本發(fā)明涉及一株過(guò)表達(dá)lae1基因的木霉工程菌及其構(gòu)建方法與應(yīng)用,屬于生物工程技術(shù)領(lǐng)域。
背景技術(shù):
木霉(Trichoderma spp.)是一類重要的真菌資源,是工業(yè)上重要的酶制劑生產(chǎn)菌株,也是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中重要的生防制劑和植物生長(zhǎng)促進(jìn)劑的生產(chǎn)菌株。木霉能夠產(chǎn)生多種次級(jí)代謝產(chǎn)物,這些次級(jí)代謝產(chǎn)物在木霉與病原生物、木霉與植物的相互作用過(guò)程中發(fā)揮著重要的作用。
Peptaibols是絲狀真菌產(chǎn)生的一類富含α-氨基異丁酸(Aib)的特殊肽類次級(jí)代謝產(chǎn)物,其分子量通常在500~2200Da,含有5~20個(gè)氨基酸殘基,多數(shù)為15~20個(gè)殘基;其N-末端烷基化(通常乙?;?,C-末端羥基化,通常為苯丙氨醇(Benedetti et al.,1982)。Peptaibols兩親性的結(jié)構(gòu)特性使其多個(gè)分子在脂雙層膜上能夠形成電荷依賴的離子通道,是研究生物大分子與生物膜相互作用的重要生物活性肽。研究還發(fā)現(xiàn)peptaibols具有抗菌、抗病毒、抗腫瘤、誘導(dǎo)植物產(chǎn)生抗性等多種生物學(xué)活性,其在農(nóng)業(yè)和醫(yī)藥領(lǐng)域都具有很好的應(yīng)用潛力。
木霉是peptaibols類次級(jí)代謝產(chǎn)物的主要產(chǎn)生菌株,已發(fā)現(xiàn)的peptaibols 80%來(lái)源于木霉屬真菌,尤其是T.viride,T.brevicompactum,T.virens,T.parceramosum和T.harzianum。我們篩選到的木霉SMF2菌株能夠產(chǎn)生含有20個(gè)氨基酸殘基的長(zhǎng)鏈peptaibols組分Trichokonins A和含有11個(gè)氨基酸殘基的中長(zhǎng)鏈peptaibols組分Trichokonins B,其中產(chǎn)量最高的組分是長(zhǎng)鏈peptaibols組分Trichokonin VI。研究發(fā)現(xiàn),Trichokonin VI具有廣譜的抗菌活性,能夠抑制革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌和真菌的生長(zhǎng),誘導(dǎo)真菌細(xì)胞的程序化死亡;通過(guò)激活Ca2+信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑引起肝癌細(xì)胞系HepG2的凋亡和自噬;通過(guò)激活以水楊酸信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑為主的防御反應(yīng)機(jī)制來(lái)誘導(dǎo)植物產(chǎn)生抗性等多種生物學(xué)活性。
Peptaibols是非核糖體合成肽,含有大量的非蛋白源的氨基酸殘基,不能采用現(xiàn)有的多肽化學(xué)合成方法生產(chǎn),因此生物合成是其主要的生產(chǎn)方法,但目前的產(chǎn)量較低,缺乏高效的生產(chǎn)菌株。Sigma aldrich公司的Alamethicin是僅有的商品化peptaibols,且價(jià)格昂貴,無(wú)法滿足peptaibols在農(nóng)業(yè)和醫(yī)藥領(lǐng)域的應(yīng)用。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)的不足,提供一株過(guò)表達(dá)lae1基因的木霉工程菌及其構(gòu)建方法與應(yīng)用。
本發(fā)明的技術(shù)方案如下:
一株過(guò)表達(dá)lae1基因的木霉工程菌的構(gòu)建方法,包括如下步驟:
(1)從木霉SMF2提取基因組DNA,然后以制得的基因組DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,制得lae1基因ORF區(qū)及終止子序列;所述lae1基因ORF區(qū)及終止子序列的PCR特異引物序列如下:
lae1OE-F:CATGccatggCCTCTCGAAACGCTCCCAAC;
lae1OE-R:CCCaagcttCTAGCTAACCTGTTGCTGTAC;
(2)將步驟(1)制得的lae1基因ORF區(qū)及終止子序列經(jīng)NcoI和HindIII雙酶切后,與同樣經(jīng)NcoI和HindIII雙酶切的載體pIG-1783進(jìn)行連接,制得重組質(zhì)粒;
(3)將步驟(2)制得的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化E.coliDH5α感受態(tài)細(xì)胞,經(jīng)含氨芐青霉素Amp的LB培養(yǎng)基篩選,提取重組表達(dá)載體,制得過(guò)表達(dá)質(zhì)粒pIG1783-lae1OE;
(4)將步驟(3)制得的過(guò)表達(dá)質(zhì)粒pIG1783-lae1OE經(jīng)HindIII酶切線性化,然后轉(zhuǎn)化原生質(zhì)體,經(jīng)再生、初篩、復(fù)篩,制得過(guò)表達(dá)lae1基因的木霉工程菌。
所述步驟(1)中木霉SMF2基因組DNA的提取參照真菌DNA提取試劑盒(E.Z.N.A.TMFungal DNA Mini Kit,OMEGA)說(shuō)明書進(jìn)行。
根據(jù)本發(fā)明優(yōu)選的,所述步驟(1)中l(wèi)ae1基因ORF區(qū)及終止子序列的PCR擴(kuò)增體系如下,總體系為50μL:
所述PCR擴(kuò)增程序如下:95℃預(yù)變性5min;95℃變性30sec,55℃退火30sec,72℃延伸1min,30個(gè)循環(huán);72℃終延伸5min。
根據(jù)本發(fā)明優(yōu)選的,所述步驟(2)中NcoI和HindIII雙酶切反應(yīng)體系如下,總體系為20μL:
NcoI和HindIII雙酶切反應(yīng)條件為:37℃溫浴30min。
根據(jù)本發(fā)明優(yōu)選的,所述步驟(2)中的連接采用T4連接酶進(jìn)行連接,反應(yīng)條件為:16℃連接過(guò)夜。連接反應(yīng)體系參照Promega公司的T4連接酶試劑盒,反應(yīng)體系為10μL。
根據(jù)本發(fā)明優(yōu)選的,所述步驟(3)中轉(zhuǎn)化E.coliDH5α感受態(tài)細(xì)胞的步驟如下:
取-80℃保存的E.coliDH5α感受態(tài)細(xì)胞冰浴融化,將重組質(zhì)粒與感受態(tài)細(xì)胞混合,冰浴30min;42℃熱激90s,冰浴2~3min;然后在LB培養(yǎng)基中37℃搖床振蕩培養(yǎng)40~50min,4000rpm離心1min,棄掉上清,重懸菌體沉淀,即得。
根據(jù)本發(fā)明優(yōu)選的,所述步驟(3)中氨芐青霉素的濃度為100μg/mL,篩選條件為:37℃,200rpm培養(yǎng)12~20h。
所述步驟(3)中提取重組表達(dá)載體用質(zhì)粒小量提取試劑盒(E.Z.N.A Plasmid Miniprep Kit,OMEGA)提取質(zhì)粒,具體步驟見(jiàn)質(zhì)粒提取試劑盒說(shuō)明書,提取的質(zhì)粒測(cè)序驗(yàn)證后獲得過(guò)表達(dá)質(zhì)粒。
根據(jù)本發(fā)明優(yōu)選的,所述步驟(4)中HindIII酶切線性化的體系如下:
根據(jù)本發(fā)明優(yōu)選的,所述步驟(4)中原生質(zhì)體的制備步驟如下:
將木霉SMF2的孢子接種于菌絲生長(zhǎng)培養(yǎng)基中,28℃、160rpm培養(yǎng)13h;將菌絲培養(yǎng)物4000rpm離心5min,用0.7M NaCl洗三次,每次25mL,加入細(xì)胞壁裂解酶液,重懸,30℃、60rpm酶解2.5~3h,過(guò)濾,濾液中加入預(yù)冷的濃度為0.7M的NaCl溶液,NaCl溶液加入量為5.7mL,4℃,3800rpm離心5min收集原生質(zhì)體,收集到的原生質(zhì)體用20mL預(yù)冷的0.7M的STC溶液洗兩次后加入600μL預(yù)冷的STC溶液重懸,使原生質(zhì)體濃度為5×107~5×108個(gè)/mL;
進(jìn)一步優(yōu)選的,所述細(xì)胞壁裂解酶液按如下方法配制:
0.24g細(xì)胞壁裂解酶,溶于5.7mL濃度為0.7M的NaCl溶液中,過(guò)濾除菌,加入0.3mL pH5.8的PBS緩沖液。
進(jìn)一步優(yōu)選的,所述STC溶液成分如下:
0.7M D-Sorbitol(D-S山梨糖醇),0.05M CaCl2,10mM Tris-HCl,pH 7.5。
根據(jù)本發(fā)明優(yōu)選的,所述步驟(4)中的轉(zhuǎn)化原生質(zhì)體,步驟為:
取150μL線性質(zhì)粒溶液和150μL原生質(zhì)體混勻加入到100mL離心管底部,冰浴20min后逐滴加入1.5mL PTC溶液,冰浴20min,再室溫放置20min;加入STC溶液清洗,4℃,4000rpm離心5min后棄上清。
進(jìn)一步優(yōu)選的,所述PTC溶液組分如下:
600g/L PEG 4000(聚乙二醇4000),10mMTris-HCl,10mM CaCl2,pH 7.5;
根據(jù)本發(fā)明優(yōu)選的,所述步驟(4)中再生,步驟為:
將轉(zhuǎn)化后的原生質(zhì)體經(jīng)液體再生培養(yǎng)基重懸,28℃過(guò)夜;然后轉(zhuǎn)接至含100μg/mL潮霉素B的固體再生培養(yǎng)基混勻,28℃培養(yǎng)16h;
根據(jù)本發(fā)明優(yōu)選的,所述步驟(4)中初篩,步驟為:
將轉(zhuǎn)化后的原生質(zhì)體轉(zhuǎn)入含100μg/mL潮霉素B的固體再生培養(yǎng)基,28℃培養(yǎng)48h左右,直至出轉(zhuǎn)化子;
根據(jù)本發(fā)明優(yōu)選的,所述步驟(4)中復(fù)篩,步驟為:
將轉(zhuǎn)化子由固體再生培養(yǎng)基中轉(zhuǎn)入含100μg/mL潮霉素B的復(fù)篩培養(yǎng)基上,28℃培養(yǎng)3d,然后轉(zhuǎn)至PDA平板上;
上述培養(yǎng)基按如下方法配制:
PDB培養(yǎng)基:馬鈴薯去皮,稱取200g,切塊加適量水煮沸30min,4層紗布過(guò)濾,加入葡萄糖20g,加蒸餾水定容到1L;115℃,30min滅菌。
PDA培養(yǎng)基:PDB培養(yǎng)基中加入質(zhì)量百分比為2%瓊脂粉;115℃,30min滅菌。
菌絲生長(zhǎng)培養(yǎng)基:PDB培養(yǎng)基中加入質(zhì)量百分比為1.5%的酵母提取物;115℃,30min滅菌。
液體再生培養(yǎng)基:菌絲生長(zhǎng)培養(yǎng)基中加入蔗糖至濃度為1M;115℃,30min滅菌。
固體再生培養(yǎng)基:PDB培養(yǎng)基中加入蔗糖至濃度為0.7M,加入瓊脂粉至濃度為7g/L;115℃,30min滅菌。
復(fù)篩培養(yǎng)基:PDA培養(yǎng)基中加入潮霉素B至濃度為100μg/mL。
根據(jù)本發(fā)明優(yōu)選的,所述步驟(4)中,復(fù)篩后還包括PCR篩選步驟:
提取SMF2及轉(zhuǎn)化子的基因組DNA,設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增出質(zhì)粒pIG-1783-lae1上啟動(dòng)子Pgpd到lae1終止子的整段序列;
所述PCR篩選的引物序列如下:
YZlae1OE-F:GATCGCTGAGATAGGTGCCTCACTG;
YZlae1OE-R:CTAGCTAACCTGTTGCTGTAC;
進(jìn)一步優(yōu)選的,所述PCR體系如下,反應(yīng)體系為20μL:
進(jìn)一步優(yōu)選的,所述PCR反應(yīng)程序如下:
95℃預(yù)變性5min;95℃變性30sec,55℃退火30sec,72℃延伸1min30sec,30個(gè)循環(huán);72℃終延伸5min。
根據(jù)本發(fā)明優(yōu)選的,所述步驟(4)中,復(fù)篩后還包括RT-PCR篩選步驟:
提取SMF2和轉(zhuǎn)化子的RNA,用紫外微量分光光度計(jì)Nano-100測(cè)定其純度和濃度。
提取SMF2和轉(zhuǎn)化子的RNA參見(jiàn)TaKaRa的PrimeScriptTM RT reagent Kit with gDNA Eraser試劑盒。
用TaKaRa的PrimeScriptTM RT reagent Kit with gDNA Eraser試劑盒對(duì)RNA進(jìn)行DNA的去除和反轉(zhuǎn)錄,根據(jù)測(cè)定的RNA樣品的濃度,依照試劑盒說(shuō)明書去除樣品中的DNA,反應(yīng)體系為10μL,每個(gè)體系加入2μg總RNA,42℃溫育2min或室溫5min。將去除DNA的RNA樣品依照試劑盒說(shuō)明書進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,反應(yīng)體系為20μL,37℃溫育15min,85℃,5s。反轉(zhuǎn)錄獲得的cDNA保存于-20℃?zhèn)溆谩?/p>
根據(jù)本發(fā)明優(yōu)選的,所述步驟(4)中,復(fù)篩后還包括qRT-PCR篩選步驟:
取反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物進(jìn)行qRT-PCR擴(kuò)增,tef1基因作為內(nèi)參基因(Seiboth et al.,2012)。
按照TaKaRa的SYBR Premix Ex TaqTM試劑盒進(jìn)行qRT-PCR分析,PCR儀為Roche公司的LightCycler 480II,數(shù)據(jù)分析采用LC480軟件;作圖時(shí),tef1基因的表達(dá)量轉(zhuǎn)換為1,其它基因的表達(dá)量進(jìn)行等比例的轉(zhuǎn)換;qRT-PCR擴(kuò)增反應(yīng)結(jié)束后,進(jìn)行60℃~95℃熔解曲線分析。
進(jìn)一步優(yōu)選的,上述所述的qRT-PCR反應(yīng)體系如下,反應(yīng)體系為20μL:
進(jìn)一步優(yōu)選的,上述所述的qRT-PCR反應(yīng)程序如下:
95℃預(yù)變性30s;PCR反應(yīng)95℃變性5s,55℃退火20s,72℃延伸20s,45個(gè)循環(huán)。
進(jìn)一步優(yōu)選的,所述的qRT-PCR的引物序列如下:
tef1-F:CCACATTGCCTGCAAGTTCGC;
tef1-R:GTCGGTGAAAGCCTCAACGCAC;
RTlae1-F:CATGAGCATGATGCCGATGAGTGAC;
RTlae1-R:CTAGATAGCGGTAGCATCCGAGTC。
上述構(gòu)建方法獲得的過(guò)表達(dá)lae1基因的木霉工程菌。
上述構(gòu)建方法獲得的過(guò)表達(dá)lae1基因的木霉工程菌含有強(qiáng)啟動(dòng)子Pgpd,可以實(shí)現(xiàn)絲狀真菌通用轉(zhuǎn)錄因子Lae1的過(guò)表達(dá),木霉peptaibols的產(chǎn)量提高,長(zhǎng)鏈peptaibols和中長(zhǎng)鏈peptaibols的產(chǎn)量與出發(fā)菌株相比分別提高了68.96%和42.85%,其菌落形態(tài)開(kāi)始時(shí)為白色,致密,圓形,向四周擴(kuò)展,生長(zhǎng)一段時(shí)間后從菌落中央產(chǎn)生綠色孢子,中央變成綠色,菌落生長(zhǎng)迅速、有明顯的輪紋,周圍有白色菌絲的生長(zhǎng)帶,4~5d左右整個(gè)菌落全部變成綠色,其色素產(chǎn)量及孢子產(chǎn)量與出發(fā)菌株相比有所提高。
上述木霉工程菌在制備peptaibols抗菌肽中的應(yīng)用。
上述應(yīng)用,步驟如下:
將構(gòu)建的過(guò)表達(dá)lae1基因的木霉工程菌接種于PDB培養(yǎng)基,在28℃,180rpm培養(yǎng)24h,制得發(fā)酵液,然后經(jīng)10000rpm離心20min,然后經(jīng)Agela C18固相萃取柱提取后,濃縮,制得peptaibols抗菌肽。
有益效果
1、本發(fā)明首次通過(guò)將強(qiáng)啟動(dòng)子Pgpd、lae1序列及其終止子的功能片段插入載體pIG-1783中,并轉(zhuǎn)化木霉SMF2菌株的原生質(zhì)體,制得可以穩(wěn)定傳代的過(guò)表達(dá)lae1基因的木霉工程菌;
2、本發(fā)明構(gòu)建的過(guò)表達(dá)lae1基因的木霉工程菌能夠顯著提高木霉peptaibols的產(chǎn)量,其中長(zhǎng)鏈peptaibols和中長(zhǎng)鏈peptiabols的產(chǎn)量分別比出發(fā)菌株提高68.96%和42.85%,有助于木霉peptaibols在醫(yī)藥和農(nóng)業(yè)上的應(yīng)用。
附圖說(shuō)明
圖1 lae1基因過(guò)表達(dá)質(zhì)粒pIG1783-lae1OE圖譜;
圖2、lae1基因過(guò)表達(dá)菌株的PCR電泳結(jié)果照片;
圖3、lae1基因過(guò)表達(dá)菌株lae1OE-16菌落形態(tài)照片;
其中,左圖為培養(yǎng)3天后菌落形態(tài)照片,右圖為培養(yǎng)5天后菌落形態(tài)照片;
圖4 lae1OE-16菌株中l(wèi)ae1基因表達(dá)量的qRT-PCR分析柱狀圖;
圖5 SMF2菌株和lae1OE-16菌株peptaibols的HPLC分析峰值圖。
具體實(shí)施方式
下面結(jié)合實(shí)施例對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步說(shuō)明,但本發(fā)明所保護(hù)范圍不限于此。
生物材料來(lái)源:
木霉(Trichoderma)SMF2來(lái)源于中國(guó)典型培養(yǎng)物保藏中心,菌種編號(hào)CCTCC NO:M209031;
大腸桿菌(Escherichia coli)DH5α購(gòu)自寶生物公司;
過(guò)表達(dá)載體構(gòu)建質(zhì)粒pIG-1783的構(gòu)建按照Stefanie Poggeler等和Peter W.Inglis等(Curr.Genet.,(2003)43:54–61;J.Gen.Appl.Microbiol.,(1999)45,63–67)中構(gòu)建獲得;
真菌基因提取試劑盒:E.Z.N.A Fungal DNA Kit,OMEGA公司,美國(guó);
質(zhì)粒小量提取試劑盒:E.Z.N.A Plasmid Miniprep Kit,OMEGA公司,美國(guó);
瓊脂糖凝膠回收試劑盒:E.Z.N.A Gel Extraction Kit,OMEGA公司,美國(guó);
T4連接酶試劑盒:pGEM-T ligation kit,Promega公司,美國(guó);
Southern雜交試劑盒:DIG High Prime DNA Labeling and Dectection Starter Kit I,Roche公司,德國(guó);
RT-PCR試劑盒:PrimeScript RT reagent Kit with gDNA Eraser(Perfect Real Time),TaKaRa公司,日本;
qPCR試劑盒:SYBR Premix Ex TaqTM(Perfect Real Time),TaKaRa公司,日本;
pMDTM-19T,TaKaRa公司,日本;
普通瓊脂糖、抗生素:上海生工,中國(guó);
Fast Pfu DNA Polymerase、DNA Marker、dNTP mix等:TransGen Biotech公司,中國(guó);
限制性核酸內(nèi)切酶:Fermentas公司,美國(guó);
裂解酶:Sigma公司;
潮霉素B:Roche公司,德國(guó);
Trizol Reagent:invitrogen公司,美國(guó);
DEPC水:生工生物,中國(guó);
所用抗生素購(gòu)自Merck公司;
甲醇購(gòu)自天津市科密歐化學(xué)試劑有限公司;
培養(yǎng)基配制原料均為本領(lǐng)域常用原料,可市場(chǎng)購(gòu)得;
DNA測(cè)序在北京博尚生物技術(shù)有限公司完成;
引物合成在華大基因完成;
實(shí)施例1
lae1基因ORF區(qū)及終止子序列的克隆及表達(dá)載體的構(gòu)建,步驟如下:
1lae1基因ORF區(qū)及終止子序列的克隆
1.1木霉SMF2基因組DNA的提取
參照真菌DNA提取試劑盒(E.Z.N.A.TM Fungal DNA Mini Kit,OMEGA)說(shuō)明書提取基因組DNA。
1.2引物設(shè)計(jì)與合成
根據(jù)lae1基因序列設(shè)計(jì)兩條引物:
lae1OE-FCATGccatggCCTCTCGAAACGCTCCCAAC
lae1OE-RCCCaagcttCTAGCTAACCTGTTGCTGTAC
由上海生工生物技術(shù)公司合成。
1.3利用PCR進(jìn)行基因序列擴(kuò)增及產(chǎn)物回收
(1)以F和R為引物,以基因組DNA為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增;
PCR反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性5min;95℃變性30sec,55℃退火30sec,72℃延伸1min,30個(gè)循環(huán);72℃終延伸5min。
PCR擴(kuò)增體系(50μL)如下:
(2)對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳,結(jié)果獲得一條約2169bp的DNA片段(圖1)。然后用Omega公司的DNA回收試劑盒按照其說(shuō)明回收擴(kuò)增出的DNA片段,獲得基因lae1的ORF區(qū)及終止子序列。
2.過(guò)表達(dá)載體及過(guò)表達(dá)菌株的構(gòu)建
(1)DNA片段與表達(dá)載體酶切
將回收得到的包含lae1ORF區(qū)和lae1終止子序列的DNA片段和載體pIG-1783用NcoI和HindIII雙酶切,酶切反應(yīng)體系如下:
蓋緊蓋子,手指輕彈離心管,混勻樣品,在離心機(jī)上瞬時(shí)離心2sec,把樣品集中在管底,37℃溫浴30min。
(2)對(duì)酶切產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳,將目的條帶切膠,然后用Omega公司的DNA回收試劑盒按照其說(shuō)明書回收目的DNA片段。
(3)DNA片段與表達(dá)載體連接
連接反應(yīng)體系參照Promega公司的T4連接酶試劑盒,反應(yīng)體系為10μL。
蓋緊蓋子,手指輕彈離心管,混勻樣品,在離心機(jī)上瞬時(shí)離心2sec,把樣品集中在管底,16℃連接過(guò)夜。
質(zhì)粒轉(zhuǎn)化:取-80℃保存的E.coliDH5α感受態(tài)細(xì)胞冰浴融化,將10μL連接體系全部加入50μL的感受態(tài)細(xì)胞中,冰浴30min,42℃熱激90s,立刻轉(zhuǎn)入冰上冰浴2~3min,加入500μL液體淡水LB培養(yǎng)基,37℃水浴15~20min,然后轉(zhuǎn)至37℃搖床振蕩培養(yǎng)40~50min,培養(yǎng)結(jié)束后,4000rpm離心1min,棄掉400μL上清,用留存的100μL上清重懸菌體沉淀。將重懸后的菌液全部涂布到含100μg/mL氨芐青霉素LB平板上,37℃培養(yǎng)12~20h。
挑取LB轉(zhuǎn)化平板上的菌落轉(zhuǎn)接到含100μg/mL氨芐青霉素LB培養(yǎng)基中,37℃,200rpm培養(yǎng)12~20h。
用質(zhì)粒小量提取試劑盒(E.Z.N.A Plasmid Miniprep Kit,OMEGA)提取質(zhì)粒,具體步驟見(jiàn)質(zhì)粒提取試劑盒說(shuō)明書,提取的質(zhì)粒測(cè)序驗(yàn)證后獲得過(guò)表達(dá)質(zhì)粒。上述重組過(guò)表達(dá)質(zhì)粒包含有強(qiáng)啟動(dòng)子Pgpd、lae1序列及其終止子的功能片段,如圖1所示。
實(shí)施例2
過(guò)表達(dá)菌株的構(gòu)建,步驟如下:
(1)木霉SMF2菌株的原生質(zhì)體制備
將木霉SMF2的孢子接種于菌絲生長(zhǎng)培養(yǎng)基中,28℃,160rpm培養(yǎng)13h;然后4000rpm離心5min,用濃度0.7M的NaCl溶液水洗三次,,每次25mL,加入細(xì)胞壁裂解酶液6mL(0.24g細(xì)胞壁裂解酶,溶于5.7mL 0.7M NaCl溶液中,過(guò)濾除菌,加入0.3mL PBS緩沖液,pH=5.8),重懸,30℃,60rpm酶解3h。酶解液用三層顯微鏡擦鏡紙過(guò)濾,在濾過(guò)液中加入20mL濃度0.7M的NaCl溶液,4℃,3800rpm離心5min收集原生質(zhì)體,收集到的原生質(zhì)體用濃度0.7M的STC溶液水洗兩次,每次15mL,后加入600μLSTC溶液重懸,使原生質(zhì)體濃度為5×107~5×108個(gè)/mL備用。以上操作均置于冰上進(jìn)行,濃度0.7M的NaCl溶液、濃度0.7M的STC溶液均應(yīng)提前預(yù)冷。
(2)原生質(zhì)體的轉(zhuǎn)化與再生
載體線性化:用HindIII酶切l(wèi)ae1基因過(guò)表達(dá)載體pIG1783-lae1OE并使其線性化,酶切后用預(yù)冷的濃度為0.7M的STC溶液稀釋;
原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化:取150μL線性質(zhì)粒溶液和150μL原生質(zhì)體混勻后加入到100mL離心管底部,冰浴20min后逐滴加入1.5mL PTC,冰浴20min,在室溫放置20min,取500μL~600μL液體再生培養(yǎng)物均勻的加入到90mm平皿中,然后倒入適量的固體再生培養(yǎng)基(含100μg/mL潮霉素B)混勻后28℃培養(yǎng)。
原生質(zhì)體再生與初篩:固體再生培養(yǎng)基上長(zhǎng)出的菌落轉(zhuǎn)接到復(fù)篩培養(yǎng)基,挑取生長(zhǎng)良好的轉(zhuǎn)化子轉(zhuǎn)接到PDA培養(yǎng)基。
(3)轉(zhuǎn)化子的篩選與驗(yàn)證,獲得過(guò)表達(dá)菌株lae1OE。
將轉(zhuǎn)化子進(jìn)行PCR驗(yàn)證,驗(yàn)證采用采用單孢分離的方法進(jìn)行純化。
YZlae1OE-F:GATCGCTGAGATAGGTGCCTCACTG
YZlae1OE-R:CTAGCTAACCTGTTGCTGTAC
PCR反應(yīng)體系為20μL,具體反應(yīng)體系和反應(yīng)條件參見(jiàn)GenStar2×Taq PCR StarMix說(shuō)明書。
上述培養(yǎng)基按如下方法配制:
PDB培養(yǎng)基:馬鈴薯去皮,稱取200g,切塊加適量水煮沸30min,4層紗布過(guò)濾,加入葡萄糖20g,加蒸餾水定容到1L;115℃,30min滅菌。
PDA培養(yǎng)基:PDB培養(yǎng)基中加入質(zhì)量百分比為2%瓊脂粉;115℃,30min滅菌。
菌絲生長(zhǎng)培養(yǎng)基:PDB培養(yǎng)基中加入質(zhì)量百分比為1.5%的酵母提取物;115℃,30min滅菌。
液體再生培養(yǎng)基:菌絲生長(zhǎng)培養(yǎng)基中加入蔗糖至濃度為1M;115℃,30min滅菌。
固體再生培養(yǎng)基:PDB培養(yǎng)基中加入蔗糖至濃度為0.7M,加入瓊脂粉至濃度為7g/L;115℃,30min滅菌。
復(fù)篩培養(yǎng)基:PDA培養(yǎng)基中加入潮霉素B至濃度為100μg/mL。
實(shí)施例3
過(guò)表達(dá)菌株lae1表達(dá)量及peptaibols產(chǎn)量的分析,步驟如下:
(1)過(guò)表達(dá)菌株的的發(fā)酵培養(yǎng)
從培養(yǎng)5d左右的平板上刮取適量的孢子,配制成孢子懸液,使孢子濃度達(dá)到108個(gè)/mL,然后接種到含有100mL PDB培養(yǎng)基的500mL三角瓶中,每瓶接種1mL孢子懸液,每個(gè)菌株接種5瓶,28℃,180rpm培養(yǎng)24h。
(2)過(guò)表達(dá)菌株中l(wèi)ae1表達(dá)量的qPCR分析
使用TRizol試劑提取真菌總RNA。用TaKaRa的PrimeScriptTM RT reagent Kit with gDNA Eraser試劑盒對(duì)RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,反應(yīng)體系為20μL,方法參照說(shuō)明書。
按照TaKaRa的SYBR Premix Ex TaqTM試劑盒進(jìn)行qRT-PCR分析,實(shí)驗(yàn)程序參照說(shuō)明書。
1μL反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物用于隨后的qRT-PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增體系為20μL,tef1基因作為內(nèi)參基因。qRT-PCR擴(kuò)增反應(yīng)結(jié)束后,進(jìn)行60℃~95℃熔解曲線分析。
用于qRT-PCR分析的引物如下:
tef1-F:CCACATTGCCTGCAAGTTCGC;
tef1-R:GTCGGTGAAAGCCTCAACGCAC;
RTlae1-F:CATGAGCATGATGCCGATGAGTGAC;
RTlae1-R:CTAGATAGCGGTAGCATCCGAGTC。
qPCR反應(yīng)體系如下:
qRT-PCR反應(yīng)條件如下:
95℃預(yù)變性30s;PCR反應(yīng)95℃變性5s,55℃退火20s,72℃延伸20s,45個(gè)循環(huán)。
(3)過(guò)表達(dá)菌株peptaibols產(chǎn)量的HPLC分析
將培養(yǎng)液10000rpm離心20min得到的用Agela C18固相萃取柱(500mg/6mL)進(jìn)行的peptaibols提取與濃縮。濃縮后的發(fā)酵液用0.22μm的針頭濾器過(guò)濾后進(jìn)行HPLC檢測(cè),流動(dòng)相為甲醇和超純水(加入0.1%TFA),甲醇與水的比例為84:16,流速為1mL/min,選用watersC18反相色譜柱,檢測(cè)波長(zhǎng)為203nm,上樣量為15μL。
比較分析結(jié)果表明,木霉SMF2菌株長(zhǎng)鏈peptaibols的產(chǎn)量為0.29mg/mL,短鏈peptaibols的產(chǎn)量為0.18mg/mL,lae1過(guò)表達(dá)菌株peptaibols的產(chǎn)量達(dá)到0.49mg/mL,短鏈peptaibols的產(chǎn)量達(dá)到0.3mg/mL,分別提高了68.96%和42.85%。
上述所用PDB培養(yǎng)基組分如下:馬鈴薯去皮,稱取200g,切塊加適量水煮沸30min,4層紗布過(guò)濾,加入葡萄糖20g,加蒸餾水定容到1L。115℃,30min滅菌。