一種桿菌自動(dòng)掃描篩選系統(tǒng)及方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明涉及顯微掃描技術(shù)，尤其涉及一種桿菌自動(dòng)掃描篩選系統(tǒng)及方法。
【背景技術(shù)】
[0002]數(shù)字切片病理掃描儀是用于將傳統(tǒng)的玻璃病理切片通過(guò)全自動(dòng)顯微鏡或光學(xué)放大系統(tǒng)掃描采集以獲得高分辨率數(shù)字圖像。數(shù)字切片病理掃描儀主要應(yīng)用在醫(yī)療，制藥等領(lǐng)域。在醫(yī)療中以掃描結(jié)核桿菌的痰涂片為例:實(shí)際診斷時(shí)需要在40倍物鏡下觀察50個(gè)視野，再統(tǒng)計(jì)在這50個(gè)視野中所看到的桿菌數(shù)量，最終給出診斷結(jié)果。結(jié)核桿菌的痰涂片由于要求暗場(chǎng)觀察，隨機(jī)取50個(gè)視野進(jìn)行數(shù)字化掃描，容易出現(xiàn)遺漏；而且40倍物鏡景深較小，用40倍物鏡制作焦平面時(shí)誤差較大，掃描圖像不清晰，為了掃描圖像能夠清晰不影響桿菌篩選識(shí)別，通常采用增加掃描層數(shù)的手段提高清晰度，但掃描速度慢，診斷效率低。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0003]針對(duì)現(xiàn)有的數(shù)字切片病理掃描儀在掃描桿菌時(shí)存在的上述問(wèn)題，現(xiàn)提供一種旨在實(shí)現(xiàn)掃描精度高，速度快的桿菌自動(dòng)掃描篩選系統(tǒng)及方法。
[0004]具體技術(shù)方案如下:
[0005]—種桿菌自動(dòng)掃描篩選系統(tǒng)，包括:
[0006]一第一掃描單元，用于在暗場(chǎng)環(huán)境下采用掃描鏡頭以第一放大倍數(shù)掃描待掃描切片，獲取第一掃描圖像；
[0007]—第一獲取單元，連接所述第一掃描單元，用以根據(jù)所述第一掃描圖像的清晰度獲取一焦平面；
[0008]—篩選單元，連接所述第一掃描單元，用以根據(jù)第一預(yù)設(shè)規(guī)則篩選出所述第一掃描圖像中有桿菌的區(qū)域；
[0009]—第二掃描單元，分別連接所述第一獲取單元和所述篩選單元，所述第二掃描單元用于在暗場(chǎng)環(huán)境下以所述焦平面為基準(zhǔn)采用掃描鏡頭以第二放大倍數(shù)掃描所述第一掃描圖像中有桿菌的區(qū)域，以獲取第二掃描圖像；
[0010]一識(shí)別單元，連接所述第二掃描單元，用以根據(jù)第二預(yù)設(shè)規(guī)則識(shí)別所述第二掃描圖像的掃描結(jié)果。
[0011]優(yōu)選的，所述第一放大倍數(shù)為20倍。
[0012]優(yōu)選的，所述第二放大倍數(shù)為40倍。
[0013]優(yōu)選的，所述第一預(yù)設(shè)規(guī)則為判斷所述第一掃描圖像是否有符合預(yù)設(shè)的第一亮度指標(biāo)及第一形狀識(shí)別參數(shù)的桿菌圖像，所述第一形狀識(shí)別參數(shù)包括桿菌的面積、長(zhǎng)度、寬度、周長(zhǎng)和縱橫比。
[0014]優(yōu)選的，所述第二預(yù)設(shè)規(guī)則為根據(jù)預(yù)設(shè)的第二亮度指標(biāo)和第二形狀識(shí)別參數(shù)識(shí)別所述第二掃描圖像的掃描結(jié)果，所述第二形狀識(shí)別參數(shù)包括桿菌的面積、長(zhǎng)度、寬度、周長(zhǎng)和縱橫比。
[0015]—種桿菌自動(dòng)掃描篩選方法，應(yīng)用如上述的桿菌自動(dòng)掃描篩選系統(tǒng)，包括下述步驟:
[0016]S1.在暗場(chǎng)環(huán)境下采用掃描鏡頭以第一放大倍數(shù)掃描待掃描切片，獲取第一掃描圖像；
[0017]S2.根據(jù)所述第一掃描圖像的清晰度獲取一焦平面；
[0018]S3.根據(jù)第一預(yù)設(shè)規(guī)則篩選出所述第一掃描圖像中有桿菌的區(qū)域；
[0019]S4.在暗場(chǎng)環(huán)境下以所述焦平面為基準(zhǔn)采用掃描鏡頭以第二放大倍數(shù)掃描所述第一掃描圖像中有桿菌的區(qū)域，以獲取第二掃描圖像；
[0020]S5.根據(jù)第二預(yù)設(shè)規(guī)則識(shí)別所述第二掃描圖像的掃描結(jié)果。
[0021 ]優(yōu)選的，所述第一放大倍數(shù)為20倍。
[0022]優(yōu)選的，所述第二放大倍數(shù)為40倍。
[0023]優(yōu)選的，所述第一預(yù)設(shè)規(guī)則為判斷所述第一掃描圖像是否有符合預(yù)設(shè)的第一亮度指標(biāo)及第一形狀識(shí)別參數(shù)的桿菌圖像，所述第一形狀識(shí)別參數(shù)包括桿菌的面積、長(zhǎng)度、寬度、周長(zhǎng)和縱橫比。
[0024]優(yōu)選的，所述第二預(yù)設(shè)規(guī)則為根據(jù)預(yù)設(shè)的第二亮度指標(biāo)和第二形狀識(shí)別參數(shù)識(shí)別所述第二掃描圖像的掃描結(jié)果，所述第二形狀識(shí)別參數(shù)包括桿菌的面積、長(zhǎng)度、寬度、周長(zhǎng)和縱橫比。
[0025]上述技術(shù)方案的有益效果:
[0026]I)桿菌自動(dòng)掃描篩選系統(tǒng)采用第一掃描單元進(jìn)行粗掃描，并獲取焦平面，通過(guò)第二掃描單元在第一掃描單元獲取的掃描圖像的基礎(chǔ)上根據(jù)焦平面進(jìn)行高精度掃描，以獲取掃描結(jié)果，無(wú)需增加掃描層數(shù)，針對(duì)性強(qiáng)，掃描時(shí)間短，準(zhǔn)確性高；
[0027]2)桿菌自動(dòng)掃描篩選方法先進(jìn)行粗掃描，再根據(jù)粗掃描獲取的掃描圖像及焦平面進(jìn)行二次高精度掃描，避免了掃描過(guò)程中遺漏視野的情況，用時(shí)短且效率高。
【附圖說(shuō)明】
[0028]圖1為本發(fā)明所述的桿菌自動(dòng)掃描篩選系統(tǒng)的一種實(shí)施例的模塊圖；
[0029]圖2為本發(fā)明所述的桿菌自動(dòng)掃描篩選方法的一種實(shí)施例的方法流程圖。
【具體實(shí)施方式】
[0030]下面將結(jié)合本發(fā)明實(shí)施例中的附圖，對(duì)本發(fā)明實(shí)施例中的技術(shù)方案進(jìn)行清楚、完整地描述，顯然，所描述的實(shí)施例僅僅是本發(fā)明一部分實(shí)施例，而不是全部的實(shí)施例?；诒景l(fā)明中的實(shí)施例，本領(lǐng)域普通技術(shù)人員在沒(méi)有作出創(chuàng)造性勞動(dòng)的前提下所獲得的所有其他實(shí)施例，都屬于本發(fā)明保護(hù)的范圍。
[0031]需要說(shuō)明的是，在不沖突的情況下，本發(fā)明中的實(shí)施例及實(shí)施例中的特征可以相互組合。
[0032]下面結(jié)合附圖和具體實(shí)施例對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步說(shuō)明，但不作為本發(fā)明的限定。
[0033]如圖1所示，一種桿菌自動(dòng)掃描篩選系統(tǒng)，包括:
[0034]一第一掃描單元I，用于在暗場(chǎng)環(huán)境下采用掃描鏡頭以第一放大倍數(shù)掃描待掃描切片，獲取第一掃描圖像；
[0035]—第一獲取單元2，連接第一掃描單元I，用以根據(jù)第一掃描圖像的清晰度獲取一焦平面；
[0036]—篩選單元3，連接第一掃描單元I，用以根據(jù)第一預(yù)設(shè)規(guī)則篩選出第一掃描圖像中有桿菌的區(qū)域；
[0037]—第二掃描單元4，分別連接第一獲取單元2和篩選單元3，第二掃描單元4用于在暗場(chǎng)環(huán)境下以焦平面為基準(zhǔn)采用掃描鏡頭以第二放大倍數(shù)掃描第一掃描圖像中有桿菌的區(qū)域，以獲取第二掃描圖像；
[0038]—識(shí)別單元5，連接第二掃描單元4，用以根據(jù)第二預(yù)設(shè)規(guī)則識(shí)別第二掃描圖像的掃描結(jié)果。
[0039]進(jìn)一步地，第一放大倍數(shù)為20倍，第二放大倍數(shù)為40倍。
[0040]本實(shí)施例主要應(yīng)用于結(jié)核桿菌的熒光掃描中。桿菌自動(dòng)掃描篩選系統(tǒng)采用第一掃描單元I進(jìn)行粗掃描，放大倍數(shù)為20倍的物鏡景深比放大倍數(shù)為40倍的物鏡大，對(duì)焦容易，獲取的焦平面較準(zhǔn)確，還可以快速篩選掉一些沒(méi)有用的區(qū)域，保留可能有桿菌的區(qū)域記錄相應(yīng)的點(diǎn)坐標(biāo)，相比隨機(jī)取視野，本實(shí)施例更有針對(duì)性，以避免遺漏情況的發(fā)生;通過(guò)第二掃描單元4在第一掃描單元I獲取的掃描圖像的基礎(chǔ)上根據(jù)焦平面進(jìn)行高精度掃描，以獲取掃描結(jié)果，無(wú)需增加掃描層數(shù)，針對(duì)性強(qiáng)，掃描時(shí)間短，準(zhǔn)確性高。
[0041]在優(yōu)選的實(shí)施例中，第一預(yù)設(shè)規(guī)則為判斷第一掃描圖像是否有符合預(yù)設(shè)的第一亮度指標(biāo)及第一形狀識(shí)別參數(shù)的桿菌圖像，第一形狀識(shí)別參數(shù)包括桿菌的面積、長(zhǎng)度、寬度、周長(zhǎng)和縱橫比。
[0042]進(jìn)一步地，第一掃描單元I是在一預(yù)設(shè)的虛擬焦平面上對(duì)待掃描切片進(jìn)行掃描的。
[0043]在本實(shí)施例中，第一亮度指標(biāo)即為第一掃描圖像的整體平均亮度值，當(dāng)?shù)谝粧呙鑸D像中的桿菌的亮度超過(guò)第一亮度指標(biāo)且桿菌的尺寸符合第一形狀