一種耐高溫木聚糖酶突變體及其應用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明屬于酶基因改造技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種耐高溫木聚糖酶突變體及其應 用。
【背景技術(shù)】
[0002] 木聚糖(xylan)廣泛存在于自然界中,是半纖維素的重要組分,它是自然界中含 量僅次于纖維素的第二豐富的多聚糖,幾乎占地球可更新有機碳含量的三分之一。在被 子植物中木聚糖占干物質(zhì)重的15% -30%,在裸子植物中占干物質(zhì)重的7% -12%。但木 聚糖具有很強的抗營養(yǎng)作用,在動物的消化道內(nèi)不能被消化和吸收,而且會影響其它養(yǎng)分 的吸收利用,因而大大限制了富含木聚糖飼料(大麥、小麥、黑麥等)的應用。木聚糖酶 (Xylanase)是指能專一降解半纖維素木聚糖為低聚木糖和木糖的一組酶的總稱。人們對木 聚糖酶的研宄早在六十年代就已開始,主要研宄集中在食品、飼料、造紙、能源工業(yè)等方面 的木聚糖酶,已經(jīng)從不同來源的微生物中分離到大量的不同類型不同功能的木聚糖酶。并 分離出多種木聚糖酶基因,已工業(yè)化生產(chǎn)多種木聚糖酶產(chǎn)品。
[0003] 因為目前在顆粒生產(chǎn)過程中有一個短暫的80-90°C的高溫階段。青霉菌來源木聚 糖酶熱穩(wěn)定性較差,其水溶液在65°C下保溫5分鐘剩余酶活性低于30%,使該酶在顆粒飼 料的應用受到限制。采用飼料制粒后木聚糖酶液體噴涂到飼料上的方法不僅增加設備投 入,而且對酶制劑的穩(wěn)定性、飼料中分布均一性都無法很好的保證。因此,提高木聚糖酶熱 穩(wěn)定性對目前飼料用木聚糖酶具有重要的現(xiàn)實意義。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0004] 本發(fā)明的目的是提供一種耐高溫木聚糖酶突變體及其在飼料中的應用。本發(fā)明通 過對來源于繩狀青霉(Penicillium funiculosum)的木聚糖酶進行蛋白質(zhì)工程改造,獲得 了突變體蛋白,其耐熱性得到顯著提高,有利于其在飼料領(lǐng)域的廣泛應用。
[0005] 申請人通過對來源于繩狀青霉的木聚糖酶進行大量突變的篩選,發(fā)現(xiàn)N34C、 S103Y、T175C、S184C和T187C這五個突變位點能引起木聚糖酶耐熱性的提高,從而促成本 發(fā)明。
[0006] 本發(fā)明一方面提供了一種木聚糖酶突變體,是氨基酸序列為SEQ ID NO :1的木聚 糖酶的第103位氨基酸由Ser變?yōu)門yr。
[0007] 上述突變體的氨基酸序列為SEQ ID NO :3,其一種編碼基因的核酸序列為SEQ ID NO :4〇
[0008] 本發(fā)明還包括攜帶有編碼序列為SEQ ID NO :4的木聚糖酶突變體的質(zhì)粒。
[0009] 本發(fā)明一方面提供了另一種木聚糖酶突變體,是氨基酸序列為SEQ ID NO :3的木 聚糖酶的第175位氨基酸由Thr變?yōu)镃ys,第184位氨基酸由Ser變?yōu)镃ys。
[0010] 上述突變體的氨基酸序列為SEQ ID NO :5,其一種編碼基因的核酸序列為SEQ ID NO :6〇
[0011] 本發(fā)明還提供攜帶編碼序列為SEQ ID NO :6的突變體基因的質(zhì)粒。
[0012] 本發(fā)明還提供了一種木聚糖酶突變體,是氨基酸序列為SEQ ID NO :3的木聚糖酶 的第34位氨基酸由Asn變?yōu)镃ys,第187位氨基酸由Thr變?yōu)镃ys。
[0013] 所述突變體的氨基酸序列為SEQ ID NO :7,其一種編碼基因的核酸序列為SEQ ID NO :8〇
[0014] 本發(fā)明還包括攜帶有編碼序列為SEQ ID NO :8的突變體基因的質(zhì)粒。
[0015] 本發(fā)明還提供了一種宿主細胞,包含攜帶有木聚糖酶突變體基因的質(zhì)粒。
[0016] 所述宿主細胞優(yōu)選為畢赤酵母(Pichia pastoris)。
[0017] 本發(fā)明提供的野生型木聚糖酶XynPF在65°C條件下處理5min后僅殘留28%左右 的酶活,在75°C、80°C條件下處理5min后酶活殘留率幾乎為0 ;而含S103Y單點突變的木聚 糖酶突變體XynTl在65°C條件下處理5min后能保持50%以上的酶活,在75°C、80°C條件下 處理5min后仍能分別保持35%、30%的酶活;而含S103Y/T175C/S184C三點突變的木聚糖 酶突變體XynT3. 1和含S103Y/N34C/T187C三點突變的木聚糖酶突變體XynT3. 2在65°C條 件下處理5min后均能保持90%以上的酶活,且在75°C、80°C條件下處理5min后仍能分別 保持45%、35%左右的酶活。此外,與野生型相比,本發(fā)明篩選到的木聚糖酶突變體XynTl, XynT3. 1和XynT3. 2的最適作用pH值未發(fā)生變化,仍為5. 5,但其耐熱性均得到顯著提高, 因此更適合在飼料中的廣泛應用。
【具體實施方式】:
[0018] 本發(fā)明用到了遺傳工程和分子生物學領(lǐng)域使用的常規(guī)技術(shù)和方法,例如 MOLECULAR CL0NING:A LABORATORY MANUAL, 3nd Ed. (Sambrook,2001)和 CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY(Ausubel, 2003)中所記載的方法。這些一般性參考文獻 提供了本領(lǐng)域技術(shù)人員已知的定義和方法。但是,本領(lǐng)域的技術(shù)人員可以在本發(fā)明所記載 的技術(shù)方案的基礎上,采用本領(lǐng)域其它常規(guī)的方法、實驗方案和試劑,而不限于本發(fā)明具體 實施例的限定。
[0019] 實驗材料和試劑:
[0020] 菌株與載體:大腸桿菌DH5a、畢赤酵母GS115、載體pPIC9k、Amp、G418購自 Invitrogen 公司。
[0021] 酶與試劑盒:PCR酶及連接酶購買自Takara公司,限制性內(nèi)切酶購自Fermentas 公司,質(zhì)粒提取試劑盒及膠純化回收試劑盒購自Omega公司,GeneMorph II隨機誘變試劑 盒購自北京博邁斯生物科技有限公司。
[0022] 培養(yǎng)基配方:
[0023] 大腸桿菌培養(yǎng)基(LB培養(yǎng)基):0. 5%酵母提取物,1%蛋白胨,1% NaCL,pH7. 0);
[0024] LB-AMP培養(yǎng)基:LB培養(yǎng)基加100 μ g/mL氨芐青霉素;
[0025] 酵母培養(yǎng)基(YH)培養(yǎng)基):1%酵母提取物、2%蛋白胨2%葡萄糖;
[0026] 酵母篩選培養(yǎng)基(MD培養(yǎng)基):2%蛋白胨、2%瓊脂糖;
[0027] BMGY培養(yǎng)基:2%蛋白胨,1%酵母提取物,IOOmM磷酸鉀緩沖液(pH6.0),l.34% YNB,4X10-5生物素,1 %甘油;
[0028] BMMY培養(yǎng)基:2%蛋白胨,1%酵母提取物,IOOmM磷酸鉀緩沖液(pH6.0),l.34% YNB,4X10-5 生物素,0. 5% 甲醇。
[0029] 下面結(jié)合實施例對本發(fā)明進行詳細的描述。
[0030] 實施例1木聚糖酶基因的擴增
[0031] 為了從繩狀青霉中擴增得到木聚糖酶基因,設計PCR引物XynPF-Fl、XynPF-Rl如 下:
[0032] XynPF-FI :GCTGTTACATCCAACGAGACCGG
[0033] XynPF-Rl :TTAAGAGACGGTAATAGTAGAAG
[0034] 以該繩狀青霉基因組為模板,以上述引物進行PCR擴增,膠回收PCR產(chǎn)物,連接 pEASY-T載體,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5a中,挑取正確的轉(zhuǎn)化子進行測序。將測序正確的轉(zhuǎn)化子 編碼的木聚糖酶命名為XynPF,其氨基酸序列為SEQ ID NO :1,核苷酸序列為SEQ ID NO :2。
[0035] 實施例2木聚糖酶突變體基因的擴增及合成
[0036] 為了提高木聚糖酶XynPF的耐熱性,通過定向進化技術(shù)對該酶進行了大量突變的 篩選,設計PCR引物XynPF-F2、XynPF-R2如下:
[0037] XynPF-F2 :GGCGAATTCGCTGTTACATCCAACGAGACCGG (下劃線為限制性內(nèi)切酶 EcoRI 識別位點);
[0038] XynPF-R2 :ATAGCGGCCGCTTAAGAGACGGTAATAGTAGAAG(下劃線為限制性內(nèi)切酶 NotI 識別位點);
[0039] 以XynPF基因為模板,以上述引物用GeneMorph II隨機突變PCR試劑盒 (Stratagene)進行PCR擴增,膠回收PCR產(chǎn)物,EcoRI、NotI進行酶切處理后與經(jīng)同樣酶切 后的pET21a載體連接,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21 (DE3)中,涂布于LB+Amp平板,37°C倒置培養(yǎng), 待轉(zhuǎn)化子出現(xiàn)后,用牙簽逐個挑至96孔板,每個孔中加入150ul含有0.1 mM IPTG的LB+Amp 培養(yǎng)基,37°C 220rpm培養(yǎng)6h左右,離心棄上清,菌體用緩沖液重懸,反復凍融破壁,獲得含 有木聚糖酶的大腸桿菌細胞裂解液。
[0040] 分別取出30ul裂解液至兩塊新的96孔板,其中一塊于75°C處理5min后,兩塊96 孔板都加入30ul底物,于37°C反應30min后,DNS法測定生成的還原糖,不同的突變子高 溫處理后保持的活性不同。實驗結(jié)果表明,有些突變對木聚糖酶的耐熱性沒有影響,有些突 變甚至使其耐熱性或酶活變得更差了;另外還有些突變,雖然能提高木聚糖酶對溫度的耐 受性,但突變后其酶學性質(zhì)發(fā)生了顯著的變化,這些均不符合要求。最終,申請人篩選到既 能顯著提高木聚糖酶的耐熱性,又不會影響其酶活及原有酶學性質(zhì)的突變位點及位點的組 合:S103Y單點突變體以及S103Y/T175C/S184C和S103Y/N34C/T187C兩個三點突變體。 [0041] 含S103Y單點突變的木聚糖酶突變體,命名為XynTl,其氨基酸序列為SEQ ID NO : 3,編碼核苷酸序列為SEQ ID NO :4。
[0042] 含S103Y、T175C和S184C的三點突變體,命名為XynT3. 1,其氨基酸序列為SEQ ID NO :5,編碼核苷酸序列為SEQ ID NO :6。
[0043] 含S103Y、N34C和T187C的三點突變體,命名為XynT3. 2,其氨基酸序列為SEQ ID NO :7,編碼核苷酸序列為SEQ ID NO :8。
[0044] 上述核苷酸序列SEQ ID NO :4、SEQ ID NO :6和SEQ ID NO :8由上海捷瑞生物公 司合成。
[0045] 用引物XynPF-F2、XynPF-R2對上述三個突變體進行PCR擴增,引物兩端引入EcoR I、