作為hcv入胞抑制劑的大環(huán)分子的制作方法
【專利說(shuō)明】
[0001] 相關(guān)申請(qǐng)的交叉參考
[0002] 本申請(qǐng)要求2013年2月7日提交的美國(guó)臨時(shí)專利申請(qǐng)61/761,861的優(yōu)先權(quán),在 此引入本申請(qǐng)作為參考。
技術(shù)領(lǐng)域
[0003] 本發(fā)明涉及新的式I化合物,包括其藥學(xué)上可接受的鹽,所述化合物具有抗丙型 肝炎病毒(HCV)的活性并可用于治療HCV感染者。本發(fā)明也涉及組合物和使用這些化合物 的方法。
【背景技術(shù)】
[0004] 據(jù)估計(jì)世界范圍內(nèi)1.7億人患有慢性丙型肝炎病毒(HCV),其中僅美國(guó)就有3至4 百萬(wàn)感染者(Boyer,N?和 Marcellin,P.J. Hepatology. 2000,32:98_112;Alter,M.J?等人 Engl. J. Med. 1999, 341:556-562)。在二十世紀(jì)九十年代中期以前,用受感染的血制品輸血 為HCV傳染的主要途徑。在血液篩查方法引入之后,經(jīng)注射藥物使用的傳染變成主要的危 險(xiǎn)因素。慢性感染通常導(dǎo)致嚴(yán)重的肝并發(fā)癥的發(fā)展,這些并發(fā)癥包括纖維化、肝硬化和肝細(xì) 胞癌。在美國(guó),HCV感染也是原位肝移植的主要原因。疾病進(jìn)展與病毒和細(xì)胞因素的相關(guān) 程度尚未得到完全了解。
[0005] 在HCV基因組的核苷酸和所編碼的氨基酸序列內(nèi)發(fā)現(xiàn)相當(dāng)大的異質(zhì)性 (Simmonds,P. J. Gen. Virology. 2004,85:3173-3188)?;谠撔蛄卸鄻有裕呀?jīng)描述了六種 主要的基因型和多個(gè)相關(guān)的亞型。HCV的各基因型在其世界范圍內(nèi)的分布上存在差別,且盡 管對(duì)于基因型對(duì)發(fā)病機(jī)理和治療的可能的影響進(jìn)行了多項(xiàng)研宄,HCV的基因異質(zhì)性的臨床 重要性仍舊是難以弄清的。
[0006] HCV的醫(yī)學(xué)治療受疫苗或批準(zhǔn)的特異性地靶向所述病毒的治療的缺乏所局限。目 前,患者接受用胃腸外給藥的PEG化的a干擾素和口服利巴韋林的組合治療?;蛐? 的HCV最難以治療且該病毒的消除(持續(xù)的病毒學(xué)響應(yīng))僅在大約50%的患者上得以 實(shí)現(xiàn)(Fried,M.W?等人 N. Engl. J.Med. 2002,347:975_982 ;Zeumzem,S. Nature Clinical Practice. 2008,5:610-622)。該治療響應(yīng)弱,并且通過(guò)該治療所引起的通常是嚴(yán)重的副作 用,這突出了對(duì)改善的抗病毒藥物(具有更好的功效和安全譜)的需要。
[0007] HCV為具有單股的有義RNA基因組的黃病毒科病毒家族的成員。在感染宿主細(xì) 胞后,所述9. 6Kb基因組被翻譯成大約3, 000個(gè)氨基酸的多聚蛋白前體(在Lindenbach, B. D?和 Rice,C. M. Nature. 2005,436:933-938 ;Moradpour,D,Penin,F(xiàn)?和 Rice,C. M. Nature Reviews. 2007,5:453-463中進(jìn)行了綜述)。細(xì)胞和病毒蛋白酶的翻譯后加工導(dǎo)致至少10個(gè) 單獨(dú)的病毒蛋白的產(chǎn)生。結(jié)構(gòu)蛋白(按照定義發(fā)現(xiàn)于成熟病毒體中)包括核心、E1、E2和 可能的P7,并且起始于多聚蛋白的氨基末端區(qū)域。核心蛋白組裝至病毒核衣殼中。E1和E2 糖蛋白形成圍繞病毒顆粒的脂質(zhì)被膜內(nèi)發(fā)現(xiàn)的異二聚體,并調(diào)節(jié)宿主細(xì)胞受體結(jié)合和病毒 進(jìn)入細(xì)胞。不清楚P7是否為結(jié)構(gòu)蛋白,并且仍需要確定其在復(fù)制中所扮演的角色。然而據(jù) 信P7在細(xì)胞膜中形成離子通道,防止細(xì)胞內(nèi)隔室(病毒粒子在其中組裝)的酸化,且已經(jīng) 顯示p7對(duì)于病毒復(fù)制和組裝是關(guān)鍵的。非結(jié)構(gòu)蛋白NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A和NS5B是 通過(guò)多聚蛋白的羧基末端區(qū)域的成熟切割而產(chǎn)生的。NS2和NS3的氨基末端形成NS2-3金 屬蛋白酶,其在NS2-NS3結(jié)合處切割。此外,NS2牽涉到新生病毒粒子的組裝和釋出中。NS3 蛋白在其氨基末端區(qū)域含有絲氨酸蛋白酶,且在其羧基末端區(qū)域含有核苷酸依賴性RNA解 螺旋酶。NS3與NS4A蛋白形成異源二聚體,構(gòu)成了調(diào)節(jié)NS3的多聚蛋白下游的切割的活性 蛋白酶(在NS3-NS4A切割位點(diǎn)為順式,在剩余的NS4A-NS4B、NS4B-NS5A、NS5A-NS5B位點(diǎn)為 反式)。NS3蛋白與NS4A的復(fù)合物形成對(duì)加工事件而言似乎是必須的,其提高了所有位點(diǎn) 的蛋白水解效率。NS3蛋白也顯示出核苷三磷酸酶和RNA解螺旋酶的活性。已經(jīng)顯示NS4B 蛋白對(duì)于HCV蛋白向在細(xì)胞內(nèi)的改變的膜結(jié)構(gòu)中的復(fù)制復(fù)合體的定位而言是重要的。NS5B 編碼牽涉HCV的復(fù)制的RNA依賴性RNA聚合酶。
[0008] 亞基因組HCV復(fù)制子(含有融合至非結(jié)構(gòu)蛋白或全長(zhǎng)的多聚蛋白的編碼序列的非 翻譯區(qū)5'和3')能夠進(jìn)行翻譯、病毒蛋白的表達(dá)和在培養(yǎng)細(xì)胞內(nèi)的復(fù)制(Lohmann,V.等人 Science. 1999, 285:110-113 ;Moradpour,D,Penin,F(xiàn)?和 Rice,C. M. Nature Reviews. 2007, 5:453-463)。已經(jīng)證實(shí)所述復(fù)制子系統(tǒng)對(duì)于靶向與這些功能有關(guān)的非結(jié)構(gòu)蛋白的抑制劑的 鑒定是有價(jià)值的。然而,僅有限的HCV基因組的亞組已經(jīng)用于產(chǎn)生功能型復(fù)制子。
[0009] 其它系統(tǒng)已經(jīng)用于研宄調(diào)節(jié)向宿主細(xì)胞的進(jìn)入的HCV結(jié)構(gòu)蛋白的生物學(xué)。例如, 重組體桿狀病毒感染的細(xì)胞中制備的病毒樣顆粒(具有HCV核心、E1和E2蛋白)也已經(jīng)用 于研宄 HCV E1 和 E2 蛋白的功能(Barth,H?等人 J.Biol.Chem.2003,278:41003-41012)。 此外,已經(jīng)開(kāi)發(fā)了假型化系統(tǒng)(pseudotyping system),其中El和E2糖蛋白用于功能上代 替逆轉(zhuǎn)錄病毒的糖蛋白(Bartosch,B.,Dubuisson,J?和 COsset,F(xiàn). -L. J. Exp. Med. 2003, 197:633-642 ;Hsu,M?等人 Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2003,100:7271-7276)。這些系統(tǒng)產(chǎn) 生了以據(jù)信類似于天然病毒的方式結(jié)合并進(jìn)入宿主細(xì)胞的HCV假顆粒,因此使其成為了研 宄病毒進(jìn)入步驟以及鑒定阻斷該過(guò)程的抑制劑的方便的工具。
[0010] 近來(lái),分離了全長(zhǎng)的基因型2a HCV克?。碕FH1)并驗(yàn)證了在體外復(fù)制的能 力。通過(guò)重復(fù)的傳代和在細(xì)胞培養(yǎng)中適應(yīng),制備了具有增加的效價(jià)的有傳染性的病毒 (Lindenbach,B.D?等人 Science. 2005, 309:623-626 ;Wakita,T?等人 Nature Med. 2005, 11:791-796)。與HCV復(fù)制子或假型化系統(tǒng)相比,有傳染性的病毒可用于研宄完整的HCV復(fù) 制循環(huán),這不僅包括鑒定復(fù)制蛋白的抑制劑,還包括鑒定牽涉病毒感染的早期步驟(入胞 和脫殼)和子代病毒的生成(基因組包裝、核衣殼組裝、病毒粒子包封和釋出)的那些。
[0011]已公開(kāi)了三嗪。參見(jiàn) W0 2009/091388 和 US 2009/0286778。
[0012] 本發(fā)明提供了技術(shù)優(yōu)勢(shì),例如,所述化合物是新的并且有效對(duì)抗丙型肝炎。此外, 所述化合物提供了藥學(xué)用途的優(yōu)勢(shì),例如,關(guān)于其作用機(jī)理、結(jié)合、抑制功效、靶向選擇性、 溶解度、安全譜或生物利用度中的一種或多種。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0013] 本發(fā)明的一個(gè)方面為式I化合物,包括其藥學(xué)上可接受的鹽:
[0014]
[0015] 其中
[0016] a、b和c均為氮;
[0017] 或a和b為氮,而c為-CH ;
[0018] 或b和c為氮,而a為-CH ;
[0019] 或a和c為氮,而b為-CH ;
[0020] QJP Q 2為含有0-6個(gè)選自以下基團(tuán)的亞烷基或亞烯基鏈:0、NR 3、S、S (0)、S (02)、 C (0) 0、C (0) NR4、0C (0) NR4、NR4C (0) NR4和Z,使得環(huán)A為13-32元,條件是任何0或S原子不 直接鍵合至另一 〇或S原子;并且其中所述亞烷基和亞烯基鏈進(jìn)一步被0-6個(gè)選自以下的 取代基所取代:烷基、羥基、烷氧基、R6、(R 6)烷基和苯基,其中所述苯基取代基進(jìn)一步被0-4 個(gè)以下取代基所取代:氛基、鹵素、烷基、鹵代烷基、烷氧基或鹵代烷氧基;
[0021] R1選自烷基、羥基烷基、烷氧基烷基、鹵代烷基、環(huán)烷基、羥基環(huán)烷基、烷氧基環(huán)燒 基、鹵代環(huán)烷基、環(huán)烯基、茚滿基、烷基羰基或芐基,其中所述芐基基團(tuán)被0-3個(gè)選自鹵素、 烷基、鹵代烷基、環(huán)烷基、烷氧基、鹵代烷氧基、條基、炔基、羥基和氛基的取代基取代;
[0022] R2選自氛基、氣、鹵素、烷基、鹵代烷基、烷氧基、鹵代烷氧基和Ar ;
[0023] R3選自氣、烷基、烷基幾基、烷氧基幾基、氣基幾基、烷基氣基幾基和^烷基氣基幾 基;
[0024] R4為氫或烷基;
[0025] R5選自氣、烷基、(氣基)烷基、(烷基氣基)烷基和(一烷基氣基)烷基;
[0026] R6為吡咯烷基、哌啶基或哌嗪基,并且被0-3個(gè)選自烷基、烷基羰基、烷氧基羰基和 芐基氧基羰基的取代基所取代;
[0027] Ar選自苯基、五元雜環(huán)基、六元雜環(huán)基、萘基和雙環(huán)雜環(huán)基;
[0028] U 為 N 或 CR11;
[0029] R11為氫或烷基;
[0030] X 選自 0、CH2、C0、(:02和 C (0) NR 5;以及
[0031] Y 為 CN;
[0032] 或者Y選自環(huán)烷基、烯基、環(huán)烯基、炔基、芳基和雜芳基,并且可被0-3個(gè)選自以下 的取代基所取代:烷基、2-氧代-1,3-二氧雜環(huán)戊烯基、苯基、Ar、C00H、0H、N0 2、氨基、酰氨 基、烷氧基和烷基氧基幾基氣基;
[0033] 或者 Y 選自 R21、C00R21、CONHR22、C0NR22R 23、S02R21、S02NHR22、S0 2NR22R23和 C0R24,
[0034] R21、R22和R23各自獨(dú)立地選自環(huán)烷基、烯基、環(huán)烯基、炔基、芳基和雜芳基,并且其可 被0-3個(gè)選自以下的基團(tuán)取代:烷基、2-氧代-1,3-二氧雜環(huán)戊烯基、苯基、Ar、酮基、C00H、 OH、N02、氨基、酰氨基、烷氧基和烷基氧基羰基氨基;
[0035] 或者R21、R22和R 23各自獨(dú)立地為具有1-3個(gè)選自以下的取代基的烷基:烷基、2-氧 代-1,3-二氧雜環(huán)戊烯基、Ar