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一種免疫組庫數(shù)據(jù)分析方法及終端的制作方法

文檔序號:9376069閱讀:640來源:國知局
一種免疫組庫數(shù)據(jù)分析方法及終端的制作方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明涉及計(jì)算機(jī)技術(shù)領(lǐng)域,尤其涉及一種免疫組庫數(shù)據(jù)分析方法及終端。
【背景技術(shù)】
[0002]免疫組庫包括個(gè)體內(nèi)的所有特異性不同的T淋巴細(xì)胞和B淋巴細(xì)胞克隆總和。T細(xì)胞受體(TCR)和B細(xì)胞受體(BCR)是特異性識別抗原和介導(dǎo)免疫應(yīng)答的分子,TCR/BCR的多樣性直接反應(yīng)了機(jī)體免疫應(yīng)答的狀態(tài)。免疫組庫在疫苗和醫(yī)藥的發(fā)展、生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)、最小殘余疾病檢測、自身免疫性疾病的研究以及移植后監(jiān)測等都具有應(yīng)用價(jià)值。在實(shí)際應(yīng)用中,現(xiàn)有的一些平臺在對免疫組庫數(shù)據(jù)進(jìn)行處理時(shí),只能對免疫組庫數(shù)據(jù)做簡單序列的識別,不能對免疫組庫數(shù)據(jù)進(jìn)行更進(jìn)一步的分析(例如,不能進(jìn)行V、D和J基因頻率分布分析,免疫多樣性分析,高克隆CDR3(即互補(bǔ)決定區(qū)3)序列頻率檢驗(yàn),CDR3長度分布分析,V、D和J基因組合分析,Ig鏈類型的比例分析和多Ig鏈類型共同序列分析等),從而不能使用戶全面評估免疫組庫的狀況,深入挖掘免疫組庫與疾病的關(guān)系。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0003]本發(fā)明實(shí)施例公開了一種免疫組庫數(shù)據(jù)分析方法及終端,有利于對免疫組庫的狀況進(jìn)行更全面的評估。
[0004]本發(fā)明實(shí)施例公開了一種免疫組庫數(shù)據(jù)分析方法,所述方法包括:
[0005]接收針對第一樣本的第一分析指令,所述第一分析指令攜帶所述第一樣本的注釋文件,所述注釋文件包括所述第一樣本的免疫組庫數(shù)據(jù)的V基因種類、D基因種類、J基因種類、CDR3序列和Ig鏈的類型,所述第一樣本的免疫組庫數(shù)據(jù)包括多個(gè)TCR基因序列和/或多個(gè)BCR基因序列;
[0006]響應(yīng)所述第一分析指令,根據(jù)所述第一樣本的注釋文件,生成并輸出針對所述第一樣本的整體分析圖,所述整體分析圖包括V基因頻率分布圖、D基因頻率分布圖、J基因頻率分布圖、高克隆CDR3序列的頻率分布圖、CDR3的長度分布圖、免疫多樣性分析圖、VDJ基因組合分析圖、Ig鏈類型比例分布圖和多Ig鏈類型共同序列分析圖中的任意一種或多種分析圖。
[0007]本發(fā)明實(shí)施例還公開了一種終端,所述終端包括:
[0008]接收模塊,用于接收針對第一樣本的第一分析指令,所述第一分析指令攜帶所述第一樣本的注釋文件,所述注釋文件包括所述第一樣本的免疫組庫數(shù)據(jù)的V基因種類、D基因種類、J基因種類、⑶R3序列和Ig鏈的類型,所述第一樣本的免疫組庫數(shù)據(jù)包括多個(gè)TCR基因序列和/或多個(gè)BCR基因序列;
[0009]輸出模塊,用于響應(yīng)所述第一分析指令,根據(jù)所述第一樣本的注釋文件,生成并輸出針對所述第一樣本的整體分析圖,所述整體分析圖包括V基因頻率分布圖、D基因頻率分布圖、J基因頻率分布圖、高克隆CDR3序列的頻率分布圖、CDR3的長度分布圖、免疫多樣性分析圖、VDJ基因組合分析圖、Ig鏈類型比例分布圖和多Ig鏈類型共同序列分析圖中的任意一種或多種分析圖。
[0010]在本發(fā)明實(shí)施例中,終端將接收針對第一樣本的第一分析指令,該第一分析指令攜帶第一樣本的注釋文件;終端將響應(yīng)第一分析指令,根據(jù)第一樣本的注釋文件,生成并輸出針對第一樣本的整體分析圖,該整體分析圖包括V基因頻率分布圖、D基因頻率分布圖、J基因頻率分布圖、高克隆CDR3序列的頻率分布圖、CDR3的長度分布圖、免疫多樣性分析圖、VDJ基因組合分析圖、Ig鏈類型比例分布圖和多Ig鏈類型共同序列分析圖中的任意一種或多種分析圖。可見,實(shí)施本發(fā)明實(shí)施例有利于對免疫組庫的狀況進(jìn)行更全面的評估。
【附圖說明】
[0011]為了更清楚地說明本發(fā)明實(shí)施例中的技術(shù)方案,下面將對實(shí)施例中所需要使用的附圖作簡單地介紹,顯而易見地,下面描述中的附圖是本發(fā)明的一些實(shí)施例,對于本領(lǐng)域普通技術(shù)人員來講,在不付出創(chuàng)造性勞動的前提下,還可以根據(jù)這些附圖獲得其他的附圖。
[0012]圖1是本發(fā)明實(shí)施例公開的一種終端防盜方法的流程示意圖;
[0013]圖2是本發(fā)明實(shí)施例公開的另一種終端防盜方法的流程示意圖;
[0014]圖3是本發(fā)明實(shí)施例公開的另一種終端防盜方法的流程示意圖;
[0015]圖4是本發(fā)明實(shí)施例公開的一種終端的結(jié)構(gòu)示意圖;
[0016]圖5是本發(fā)明實(shí)施例公開的另一種終端的結(jié)構(gòu)示意圖;
[0017]圖6為本發(fā)明實(shí)施例公開的V基因頻率分布圖;
[0018]圖7為本發(fā)明實(shí)施例公開的D基因頻率分布圖;
[0019]圖8為本發(fā)明實(shí)施例公開的J基因頻率分布圖;
[0020]圖9為本發(fā)明實(shí)施例公開的⑶R3的長度分布圖;
[0021]圖10為本發(fā)明實(shí)施例公開的免疫多樣性分析圖;
[0022]圖11為本發(fā)明實(shí)施例公開的Ig鏈類型比例分布圖。
【具體實(shí)施方式】
[0023]下面將結(jié)合本發(fā)明實(shí)施例中的附圖,對本發(fā)明實(shí)施例中的技術(shù)方案進(jìn)行清楚、完整地描述,顯然,所描述的實(shí)施例是本發(fā)明一部分實(shí)施例,而不是全部的實(shí)施例?;诒景l(fā)明中的實(shí)施例,本領(lǐng)域普通技術(shù)人員在沒有做出創(chuàng)造性勞動前提下所獲得的所有其他實(shí)施例,都屬于本發(fā)明保護(hù)的范圍。
[0024]本發(fā)明實(shí)施例公開了一種免疫組庫數(shù)據(jù)分析方法及終端,有利于對免疫組庫的狀況進(jìn)行更全面的評估。以下分別進(jìn)行詳細(xì)說明。
[0025]請參見圖1,圖1為本發(fā)明實(shí)施例公開的一種免疫組庫數(shù)據(jù)分析方法的流程示意圖。如圖1所示,該免疫組庫數(shù)據(jù)分析方法可以包括以下步驟。
[0026]S101、接收針對第一樣本的第一分析指令,該第一分析指令攜帶該第一樣本的注釋文件。
[0027]本發(fā)明實(shí)施例中,終端接收針對第一樣本的第一分析指令,該第一分析指令攜帶該第一樣本的注釋文件。其中,該終端可包括但不限于智能手機(jī)、平板電腦、筆記本電腦、臺式電腦等終端。該終端的操作系統(tǒng)可包括但不限于Android操作系統(tǒng)、1S操作系統(tǒng)、Symbian (塞班)操作系統(tǒng)、Black Berry (黑莓)操作系統(tǒng)和Windows操作系統(tǒng)等等,本發(fā)明實(shí)施例不做限定。
[0028]本發(fā)明實(shí)施例中,第一分析指令攜帶第一樣本的注釋文件,其中,該注釋文件包括第一樣本的免疫組庫數(shù)據(jù)的V基因種類、D基因種類、J基因種類、⑶R3序列和Ig鏈的類型;其中,該第一樣本的免疫組庫數(shù)據(jù)包括多個(gè)TCR基因序列和/或多個(gè)BCR基因序列。
[0029]S102、響應(yīng)該第一分析指令,根據(jù)該第一樣本的注釋文件,生成并輸出針對該第一樣本的整體分析圖,該整體分析圖包括V基因頻率分布圖、D基因頻率分布圖、J基因頻率分布圖、高克隆CDR3序列的頻率分布圖、CDR3的長度分布圖、免疫多樣性分析圖、VDJ基因組合分析圖、Ig鏈類型比例分布圖和多Ig鏈類型共同序列分析圖中的任意一種或多種分析圖。
[0030]本發(fā)明實(shí)施例中,終端接收第一分析指令之后,將響應(yīng)該第一分析指令,根據(jù)該第一樣本的注釋文件,生成并輸出針對該第一樣本的整體分析圖。
[0031]可選的,終端接收第一分析指令之后,將響應(yīng)該第一分析指令,根據(jù)第一樣本的注釋文件中包括的V基因種類,生成并輸出第一樣本的V基因頻率分布圖;該V基因頻率分布圖用于指示第一樣本包括的各V基因種類所具有的數(shù)量,即用于指示第一樣本的V基因有哪些種類,各種類的數(shù)量有多少。如圖6所示,圖6為V基因頻率分布圖。
[0032]可選的,終端接收第一分析指令之后,終端將響應(yīng)該第一分析指令,根據(jù)第一樣本的注釋文件中包括的D基因種類,生成并輸出第一樣本的D基因頻率分布圖;該D基因頻率分布圖用于指示第一樣本包括的各D基因種類所具有的數(shù)量,即用于指示第一樣本的D基因有哪些種類,各種類的數(shù)量有多少。如圖7所示,圖7為D基因頻率分布圖。
[0033]可選的,終端接收第一分析指令之后,終端將響應(yīng)該第一分析指令,根據(jù)第一樣本的注釋文件中包括的J基因種類,生成并輸出第一樣本的J基因頻率分布圖;該J基因頻率分布圖用于指示第一樣本包括的各J基因種類所具有的數(shù)量,即用于
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