專利名稱:副溶血性弧菌多重定量pcr檢測(cè)試劑盒及檢測(cè)方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及一種副溶血性弧菌毒素基因多重定量PCR檢測(cè)試劑盒及其檢測(cè)方法。
背景技術(shù):
副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus, Vp)是一種革蘭陰性嗜鹽性弧菌,是弧菌屬內(nèi)比較重要的致病菌之一,主要存在于近海岸的魚(yú)貝類(lèi)等海產(chǎn)品、海水及其沉積物中, 是沿海地區(qū)夏、秋季食物中毒和急性腹瀉的主要病原菌,可引起急性胃腸道癥狀。目前副溶血性弧菌的發(fā)病率已居各種微生物食源性疾病之首,并明顯高于位居第二的沙門(mén)菌食物中毒,尤其在沿海地區(qū)的發(fā)病率更是居高不下。據(jù)報(bào)道,副溶血性弧菌菌體攜帶多種毒素基因,這些基因表達(dá)的毒素蛋白是造成食物中毒的主要原因。傳統(tǒng)的副溶血性弧菌的鑒定方法主要包括分離培養(yǎng)、生化試驗(yàn)、血清分型等,因其操作復(fù)雜、周期長(zhǎng),已不能滿足目前實(shí)際工作(傳染病現(xiàn)場(chǎng)診斷、流行趨勢(shì)分析等)的需要,而且對(duì)于毒素的診斷多使用經(jīng)典細(xì)胞學(xué)手段,無(wú)法實(shí)現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)化判定。因此建立一種快速、敏感、特異的檢測(cè)和鑒定相關(guān)毒素的方法對(duì)預(yù)防和控制副溶血性弧菌食物中毒及其早期診斷具有十分重要的意義。副溶血弧菌的tdh (耐熱直接溶血毒素)、tlh (不耐熱溶血毒素)、toxR(毒素表達(dá)調(diào)控蛋白基因)和 trh (耐熱直接相關(guān)溶血毒素)是目前報(bào)道該菌攜帶的主要毒素基因,與海產(chǎn)品食物中毒具有密切關(guān)系,準(zhǔn)確和快速的明確病原是有效預(yù)防傳染病大面積發(fā)生和傳播的前提和基礎(chǔ)。 實(shí)時(shí)熒光定量PCR是近幾年發(fā)展起來(lái)的新型檢測(cè)技術(shù),具有快速、準(zhǔn)確、可定量等優(yōu)勢(shì),其中TaqMan探針、TaqMan-MGB探針、復(fù)合探針、染料及分子信標(biāo)等方法目前已成功應(yīng)用到病原菌分子診斷領(lǐng)域。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明目的是提供一種副溶血性弧菌四種相關(guān)毒素基因的多重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)試劑盒及檢測(cè)方法,能夠?qū)Ω比苎曰【姆N相關(guān)毒素基因進(jìn)行準(zhǔn)確、有效地甄別。本發(fā)明采用的技術(shù)方案收是一種副溶血性弧菌毒素基因多重定量PCR檢測(cè)試劑盒,主要包括特異性引物和探針以及PCR反應(yīng)試劑,所述特異性引物和探針由副溶血性弧菌耐熱直接溶血素基因(tdh)、 不耐熱溶血素基因(tlh)、毒素表達(dá)調(diào)控蛋白基因(toxR)和耐熱相關(guān)溶血素基因(trh)的特異性引物和探針組成tdh 上游引物5' -TCTGCTTTTGAGCTTCCATCTGT-3';tdh 下游引物5' -TGACCGGAGCTTGGGTATTAA-3';tdh熒光探針5' -FAM-CCTGCCCCCGGTTCTGATGAGATATT-BHQ1-3';tlh 上游引物5' -CCAGAAGAGCACGGTTTC-3';tlh 下游引物5' -GGTGTACATGTAATCGACAGACGAT-3';tlh熒光探針
5' -VIC-CGATCCTTGTTTGGACATCAACCGCT-BHQ1-3';
toxR 上游引物5' -TTCCGTCAGATTGGTGAGTATCAG-3';
toxR 下游引物5' -TGCTCAATAGAAGGCAACCAGTT-3';
toxR突光探針
5' -R0X-TGATGACACCTGTAAATCACCCGCAAATC-BHQ2-3';
trh 上游引物5' -TGCTATTGGCTTCGATATTTTCAGTA-3';
trh 下游引物5' -CGAACCTGGAGAAGGAAAAGGT-3';
trh突光探針
5' -CY5-CTAAATCATTCGCGATTGACCTGCCATC-BHQ2-3';
其中FAM、VIC、ROX和CY5為不同波長(zhǎng)的熒光報(bào)告基團(tuán),BHQl和BHQ2為熒光淬滅基團(tuán)。
本發(fā)明的關(guān)鍵在于擴(kuò)增引物的設(shè)計(jì),試劑盒中其他組成,可按本領(lǐng)域常規(guī)進(jìn)行選
擇。PCR反應(yīng)試劑包括PCR緩沖液、脫氧三磷酸核苷混合物和DNA聚合酶等,其中PCR緩沖液可采用市購(gòu)商品,也可自行配制,例如將Tris-HCl、KC1、MgCl2等按比例混合進(jìn)行配制, 進(jìn)行檢測(cè)時(shí),將PCR反應(yīng)試劑和擴(kuò)增引物和探針混合,再加入待測(cè)樣品或?qū)φ掌?,即可進(jìn)行 PCR擴(kuò)增反應(yīng)。為達(dá)到定量檢測(cè)的目的,所述試劑盒還可包括副溶血性弧菌耐熱直接溶血素基因 (tdh)、不耐熱溶血素基因(tlh)、毒素表達(dá)調(diào)控蛋白基因(toxR)和耐熱相關(guān)溶血素基因 (trh)的標(biāo)準(zhǔn)品,所述標(biāo)準(zhǔn)品序列如下tdh 標(biāo)準(zhǔn)品tctgcttttga gcttccatct gtcccttttc ctgcccccg gttctgatga gatattgttt gttgttcgag atacaacttt taatacccaa gctccggtca ;tlh標(biāo)準(zhǔn)品 ccagaagagc acggtttcgt gaacgcgagt gatccttgtt tggacatcaa ccgctcatcg tctgtcgatt acatgtacacc ;toxR 標(biāo)準(zhǔn) 品ttccgt cagattggtg agtatcagaa cgtaccagtg atgacacctg taaatcaccc gcaaatcaac aactggttgc cttctattga gca ;trh 標(biāo)準(zhǔn) 品tgctattg gcttcgatat tttcagtatc taaatcattc gcgattgacc taccatccat accttttcct tctccaggtt eg。本發(fā)明還涉及一種副溶血性弧菌毒素基因多重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)方法,所述方法包括(I)提取待測(cè)樣品DNA ;(2)以待測(cè)樣品DNA為模板,加入副溶血性弧菌耐熱直接溶血素基因(tdh)、不耐熱溶血素基因(tlh)、毒素表達(dá)調(diào)控蛋白基因(toxR)和耐熱相關(guān)溶血素基因(trh)的特異性引物和探針,PCR緩沖液,脫氧三磷酸核苷混合物和DNA聚合酶配制PCR反應(yīng)液,進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,以非靶細(xì)菌為陰性對(duì)照于相同條件下進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以閾值線剛好超過(guò)正常陰性對(duì)照的最高點(diǎn)設(shè)定閾值線;若待測(cè)樣品熒光增長(zhǎng)曲線超過(guò)閾值線,并呈良好的對(duì)數(shù)增長(zhǎng),則判斷為陽(yáng)性;所述特異性引物和探針如前所述。為達(dá)到定量檢測(cè)的效果,所述方法可同時(shí)以副溶血性弧菌耐熱直接溶血素基因 (tdh)、不耐熱溶血素基因(tlh)、毒素表達(dá)調(diào)控蛋白基因(toxR)和耐熱相關(guān)溶血素基因 (trh)標(biāo)準(zhǔn)品的梯度濃度的DNA溶液進(jìn)行熒光PCR檢測(cè),分別根據(jù)拷貝濃度的對(duì)數(shù)值與各標(biāo)準(zhǔn)品Ct值的關(guān)系繪制得到標(biāo)準(zhǔn)曲線,測(cè)得樣品DNA的Ct值后,對(duì)照相應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得樣品 DNA中相應(yīng)基因的拷貝濃度;所述標(biāo)準(zhǔn)品序列如前所述。所述PCR反應(yīng)條件如下95°C預(yù)變性5分鐘,95°C 15秒、60°C 45秒進(jìn)行40個(gè)循環(huán)
擴(kuò)增,最后置4°C。熒光采集在每個(gè)循環(huán)的退火溫度時(shí)進(jìn)行。本發(fā)明的有益效果主要體現(xiàn)在本發(fā)明針對(duì)副溶血弧菌毒素基因提供了一種快速、敏感、特異的多重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)試劑盒和檢測(cè)方法,為及時(shí)控制副溶血性弧菌食物中毒及其早期診斷提供了基礎(chǔ)。
圖I 為標(biāo)準(zhǔn)品檢測(cè)結(jié)果;1 7 分別為 30ng、3ng、0. 3ng、30pg、3pg、0. 3pg、30fg/ uL標(biāo)準(zhǔn)品;圖2為四種毒素基因?qū)?yīng)的標(biāo)準(zhǔn)曲線'Y :對(duì)應(yīng)的Ct值;X :基因的質(zhì)量數(shù)。圖3為陽(yáng)性菌株DNA檢測(cè)結(jié)果;1為tdh基因,2為toxR基因,3為tlh基因,4為 trh基因。
具體實(shí)施例方式下面結(jié)合具體實(shí)施例對(duì)本發(fā)明進(jìn)行進(jìn)一步描述,但本發(fā)明的保護(hù)范圍并不僅限于此實(shí)施例I :標(biāo)準(zhǔn)品的犾得I、材料pGEM-T-Easy克隆系統(tǒng)、PCR相關(guān)試劑及Taq DNA聚合酶購(gòu)自美國(guó)Promega公司, 377 型測(cè)序儀(ABI 公司)、Bio-Rad icycler PCR 儀(Bio-Rad 公司)、ABI7500 fast 定量 PCR儀(ABI公司)。2、引物及探針設(shè)計(jì)與合成以副溶血性弧菌tdh(耐熱直接溶血素)基因(Genbank注冊(cè)號(hào)為⑶971653)、 tlh (不耐熱溶血素)基因(Genbank注冊(cè)號(hào)為AY829372)、toxR(毒素表達(dá)調(diào)控蛋白)基因(Genbank注冊(cè)號(hào)為JN188468)和trh(耐熱相關(guān)溶血素)基因(Genbank注冊(cè)號(hào)為 DQ359749)為模板,使用Primer Express TM(V3. 0,美國(guó)ABI公司)軟件分析TaqMan引物和探針位點(diǎn),從中選擇最佳組合。由上海輝睿生物科技有限公司進(jìn)行引物和探針的合成與純化。3、陽(yáng)性參考品的制備以副溶血性弧菌標(biāo)準(zhǔn)株(ATCC 17802)做為模板,用DNA提取試劑提取基因組DNA, 用分光光度計(jì)測(cè)定濃度,取I. O μ L (50ng/ μ L)做PCR反應(yīng)模板,分別用上述的上下游引物在Bio-Rad icycler PCR儀上進(jìn)行PCR擴(kuò)增PCR反應(yīng)液組成如下2 x PCR bufferlO.OfiL
上游引物(10pM)l^iL
下游引物(10pM)l^iL
DNA 聚合酶(5U/pL )0.2^iL
dNTPs (各 250mM)1.6^iL (dATP、dTTP、dCTP、dGTP 物質(zhì)的量比 1: 1: 1: 1)
基因組 DNA ( 50ng/^iL )1 ^iL去離子水補(bǔ)足至20 U L。PCR條件為94°C 5分鐘變性,94°C 30秒、60°C 30秒、72°C 30秒進(jìn)行35個(gè)循環(huán)擴(kuò) 增,最后于72°C延伸5分鐘后置4°C。PCR產(chǎn)物經(jīng)1. 5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后即用克隆系統(tǒng)插入pGEM-T-Easy克隆載 體,并將陽(yáng)性克隆經(jīng)測(cè)序驗(yàn)證。tdh (耐熱直接溶血素)、tlh(不耐熱溶血素)、toxR(毒素 表達(dá)調(diào)控蛋白)和trh(耐熱相關(guān)溶血素)基因?qū)?yīng)的片段長(zhǎng)度分別為100bp、81bp、89bp 和80bp片段,即為標(biāo)準(zhǔn)品,測(cè)定濃度并換算成質(zhì)量/體積,分別命名為質(zhì)粒tdh、tlh、toxR 和 trho4、結(jié)果經(jīng)測(cè)序,上述設(shè)計(jì)標(biāo)準(zhǔn)品完全與預(yù)期相符,回收的標(biāo)準(zhǔn)品片段序列如下tdh (耐熱直接溶血素)基因標(biāo)準(zhǔn)品序列tctgcttttga gcttccatct gtcccttttc ctgcccccg gttctgatga gatattgttt gttgttcgag atacaacttt taatacccaa gctccggtca。tlh(不耐熱溶血素)基因標(biāo)準(zhǔn)品序列 ccagaagagc acggtttcgt gaacgcgagt gatccttgtt tggacatcaa ccgctcatcg tctgtcgatt acatgtacacc。toxR(毒素表達(dá)調(diào)控蛋白)基因標(biāo)準(zhǔn)品序列ttccgt cagattggtg agtatcagaa cgtaccagtg atgacacctg taaatcaccc gcaaatcaac aactggttgc cttctattga gca。trh(耐熱相關(guān)溶血素)基因標(biāo)準(zhǔn)品序列tgctattg gcttcgatat tttcagtatc taaatcattc gcgattgacc taccatccat accttttcct tctccaggtt eg。實(shí)施例2 :多重?zé)晒舛縋CR法檢測(cè)副溶血性弧菌四種相關(guān)毒素基因方法的建立1、質(zhì)粒DNA及其他細(xì)菌DNA提取采用基因組DNA提取試劑提取細(xì)菌基因組DNA,采用質(zhì)粒DNA提取試劑盒提取陽(yáng) 性質(zhì)粒DNA,分別取1. Oil L(50ng/ii L)做模板,用檢測(cè)用上下游引物在ABI7500 fast定量 PCR儀(ABI公司)上進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR反應(yīng)液組成如下IOx PCR buffer5 · O pL
tdh 上游引物(ΙΟμΜ)l.OpL
tdh 下游引物(ΙΟμΜ)2ΛμL
tlh 上游引物(ΙΟμΜ)2ΛμL
tlh 下游引物(ΙΟμΜ)2ΛμL
toxR 上游引物(ΙΟμΜ)2·4μ!ν
toxR 下游引物(ΙΟμΜ)2ΛμΙ
trh 上游引物(ΙΟμΜ)2ΛμL
trh 下游引物(ΙΟμΜ)2ΛμL
tdh 熒光探針(ΙΟμΜ)\ΛμL
tlh 熒光探針(ΙΟμΜ)\ΛμL
toxR 焚;光探針(ΙΟμΜ)\ΛμL
trh 熒光探針(ΙΟμΜ)\ΛμL
DNA 聚合酶(5U/pL )0.5pL
dNTPs (各 250mM)4·0μΙ^
(dATP, dTTP, dCTP、dGTP 物質(zhì)的量比 I: I: I: I)
質(zhì)粒 DNA (tdh、tlh、toxR、trh 各 50ng/pL)或模板 DNA去離子水補(bǔ)足至50 μ LoPCR反應(yīng)條件為95°C預(yù)變性5分鐘,95°C 15秒、60°C 45秒進(jìn)行40個(gè)循環(huán)擴(kuò)增, 最后置4°C,熒光采集在每個(gè)循環(huán)的退火溫度時(shí)進(jìn)行。以非靶細(xì)菌志賀菌(ACCC04121)為陰性對(duì)照于相同條件下進(jìn)行PCR檢測(cè),以閾值線剛好超過(guò)正常陰性對(duì)照的最高點(diǎn)設(shè)定閾值線;若待測(cè)模板熒光增長(zhǎng)曲線超過(guò)閾值線,并呈良好的對(duì)數(shù)增長(zhǎng),則判斷為陽(yáng)性。同時(shí)在相同條件下以不同濃度標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行檢測(cè),并繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。待測(cè)DNA的測(cè)定結(jié)果經(jīng)儀器處理根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算出檢測(cè)副溶血性弧菌含有 tdh (耐熱直接溶血素)、tlh (不耐熱溶血素)、toxR(毒素表達(dá)調(diào)控蛋白)和trh (耐熱相關(guān)溶血素)基因的數(shù)量。以腸出沙門(mén)氏菌(CICC21490)、血性大腸桿菌(EHEC)0157 :H7 (ATCC43889),致病性大腸桿菌(EPEC) (ATCC 43887),腸產(chǎn)毒性大腸桿菌(ETEC) (ATCC35401),腸侵襲性大腸桿菌(EIEC) (ATCC 43893),創(chuàng)傷弧菌(CICC 10383)等按照上述方法進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果均為陰性,說(shuō)明本發(fā)明方法特異性好。2.檢測(cè)結(jié)果標(biāo)準(zhǔn)品檢測(cè)結(jié)果參見(jiàn)圖1,標(biāo)準(zhǔn)曲線參見(jiàn)圖2,其中tdh基因標(biāo)準(zhǔn)方程(FAM) Y = -3. 5782Χ lgX+38. 406, R2 = O. 9695 ;toxR 基因標(biāo)準(zhǔn)方程(ROX) Y = -3. 9223XlgX+39. 3586, R2 = O. 9819 ;tlh 基因標(biāo)準(zhǔn)方程 (VIC) Y = -3. 6574XlgX+41. 3161, R2 = O. 9889 ;trh 基因標(biāo)準(zhǔn)方程(CY5) Y =-3. 7139XlgX+40. 0543,R2 = 0. 9987。陽(yáng)性菌株DNA檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)圖3 ;1為tdh基因,Ct值為26. 05,基因濃度為2. 84pg/ μ L ;2為toxR基因,Ct值為28. 30,基因濃度為O. 67pg/μ L ;3為tlh基因,Ct值為29. 62, 基因濃度為I. 59pg/ μ L ;4為trh基因,Ct值為29. 61,基因濃度為O. 65pg/y L。
權(quán)利要求
1.一種副溶血性弧菌毒素基因多重定量PCR檢測(cè)試劑盒,主要包括特異性引物和探針以及PCR反應(yīng)試劑,所述特異性引物和探針由副溶血性弧菌耐熱直接溶血素基因(tdh)、不耐熱溶血素基因(tlh)、毒素表達(dá)調(diào)控蛋白基因(toxR)和耐熱相關(guān)溶血素基因(trh)的特異性引物和探針組成tdh 上游引物5' -TCTGCTTTTGAGCTTCCATCTGT-3'; tdh 下游引物5' -TGACCGGAGCTTGGGTATTAA-3'; tdh突光探針5' -FAM-CCTGCCCCCGGTTCTGATGAGATATT-BHQ1-3'; tlh 上游引物5' -CCAGAAGAGCACGGTTTC-3'; tIh 下游引物5' -GGTGTACATGTAATCGACAGACGAT-3'; tlh突光探針5' -VIC-CGATCCTTGTTTGGACATCAACCGCT-BHQ1-3'; toxR 上游引物5' -TTCCGTCAGATTGGTGAGTATCAG-3'; toxR 下游引物5' -TGCTCAATAGAAGGCAACCAGTT-3'; toxR突光探針5' -R0X-TGATGACACCTGTAAATCACCCGCAAATC-BHQ2-3'; trh 上游引物5' -TGCTATTGGCTTCGATATTTTCAGTA-3'; trh 下游引物5' -CGAACCTGGAGAAGGAAAAGGT-3'; trh突光探針5' -CY5-CTAAATCATTCGCGATTGACCTGCCATC-BHQ2-3';其中FAM、VIC、R0X和CY5為不同波長(zhǎng)的熒光報(bào)告基團(tuán),BHQl和BHQ2為熒光淬滅基團(tuán)。
2.如權(quán)利要求I所述的試劑盒,其特征在于所述試劑盒還包括副溶血性弧菌耐熱直接溶血素基因(tdh)、不耐熱溶血素基因(tlh)、毒素表達(dá)調(diào)控蛋白基因(toxR)和耐熱相關(guān)溶血素基因(trh)的標(biāo)準(zhǔn)品,所述標(biāo)準(zhǔn)品序列如下tdh 標(biāo)準(zhǔn) 品tctgcttttga gcttccatct gtcccttttc ctgcccccg gttctgatga gatattgttt gttgttcgag atacaacttt taatacccaa gctccggtca ;tlh 標(biāo)準(zhǔn) 品ccagaagagc acggtttcgt gaacgcgagt gatccttgtt tggacatcaa ccgctcatcg tctgtcgatt acatgtacacc ;toxR 標(biāo)準(zhǔn)品ttccgt cagattggtg agtatcagaa cgtaccagtg atgacacctg taaatcaccc gcaaatcaac aactggttgc cttctattga gca ;trh標(biāo)準(zhǔn)品tgctattg gcttcgatat tttcagtatc taaatcattc gcgattgacc taccatccat accttttcct tctccaggtt eg。
3.一種副溶血性弧菌毒素基因多重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)方法,所述方法包括(1)提取待測(cè)樣品DNA;(2)以待測(cè)樣品DNA為模板,加入副溶血性弧菌耐熱直接溶血素基因(tdh)、不耐熱溶血素基因(tlh)、毒素表達(dá)調(diào)控蛋白基因(toxR)和耐熱相關(guān)溶血素基因(trh)的特異性引物和探針,PCR緩沖液,脫氧三磷酸核苷混合物和DNA聚合酶配制PCR反應(yīng)液,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以非靶細(xì)菌為陰性對(duì)照于相同條件下進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以閾值線剛好超過(guò)正常陰性對(duì)照的最高點(diǎn)設(shè)定閾值線;若待測(cè)樣品熒光增長(zhǎng)曲線超過(guò)閾值線,并呈良好的對(duì)數(shù)增長(zhǎng),則判斷為陽(yáng)性;所述特異性引物和探針如下tdh 上游引物5' -TCTGCTTTTGAGCTTCCATCTGT-3'; tdh 下游引物5' -TGACCGGAGCTTGGGTATTAA-3'; tdh突光探針5' -FAM-CCTGCCCCCGGTTCTGATGAGATATT-BHQ1-3'; tIh 上游引物5' -CCAGAAGAGCACGGTTTC-3'; tIh 下游引物5' -GGTGTACATGTAATCGACAGACGAT-3'; tlh突光探針5' -VIC-CGATCCTTGTTTGGACATCAACCGCT-BHQ1-3'; toxR 上游引物5' -TTCCGTCAGATTGGTGAGTATCAG-3'; toxR 下游引物5' -TGCTCAATAGAAGGCAACCAGTT-3'; toxR突光探針5' -R0X-TGATGACACCTGTAAATCACCCGCAAATC-BHQ2-3'; trh 上游引物5' -TGCTATTGGCTTCGATATTTTCAGTA-3'; trh 下游引物5' -CGAACCTGGAGAAGGAAAAGGT-3'; trh突光探針5' -CY5-CTAAATCATTCGCGATTGACCTGCCATC-BHQ2-3';其中FAM、VIC、R0X和CY5為不同波長(zhǎng)的熒光報(bào)告基團(tuán),BHQl和BHQ2為熒光淬滅基團(tuán)。
4.如權(quán)利要求3所述的方法,其特征在于所述方法同時(shí)以副溶血性弧菌耐熱直接溶血素基因(tdh)、不耐熱溶血素基因(tlh)、毒素表達(dá)調(diào)控蛋白基因(toxR)和耐熱相關(guān)溶血素基因(trh)標(biāo)準(zhǔn)品的梯度濃度的DNA溶液進(jìn)行熒光PCR檢測(cè),分別根據(jù)拷貝濃度的對(duì)數(shù)值與各標(biāo)準(zhǔn)品Ct值的關(guān)系繪制得到標(biāo)準(zhǔn)曲線,測(cè)得樣品DNA的Ct值后,對(duì)照相應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得樣品DNA中相應(yīng)基因的拷貝濃度;所述標(biāo)準(zhǔn)品序列如下tdh 標(biāo)準(zhǔn) 品tctgcttttga gcttccatct gtcccttttc ctgcccccg gttctgatga gatattgttt gttgttcgag atacaacttt taatacccaa gctccggtca ;tlh 標(biāo)準(zhǔn) 品ccagaagagc acggtttcgt gaacgcgagt gatccttgtt tggacatcaa ccgctcatcg tctgtcgatt acatgtacacc ;toxR 標(biāo)準(zhǔn)品ttccgt cagattggtg agtatcagaa cgtaccagtg atgacacctg taaatcaccc gcaaatcaac aactggttgc cttctattga gca ;trh標(biāo)準(zhǔn)品tgctattg gcttcgatat tttcagtatc taaatcattc gcgattgacc taccatccat accttttcct tctccaggtt eg。
5.如權(quán)利要求3或4所述的方法,其特征在于所述PCR反應(yīng)條件如下95°C預(yù)變性5分鐘,95°C 15秒、60°C 45秒進(jìn)行40個(gè)循環(huán)擴(kuò)增,最后置4°C。
全文摘要
本發(fā)明提供了一種副溶血性弧菌毒素基因多重定量PCR檢測(cè)試劑盒及檢測(cè)方法。所述試劑盒主要包括特異性引物和探針以及PCR反應(yīng)試劑,所述特異性引物和探針由副溶血性弧菌耐熱直接溶血素基因(tdh)、不耐熱溶血素基因(tlh)、毒素表達(dá)調(diào)控蛋白基因(toxR)和耐熱相關(guān)溶血素基因(trh)的特異性引物和探針組成。本發(fā)明針對(duì)副溶血弧菌毒素基因提供了一種快速、敏感、特異的多重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)試劑盒和檢測(cè)方法,為及時(shí)控制副溶血性弧菌食物中毒及其早期診斷提供了基礎(chǔ)。
文檔編號(hào)C12Q1/06GK102605055SQ20121004206
公開(kāi)日2012年7月25日 申請(qǐng)日期2012年2月23日 優(yōu)先權(quán)日2012年2月23日
發(fā)明者葉菊蓮, 張政, 王復(fù)甦, 羅蕓, 金大智 申請(qǐng)人:浙江省疾病預(yù)防控制中心