基于DNABarcoding 的黃顙魚、云斑鮰和鱸魚及其生物制品鑒別試劑盒的制作方法
【專利摘要】本發(fā)明公開了一種基于DNABarcoding的黃顙魚、云斑鮰和鱸魚及其生肉制品的一種鑒別方法。通過對編輯好的堿基序列長度進行比較來鑒別這3種魚類及其生肉制品,該方法是基于DNABarcoding建立的,不受被鑒定材料的形態(tài)限制,即便是個體的組織碎片,也能得出準確的結(jié)論,因此可廣泛用于魚類及其生肉制品的準確鑒定。
【專利說明】基于DNABarcoding的黃顙魚、云斑鮰和鱸魚及其生物制 品鑒別試劑盒
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明公開了一種魚類的鑒別方法,尤其涉及到一種基于DNA Barcoding的黃顙 魚、云斑鮰和鱸魚鑒別方法。
【背景技術(shù)】
[0002] 魚類作為水生環(huán)境的指標生物,不僅可做為水體凈化指標,還可以作為外來物種 入侵檢驗指標,同時魚類多樣性指標也可以反映其生境狀態(tài)。近年來,隨著我國經(jīng)濟的高速 發(fā)展,生態(tài)問題日益突出,為外來物種的入侵提供了便利條件,給當?shù)佤~類開發(fā)和保護帶來 隱憂。如何快速有效的識別魚類成為迫切需要解決的問題。但是,由于傳統(tǒng)的形態(tài)分類學(xué) 目前得不到足夠的重視,形態(tài)分類的專業(yè)人員逐步減少,影響了魚類資源保護以及生境研 究等工作。
[0003] 近年來廣泛發(fā)展的一種由四川大學(xué)研發(fā)出的魚類分子生物學(xué)快速鑒別方法 CN200510022323. 1,是通過編碼魚類RNA的核DNA序列的保守性及其轉(zhuǎn)錄間隔子的種間差 異結(jié)合傳統(tǒng)的電泳技術(shù)鑒別魚類,這種方法耗時較長,成本較高,更關(guān)鍵的是這種方法無法 用于篩選和鑒定特定的魚類。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0004] 針對現(xiàn)有技術(shù)的缺陷,本發(fā)明公開了一種黃顙魚、云斑鮰和鱸魚及其生肉制品的 鑒別方法,通過對編輯好的堿基序列長度進行比較來鑒別多種魚類中是否有這3種魚類中 的某種,該方法是基于DNA Barcoding建立的,不受被鑒定材料的形態(tài)限制,即便是個體的 組織碎片,也能得出準確的結(jié)論,因此可廣泛用于這3種常見魚類及其生肉制品的準確鑒 定。
[0005] 為實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用如下技術(shù)方案: 1、根據(jù)已知魚類的DNA條形碼數(shù)據(jù)庫,設(shè)計和合成多組引物。
[0006] 2、從包含這3種魚的多種魚類中提取DNA,利用引物對每個待測對象的DNA進行擴 增,根據(jù)擴增的結(jié)果,選出最佳引物和反應(yīng)條件。
[0007] 3、利用步驟(2)篩選出的引物對每個待測對象的DNA進行擴增,擴增后的序列進 行測序,然后進行數(shù)據(jù)分析,從而得到針對常見魚類DNA Barcoding數(shù)據(jù)庫。
[0008] 4、在建立DNA Barcoding數(shù)據(jù)庫后,對新的待測對象采用步驟(2)篩選出的引物 進行檢測,將其與步驟(3)的DNA Barcoding數(shù)據(jù)庫中的序列長度進行比對,從而確定其是 否為這3種魚類中的某種。
[0009] 通過上述方法,先建立對應(yīng)特定引物的準確的含有常見魚類C0I序列長度的DNA Barcoding數(shù)據(jù)庫,在后續(xù)檢測新的待測樣品是否為該3種魚時只需進行序列長度比對即 可進行鑒定得到準確結(jié)果。
[0010] 其中,在上述方法中,采用酚氯仿抽提法提取DNA。
[0011] 具體的說,通過上述方法篩選得到了 一對具有良好PCR擴增性能的引物 (F-BaL1733/F-BaH2364 :GTGGGCCTAAAAGCAGCC/AAGCTCCAAAGGGTCTTCTCGT)。
[0012] 通過上述引物,得到的這3種魚類DNABarcoding數(shù)據(jù)庫如下表1所示 表 1:DNABarcoding數(shù)據(jù)庫
[0013] 【具體實施方式】
【權(quán)利要求】
1. 基于DNABarcoding的黃顙魚、云斑鮰和S盧魚及其生肉制品鑒別試劑盒,其特征在 于它是通過對試驗所得的堿基序列長度進行比較從而準確鑒別這3種魚類及其生肉制品 的方法,簡便易行,操作容易;基于DNABarcoding的黃顙魚、云斑鮰和鱸魚及其生肉制品 的鑒別方法,包括下述步驟:(1)根據(jù)已知魚類的DNA條形碼數(shù)據(jù)庫,設(shè)計和合成多組引 物;(2)從包含這3種魚的多種魚類中提取DNA,利用引物對每個待測對象的DNA進行擴增, 根據(jù)擴增的結(jié)果,選出最佳引物和反應(yīng)條件;(3)利用步驟(2)篩選出的引物對每個待測對 象的DNA進行擴增,擴增后的序列進行測序,然后進行數(shù)據(jù)分析,從而得到針對這3種魚類 DNABarcoding數(shù)據(jù)庫;(4)在建立DNABarcoding數(shù)據(jù)庫后,對新的待測對象采用步驟 (2)篩選出的引物進行檢測,將其與步驟(3)的DNABarcoding數(shù)據(jù)庫中的序列長度進行 比對,從而確定其是否為這3種魚類中的某種。
2. 根據(jù)權(quán)利要求1的鑒定方法,其特征在于采用酚氯仿抽提法提取DNA。
3. 根據(jù)權(quán)利要求1的鑒定方法,其特征在于篩選出一組特異引物,該引物為: F-BaL1733/F-BaH2364 :GTGGGCCTAAAAGCAGCC/AAGCTCCAAAGGGTCTTCTCGT〇
4. 根據(jù)權(quán)利要求3的鑒定方法,其特征在于基于這一組引物建立的3種魚類DNA Barcoding數(shù)據(jù)庫如下所示:
一種黃顙魚、云斑鮰和鱸魚及其生肉制品的鑒別試劑盒,其特征在于包含權(quán)利要求3 中的引物。
【文檔編號】C12Q1/68GK104450882SQ201410561559
【公開日】2015年3月25日 申請日期:2014年10月22日 優(yōu)先權(quán)日:2014年10月22日
【發(fā)明者】趙生國, 邊琳鶴, 汪文強, 李永青, 郭永博, 鄭王山, 權(quán)金強, 車攏杰 申請人:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)