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分子動(dòng)力學(xué)模擬的作用力分析方法、裝置、和計(jì)算機(jī)設(shè)備

文檔序號(hào):39526879發(fā)布日期:2024-09-27 17:11閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種分子動(dòng)力學(xué)模擬的作用力分析方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述基于所述當(dāng)前進(jìn)程的本地原子的數(shù)目,確定所述當(dāng)前進(jìn)程適配的各組鄰接表的組數(shù)、以及所有組鄰接表的分配內(nèi)存值,包括:

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于,所述基于所述當(dāng)前進(jìn)程適配的各組鄰接表的組數(shù),將各所述本地原子進(jìn)行分組處理,得到各原子組,包括:

4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述在各所述原子組中,隨機(jī)篩選目標(biāo)原子組、以及目標(biāo)原子組中的各本地原子對(duì)應(yīng)的鄰居列表之后,還包括:

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法,其特征在于,所述基于所述目標(biāo)原子組中的各本地原子對(duì)應(yīng)的鄰居列表、以及所有組鄰接表的分配內(nèi)存值,通過鄰接表構(gòu)建策略,構(gòu)建目標(biāo)組鄰接表,包括:

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的方法,其特征在于,所述基于每個(gè)目標(biāo)組鄰接表、每個(gè)目標(biāo)鄰接表對(duì)應(yīng)的各目標(biāo)原子組、以及各所述本地原子的三維坐標(biāo),計(jì)算所述當(dāng)前進(jìn)程的各本地原子的分子受力結(jié)果,包括:

7.一種分子動(dòng)力學(xué)模擬的作用力分析裝置,其特征在于,所述裝置包括:

8.一種計(jì)算機(jī)設(shè)備,包括存儲(chǔ)器和處理器,所述存儲(chǔ)器存儲(chǔ)有計(jì)算機(jī)程序,其特征在于,所述處理器執(zhí)行所述計(jì)算機(jī)程序時(shí)實(shí)現(xiàn)權(quán)利要求1至6中任一項(xiàng)所述的方法的步驟。

9.一種計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì),其上存儲(chǔ)有計(jì)算機(jī)程序,其特征在于,所述計(jì)算機(jī)程序被處理器執(zhí)行時(shí)實(shí)現(xiàn)權(quán)利要求1至6中任一項(xiàng)所述的方法的步驟。

10.一種計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品,包括計(jì)算機(jī)程序,其特征在于,該計(jì)算機(jī)程序被處理器執(zhí)行時(shí)實(shí)現(xiàn)權(quán)利要求1至6中任一項(xiàng)所述的方法的步驟。


技術(shù)總結(jié)
本申請(qǐng)涉及一種分子動(dòng)力學(xué)模擬的作用力分析方法、裝置、和計(jì)算機(jī)設(shè)備。所述方法包括:獲取當(dāng)前進(jìn)程的本地原子的數(shù)目和其對(duì)應(yīng)的鄰居列表,并基于所述當(dāng)前進(jìn)程的本地原子的數(shù)目,確定所述當(dāng)前進(jìn)程適配的各組鄰接表的組數(shù)和分配內(nèi)存值;將各所述本地原子進(jìn)行分組處理,得到各原子組,并基于各所述目標(biāo)原子組中的各本地原子對(duì)應(yīng)的鄰居列表、以及所有組鄰接表的分配內(nèi)存值,通過鄰接表構(gòu)建策略,構(gòu)建各目標(biāo)組鄰接表;基于每個(gè)目標(biāo)組鄰接表、每個(gè)目標(biāo)鄰接表對(duì)應(yīng)的各目標(biāo)原子組、以及各所述本地原子的三維坐標(biāo),計(jì)算所述當(dāng)前進(jìn)程的各本地原子的分子受力結(jié)果。采用本方法能夠提升分子動(dòng)力學(xué)模擬各本地原子的分子受力結(jié)果的效率。

技術(shù)研發(fā)人員:高萍,柳嘉,楊廣文
受保護(hù)的技術(shù)使用者:清華大學(xué)
技術(shù)研發(fā)日:
技術(shù)公布日:2024/9/26
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