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慢性心力衰竭相關的血清miRNA及其應用_2

文檔序號:9271068閱讀:來源:國知局
;在屯、肌組織中表 達出現(xiàn)顯著性差異(包括升高或者降低)的有74個miRNAs,而在外周血中表達出現(xiàn)顯 著性差異(包括升高或者降低)的有599個miRNAs,有25個miRNAs在兩種巧片中的 表達均發(fā)生改變,其中表達均升高的有6種(圖2A) 〇isa-miR-4491、hsa-miR-1285-3p、 hsa-miR-665、hsa-miR-660-:3p、hsa-miR-206 和hsa-miR-1268b),表達均下降的有 2 種(圖 2B)化sa-miR-130a-化和hsa-miR-33〇-化),提不該8種miRNAs均可作為候選生物學標志 物用于慢性屯、力衰竭的診斷。由于循環(huán)miRNAs與組織miRNAs之間的表達分布受多種因 素影響,包括:組織生成、組織降解、組織攝取和組織分泌等,因此可能出現(xiàn)循環(huán)miRNAs和 組織miRNAs表達改變不一致的情況(Oncotarget. 2015Mar10.圧pub址eadofprint], PMID:25860935)。并且由于慢性屯、力衰竭是由多種原因導致的全身多器官受累的疾病,其 他臟器功能也不同程度發(fā)生變化,循環(huán)miRNAs表達量不僅與屯、肌miRNAs表達量密切相關, 其他臟器功能也可能影響外周血miRNAs的表達(ClinChem. 2013Dec;59 (12) : 1742-52J HumHypedens. 2014May;28巧):288-91)。因此只有該8種miRNAs是最可能和慢性屯、力 衰竭特異性相關的。
[0035] 實施例4.巧片結果Real-timePCR驗證
[0036] 在第二個獨立人群中,另外分別收集200例慢性屯、力衰竭患者和200例正常對照 人群外周血,按照上述方式提取RNA。
[0037] 采用廣州銳博公司miRNA檢測試劑盒對上述巧片初篩的在兩種巧片中的表達均 發(fā)生改變的8種miRNAs的表達在第二個獨立人群中進行real-time PCR檢測;
[003引 miRNAs逆轉錄;
[0039] 逆轉錄引物(RTPrimerMix)配置;
[0040] miRNARTPrimer1y1
[0041]U6RTPrimer1y1
[0042] RNasefree&0 78y1
[0043] 逆轉錄反應體系;
[0044] RNAtemplate2yg
[0045]RTPrimerMix4y1
[0046] RNasefree&0upto19y1
[0047]W上體系混勻后,瞬時離心7〇°C解育lOmin后,冰育2min,再加入W下試劑:
[0048] 2XTSreactionbuffer25y1
[0049]TSenzyme2. 5y1
[0050]RNasefree&0 3. 5y1
[0化1] 逆轉錄反應程序:
[0化引 42°C60min,70°ClOmin;停止后4°C備用,產物保存于-20°c。
[005引miRNAsreal-timePCR;
[0054]反應體系;2XSYBRGreenMix9y1 [0化5]RTproduct2y1
[0056] miRNA化風3'(1Primer2y1
[0057] miRNAReversePrimer2y1
[0化引RNase-free&0 5y1
[0059] 反應程序:
[0060] 95°C30sec-巧5°ClOsec-60°C20sec-70°CIsec)X40cycles-Melting Curve
[0061] 結果顯示;其中8種miRNAs,即miR-4491、miR-1285-3p、miR-665、miR-660-化、 miR-206、miR-1268b、miR-130a-化和miR-33〇-化表達的結果與巧片檢測結果一致,兩個慢 性屯、力衰竭患者人群的外周血中miRNAs變化趨勢結果相同(圖3)。表明8種miRNAs可作 為一類慢性屯、力衰竭診斷的候選生物標志物,realtimePCR檢測方法結果可靠。
[0062] 實施例5.差異性表達miRNAs診斷慢性屯、力衰竭的靈敏度
[0063] 收集200例慢性屯、力衰竭患者(取自2007-2014年武漢市醫(yī)院住院患者,每個病 例均由兩個或W上臨床醫(yī)師確診分類)和200例正常對照人群外周血。按照前述方法提取 RNA,并檢測實施例4中篩選出的8種miRNAs的表達,并進行R0C分析。
[0064] 結果顯示;患者外周血中miR-4491、miR-1285-3p、miR-665、miR-660-:3p、miR-206 和miR-1268b分別升高至對照組人群的約50倍、40倍、100倍、800倍、45倍和50倍,而 1111尺-1303-化和11111?-330-化分別下降至對照組人群的50%左右(圖3)。且11111?-4491、 miR-1285-3p、miR-665、miR-660-化、miR-206 和miR-1268b對診斷慢性屯、力衰竭具有高靈 敏度(AUOO. 9)(圖4A),其中屯、肌高豐度的miR-1285-3p,miR-665和miR-660-化的表達 量與射血分數(shù)顯著相關(P<〇. 05)(圖4B)。
[0065] 目前,屯、臟射血分數(shù)是臨床上最常用的用于評估屯、臟功能指標,屯、臟射血分數(shù)越 低提示患者預后越差。表明miR-1285-3p,miR-665和miR-660-化可作為一種診斷和評估 慢性屯、力衰竭預后的生物標志物。
[0066] 實施例6.制備檢測慢性屯、力衰竭風險評估的試劑盒
[0067] 試劑盒成分;檢測試劑盒包括用于擴增8種miRNAs(miR-4491、miR-1285-3p、 miR-665、miR-66〇-3p、miR-206、miR-1268b、miR-130a-化和miR-33〇-化)的特異性逆轉 錄引物及real-timePCR引物對各一套;用于擴增對照RNA扣6)的特異性逆轉錄引物及 real-timePCR引物對一套及相關試劑,成分和含量如下(100次),保存于-20度。所述 引物根據下列引物設計原則獲得;1)基于莖凸環(huán)結構設計的的特異性逆轉錄引物與miRNA 3'端序列結合,在逆轉錄酶作用下進行針對特定miRNA的特異性逆轉錄反應;2)基于逆轉 錄引物序列設計的特異性正向PCR引物、通用反向引物。
[0068]
[0069]
[0070] W上試劑均由各來源公司提供,已經商品化。具體檢測方法及相關反應參數(shù)參照 實施例1。
[0071] 序列表;
[0072] miR-4491、miR-1285-3p、miR-665、miR-660-:3p、miR-206、miR-1268b、miR-130a-3p 和miR-330-化
[0073] hsa-miR-4491 核酸序列;
[0074] SequenceIDNo. 1:5'AAUGUGGACUGGUGUGACCAAA3'
[0075] hsa-miR-1285-化核酸序列;
[0076] SequenceIDNo. 2:5'UCUGGGCAACAAAGUGAGACCU3'
[0077] hsa-miR-665 核酸序列;
[0078] SequenceIDNo. 3:5-ACCAGGAGGCUGAGGCCCCU3-
[0079] hsa-miR-660-化核酸序列;
[0080] SequenceIDNo. 4:5'ACCUCCUGUGUGCAUGGAUUA3'
[OOW] hsa-miR-206 核酸序列;
[0082] SequenceIDNo. 5:5'UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG3'
[008引hsa-miR-1268b核酸序列;
[0084] SequenceIDNo. 65'CGGGCGUGGUGGUGGGGGUG3'
[0085] hsa-miR-130a-化核酸序列;
[0086] SequenceIDNo. 7:5'CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU3'
[0087] hsa-miR-330-化核酸序列;
[0088] SequenceIDNo. 8:5-GCAAAGCACACGGCCUGCAGAGA3-。
【主權項】
1. 一種診斷慢性心力衰竭或評估慢性心力衰竭預后的外周血miRNAs生物標志 物,其特征在于,所述生物標志物包括hsa-miR-4491、hsa-miR-1285-3p、hsa-miR-665、 hsa-miR-660-3p、hsa-miR-206、hsa-miR-1268b、hsa-miR-130a-3p 和 / 或 hsa_miR-33〇-3p, 其序列結構分別如SEQ ID No. 1-8所示。2. 如權利要求1所述的生物標志物,其特征在于,所述生物標志物包括 hsa-miR-1285-3p、hsa-miR-665 和 / 或 hsa-miR-660-3p,其序列結構分別如 SEQ ID No. 2、 3和4所示。3. -種用于檢測下列miRNAs序列的試劑,其特征在于,所述序列包括SEQ ID No. 1,2, 3,4,5,6,7 和 / 或 8。4. 如權利要求3所述的試劑,其特征在于,所述試劑為所述miRNAs序列的逆轉錄引物 和擴增引物。5. 如權利要求3或4所述的試劑,其特征在于,所述miRNAs序列為SEQ ID No. 2、3和 /或4。6. 權利要求3-5任一所述的試劑在制備診斷或者評估慢性心力衰竭患者預后的試劑 盒中的用途。7. 如權利要求6所述的用途,其特征在于,所述的慢性心力衰竭包括先天性心臟病、冠 心病、急性心肌梗死、風心病、高血壓、心律失常、各種病因導致的心肌炎、心肌病等病因導 致的慢性心力衰竭。8. -種診斷或者評估慢性心力衰竭患者預后的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括 權利要求3-5任一所述的試劑。9. 如權利要求8所述的試劑盒,其特征在于,所述的慢性心力衰竭包括先天性心臟病、 冠心病、急性心肌梗死、風心病、高血壓、心律失常、各種病因導致的心肌炎、心肌病等病因 導致的慢性心力衰竭。10. -種檢測權利要求1所述的miRNAs生物標志物的方法,其特征在于,用權利要求 3-5任一的試劑對所述miRNAs生物標志物進行檢測。
【專利摘要】慢性心力衰竭相關的血清miRNA及其應用。本發(fā)明提供一類外周血miRNAs在慢性心力衰竭的作為生物標志物風險評估/診斷和預后中的用途。其中,hsa-miR-4491、hsa-miR-1285-3p、hsa-miR-665、hsa-miR-660-3p、hsa-miR-206、hsa-miR-1268b、hsa-miR-130a-3p和hsa-miR-330-3p在慢性心力衰竭患者外周血中差異性表達;證明外周血hsa-miR-665等能特異性診斷慢性心力衰竭,并且其表達水平與射血分數(shù)呈相關性,具有評估預后的作用。從而,通過檢測上述miRNAs的表達水平可用來預測和協(xié)助診斷已經存在的慢性心力衰竭或評估慢性心力衰竭的預后。
【IPC分類】C12Q1/68, C12N15/113
【公開號】CN104988216
【申請?zhí)枴緾N201510308334
【發(fā)明人】汪道文, 陳琛, 李華萍
【申請人】汪道文, 陳琛, 李華萍
【公開日】2015年10月21日
【申請日】2015年6月8日
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