AUG-FITC-5'
[0036] 同時(shí),考察了該檢測(cè)方法的選擇性。圖3為本發(fā)明的檢測(cè)方法檢測(cè)凝血酶 (Thrombin),牛血清白蛋白(BSA),血紅蛋白(Hemoglobin),免疫球蛋白G (IgG)和Ago2的 化學(xué)發(fā)光信號(hào),從圖3可以看出,檢測(cè)Thrombin,BSA,Hemoglobin和IgG的化學(xué)發(fā)光信號(hào)遠(yuǎn) 遠(yuǎn)低于檢測(cè)Ag 〇2的化學(xué)發(fā)光信號(hào),說(shuō)明該方法檢測(cè)Ag〇2具有很高的選擇性。
【主權(quán)項(xiàng)】
1. 一種基于光二極管誘導(dǎo)化學(xué)發(fā)光測(cè)定Ag〇2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性的方法,具體 特征包括以下步驟: (a) 首先,制備MoS2單層膜,將MoS 2粉體分散到得到DMF中,得到MoS 2的DMF溶液,將 該溶液在室溫下超聲,然后離心,得到黑色沉淀,最后,收集沉淀物,經(jīng)過(guò)水洗滌,然后再分 散于水中,形成溶液; (b) P-FITC修飾MoS2的制備,將(a)步驟中制得的MoS^ P-FITC混合均勾,然后加入 一定量的Tris-HCl緩沖液,反應(yīng)一段時(shí)間,然后離心,收集沉淀物,經(jīng)過(guò)水洗滌,然后再分 散于水中,得P-FITC修飾此&的溶液; (c) Ag〇2-RNA復(fù)合物制備,將Ag〇2樣品溶液與含有RNA的Tris-HCl-RNasin緩沖液混 合,孵化,使得RNA與Ag 〇2蛋白充分結(jié)合,得Ag〇2-RNA復(fù)合物; (d) 隨后,再將(c)步驟所得的Ago2-RNA復(fù)合物加入到(b)步驟的P-FITC修飾MoS2 的溶液中,反應(yīng); (e) 將(d)步驟所得的溶液經(jīng)過(guò)離心之后,取部分上層清夜置于小燒杯中,再加入魯米 諾溶液,打開(kāi)光二極管電源,照射后關(guān)閉電源,然后測(cè)定化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度,根據(jù)化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度 實(shí)現(xiàn)Ag 〇2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性測(cè)定。2. 根據(jù)權(quán)利要求1的測(cè)定Ag〇2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性的方法,其特征在于所述化 學(xué)試劑為分析純?cè)噭腥芤壕枚握麴s水配置。3. 根據(jù)權(quán)利要求1的測(cè)定Ag〇2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性的方法,其特征在于所述 Tris-HCl 緩沖液由 pH 7. 4 的 20mM Tris-HCl,50mM KC1,I. 5mM MgCl2,1%。DEPC 組成。4. 根據(jù)權(quán)利要求1的測(cè)定Ag〇2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性的方法,其特征在于所述 Tris-HCl-RNasin緩沖液由 pH 7.4 的 20mM Tris-HCl,lynit/y L RNasin,50mM KCl,1.5mM MgCl2,1 %。DEPC 組成。5. 根據(jù)權(quán)利要求1的測(cè)定Ag〇2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性的方法,其特征在于所述化 學(xué)發(fā)光測(cè)定選用MPI-E型化學(xué)發(fā)光分析系統(tǒng)。6. 根據(jù)權(quán)利要求1的測(cè)定Ag〇2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性的方法,其特征在于所述振 蕩孵育選用THZ-82A氣浴恒溫振蕩器。7. 根據(jù)權(quán)利要求1的測(cè)定Ag〇2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性的方法,其特征在于所述離 心機(jī)選用Anke-TGL-16C飛翁牌高速離心機(jī)。8. 根據(jù)權(quán)利要求1的測(cè)定Ag〇2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性的方法,其特征在于所述 pH測(cè)量選用PHS-3D型酸度計(jì)。9. 根據(jù)權(quán)利要求1的測(cè)定Ag〇2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性的方法,其特征在于所述的 RNA和P-FITC的核苷酸部分序列如下: RNA :5,-UUG UCU CUG ⑶C CUU AC-3' ; P-FITC :5'-GUA AGG ACC AGA GAC AAA AAT GAT GAT GAT GTA GTA GTA GTA GTA GTA GTA GTA GTA CCC-FITC-3'。
【專利摘要】一種基于光二極管誘導(dǎo)化學(xué)發(fā)光測(cè)定Ago2蛋白的RNA核酸內(nèi)切酶活性的方法,屬于化學(xué)發(fā)光技術(shù)領(lǐng)域。首先,制備Ago2-RNA復(fù)合物和P-FITC修飾MoS2復(fù)合物。然后,將Ago2-RNA復(fù)合物加入到P-FITC修飾MoS2的溶液中,反應(yīng)一段時(shí)間后,離心,取部分上層清夜于2mL玻璃燒杯中,并加入20μLpH11.30的4mM的魯米諾溶液。然后,打開(kāi)光二極管電源,照射一段時(shí)間后關(guān)閉電源,然后測(cè)定化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度,根據(jù)化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度實(shí)現(xiàn)Ago2的RNA核酸內(nèi)切酶活性的測(cè)定。本發(fā)明方法簡(jiǎn)單、成本低、靈敏度高。
【IPC分類】C12Q1/44
【公開(kāi)號(hào)】CN105039498
【申請(qǐng)?zhí)枴緾N201510325008
【發(fā)明人】混旭, 張躍, 王慧敏
【申請(qǐng)人】青島科技大學(xué)
【公開(kāi)日】2015年11月11日
【申請(qǐng)日】2015年6月12日
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