本文尤其提供了可用于改善受試者代謝健康的細(xì)菌組合物及其制備和使用方法。

背景技術(shù)：

1、人胃腸道含有復(fù)雜多樣的微生物生態(tài)系統(tǒng)。腸細(xì)菌不僅是共棲的，而且它們還與其宿主進(jìn)行共生的共同進(jìn)化。腸道微生物群和宿主之間的相互作用是復(fù)雜的。有益的腸細(xì)菌具有許多重要的功能，并且它們直接或間接影響宿主的各種生理功能，例如，它們?yōu)槠渌拗魈峁I(yíng)養(yǎng)、預(yù)防腸病原體引起的感染并且調(diào)節(jié)正常的免疫應(yīng)答。已經(jīng)確定微生物群組成的失衡會(huì)導(dǎo)致宿主的各種疾病狀態(tài)。因此，以實(shí)現(xiàn)、恢復(fù)和維持生態(tài)系統(tǒng)中有利平衡，以及胃腸道中存在的微生物的活性為目的進(jìn)行的腸微生物群的改變對(duì)于維持和改善宿主的健康狀況是必要的。

2、第一代益生菌是主要衍生自乳桿菌(lactobacillus)屬和雙歧桿菌(bifidobacterium)屬的活微生物，它們通常是消化道的次要成分或由使用中獲得，作為乳品發(fā)酵劑培養(yǎng)物。傳統(tǒng)上，第一代益生菌主要針對(duì)腸道和免疫健康。已證明一些益生菌(如乳酸雙歧桿菌(b.lactis)b420)也發(fā)揮與代謝健康相關(guān)的有益活性，例如，在體脂質(zhì)量的減少和對(duì)血糖和胰島素的一些改善方面。然而，目前的第一代益生菌似乎沒有提供葡萄糖和胰島素代謝方面的最佳解決方案，即，作為2型糖尿病、糖尿病前期或代謝綜合征的潛在治療劑或預(yù)防劑。

3、因此，需要的是如下另外的微生物，這些微生物基于其在代謝健康個(gè)體的消化道中的天然存在而鑒定，并且基于其維持和優(yōu)化代謝健康以及預(yù)防疾病的能力而選擇。

4、本文公開的主題解決了這些需求，并且還提供了另外的益處。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、本文尤其提供了包含一種或多種生物純的細(xì)菌菌株的組合物和制備并使用這些組合物治療和/或預(yù)防有需要的受試者的一種或多種肥胖相關(guān)障礙的方法，該一種或多種肥胖相關(guān)障礙如但不限于肥胖、代謝綜合征、糖尿病、胰島素缺乏相關(guān)障礙、胰島素抵抗相關(guān)障礙、葡萄糖耐受不良、異常脂質(zhì)代謝、非酒精性脂肪性肝病、肝脂肪變性、瘦素抵抗、抵抗素水平下降和/或心血管疾病。

2、因此，在一些方面，本文提供了一種組合物，其包含以下中至少一種或多種：(a)生物純的腸道巴恩斯氏菌(barnesiella?intestinihominis)菌株；(b)生物純的昂氏另枝菌(alistipes?onderdonkii)菌株；(c)生物純的細(xì)金擬桿菌(bacteroidesfinegoldii)菌株；(d)生物純的普通擬桿菌(bacteroides?vulgatus)菌株；和/或(e)具有與保藏在德國(guó)微生物菌種保藏中心(dsm)編號(hào)為dsm?34011的顫螺菌屬物種(oscillibactersp.)的16s核糖體rna序列顯示出至少97.0％序列相似性的16s核糖體rna序列的細(xì)菌菌株。在一些實(shí)施例中，該組合物包含(a)(i)具有與保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34032的腸道巴恩斯氏菌的16s核糖體rna序列顯示出至少97.0％序列相似性的16s核糖體rna序列的細(xì)菌菌株；和/或(ii)具有與保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34012的腸道巴恩斯氏菌的16s核糖體rna序列顯示出至少97.0％序列相似性的16s核糖體rna序列的細(xì)菌菌株；(b)具有與保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34033的昂氏另枝菌的16s核糖體rna序列顯示出至少97.0％序列相似性的16s核糖體rna序列的細(xì)菌菌株；(c)具有與保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34013的細(xì)金擬桿菌的16s核糖體rna序列顯示出至少97.0％序列相似性的16s核糖體rna序列的細(xì)菌菌株；和/或(d)具有與保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34030的普通擬桿菌的16s核糖體rna序列顯示出至少97.0％序列相似性的16s核糖體rna序列的細(xì)菌菌株。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，(a)(i)保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34032的腸道巴恩斯氏菌的該16s核糖體rna序列包含seq?id?no:1；(ii)與保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34012的腸道巴恩斯氏菌的16s核糖體rna序列顯示出至少97.0％序列相似性的該16s核糖體rna序列包含seq?id?no:2；(b)保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34033的昂氏另枝菌的該16s核糖體rna序列包含seq?id?no:3；(c)保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34013的細(xì)金擬桿菌的該16s核糖體rna序列包含seq?id?no:4；(d)與保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34030的普通擬桿菌的16s核糖體rna序列顯示出至少97.0％序列相似性的該16s核糖體rna序列包含seqid?no:5；和/或(e)保藏在德國(guó)微生物菌種保藏中心(dsm)、編號(hào)為dsm?34011的顫螺菌屬物種的該16s核糖體rna序列包含seq?id?no:6。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物包含(a)(i)該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34032的腸道巴恩斯氏菌菌株或具有該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34032的腸道巴恩斯氏菌菌株的所有鑒定特征的活菌株；和/或(ii)該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34012的腸道巴恩斯氏菌菌株或具有該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34012的腸道巴恩斯氏菌菌株的所有鑒定特征的活菌株；(b)該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34033的昂氏另枝菌菌株或具有該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34033的昂氏另枝菌菌株的所有鑒定特征的活菌株；(c)該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34013的細(xì)金擬桿菌菌株或具有該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34013的細(xì)金擬桿菌菌株的所有鑒定特征的活菌株；(d)該保藏在dsm、編號(hào)為dsm34030的普通擬桿菌菌株或具有該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34030的普通擬桿菌菌株的所有鑒定特征的活菌株；和/或(e)該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34011的顫螺菌屬物種或具有該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34011的顫螺菌屬物種的所有鑒定特征的活菌株，這些菌株(a)是單獨(dú)的；和/或(b)與衍生自這些菌株中的一種或多種的培養(yǎng)上清液組合。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物是凍干或冷凍干燥的。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物是包入膠囊內(nèi)的或包衣的。在一些實(shí)施例中，該包衣是腸溶包衣。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物是食品產(chǎn)品、食品成分、膳食補(bǔ)充劑或藥物。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，至少約1x?104cfu/g組合物到至少約1x1012cfu/g組合物的細(xì)菌存在于該組合物中。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物是益生菌。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物已經(jīng)過巴氏滅菌或熱處理。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物是藥物組合物，并且進(jìn)一步包含至少一種藥學(xué)上可接受的載體和/或賦形劑。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物進(jìn)一步包含一種或多種其他益生菌微生物和/或益生元。在一些實(shí)施例中，表1列出了該一種或多種其他益生菌微生物中的至少一種。

3、在其他方面，本文提供了一種包含分離的細(xì)菌細(xì)胞外囊泡(ev)的組合物，這些分離的細(xì)菌細(xì)胞外囊泡衍生自以下中的至少一種或多種：(a)生物純的腸道巴恩斯氏菌菌株；(b)生物純的昂氏另枝菌菌株；(c)生物純的細(xì)金擬桿菌菌株；(d)生物純的普通擬桿菌菌株；和/或(e)具有與保藏在德國(guó)微生物菌種保藏中心(dsm)、編號(hào)為dsm?34011的顫螺菌屬物種的16s核糖體rna序列顯示出至少97.0％序列相似性的16s核糖體rna序列的細(xì)菌菌株。在一些實(shí)施例中，該組合物進(jìn)一步包含來(lái)自(a)、(b)、(c)、(d)和/或(e)的一種或多種細(xì)菌。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物包含(a)(i)衍生自以下細(xì)菌菌株的ev，該細(xì)菌菌株具有與保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34032的腸道巴恩斯氏菌的16s核糖體rna序列顯示出至少97.0％序列相似性的16s核糖體rna序列；和/或(ii)衍生自以下細(xì)菌菌株的ev，該細(xì)菌菌株具有與保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34012的腸道巴恩斯氏菌的16s核糖體rna序列顯示出至少97.0％序列相似性的16s核糖體rna序列；(b)衍生自以下細(xì)菌菌株的ev，該細(xì)菌菌株具有與保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34033的昂氏另枝菌的16s核糖體rna序列顯示出至少97.0％序列相似性的16s核糖體rna序列；(c)衍生自以下細(xì)菌菌株的ev，該細(xì)菌菌株具有與保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34013的細(xì)金擬桿菌的16s核糖體rna序列顯示出至少97.0％序列相似性的16s核糖體rna序列；和/或(d)衍生自以下細(xì)菌菌株的ev，該細(xì)菌菌株具有與保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34030的普通擬桿菌的16s核糖體rna序列顯示出至少97.0％序列相似性的16s核糖體rna序列。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物包含的(a)(i)保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34032的腸道巴恩斯氏菌的該16s核糖體rna序列包含seq?id?no:1；(ii)與保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34012的腸道巴恩斯氏菌的16s核糖體rna序列顯示出至少97.0％序列相似性的該16s核糖體rna序列包含seq?id?no:2；(b)保藏在dsm、編號(hào)為dsm34033的昂氏另枝菌的該16s核糖體rna序列包含seq?id?no:3；(c)保藏在dsm、編號(hào)為dsm34013的細(xì)金擬桿菌的該16s核糖體rna序列包含seq?id?no:4；(d)與保藏在dsm、編號(hào)為dsm34030的普通擬桿菌的16s核糖體rna序列顯示出至少97.0％序列相似性的該16s核糖體rna序列包含seq?id?no:5；和/或(e)保藏在德國(guó)微生物菌種保藏中心(dsm)、編號(hào)為dsm?34011的顫螺菌屬物種的該16s核糖體rna序列包含seq?id?no:6。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物包含(a)(i)以下ev，這些ev衍生自該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34032的腸道巴恩斯氏菌菌株或具有該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34032的腸道巴恩斯氏菌菌株的所有鑒定特征的活菌株；和/或(ii)以下ev，這些ev衍生自該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34012的腸道巴恩斯氏菌菌株或具有該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34012的腸道巴恩斯氏菌菌株的所有鑒定特征的活菌株；(b)以下ev，這些ev衍生自該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34033的昂氏另枝菌菌株或具有該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34033的昂氏另枝菌菌株的所有鑒定特征的活菌株；(c)以下ev，這些ev衍生自該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34013的細(xì)金擬桿菌菌株或具有該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34013的細(xì)金擬桿菌菌株的所有鑒定特征的活菌株；(d)以下ev，這些ev衍生自該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34030的普通擬桿菌菌株或具有該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34030的普通擬桿菌菌株的所有鑒定特征的活菌株；和/或(e)以下ev，這些ev衍生自該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34011的顫螺菌屬物種或具有該保藏在dsm、編號(hào)為dsm?34011的顫螺菌屬物種的所有鑒定特征的活菌株。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物是凍干或冷凍干燥的。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物是包入膠囊內(nèi)的或包衣的。在一些實(shí)施例中，該包衣是腸溶包衣。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物是食品產(chǎn)品、食品成分、膳食補(bǔ)充劑或藥物。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，至少約1x?104cfu/g組合物到至少約1x?1012cfu/g組合物的細(xì)菌存在于該組合物中。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物是益生菌。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物已經(jīng)過巴氏滅菌或熱處理。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物是藥物組合物，并且進(jìn)一步包含至少一種藥學(xué)上可接受的載體和/或賦形劑。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物進(jìn)一步包含一種或多種其他益生菌微生物和/或益生元。在一些實(shí)施例中，表1列出了該一種或多種其他益生菌微生物中的至少一種。

4、在其他方面，本文提供了包含本文公開的益生菌組合物中任一種的片劑、延長(zhǎng)釋放膠囊劑、延長(zhǎng)釋放顆粒劑、粉劑、小袋劑或粘性劑。

5、在另一方面，本文提供了一種試劑盒，其包含(a)(i)本文公開的益生菌組合物中的任一種；或(ii)本文公開的片劑、延長(zhǎng)釋放膠囊劑、延長(zhǎng)釋放顆粒劑、粉劑、小袋劑或粘性劑組合物中的任一種，和b)針對(duì)受試者的書面施用說(shuō)明書。

6、在其他方面，本文提供了一種用于治療和/或預(yù)防有需要的受試者的一種或多種肥胖相關(guān)障礙的方法，該方法包括向該受試者施用治療有效量的本文公開的益生菌組合物中的任一種或本文公開的片劑、延長(zhǎng)釋放膠囊劑、延長(zhǎng)釋放顆粒劑、粉劑、小袋劑或粘性劑組合物中的任一種。在一些實(shí)施例中，該肥胖相關(guān)障礙是選自由以下組成的組的一種或多種障礙：肥胖、代謝綜合征、糖尿病、胰島素缺乏相關(guān)障礙、胰島素抵抗相關(guān)障礙、葡萄糖耐受不良、異常脂質(zhì)代謝、非酒精性脂肪性肝病、肝脂肪變性、瘦素抵抗、抵抗素水平下降和/或心血管疾病。在一些實(shí)施例中，心血管疾病是以下中的一種或多種：冠心病、心肌病、缺血性心臟病、心力衰竭、外周動(dòng)脈疾病、高血壓、炎性心臟病、瓣膜性心臟病和/或動(dòng)脈瘤。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該方法使得受試者的以下中的一種或多種的產(chǎn)生增加：胍丁胺、肌肽、ile-pro-pro和val-pro-pro生物活性三肽、辛酸、短鏈脂肪酸和/或支鏈酮酸。

7、在另一方面，本文提供了一種用于治療和/或預(yù)防有需要的受試者的病毒感染的方法，該方法包括向該受試者施用治療有效量的本文公開的益生菌組合物中的任一種或本文公開的片劑、延長(zhǎng)釋放膠囊劑、延長(zhǎng)釋放顆粒劑、粉劑、小袋劑或粘性劑組合物中的任一種。在一些實(shí)施例中，該方法使受試者的噴昔洛韋(penciclovir)的產(chǎn)生增加。

8、在一方面，本文提供了一種用于預(yù)防和/或治療有需要的受試者的一種或多種肥胖相關(guān)障礙的組合物，該組合物包含本文公開的益生菌組合物中的任一種或本文公開的片劑、延長(zhǎng)釋放膠囊劑、延長(zhǎng)釋放顆粒劑、粉劑、小袋劑或粘性劑組合物中的任一種。在一些實(shí)施例中，該肥胖相關(guān)障礙是選自由以下組成的組的一種或多種障礙：肥胖、代謝綜合征、糖尿病、胰島素缺乏相關(guān)障礙、胰島素抵抗相關(guān)障礙、葡萄糖耐受不良、異常脂質(zhì)代謝、非酒精性脂肪性肝病、肝脂肪變性、瘦素抵抗、抵抗素水平下降和/或心血管疾病。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，心血管疾病是以下中的一種或多種：冠心病、心肌病、缺血性心臟病、心力衰竭、外周動(dòng)脈疾病、高血壓、炎性心臟病、瓣膜性心臟病和/或動(dòng)脈瘤。在本文公開的任何實(shí)施例中的一些實(shí)施例中，該組合物使得受試者的以下中的一種或多種的產(chǎn)生增加：胍丁胺、肌肽、ile-pro-pro和val-pro-pro生物活性三肽、辛酸、短鏈脂肪酸和/或支鏈酮酸。

9、在另一方面，本文提供了一種用于預(yù)防和/或治療有需要的受試者的病毒感染的組合物，該組合物包含本文公開的益生菌組合物中的任一種或本文公開的片劑、延長(zhǎng)釋放膠囊劑、延長(zhǎng)釋放顆粒劑、粉劑、小袋劑或粘性劑組合物中的任一種。在一些實(shí)施例中，該組合物使受試者的噴昔洛韋的產(chǎn)生增加。

10、本文所述的方面和實(shí)施例中的每一個(gè)能夠一起使用，除非明確地或清楚地從實(shí)施例或方面的上下文中排除。

11、在整個(gè)說(shuō)明書中，引用了各種專利、專利申請(qǐng)和其他類型的出版物(例如，期刊文章、電子數(shù)據(jù)庫(kù)條目等)。出于所有目的，本文所引用的所有專利、專利申請(qǐng)和其他出版物的公開內(nèi)容通過引用以其全文特此并入。