用于治療丙型肝炎的squaric衍生物的制作方法
【專利說明】用于治療丙型肝炎的SQUARIC衍生物
[0001] 相關申請的交叉引用 本申請要求2013年1月25日提交的美國臨時申請序列號61/756, 557的優(yōu)先權,其被 并入本文中作為參考。 發(fā)明領域
[0002] 本發(fā)明涉及式I的新型化合物,包括其藥學上可接受的鹽,其具有對抗丙型肝炎 病毒(HCV)的活性,并可用于治療被HCV感染的那些。本發(fā)明還涉及使用這些化合物的組 合物和方法。
[0003] 發(fā)明背景 在全世界范圍內,丙型肝炎病毒(HCV)慢性感染預估1億7千萬人,其中單獨在美 國就有 3 至 4 百萬感染的個體(Boyer, N. and Marcellin, P. J 2000, 32:98-112; Alter, M. J·,等人·份取/· 7; ifei/· 1999,341:556-562)。在 20 世紀 90 年代中期之前,采用感染血液樣品的輸血是HCV傳播的主要途徑。在引入血液篩查方法之 后,通過注射藥物的使用的傳播成為主要的危險因素。慢性感染通常導致形成嚴重的肝臟 并發(fā)癥,包括纖維化、硬化、和肝細胞癌。HCV感染也是美國原位肝移植的主要誘因。尚未完 全理解疾病發(fā)展與病毒和細胞因子相關的程度。
[0004] 在HCV基因組的核苷酸和編碼的氨基酸序列內發(fā)現(xiàn)相當大的異質性(Simmonds, P. 7; KiiWof 2004,85:3173-3188)?;谠撔蛄胁町?,記載了六種主要的基因 型和多個相關亞型。HCV基因型其在世界范圍內的分布不同,并且HCV的基因異質性的臨床 顯著性一直很難懂,即使進行了對發(fā)病機理和療法的基因型的可能效果的大量研宄。
[0005] 缺少特定靶向病毒的疫苗或核準療法限制HCV的醫(yī)學治療。近期,患者經歷采用 腸胃外給藥的聚乙二醇α-干擾素和口服病毒唑的組合的治療?;蛐虸 HCV是最難治療 的并且僅對約50%患者實現(xiàn)了實現(xiàn)了病毒的消除(持續(xù)病毒學響應)(Fried,Μ. W.等人. K EngL J. Med. 2002, 347:975-982; Zeumzemj S. Nature Clinical Practice. 2008, 5:610-622)。這種差的治療響應,通常伴隨由治療誘發(fā)的嚴重的副作用,高度需要具有更好 的功效和安全特征的改進的抗病毒藥物。
[0006] HCV是具有單鏈正義RNA基因組的病毒的黃病毒科家族的成員。在宿主細胞的感 染之后,將9. 6 Kb基因組翻譯成約3, 000個氨基酸的多蛋白前體(在Lindenbach,B. D. and Rice, C. M. Nature. 2005, 436:933-938; Moradpour, D, Penin, F., and Rice, C. M. yVaiare Tfeher1S. 2007, 5:453-463中評論)。由細胞和病毒蛋白酶進行的翻譯后 加工導致形成至少10個單獨的病毒蛋白。結構蛋白(其按照定義存在于成熟病毒體中) 包括芯,E1,E2,和可能的p7,并源于多蛋白的氨基末端區(qū)域。芯蛋白組裝成病毒核殼 體。El和E2糖蛋白形成在病毒粒子周圍的脂質包膜內存在的異二聚體,并介導宿主細胞受 體結合和病毒進入細胞。如果P7是結構蛋白,則是不清楚的,并且其在復制方面的作用有 待定義。然而,據信P7在細胞膜中形成離子通道,防止病毒體在其中組裝的細胞內隔室的 酸化,并且其示出對病毒復制和組裝是必不可少的。通過多蛋白的羧基末端區(qū)域的成熟裂 解產生非結構蛋白NS2,NS3,NS4A,NS4B,NS5A,和NS5BCNS2以及NS3的氨基末端形 成NS2-3金屬蛋白酶,其在NS2-NS3接合點裂解。另外,NS2參與初生病毒體的組裝和排出 (egress)。NS3蛋白含有在其氨基末端區(qū)域中的絲氨酸蛋白酶和在其羧基-末端區(qū)域中的 核苷酸依賴性RNA解旋酶。NS3形成具有NS4A蛋白的異質二聚體,構成活性蛋白酶,其介導 NS3下游的多蛋白裂解,在NS3-NS4A裂解位點的順式和對于其余NS4A-NS4B,NS4B-NS5A, NS5A-NS5B位點的反式。NS3蛋白與NS4A的復合形成似乎對于加工事件是必要的,提高了全 部位點的解蛋白效果。NS3蛋白還表現(xiàn)出核苷三磷酸酶和RNA解旋酶活性。已經示出NS4B 蛋白對于在細胞內變化的膜結構中將HCV蛋白定位于復制復合物中是重要的。NS5B編碼參 與HCV復制的RNA-依賴性RNA聚合酶。
[0007] 次基因組HCV復制子,含有未翻譯成融合成非結構蛋白或全長多蛋白的編碼序列 的區(qū)域5'和3',對于培養(yǎng)細胞中的翻譯、病毒蛋白表達和復制是感受態(tài)的(competent) (Lohmann,V.等人· 5bi<9/?c<9· 1999,285:110-113; Moradpour,D,Penin,F(xiàn)·,and Rice, C. M. TfeitfreTferier1S. 2007,5:453-463)。已經證明復制子系統(tǒng)對于革巴向與這些 功能相關的非結構蛋白的抑制劑的識別是有價值的。然而,已經將唯一限制的HCV基因型 亞組用于形成功能復制子。
[0008] 已經使用其他系統(tǒng)研宄介導進入宿主細胞的HCV結構蛋白的生物學。例如,在具 有HCV芯、El和E2蛋白的重組體桿狀病毒感染的細胞中產生的病毒樣粒子已經用于研宄 HCV El 和 E2 蛋白的功能(Barth, H·,等人· 7;沿泛6?· 2003,278:41003-41012)。 另外,已經開發(fā)了其中El和E2糖蛋白用于功能性代替逆轉錄酶病毒的糖蛋白的假型系統(tǒng) (Bartosch, B., Dubuisson, J. and Cosset, F.-L. J. Exp. Med. 2003, 197:633-642; Hsu, M.等人.Jcaol 5bi. 2003, 100:7271-7276)。這些系統(tǒng)以據信 類似于天然病毒的方式獲得結合至并進入宿主細胞的HCV假型粒子,從而使它們成為研宄 病毒進入階段以及鑒定抑制劑阻斷該過程的方便的工具。
[0009] 近期,分離全長基因型2a HCV克隆,JFH1,并證明體外復制的能力。通過細胞 培養(yǎng)中的重復通過和適應,產生增加的感染病毒的滴定度(Lindenbach, B. D.,等人. 2005,309:623-626; Wakita, T.等人· yVaiareifeo; 2005,11:791-796)。相 比于HCV復制子或假型系統(tǒng),感染性病毒可用于研宄完整的HCV復制周期,包括識別不只是 復制蛋白的抑制劑,還有參與在病毒感染(進入和未包衣)和產生子代病毒(基因組包裝、核 殼體組裝、病毒體包封和排出)早期階段的那些。
[0010] 已經公開了三嗪類。參見 WO 2009/091388 和 US 2009/0286778。
[0011] 本發(fā)明提供技術優(yōu)勢,例如所述化合物是新穎的并且有效對抗丙型肝炎。另外,所 述化合物提供藥物使用的優(yōu)勢,例如在一種或多種它們的作用機制、結合、抑制功效、靶選 擇性、溶解性、安全特征、或生物利用度方面。
[0012] 發(fā)明概述 本發(fā)明的一個方面是式I化合物,包括其藥學上可接受的鹽:
其中 a, b和c為氮; 或a和b為氮,同時c為-CH; 或b和c為氮,同時a為-CH; 或a和c為氮,同時b為-CH; R1選自烷基,羥基烷基,烷氧基烷基,鹵代烷基,環(huán)烷基,羥基環(huán)烷基,烷氧基 環(huán)烷基,鹵代環(huán)烷基,環(huán)烯基,茚滿基,烷基羰基,和芐基,其中芐基被0-3個選自 如下的取代基取代:鹵素,烷基,環(huán)烷基,條基,炔基,羥基,氛基,鹵代烷基,燒 氧基,和鹵代烷氧基; R2選自烷基,環(huán)烷基,(Ar 2)烷基,(Ar2)環(huán)烷基,((Ar2)環(huán)烷基)烷基,((Ar 2) 烷基)環(huán)烷基,和(((Ar2)烷基)環(huán)烷基)烷基; R3為氫,烷基或環(huán)烷基; R4為氫,烷基或環(huán)烷基; R5為*
,其 中環(huán)A為被L取代的4至7元亞烷基環(huán); R6選自氛,鹵素,烷基,環(huán)烷基,鹵代烷基,鹵代環(huán)烷基,烷氧基,和鹵代燒氧 基; R7為羥基,烷氧基,苯氧基,SO2R9, SO2N(Rltl)(Rn), CN,烷基,環(huán)烷基,苯并環(huán) 烷基,一環(huán)烷基,(環(huán)烷基)烷基,(烷基)環(huán)烷基,((烷基))環(huán)烷基)烷基,或橋 連二環(huán)烷基,并被0-4個選自如下的取代基取代:鹵素,烷基,環(huán)烷基,苯并環(huán)烷基, 二環(huán)烷基,羥基烷基,烷氧基烷基,羥基,烷氧基,芐氧基,醚,環(huán)醚,苯并環(huán)醚, 二環(huán)醚,CO2R9, NR9CO2R11, N (Riq) (Rn),CON (Riq) (Rn),NR9CON (Riq) (Rn),SO2N (Riq) (Rn),四 氫呋喃基,四氫吡喃基,Ar3, OAr3,NR13Ar3, N(R13)COAr3, N(R13)COAr3,和 N (R13)SO2Ar3; 或R7為氫,N-烷氧基羰基哌啶基,哌啶酮基,或Ar 4; R8為氫,烷基,或環(huán)烷基,和烷基或環(huán)烷基被0-4個選自如下的取代基取代:鹵素, 烷基,環(huán)烷基,桐合 ^環(huán)烷基,橋連^環(huán)烷基,螺^環(huán)烷基,羥基烷基,烷氧基烷基,羥基,烷氧基, 芐氧基,CO2R9, N(Rltl)(Rn),四氫呋喃基,四氫吡喃基,Ar3, OAr3,NR13Ar3, N(R13)COAr3, 和 N (R13)SO2Ar3; 或R7和R8和與它們連接的氮一起為氮雜環(huán)丁烷基,吡咯烷基,哌啶基,哌嗪基, 嗎啉基,硫代嗎啉基,硫代嗎啉1,1-二氧化物,四氫喹啉基,四氫異喹啉基,吲哚啉 基或異吲哚啉基,并被0-2個選自如下的取代基取代:烷基,(芳基)烷基,烷基羰基, 和烷氧基幾基; R9為氣,Ar 3,烷基,環(huán)烷基,羥基烷基,烷氧基烷基,((羥基烷基)烷氧基)燒 氧基,或((烷氧基)烷氧基)烷氧基; Rici為氣,烷基,環(huán)烷基,烷基幾基,烷氧基幾基,或Ar 6; Rn為氫,烷基,環(huán)烷基,或Ar 6; 或Rltl和R11和與它們連接的氮一起為氮雜環(huán)丁烷基,吡咯烷基,哌啶基,哌嗪基, 嗎啉基,硫代嗎啉基,硫代嗎啉1,1-二氧化物,四氫喹啉基,四氫異喹啉基,吲哚啉 基或異吲哚啉基,并被0-2個選自如下的取代基取代:烷基,(芳基)烷基,烷基羰基, 和烷氧基幾基; R12為氫,烷基,環(huán)烷基,或Ar 6; R13為氫,烷基,環(huán)烷基,烷基羰基,烷氧基羰基,或Ar 6,并被0-3個選自如下 的取代基取代:氛基,鹵素,烷基,條基,鹵代烷基,烷氧基,和鹵代烷氧基,N(R15) (R16),和烷基CO; R14為氫,烷基,環(huán)烷基,或Ar 6; 或R13和R14和與它們連接的氮一起為氮雜環(huán)丁烷基,吡咯烷基,哌啶基,哌嗪基, 嗎啉基,硫代嗎啉基,硫代嗎啉1,1-二氧化物,四氫喹啉基,四氫異喹啉基,吲哚啉 基,或異吲哚啉基,并被0-2個選自如下的取代基取代:烷基,(芳基)烷基,烷基羰 基,和烷氧基幾基; R15為氛,烷基,環(huán)烷基,烷基幾基,或烷氧基幾基; R16為氫,烷基,或環(huán)烷基; 或R15和R16和與它們連接的氮一起為氮雜環(huán)丁烷基,吡咯烷基,哌啶基,哌嗪基