專利名稱:用于制備用作蛋白激酶抑制劑的嘧啶衍生物的方法
用于制備用作蛋白激酶抑制劑的嘧啶衍生物的方法交叉引用本申請要求2009年9月25日提交的美國申請?zhí)?1/M5,773的優(yōu)先權(quán)。將前述申請的全部內(nèi)容并入本文。
背景技術(shù):
近年來,對與疾病有關(guān)的酶和其他生物分子的結(jié)構(gòu)的更好理解,大大有助于尋求新的治療劑。已經(jīng)成為重點(diǎn)研究的主題的一類重要的酶是蛋白激酶。蛋白激酶構(gòu)成一大家族在結(jié)構(gòu)上相關(guān)的酶,它們負(fù)責(zé)控制細(xì)胞內(nèi)的多種信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過禾呈(參見Hardie,G and Hanks, S. The Protein Kinase Facts Book, I and II, Academic Press, San Diego, CA 1995)。由于保存了它們的結(jié)構(gòu)和催化功能,蛋白激酶被認(rèn)為從共同的祖先基因進(jìn)化而來。幾乎所有的激酶都含有相似的250-300個氨基酸催化域。激酶可以根據(jù)它們磷酸化的底物(例如蛋白質(zhì)-酪氨酸、蛋白質(zhì)-絲氨酸/蘇氨酸、脂質(zhì)等)分為若干家族。已經(jīng)鑒別了一般對應(yīng)于每種激酶家族的序列基元(例如參見HankS,S. K. ,Hunter, Τ.,F(xiàn)ASEB J. 1995,9,576-596 ;Knighton 等人,Science 1991,253,407-414 ;Hiles 等人, Cell 1992,70,419-429 ;Kunz 等人,Cell 1993,73,585-596 ;Garcia-Bustos 等人,EMBO J 1994,13,2352-2361)。一般而言,蛋白激酶通過影響磷酰基從三磷酸核苷轉(zhuǎn)移至參與信號傳導(dǎo)途徑的蛋白質(zhì)受體而介導(dǎo)細(xì)胞內(nèi)信號傳導(dǎo)。這些磷酸化事件充當(dāng)分子開關(guān),能夠調(diào)控或調(diào)節(jié)靶蛋白的生物功能。這些磷酸化事件最終是響應(yīng)于多種細(xì)胞外與其他刺激而被激發(fā)的。這類刺激的實例包括環(huán)境與化學(xué)應(yīng)激信號(例如休克、熱激、紫外輻射、細(xì)菌內(nèi)毒素和H2O2)、細(xì)胞因子(例如白介素-I(IL-I)和腫瘤壞死因子α (TNF-α))和生長因子(例如粒細(xì)胞巨噬細(xì)胞集落刺激因子(GM-CSF)和成纖維細(xì)胞生長因子(FGF))。細(xì)胞外刺激可以影響一種或多種細(xì)胞應(yīng)答,其涉及細(xì)胞生長、移行、分化、激素分泌、轉(zhuǎn)錄因子活化、肌肉收縮、葡萄糖代謝、蛋白質(zhì)合成控制、細(xì)胞周期存活和調(diào)節(jié)。很多疾病與由上述蛋白激酶介導(dǎo)的事件激發(fā)的異常細(xì)胞應(yīng)答有關(guān)。這些疾病包括但不限于癌癥、自體免疫疾病、炎性疾病、骨疾病、代謝疾病、神經(jīng)系統(tǒng)疾病與神經(jīng)變性疾病、心血管疾病、變態(tài)反應(yīng)與哮喘、阿爾茨海默氏病和激素相關(guān)性疾病。因此,醫(yī)藥化學(xué)界一直努力尋找作為治療劑有效的蛋白激酶抑制劑。極體樣激酶(Plk)屬于酵母至人中物種間高度保守的絲氨酸/蘇氨酸激酶家族 (在Lowery DM等人,Oncogene 2005,M ;248_259中被綜述)。Plk激酶在細(xì)胞周期中有多重角色,包括對進(jìn)入有絲分裂和其中進(jìn)展的控制。Plkl是Plk家族成員中表征最充分的。Plkl廣泛表達(dá),且在高有絲分裂指數(shù)的組織中最豐富。在有絲分裂中Plkl的蛋白水平升高并達(dá)到頂峰(Hamanaka,R 等人,J Biol Chem 1995,270,21086-21091)。已報道 Plkl 的底物是已知的在有絲分裂中調(diào)節(jié)進(jìn)入和進(jìn)程的所有分子,包括CDC25C、細(xì)胞周期蛋白B、 p53、APC、BRCA2和蛋白酶體。Plkl在多種癌癥類型中上調(diào),且表達(dá)水平與疾病嚴(yán)重性相關(guān) (Macmillan,JC 等人,Ann Surg 0ncol2001,8, 729-740)。Plkl 是癌基因,且能轉(zhuǎn)化NIH-3T3細(xì)胞(Smith,MR 等人,Biochem Biophys Res Commun 1997,234,397-405)。由 siRNA、反義引物、抗體的顯微注射或Plkl的顯性負(fù)性結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)染進(jìn)細(xì)胞導(dǎo)致的Plkl的耗竭或抑制,在體外降低增殖及腫瘤細(xì)胞活力(Guan, R等人,Cancer Res2005,65, 2698-2704 ;Liu, X等人, Proc Natl Acad Sci USA 2003,100,5789_5794,F(xiàn)an,Y等人,World J Gastroenter012005, 11,4596-4599 ;Lane,HA 等人,J Cell Bioll996,135,1701-1713)。耗盡 Plkl 的腫瘤細(xì)胞具有活化的紡錘體關(guān)卡,且在紡錘體結(jié)構(gòu)、染色體排列和分離與胞質(zhì)分裂中有缺陷。已報道缺少活力是細(xì)胞凋亡的誘導(dǎo)結(jié)果。相反,已報道正常細(xì)胞維持耗竭的Plkl的活力。在異種移植物模型中,體內(nèi)Plkl被siRNA敲除或利用顯性負(fù)性結(jié)構(gòu)導(dǎo)致對腫瘤生成的抑制或腫瘤消退。Plk2主要在細(xì)胞周期的Gl期表達(dá),且集中于分裂間期細(xì)胞中心體。Plk2敲除的小鼠發(fā)育正常,可生育,且存活率正常,但比野生型小鼠小大約20%。與在正常小鼠中相比,來自敲除動物的細(xì)胞更緩慢地度過細(xì)胞周期(Ma,S等人,Mol Cell Biol2003,23, 6936-694;3)。Plk2被siRNA耗盡或激酶無活性的突變體轉(zhuǎn)染進(jìn)細(xì)胞阻斷中心粒復(fù)制。部分由于p53應(yīng)答的抑制,Plk2的下調(diào)也使腫瘤細(xì)胞對泰素敏感且促使有絲分裂失敗(Burns TF 等人,Mol Cell Biol2003,23,5556-5571)。Plk3在細(xì)胞周期中自始自終表達(dá),且從Gl至有絲分裂增加。在高度增殖的卵巢癌和乳癌中表達(dá)上調(diào),且與更壞的預(yù)后相關(guān)(Weichert,W等人,Br J Cancer2004,90, 815-821 ;Weichert, W 等人,VirchowS Arch2005,446,442-450)。除了調(diào)節(jié)有絲分裂,認(rèn)為 Plk3與細(xì)胞周期中和DNA-損傷應(yīng)答中的高爾基斷裂相關(guān)。已報道在DNA損傷和被腫瘤細(xì)胞抑制集落形成后,Plk3被顯性負(fù)性表達(dá)抑制促進(jìn)與p53無關(guān)的細(xì)胞凋亡(Li,Z等人,J Biol Chem2005,280,16843-16850。與其他Plk家族成員相比,Plk4結(jié)構(gòu)更不同。在癌細(xì)胞中激酶耗盡引發(fā)細(xì)胞凋亡 (Li, J等人,Neoplasia 2005,7,312-323)。Plk4敲除的小鼠在E7. 5停博,大部分細(xì)胞在有絲分裂階段,部分分離的染色體(Hudson,JW等人,Current Biology 2001,11,441-446)。蛋白激酶家族的分子涉及腫瘤細(xì)胞生長、增殖和存活。因此,急需發(fā)展作為蛋白激酶抑制劑的化合物。涉及Plk激酶對細(xì)胞分裂是關(guān)鍵的證據(jù)是充分的。阻斷細(xì)胞周期是臨床確認(rèn)的抑制腫瘤細(xì)胞增殖和活力的方法。在本領(lǐng)域,已報道大量Plk激酶抑制劑。參見,例如,US2009/0062^2、US 2008/0167289、US 2006/004014、US 6,806,272、US 6,861,422、W02009/040556、WO 2009/042711和WO 2006/058876??紤]到這些Plk激酶抑制劑對治療一種或多種前述疾病的潛能,將需要發(fā)展用于該抑制劑和其衍生物的新有效的合成方法。發(fā)明概述本發(fā)明一般涉及制備由結(jié)構(gòu)式(I)表示的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽的方法
權(quán)利要求
1.制備由結(jié)構(gòu)式(I)表示的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽的方法
2.權(quán)利要求1的方法,其中R1是任選地被取代的CV6脂肪族基團(tuán)、任選地被取代的C6_1(l 芳基或任選地被取代的5-10元雜芳基。
3.權(quán)利要求2的方法,其中R7是-H或任選地被取代的Cp6脂肪族基團(tuán)。
4.權(quán)利要求1-3任一項的方法,其中R6是-H、任選地被取代的CV6脂肪族基團(tuán)、任選地被取代的C3_7脂環(huán)族基團(tuán)、任選地被取代的3-7元雜環(huán)基、任選地被取代的苯基或任選地被取代的5-6元雜芳基。
5.權(quán)利要求1-4任一項的方法,其中各個R2、R3、R4和R5獨(dú)立地是-H、鹵素、任選地被取代的CV6脂肪族基團(tuán)或任選地被取代的C3_7脂環(huán)族基團(tuán);或任選地,R2和R3、R3和R4及R4 和R5,分別連同它們所結(jié)合的原子,獨(dú)立地形成任選地被取代的C3_7脂環(huán)族環(huán)。
6.權(quán)利要求1-5任一項的方法,其中R8是-H或任選地被取代的Cp6脂肪族基團(tuán)。
7.權(quán)利要求1-6任一項的方法,所述方法進(jìn)一步包含下述步驟將結(jié)構(gòu)式(C)表示的化合物
8.權(quán)利要求7的方法,其中各個LG1和LG2獨(dú)立地是鹵素。
9.權(quán)利要求8的方法,其中LG1和LG2均是-Cl。
10.權(quán)利要求1-9任一項的方法,其中R12是-NO2和R11是-OR14。
11.權(quán)利要求10的方法,其中R14是CV6烷基。
12.權(quán)利要求1-9任一項的方法,其中R12是鹵素和R11是-NHR13。
13.權(quán)利要求12的方法,其中R12是-Br或-1,且R13是C^6烷基。
14.權(quán)利要求13的方法,其中R12是-Br。
15.權(quán)利要求1-14任一項的方法,其中各個 Z1 獨(dú)立地是-N (R) -、-0-、-S-、-C02-、-C (0) N (R) -,-OC (0) N (R) -、-N (R) CO2-、-N (R) C (0) N(R)-, -C (0) N (R) CO2-、-SO2N (R)-或-N (R) SO2N (R)-;且各個 Z2 獨(dú)立地是-N (R) -、-0-、-S-、-CO2-、-OC (0) -、-C (0) N(R)-, -N (R) C(O)-, -OC (0) N (R) -、-N (R) CO2-、-N (R) C (0) N (R) -、-C (0) N (R) CO2-、-S (0) 2-、-SO2N (R) -、-N (R) SO2-或-N (R) SO2N(R)-O
16.權(quán)利要求15的方法,其中R1是被Q1取代的C"烷基并且任選地進(jìn)一步被一個或多個取代基取代,所述取代基獨(dú)立地選自鹵素、氧代、-CN、-OH、-NH2、-NH (C1-C4烷基)、-N (C1-C4 烷基)2、-OCO (C1-C4 烷基)、-CO (C1-C4 烷基)、-C02H、-CO2 (C1-C4 烷基)和-0 (C1-C4 烷基)。
17.權(quán)利要求15的方法,其中R1是C6,芳基或5-6元雜芳基,前述基團(tuán)各自任選地且獨(dú)立地被一個或多個取代基取代,所述取代基獨(dú)立地選自T和CV6脂肪族基團(tuán), 前述基團(tuán)任選地被一個或多個T的實例取代;并且其中各個T是鹵素、氰基、Q1、-N(R) H、-OH、-SH、-CO2H, -C (0) N (R) H、-OC (0) N (R) H、-N (R) C (0) N (R) H、-SO2N (R) H、-N (R) SO2N (R) H、-S(O)2Q2, -N(R) Q2, -OQ2、-SQ2、-CO2Q2、-OC(O) Q2、-C (O)N (R) Q2、-N (R) C(O) Q2、-N(R) CO2Q2、-OC (0) N (R) Q2、-C (0) N (R) CO2Q2、-N (R) C (0) N (R) Q2、-SO2N (R) Q2、-N (R) SO2Q2 或-N (R) SO2N(R) Q2。
18.權(quán)利要求16或17的方法,其中R7是-H或Cp6烷基。
19.權(quán)利要求18的方法,其中R6是-H、任選地被取代的CV6烷基或任選地被取代的C3_7 環(huán)烷基。
20.權(quán)利要求19的方法,其中R8是-H或Cp6烷基。
21.權(quán)利要求20的方法,其中各個R2、R3、R4和R5獨(dú)立地是-H或任選地被取代的C^6 烷基;或任選地,R2和R3,連同它們所結(jié)合的原子,形成任選地被取代的C3_7環(huán)烷基環(huán)。
22.權(quán)利要求21的方法,其中i)R2是-H或C1^烷基;R3是CV3烷基;R4是-H或C1^烷基;并且R5是-H或C1^烷基;或ii)R2和R3連同它們所結(jié)合的原子形成C3_7環(huán)烷基環(huán);R4是-H或CV3烷基;并且R5是-H 或Cp3烷基。
23.權(quán)利要求22的方法,其中R4和R5均是-H。
24.權(quán)利要求17-23任一項的方法,其中R1是任選地被一個或多個取代基取代的苯基,所述取代基獨(dú)立地選自T和CV6脂肪族基團(tuán),前述基團(tuán)任選地被一個或多個T的實例取代;并且其中各個 T 是鹵素、氰基、-N (R) H、-OH、-CO2H、-C (0) N (R) H、-OC (0) N (R) H、-N (R) Q2、-OQ2、-CO2Q2、-OC (0) Q2、-C (0) N (R) Q2、-N (R) C (0) Q2、-N (R) CO2Q2、-OC (0) N (R) Q2、-C (0) N (R) (X)2Q2 或-N (R) C (O)N (R) Q2。
25.權(quán)利要求M的化合物,其中R7是-H。
26.權(quán)利要求25的方法,其中R6是任選地被取代的C3_6環(huán)烷基。
27.權(quán)利要求116任一項的方法,其中R1是任選地被取代的芳基或任選地被取代的雜方基。
28.權(quán)利要求1-27任一項的方法,其中q是1。
29.制備由結(jié)構(gòu)式(III)表示的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽的方法
30.權(quán)利要求四的方法,其中R1是任選地被取代的C6,芳基或任選地被取代的5-10元雜芳基; 各個 Z1 獨(dú)立地是-N (R) -、-0-、-S-、-C02-、-C (0) N (R) -,-OC (0) N (R) -、-N (R) CO2-、-N (R) C (0) N(R)-, -C (0) N (R) CO2-、-SO2N (R)-或-N (R) SO2N (R)-;各個 Z2 獨(dú)立地是-N (R) -、-0-、-S-、-CO2-、-OC (0) -、-C (0) N(R)-, -N (R) C(O)-, -OC (0) N(R)-, -N(R) CO2-, -N(R) C (0) N(R)-、-C (O)N(R) CO2-、-S(O)-, -S(O)2-, -SO2N (R)-、-N(R) SO2-或-N (R) SO2N(R)-;各個Q1獨(dú)立地是任選地被取代的C3_7環(huán)烷基、任選地被取代的苯基、任選地被取代的 5-6元雜芳基或任選地被取代的4-7元雜環(huán)基;各個R2和R3、R4和R5獨(dú)立地是-H、鹵素、氰基或CV6脂肪族基團(tuán),或任選地,R2和R3,R3 和R4,R4和R5,各自連同它們所結(jié)合的碳原子,獨(dú)立地形成C3_7環(huán)烷基環(huán),其中各個所述脂肪族基團(tuán)和環(huán)烷基環(huán)獨(dú)立地且任選地被一個或多個取代基取代,所述取代基獨(dú)立地選自鹵素、氧代、-CN、-OH、-NH2、-NH(C1-C4 烷基)、_N(C「C4 烷基)2、-OCO (C1-C4 烷基)、-CO (C1-C4 烷基)、-CO2H, -CO2 (C1-C4 烷基)和-0 (C1-C4 烷基);R6是-H、CV6脂肪族基團(tuán)或C3_7脂環(huán)族基團(tuán),其中的各個基團(tuán)任選地且獨(dú)立地被一個或多個取代基取代,所述取代基獨(dú)立地選自鹵素、氧代、-CN、-OH、-NH2, -MKC1-C4烷基)、-N(C1-C4 烷基)2、-OCO (C1-C4 烷基)、-CO (C1-C4 烷基)、-CO2H, -CO2 (C1-C4 烷基) 和-(KC1-C4烷基);且各個R7和R8獨(dú)立地是-H或Cp6烷基。
31.權(quán)利要求30的方法,其中通過該方法制備的化合物由結(jié)構(gòu)式(IV)或其藥學(xué)上可接受的鹽表示
32.權(quán)利要求31的方法,其中R6是C5_6環(huán)烷基。
33.權(quán)利要求32的方法,其中i)R2是-H或CV3烷基;并且R3是C"烷基;或ii)R2和R3連同它們所結(jié)合的原子形成C3_6環(huán)烷基環(huán)。
34.權(quán)利要求31-33任一項的方法,其中苯基環(huán)A被一個或多個取代基取代,所述取代基獨(dú)立地選自-C (O)N (R) H、-C(O)N(R) Q2, -N (R) C(O) Q2、-CO2H, -(X)2Q2、-OC(O) Q2、-N(R) CO2Q2、-OC(O)N(R)Q2和-N(R)C(O)N(R)Q2;前述基團(tuán)任選地進(jìn)一步被一個或多個取代基取代,所述取代基獨(dú)立地選自鹵素、-CN、-OH、-NH2、-NH (C1-C4烷基)、-N (C1-C4烷基)2、-0 (C1-C4 燒基)、C1-C4燒基、C1-C4 代燒基;C1-C4氰基燒基、C1-C4氨基燒基、C1-C4輕基燒基禾口 C2-C4 烷氧基烷基。
35.權(quán)利要求34的方法,其中苯基環(huán)A被-OC(0) Q2、-C (0) N (R) Q2或-N (R) C (0) Q2取代,前述基團(tuán)任選地進(jìn)一步被一個或多個取代基取代,所述取代基獨(dú)立地選自鹵素、-CN、-OH、-NH2、-NH(C1-C4 烷基)、-N(C1-C4 烷基)2、-0 (C1-C4 烷基)、C1-C4 烷基、C1-C4 鹵代烷基K1-C4氰基烷基、C1-C4氨基烷基、C1-C4羥基烷基和C2-C4烷氧基烷基。
36.權(quán)利要求1的方法,其中所述式(I)化合物由下列結(jié)構(gòu)式的任一個,或其藥學(xué)上可接受的鹽表示
37.權(quán)利要求1的方法,其中所述結(jié)構(gòu)式(I)的化合物由下列結(jié)構(gòu)式的任一個,或其藥學(xué)上可接受的鹽表示
38.權(quán)利要求1的方法,其中通過該方法制備的化合物由下列結(jié)構(gòu)式的任一個,或其藥學(xué)上可接受的鹽表示
39.權(quán)利要求1的方法,其中由結(jié)構(gòu)式(I)表示的化合物由下列結(jié)構(gòu)式或其藥學(xué)上可接受的鹽表示
40.權(quán)利要求1的方法,其中由結(jié)構(gòu)式(I)表示的化合物由下列結(jié)構(gòu)式或其藥學(xué)上可接受的鹽表示
全文摘要
制備由結(jié)構(gòu)式(I)表示的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽的方法其中結(jié)構(gòu)式(I)的變量如說明書和權(quán)利要求中所述,所述方法包含下述步驟a)在適宜的條件下使由結(jié)構(gòu)式(A)表示的化合物與FHNR1R7反應(yīng)以形成由結(jié)構(gòu)式(B)表示的化合物;b)i)當(dāng)R12是-NO2和R11是-OR14時1)在適宜的環(huán)化條件下環(huán)化由結(jié)構(gòu)式(B)表示的化合物以形成由結(jié)構(gòu)式(II)表示的化合物;2)任選地使由結(jié)構(gòu)式(II)表示的化合物與R9-LG2反應(yīng),其中LG2是適宜的離去基團(tuán),以形成由結(jié)構(gòu)式(I)表示的化合物,其中R8是R9;或ii)當(dāng)R12是鹵素和R11是-NHR13時1)在適宜的環(huán)化條件下環(huán)化由結(jié)構(gòu)式(B)表示的化合物以形成由結(jié)構(gòu)式(I)表示的化合物;2)任選地,當(dāng)R13是-H時,使由步驟b),ii),1)制備的化合物與R9-LG2反應(yīng),其中LG2是適宜的離去基團(tuán),以形成由結(jié)構(gòu)式(I)表示的化合物,其中R8是R9
文檔編號C07D487/04GK102548994SQ201080042380
公開日2012年7月4日 申請日期2010年9月24日 優(yōu)先權(quán)日2009年9月25日
發(fā)明者J-D·查理爾, M·歐度內(nèi)爾, S·杜拉特 申請人:沃泰克斯藥物股份有限公司