用于蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)分析的系統(tǒng)和方法
【專利摘要】本教導(dǎo)涉及用于分析多個(gè)樣品的熔解曲線數(shù)據(jù)的系統(tǒng)和方法的實(shí)施方案。根據(jù)多個(gè)實(shí)施方案，為了適應(yīng)蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的復(fù)雜性，熔解溫度(Tm)可通過(guò)一系列不同類型的蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)來(lái)確定，所述蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)在多種分析屬性上具有可變性。多個(gè)樣品的組合，連同數(shù)據(jù)的復(fù)雜性產(chǎn)生了以很容易方便最終用戶分析數(shù)據(jù)的方式處理所述數(shù)據(jù)的需要。本教導(dǎo)的交互式圖形用戶界面(GUI)的多個(gè)實(shí)施方案提供了可由最終用戶進(jìn)行的快速且連續(xù)的變化，從而顯示蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)以允許此類分析。
【專利說(shuō)明】用于蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)分析的系統(tǒng)和方法
[0001]相關(guān)申請(qǐng)的交叉引用:
[0002]本申請(qǐng)要求于2011年2月I日提交的美國(guó)臨時(shí)專利申請(qǐng)第61/438621號(hào)、于2011年3月8日提交的美國(guó)臨時(shí)專利申請(qǐng)第61/450306號(hào)和于2011年6月14日提交的美國(guó)臨時(shí)專利申請(qǐng)第61/496980號(hào)的優(yōu)先權(quán)，所述申請(qǐng)全部在此通過(guò)引用并入本文中。
[0003]背景
[0004]正如蛋白化學(xué)領(lǐng)域中的技術(shù)人員可獲悉的，蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)可發(fā)生很大的變化，并且可在多種分析屬性上展現(xiàn)出可變性。此類分析屬性可包括，例如但不限于曲線形狀、背景信號(hào)、信號(hào)幅度的變化以及噪聲。
[0005]用于蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)分析的本教導(dǎo)的系統(tǒng)和方法(其中可確定熔解溫度(Tm))，滿足了客觀且一致地分析蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的需要。對(duì)于蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)，例如在高通量分析中，可處理多個(gè)蛋白樣品，這可產(chǎn)生一組蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)，其在一系列分析屬性上展現(xiàn)出高可變性。
[0006]同時(shí)處理的多個(gè)樣品的組合，連同數(shù)據(jù)的復(fù)雜性，產(chǎn)生了以容易幫助最終用戶評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)的方式處理數(shù)據(jù)的需要。
[0007]附圖簡(jiǎn)述
[0008]圖1的框圖說(shuō)明了示例性計(jì)算機(jī)系統(tǒng)的元件，所述計(jì)算機(jī)系統(tǒng)可應(yīng)用于用于處理熔解曲線分析的蛋白樣品的系統(tǒng)的控制和連接中。
[0009]圖2為可用于熔解曲線分析的蛋白樣品的處理的一些儀器特征的實(shí)例的框圖。
[0010]圖3為用于分析熔解曲線數(shù)據(jù)的交互式GUI的多個(gè)實(shí)施方案的輸入示意圖/輸出示意圖。
[0011]圖4的流程圖描述了用于分析蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案。
[0012]圖5的流程圖描述了用于分析蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案。
[0013]圖6的流程圖描述了用于分析蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案。
[0014]圖7的圖示說(shuō)明了用于多相蛋白熔解的峰選擇的方法的多個(gè)實(shí)施方案。
[0015]圖8的圖示說(shuō)明了用于多相蛋白熔解的峰選擇的方法的多個(gè)實(shí)施方案。
[0016]圖9為根據(jù)本教導(dǎo)中系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案的交互式⑶I的不例性窗口。
[0017]圖1OA和圖1OB為圖9的⑶I的實(shí)施方案的示例性部分，其顯示了示例性彈出窗口的功能選擇的作用。
[0018]圖11為根據(jù)本教導(dǎo)中系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案的交互式GUI的示例性窗口。
[0019]圖12為圖9的交互式GUI的實(shí)施方案的示例性部分，其顯示了最終用戶比較熔解溫度(Tm)確定的多個(gè)實(shí)施方案的交互性質(zhì)。
[0020]圖13為圖9的交互式GUI的實(shí)施方案的示例性部分，其顯示了最終用戶選擇用于分析熔解溫度(Tm)確定的多個(gè)實(shí)施方案的目標(biāo)溫度區(qū)域的交互性質(zhì)。
[0021]圖14為圖9的交互式GUI的實(shí)施方案的示例性部分，其顯示了用于觀察熔解溫度(Tffl)確定的多個(gè)實(shí)施方案的選擇數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)的擬合的設(shè)施。
[0022]圖15為本教導(dǎo)中交互式GUI的實(shí)施方案的示例性部分，其顯示了用于觀察顯示多相熔解的數(shù)據(jù)的擬合的設(shè)施。
[0023]圖16為圖14的交互式⑶I的實(shí)施方案的示例性部分，其顯示了用于觀察顯示多相的數(shù)據(jù)的擬合的設(shè)施。
[0024]圖17A和圖17B顯示了根據(jù)提供蛋白熔解分析的系統(tǒng)的多個(gè)實(shí)施方案的交互式GUI的特征，其顯示了用于觀察曲線與共有y軸對(duì)齊的多條曲線的設(shè)施。
[0025]圖18為顯示了用于傳送重復(fù)數(shù)據(jù)組相關(guān)信息的本教導(dǎo)中的多個(gè)實(shí)施方案的交互式⑶I的特征。
[0026]圖19的圖表描述了根據(jù)本教導(dǎo)中交互式GUI的系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案,其描述了最終用戶可接收的標(biāo)志通知的多種條件圖20描述了根據(jù)提供蛋白熔解分析的系統(tǒng)的多個(gè)實(shí)施方案的交互式GUI的特征的示例性部分，其顯示了用于觀察多種參數(shù)對(duì)重復(fù)數(shù)據(jù)組的影響的設(shè)施。
[0027]圖21描述了根據(jù)提供蛋白熔解分析的系統(tǒng)的多個(gè)實(shí)施方案的交互式GUI的特征的示例性部分，其顯示了經(jīng)由示例性彈出窗口的選擇用于觀察多種參數(shù)對(duì)重復(fù)數(shù)據(jù)組的影響的設(shè)施。
[0028]圖22是圖19的交互式GUI的實(shí)施方案的示例性部分，其顯示了用于觀察多種參數(shù)對(duì)重復(fù)數(shù)據(jù)組的影響的設(shè)施。
[0029]圖23是圖19的交互式GUI的實(shí)施方案的示例性部分，其顯示了用于觀察多種參數(shù)對(duì)重復(fù)數(shù)據(jù)組的影響的設(shè)施。
[0030]圖24A和圖24B為本教導(dǎo)中交互式⑶I的實(shí)施方案的示例性部分,其顯示了用于觀察顯示出雙相熔解的所選數(shù)據(jù)集的設(shè)施。圖24C是本教導(dǎo)的交互式GUI的實(shí)施方案的示例性部分，其顯示了用于觀察多種參數(shù)對(duì)圖24A和圖24B中選擇的數(shù)據(jù)集的重復(fù)數(shù)據(jù)組的影響的設(shè)施。
[0031]圖25A描述了根據(jù)提供蛋白熔解分析的系統(tǒng)的多個(gè)實(shí)施方案的交互式GUI的特征的示例性部分，其顯示了經(jīng)由示例性彈出窗口的選擇用于觀察Λ 所選正閾值的結(jié)果的設(shè)施。圖25Β是圖25Α的交互式GUI的實(shí)施方案的示例性部分，其顯示了用于觀察落入所選正閾值的重復(fù)數(shù)據(jù)組的設(shè)施。
[0032]圖26Α描述了本教導(dǎo)中交互式⑶I的特征的示例性部分，其顯示了經(jīng)由示例性彈出窗口的選擇用于觀察Λ Tm的所選負(fù)閾值的結(jié)果的設(shè)施。圖26Β是圖25Α的交互式GUI的實(shí)施方案的示例性部分，其顯示了用于觀察落入所選負(fù)閾值的重復(fù)數(shù)據(jù)組的設(shè)施。
[0033]詳述
[0034]本教導(dǎo)涉及容易幫助最終用戶分析蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的系統(tǒng)和方法的實(shí)施方案。根據(jù)多個(gè)實(shí)施方案，熔解溫度CU可通過(guò)一系列不同類型的蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)從蛋白熱穩(wěn)定性研究來(lái)確定，所述蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)可在多種分析屬性上展現(xiàn)出可變性。對(duì)于多個(gè)實(shí)施方案，分析屬性可包括，例如但不限于曲線形狀、背景信號(hào)、信號(hào)幅度的變化以及噪聲。另夕卜，多個(gè)樣品可在多種實(shí)驗(yàn)條件下進(jìn)行處理，從而產(chǎn)生最終用戶可評(píng)價(jià)的大量數(shù)據(jù)。對(duì)于多個(gè)實(shí)施方案，由于產(chǎn)生數(shù)據(jù)的復(fù)雜性和數(shù)量，本教導(dǎo)的系統(tǒng)和方法提供了最終用戶分析和評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)的容易便利性。根據(jù)多個(gè)實(shí)施方案，提供了交互式圖形用戶界面(GUI)以方便最終用戶分析和評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)。在多個(gè)實(shí)施方案中，交互式GUI可為能提供允許最終用戶連續(xù)并快速分析蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的各種特征的交互式工具。根據(jù)多個(gè)實(shí)施方案，交互式GUI可允許最終用戶連續(xù)并快速分析和評(píng)價(jià)蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)和用于確定Tm的數(shù)據(jù)亞集。對(duì)于多個(gè)實(shí)施方案，交互式GUI可允許最終用戶連續(xù)并快速分析和評(píng)價(jià)蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)和關(guān)于重復(fù)組數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)亞集，例如多個(gè)實(shí)驗(yàn)變量對(duì)重復(fù)數(shù)據(jù)集的影響，以及與所選組的蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)有關(guān)的重復(fù)的集中趨勢(shì)和方差。
[0035]本領(lǐng)域技術(shù)人員可認(rèn)識(shí)運(yùn)用蛋白的熔解溫度(Tm)的確定情況的各種測(cè)定。其中具有例如三級(jí)結(jié)構(gòu)的蛋白，從所述三級(jí)結(jié)構(gòu)變成無(wú)規(guī)卷曲結(jié)構(gòu)的過(guò)程在本領(lǐng)域中被稱為，例如但不限于蛋白變性、蛋白解折疊和蛋白熔解。此外，在多種樣品溶液條件下，蛋白可顯示出針對(duì)該蛋白所觀察到的Tm的變化或移位為所述樣品溶液條件的函數(shù)。多個(gè)術(shù)語(yǔ)例如熱熔解測(cè)定(TMA)、熱轉(zhuǎn)移測(cè)定(TSA)、蛋白熱轉(zhuǎn)移(PTS)分析和差示掃描熒光光譜(DSF)是其中一種或多種蛋白的Tm的確定情況對(duì)分析是至關(guān)重要的領(lǐng)域中的術(shù)語(yǔ)的實(shí)例。
[0036]關(guān)于蛋白化學(xué)適用的測(cè)量科學(xué)的方面，可以觀察到檢測(cè)器信號(hào)幅度的變化為蛋白折疊狀態(tài)的變化的函數(shù)。在這方面，由于熒光信號(hào)幅度隨施加于蛋白樣品的溫度而變化，可基于所述熒光信號(hào)幅度的增加或減少來(lái)進(jìn)行多種分析。
[0037]例如，在多種分析中，信號(hào)幅度可源自蛋白的氨基酸殘基例如色氨酸。如本領(lǐng)域的技術(shù)人員所獲悉的，色氨酸的最大熒光發(fā)射的強(qiáng)度、量子產(chǎn)率和波長(zhǎng)是非常依賴于溶劑的。隨著色氨酸殘基周圍溶劑極性的降低，熒光色譜位移至較短的波長(zhǎng)并且熒光的強(qiáng)度增加。因此，當(dāng)?shù)鞍捉庹郫B時(shí)，埋藏的色氨酸殘基可暴露于更極性水溶劑環(huán)境中，以致從折疊狀態(tài)到解折疊狀態(tài)可觀察到減少的信號(hào)幅度。
[0038]不是使用源自蛋白分子的固有信號(hào)，其它分析可運(yùn)用染料以指示蛋白的折疊狀態(tài)。例如，可運(yùn)用例如Sypro?Orange的熒光染料以監(jiān)測(cè)蛋白的折疊狀態(tài)。對(duì)于極性溶劑
環(huán)境中的Sypro? Orange，觀察到熒光信號(hào)的淬滅。對(duì)于與溶液中折疊蛋白的表面基團(tuán)相
關(guān)的SypiO?Orange，所述染料是在水環(huán)境中，以致其熒光信號(hào)被淬滅。當(dāng)?shù)鞍桌美?br> 熱解折疊來(lái)解折疊時(shí)，可暴露疏水區(qū)或疏水殘基。接著Sypro?Omnge可結(jié)合疏水區(qū)或
疏水殘基，從而可增加熒光。對(duì)于此類Sypro?Orange測(cè)定，接著可觀察到從折疊狀態(tài)到
解折疊狀態(tài)增加的信號(hào)幅度。染料例如1-苯胺基萘-8-磺酸(1，8-ANS)和4，4’ - 二苯胺基-1，I’ -聯(lián)萘_5，5’ - 二磺酸(雙-ANS)，其在水環(huán)境中淬滅，已顯示可用于監(jiān)測(cè)蛋白的折疊,其中，1,8-ANS和雙-ANS的熒光在例如蛋白再折疊的過(guò)程中可大大增加。
[0039]如蛋白質(zhì)科學(xué)領(lǐng)域中的普通技術(shù)人員所獲悉的，可出于多種原因在學(xué)術(shù)界以及工業(yè)中進(jìn)行蛋白熱穩(wěn)定性的監(jiān)測(cè)。為了研究例如由定向誘變研究所引起的靶蛋白的突變，可進(jìn)行例如但不限于，蛋白熔解曲線研究或熱研究。此外，可進(jìn)行蛋白熱穩(wěn)定性研究以篩選由于多種體外處理和保存條件對(duì)蛋白穩(wěn)定性的影響。此類蛋白熱穩(wěn)定性研究可篩選多種添加物，例如緩沖液、配體和有機(jī)試劑可以對(duì)目標(biāo)蛋白的熱穩(wěn)定性產(chǎn)生的影響。侯選藥物對(duì)蛋白靶標(biāo)的結(jié)合的高通量篩選也可通過(guò)侯選藥物的結(jié)合可以對(duì)蛋白熱穩(wěn)定性產(chǎn)生的影響來(lái)監(jiān)測(cè)。因此，鑒定影響蛋白熱穩(wěn)定性的條件可提高影響蛋白純化、結(jié)晶和功能性表征的多種所需條件的鑒定。
[0040]正如隨后將更詳細(xì)討論的，系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案可運(yùn)用從蛋白熔解測(cè)定的全部限定的溫度范圍收集起來(lái)的檢測(cè)器信號(hào)數(shù)據(jù)。此類信號(hào)可存儲(chǔ)于各種計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)中。在本教導(dǎo)的多個(gè)實(shí)施方案中，可提供計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品，其可包括有形計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì)，其內(nèi)容包括具有這樣的指令的程序，當(dāng)在處理器上實(shí)施時(shí)，該指令執(zhí)行用于向最終用戶提供連續(xù)并快速分析和評(píng)價(jià)蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的能力的方法。
[0041]圖1的框圖說(shuō)明了可用于根據(jù)多個(gè)實(shí)施方案執(zhí)行處理功能的計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100，依靠該計(jì)算機(jī)系統(tǒng)可實(shí)施本教導(dǎo)的實(shí)施方案。計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100可包括一個(gè)或多個(gè)處理器，例如處理器104。處理器104可利用通用用途或特殊用途的處理引擎(例如微處理器、控制器或其它控制邏輯)來(lái)實(shí)施。在該實(shí)例中，處理器104與總線102或其它通信介質(zhì)連接。
[0042]此外，應(yīng)理解的是，圖1的計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100可以多種形式的任何一種呈現(xiàn)，例如機(jī)架式計(jì)算機(jī)、大型機(jī)、超級(jí)計(jì)算機(jī)、服務(wù)器、客戶端、臺(tái)式電腦、筆記本電腦、平板電腦、手持計(jì)算設(shè)備(如PDA、手機(jī)、智能手機(jī)、掌上電腦等)、集群網(wǎng)格、上網(wǎng)本、嵌入式系統(tǒng)、或者任何其它類型的特殊用途或通用用途的計(jì)算設(shè)備，其是給定應(yīng)用或環(huán)境所需或適用的。此外，計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100可包括傳統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)包括客戶端/服務(wù)器環(huán)境以及一個(gè)或多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)服務(wù)器，或帶有LIS/LIMS基礎(chǔ)設(shè)施的集成。一些傳統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)，包括局域網(wǎng)(LAN)或廣域網(wǎng)(WAN)，并包括無(wú)線元件和/或有線元件，是本領(lǐng)域中已知的。此外，客戶端/服務(wù)器環(huán)境、數(shù)據(jù)庫(kù)服務(wù)器和網(wǎng)絡(luò)在本領(lǐng)域中都是有良好記錄的。
[0043]計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100可包括總線102或用于通信的其它通信機(jī)制，以及與總線102耦合的用于處理信息的處理器104。
[0044]計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100還包括存儲(chǔ)器106，其可為與總線102耦合的用于存儲(chǔ)由處理器104執(zhí)行的指令的隨機(jī)存取存儲(chǔ)器(RAM)或其它動(dòng)態(tài)存儲(chǔ)器。存儲(chǔ)器106還可用于在由處理器104執(zhí)行指令的執(zhí)行期間存儲(chǔ)臨時(shí)變量或其它中間信息。計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100進(jìn)一步包括與總線102耦合的用于存儲(chǔ)靜態(tài)信息和處理器104的指令的只讀存儲(chǔ)器(ROM) 108或其它靜態(tài)存儲(chǔ)設(shè)備。
[0045]計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100還可包括存儲(chǔ)設(shè)備110，例如提供與總線102耦合的用于存儲(chǔ)信息和指令的磁盤、光盤、或固態(tài)驅(qū)動(dòng)器(SSD)。存儲(chǔ)設(shè)備110可包含介質(zhì)驅(qū)動(dòng)器和移動(dòng)式存儲(chǔ)接口。介質(zhì)驅(qū)動(dòng)器可包括驅(qū)動(dòng)器或其它機(jī)制以支持固定式存儲(chǔ)介質(zhì)或移動(dòng)式存儲(chǔ)介質(zhì)，例如硬盤驅(qū)動(dòng)器、軟盤驅(qū)動(dòng)器、磁帶驅(qū)動(dòng)器、光盤驅(qū)動(dòng)器、⑶驅(qū)動(dòng)器或DVD驅(qū)動(dòng)器(R或RW)、閃存驅(qū)動(dòng)器或其它移動(dòng)式或固定式介質(zhì)驅(qū)動(dòng)器。正如這些實(shí)例所示，存儲(chǔ)介質(zhì)可包括在其中存儲(chǔ)有特定的計(jì)算機(jī)軟件、指令和/或數(shù)據(jù)的計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì)。
[0046]在備選的實(shí)施方案中，存儲(chǔ)設(shè)備110可包括其它類似的工具，用于允許將計(jì)算機(jī)程序或者其它指令或數(shù)據(jù)加載到計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100中。此類工具可包括，例如移動(dòng)式存儲(chǔ)單元和接口，例如程序盒和盒式接口、移動(dòng)式存儲(chǔ)器(例如，閃存或其它移動(dòng)式存儲(chǔ)器模塊)和存儲(chǔ)器插槽以及允許軟件和數(shù)據(jù)從存儲(chǔ)設(shè)備110傳輸至計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100的其它移動(dòng)式存儲(chǔ)單元和接口。
[0047]計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100還可包括通信接口 118。通信接口 118可用于允許軟件和數(shù)據(jù)在計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100和外部設(shè)備之間傳輸。通信接口 118的實(shí)例可包括調(diào)制解調(diào)器、網(wǎng)絡(luò)接口(如以太網(wǎng)或其它NIC卡)、通信端口(例如如，USB端口、RS-232C串行端口)、PCMCIA插槽、PCMCIA卡、藍(lán)牙等。經(jīng)由通信接口 118傳輸?shù)能浖蛿?shù)據(jù)為這樣的信號(hào)形式，該信號(hào)可以為能被通信接口 118接收的電子信號(hào)、電磁信號(hào)、光信號(hào)或其它信號(hào)。這些信號(hào)可通過(guò)諸如無(wú)線介質(zhì)、電線或電纜、光纖或其它通信介質(zhì)的通道由通信接口 118來(lái)發(fā)送和接收。通道的一些實(shí)例包括電話線、手機(jī)鏈接、RF鏈路、網(wǎng)絡(luò)接口、局域網(wǎng)或廣域網(wǎng)及其它通信通道。
[0048]計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100可通過(guò)通信接口 118與顯示器112通信，例如用于向計(jì)算機(jī)用戶顯示信息的陰極射線管(CRT)、液晶顯示器(LCD)、發(fā)光二極管(LED)顯示器。在多個(gè)實(shí)施方案中，計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100可通過(guò)總線與顯示器耦合。輸入設(shè)備114，包括字母數(shù)字鍵和其它鍵，與總線102耦合，用于向處理器104通信信息和命令選擇。例如，輸入設(shè)備也可為顯示器，如配置具有觸屏輸入功能的IXD顯示器。用戶輸入設(shè)備的另一種類型是光標(biāo)控制116，例如鼠標(biāo)、軌跡球或光標(biāo)方向鍵，用于向處理器104通信方向信息和命令選擇和用于在顯示器112上控制光標(biāo)的移動(dòng)。該輸入設(shè)備通常在兩個(gè)軸(第一軸(例如，X)和第二軸(例如，y))上具有二維自由度，其允許設(shè)備在平面內(nèi)指定位置。計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100提供了數(shù)據(jù)處理并對(duì)此類數(shù)據(jù)提供了置信水平。與本教導(dǎo)中實(shí)施方案的某些實(shí)施一致，計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100提供數(shù)據(jù)處理和置信值，以響應(yīng)處理器104執(zhí)行的包含于存儲(chǔ)器106中的一個(gè)或多個(gè)指令的一個(gè)或多個(gè)序列。此類指令可從另一種計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)，如存儲(chǔ)設(shè)備110讀入存儲(chǔ)器106中。存儲(chǔ)器106中包含的指令序列的執(zhí)行導(dǎo)致處理器104進(jìn)行本文所述的處理狀態(tài)?；蛘撸步泳€電路可用于代替或結(jié)合軟件指令以實(shí)施本教導(dǎo)的實(shí)施方案。因此，本教導(dǎo)中實(shí)施方案的實(shí)施并不限于硬件電路和軟件的任何特定組合。
[0049]本文所用術(shù)語(yǔ)“計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)”和“計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品”通常是指參與向處理器104提供用于執(zhí)行的一個(gè)或多個(gè)序列或一個(gè)或多個(gè)指令的任何介質(zhì)。此類指令，通常被稱作“計(jì)算機(jī)程序代碼”(其可以計(jì)算機(jī)程序或其它分組的形式分組)，當(dāng)執(zhí)行時(shí)，能使計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100進(jìn)行本發(fā)明的實(shí)施方案的特征或功能。計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)的這些形式和其它形式可采用很多形式，包括但不限于非易失性介質(zhì)、易失性介質(zhì)和傳輸介質(zhì)。非易失性介質(zhì)包括例如，固態(tài)硬盤、光盤或磁盤，比如存儲(chǔ)設(shè)備110，易失性介質(zhì)包括動(dòng)態(tài)存儲(chǔ)器，例如存儲(chǔ)器106。傳輸介質(zhì)包括同軸電纜、銅線和光纖，包括與總線102的連通性。
[0050]計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)的常見形式包括例如，軟盤、柔性盤、硬盤、磁帶或任何其它磁性介質(zhì)、CD-ROM、任何其它光學(xué)介質(zhì)、穿孔卡、紙帶、帶有孔圖案的任何其它物理介質(zhì)、RAM、PROM和EPROM、FLASH-EPR0M、任何其它存儲(chǔ)芯片或盒、如下文所述的載波，或者計(jì)算機(jī)可讀取的任何其它介質(zhì)。
[0051]計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)的各種形式可攜帶一個(gè)或多個(gè)指令的一個(gè)或多個(gè)序列至處理器104用于執(zhí)行。例如，所述指令最初可攜帶在遠(yuǎn)程計(jì)算機(jī)的磁盤上。所述遠(yuǎn)程計(jì)算機(jī)可將所述指令加載到其動(dòng)態(tài)存儲(chǔ)器中并用調(diào)制解調(diào)器通過(guò)電話線發(fā)送指令。計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100的本地調(diào)制解調(diào)器可接收電話線上的數(shù)據(jù)并用紅外發(fā)射器將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成紅外線信號(hào)。與總線102耦合的紅外檢測(cè)器可接收紅外線信號(hào)中攜帶的數(shù)據(jù)并將所述數(shù)據(jù)置于總線102上。總線102將所述數(shù)據(jù)攜帶至存儲(chǔ)器106，從存儲(chǔ)器106中，處理器104檢索并執(zhí)行指令。在由處理器104執(zhí)行之前或之后，通過(guò)存儲(chǔ)器106接收的指令可任選存儲(chǔ)于存儲(chǔ)設(shè)備110上。
[0052]若適用的話，本領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)認(rèn)識(shí)到，多個(gè)實(shí)施方案的操作可使用硬件、軟件、固件或其組合來(lái)實(shí)施。例如，可在軟件、固件或硬線邏輯的控制下使用處理器或其它數(shù)字電路來(lái)進(jìn)行某些處理。(正如本領(lǐng)域技術(shù)人員進(jìn)行所述功能應(yīng)認(rèn)識(shí)到的，本文術(shù)語(yǔ)“邏輯”是指固定的硬件、可編程邏輯和/或其合適的組合)。軟件和固件可存儲(chǔ)于計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)上。一些其它處理可利用模擬電路來(lái)實(shí)施，如本領(lǐng)域普通技術(shù)人員所熟知的。此外，存儲(chǔ)器或其它存儲(chǔ)以及通信元件可應(yīng)用于本發(fā)明的實(shí)施方案中。[0053]為清楚起見，應(yīng)理解的是以上描述已參考不同的功能單元和處理器來(lái)描述本發(fā)明的實(shí)施方案。然而，顯而易見的是在不損害本發(fā)明的情況下可使用不同的功能單元、處理器或域之間功能性的任何合適的分布。例如，說(shuō)明由單獨(dú)的處理器或控制器執(zhí)行的功能可通過(guò)同一處理器或同一控制器來(lái)執(zhí)行。因此，提及特定的功能單元僅被視為提及用于提供所述功能的合適方式，而非指示嚴(yán)格的邏輯或物理結(jié)構(gòu)或組織。
[0054]本教導(dǎo)中用于分析蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的方法和系統(tǒng)的多個(gè)實(shí)施方案可運(yùn)用圖2所示的框圖中所述的循環(huán)儀的多個(gè)實(shí)施方案。
[0055]正如前面所提及的，其中蛋白可解折疊的一種方法是通過(guò)利用熱解折疊，其中隨著溫度的升高可進(jìn)行解折疊。本教導(dǎo)中用于分析蛋白熔解曲線的方法和系統(tǒng)的多個(gè)實(shí)施方案可運(yùn)用如圖2所示框圖中所述的熱循環(huán)儀的多個(gè)實(shí)施方案。如圖2所示，熱循環(huán)儀可包括置于樣品支持設(shè)備中含有的多份樣品216之上的加熱蓋214。在多個(gè)實(shí)施方案中，樣品支持設(shè)備也可為具有多個(gè)樣品區(qū)的玻璃的、金屬的或塑料的載片或基底，其樣品區(qū)在所述樣品區(qū)和加熱蓋214之間有蓋。樣品支持設(shè)備的一些實(shí)例可包括，但不局限于多孔板，例如標(biāo)準(zhǔn)的微量滴定的96孔板、384孔板、能夠在每次分析時(shí)處理幾千個(gè)樣品的微型設(shè)備、或微卡、或基本平的支持物，例如各種微流體裝置，微卡設(shè)備和從例如但不限于玻璃的、金屬的或塑料的載片或基底構(gòu)建的微芯片設(shè)備。樣品支持設(shè)備的多個(gè)實(shí)施方案的樣品區(qū)可包括凹陷、凹口、洞、隆起及其組合，以在載片或基底的表面上形成規(guī)則或不規(guī)則的陣列來(lái)定制。熱循環(huán)儀的多個(gè)實(shí)施方案可包括樣品塊218、用于加熱和冷卻的元件220以及熱交換器222。
[0056]熱循環(huán)儀的多個(gè)實(shí)施方案可同時(shí)處理多個(gè)樣品，并且可用于蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的生成和采集。在圖2中，熱循環(huán)系統(tǒng)200的多個(gè)實(shí)施方案提供了針對(duì)多個(gè)生物樣品中的各樣品的運(yùn)行時(shí)間信號(hào)采集的檢測(cè)系統(tǒng)，在進(jìn)行用于產(chǎn)生蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的全部溫度范圍內(nèi)。檢測(cè)系統(tǒng)可具有發(fā)射電磁能量的照明源和檢測(cè)器或成像器210，用于從樣品支持設(shè)備中的樣品216中接收電磁能量。因此，雖然熱循環(huán)儀可為蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的生成和采集的可用平臺(tái)，但本領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)認(rèn)識(shí)到，具有檢測(cè)和樣品調(diào)溫能力的儀器可用于產(chǎn)生蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)。
[0057]控制系統(tǒng)224可用于控制檢測(cè)器、加熱蓋和熱塊組件的功能。所述控制系統(tǒng)可通過(guò)熱循環(huán)儀200的用戶界面226由最終用戶訪問(wèn)。如圖1所示，計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100可用于提供熱循環(huán)儀的功能的控制以及用戶界面功能的控制。此外，計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100可提供數(shù)據(jù)處理、顯示和報(bào)告準(zhǔn)備功能。所有此類儀器控制功能可局部專用于熱循環(huán)儀，或者計(jì)算機(jī)系統(tǒng)100可提供所述控制、分析和報(bào)告功能的部分或全部的遠(yuǎn)程控制。
[0058]如上所述，大量蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)可作為用于同一運(yùn)行中分析的大量樣品各自的蛋白熔解測(cè)定的整個(gè)限定的溫度范圍中收集的檢測(cè)器信號(hào)數(shù)據(jù)來(lái)生成。由于大量的數(shù)據(jù)，連同蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的復(fù)雜性，本教導(dǎo)中系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案提供了計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)的實(shí)施方案，所述計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)可從收集為檢測(cè)器信號(hào)輸出的初始蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)生成已處理的數(shù)據(jù)，所述檢測(cè)器信號(hào)輸出為樣品支持設(shè)備中各樣品的溫度的函數(shù)。
[0059]此外，本教導(dǎo)中系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案提供了計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)的實(shí)施方案，所述計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)可允許最終用戶利用交互式用戶界面來(lái)靈活地和動(dòng)態(tài)地分析大數(shù)據(jù)集及其所選子集。此類交互式用戶界面可有助于最終用戶選擇以下:例如但不限于一組新的分析參數(shù)，可分析數(shù)據(jù)的另一方法、為所選的重復(fù)的數(shù)據(jù)集檢查數(shù)據(jù)、以及用于所述重復(fù)集的相關(guān)統(tǒng)計(jì)以及檢查哪組數(shù)據(jù)集可以落入與目標(biāo)樣品集相比的所選閾值內(nèi)。
[0060]圖3描述了旨在傳達(dá)這樣的過(guò)程的輸入圖/輸出圖，通過(guò)該過(guò)程，用于分析蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案可提供最終用戶動(dòng)態(tài)分析蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的大數(shù)據(jù)集的能力。如圖3所示，初始輸入可包括，例如但不限于板設(shè)置信息(set-upinformation)以及在整個(gè)運(yùn)行中對(duì)各樣品收集的檢測(cè)器輸出信號(hào)。板設(shè)置信息包括識(shí)別樣品名稱、以及待測(cè)試條件例如緩沖液、配體或測(cè)試化合物的類型、蛋白樣品的類型等。在多個(gè)實(shí)施方案中，板設(shè)置信息稍后可用于識(shí)別復(fù)孔并展示針對(duì)包括重復(fù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果在內(nèi)的各測(cè)試條件的最終結(jié)果。根據(jù)本教導(dǎo)中系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案，板設(shè)置信息可作為初始輸入由最終用戶在分析前輸入，并接著可以輸入生成結(jié)果的自動(dòng)模式的多個(gè)實(shí)施方案中的分析引擎中。此類信息提供了條件值，所述條件例如但不限于樣品類型、樣品濃度、緩沖液類型以及很多其它的測(cè)定條件。在多個(gè)實(shí)施方案中，板設(shè)置信息可在運(yùn)行后通過(guò)最終用戶利用測(cè)定條件的值的手工分配作為二次輸入來(lái)手動(dòng)編輯。對(duì)于本教導(dǎo)中系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案，分析組可通過(guò)最終用戶在運(yùn)行前作為初始輸入或在運(yùn)行后的分析期間作為二次輸入來(lái)限定。在多個(gè)實(shí)施方案中，最終用戶可從整個(gè)樣品支持設(shè)備(例如微量滴定板)限定樣品數(shù)據(jù)作為分析組。對(duì)于多個(gè)實(shí)施方案，分析組可包含來(lái)自多個(gè)樣品支持設(shè)備的樣品數(shù)據(jù)。在多個(gè)實(shí)施方案中，分析組可由最終用戶限定為來(lái)自選擇的樣品區(qū)，例如微量滴定板的孔中的樣品數(shù)據(jù)，所述選擇的樣品區(qū)選自一個(gè)或多個(gè)樣品支持設(shè)備。在多個(gè)實(shí)施方案中，選自單個(gè)樣品支持設(shè)備的樣品區(qū)的樣品數(shù)據(jù)可分成多個(gè)分析組。分析組可由在相同或不同的條件下測(cè)定的一個(gè)樣品的數(shù)據(jù)組成，或可由相同或不同的條件下測(cè)定的多個(gè)樣品的數(shù)據(jù)組成，或以上的任何組合。因此，本教導(dǎo)中系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案向最終用戶提供了限定的動(dòng)態(tài)靈活性，例如但不限于板設(shè)置信息、分析組、分析設(shè)置和閾值設(shè)置。
[0061]如圖3的分析引擎所示，計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)的多個(gè)實(shí)施方案可采用初始輸入或二次輸入并生成已處理的熔解曲線數(shù)據(jù)，例如但不限于，檢測(cè)器信號(hào)響應(yīng)相對(duì)溫度的熔解曲線圖、所述熔解曲線圖的η階導(dǎo)數(shù)圖、Tffl的確定、用于提醒最終用戶數(shù)據(jù)的各個(gè)方面及其分析的標(biāo)志、以及由最終用戶識(shí)別的作為樣品重復(fù)的樣品組的重復(fù)組統(tǒng)計(jì)結(jié)果，其中多個(gè)重復(fù)組可包含分析組。自動(dòng)模式或手動(dòng)模式的分析設(shè)置利用初始輸入，例如檢測(cè)器輸出信息和板設(shè)置信息，其可用于生成如圖3所示的各樣品的孔水平的結(jié)果。最終用戶的板設(shè)置信息的輸入也可用于計(jì)算重復(fù)水平的結(jié)果和統(tǒng)計(jì)結(jié)果。在用于蛋白熔解曲線分析的系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案中，用戶界面可顯示來(lái)自初始輸入的已處理數(shù)據(jù)的結(jié)果。對(duì)于本教導(dǎo)中系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案，一旦通過(guò)用戶界面已復(fù)查來(lái)自初始輸入的已處理的數(shù)據(jù)的顯示情況，最終用戶可通過(guò)二次輸入的選擇來(lái)改變影響數(shù)據(jù)處理的參數(shù)。根據(jù)用于本教導(dǎo)的蛋白熔解曲線分析的系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案，二次輸入是繼初始輸入后發(fā)生的任何用戶輸入。在這方面，對(duì)于本教導(dǎo)中系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案，最終用戶可反復(fù)選擇用于分析和顯示數(shù)據(jù)的參數(shù)的方式數(shù)目并不受限制。此外，最終用戶可同時(shí)分析來(lái)自不同類型的計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)上存儲(chǔ)的任何初始數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)。在這方面，最終用戶可同時(shí)分析來(lái)自不同儀器、不同的運(yùn)行、不同的實(shí)驗(yàn)條件或最終用戶可期望選擇和分析蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的任何組合的數(shù)據(jù)。此類參數(shù)可包括，例如但不限于:分析設(shè)置、閾值分析、分析模式或Tm可如何確定的方法的選擇、用于比較樣品或重復(fù)組的Tm與另一樣品或另一重復(fù)組的Tm的方法、作為用戶選擇的實(shí)驗(yàn)變量的函數(shù)的重復(fù)組顯示以及作為用戶確定的閾值的函數(shù)的重復(fù)組顯示。板設(shè)置的相關(guān)信息尤其可影響需要多于一個(gè)孔的所有結(jié)果，以產(chǎn)生如ATm、重復(fù)水平的標(biāo)志和統(tǒng)計(jì)分析。
[0062]在圖4-圖6中，顯示了用于分析初始蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的方法的多個(gè)實(shí)施方案。在方法300的圖3、方法310的圖4和方法320的圖5的步驟10中，初始蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)集由用于多個(gè)樣品的處理器來(lái)接收。如前面所述，所述初始蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)包括作為多個(gè)樣品中每一個(gè)樣品的溫度的函數(shù)的檢測(cè)器信號(hào)。
[0063]參考圖4-圖6，方法300和方法310的步驟20中，可分別進(jìn)行多個(gè)樣品蛋白熔解曲線的每一個(gè)的預(yù)處理以對(duì)檢測(cè)收集的數(shù)據(jù)進(jìn)行降噪。如信號(hào)處理領(lǐng)域中的技術(shù)人員所知悉的，降噪數(shù)據(jù)可包括例如但不限于以下的處理步驟:清理、歸一化、變換、特征提取和特征選擇。對(duì)于多個(gè)實(shí)施方案，可進(jìn)行第一全局平滑(global smoothing)步驟,其中可去除較高頻率的噪聲元件。在多個(gè)實(shí)施方案中，可應(yīng)用傅立葉變換平滑。依照多個(gè)實(shí)施方案，可進(jìn)行第二局部平滑。在多個(gè)實(shí)施方案中，可進(jìn)行局部回歸平滑，其中在限定的窗口內(nèi)對(duì)樣品熔解曲線依次進(jìn)行平滑處理。對(duì)于多個(gè)實(shí)施方案，可基于諸如數(shù)據(jù)點(diǎn)和系統(tǒng)噪聲的數(shù)目來(lái)選擇窗口。依照多個(gè)實(shí)施方案，可應(yīng)用局部平滑函數(shù)例如但并不限于，二次回歸、線性回歸和Savitzky-Golay平滑函數(shù)。在多個(gè)實(shí)施方案中，可利用魯棒二次平滑函數(shù)或線性平滑函數(shù)。
[0064]參考方法300的圖4的步驟30和方法310的圖5的步驟40，對(duì)于用于分析蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的多種系統(tǒng)和方法，在預(yù)處理數(shù)據(jù)的步驟之后，可進(jìn)行選擇分析區(qū)域的步驟。
[0065]根據(jù)用于分析蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的系統(tǒng)和方法的多個(gè)實(shí)施方案，在確定分析區(qū)域的步驟后可將Boltzmann擬合應(yīng)用于樣品蛋白熔解曲線中。根據(jù)多個(gè)實(shí)施方案，可通過(guò)以下給出描述Boltzmann擬合的等式:
【權(quán)利要求】
1.系統(tǒng)，所述系統(tǒng)包括: 處理器；和 與所述處理器通信的存儲(chǔ)器；所述存儲(chǔ)器存儲(chǔ)以下指令: 通過(guò)所述處理器接收一組蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)； 從初始熔解曲線數(shù)據(jù)生成并顯示已處理的熔解曲線數(shù)據(jù)的第一數(shù)據(jù)集； 向最終用戶呈遞用于交互式分析所述已處理的蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的第一數(shù)據(jù)集的界面，其中所述交互式分析包括生成已處理的蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的第二數(shù)據(jù)集的顯示，其中所述已處理的蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的第二數(shù)據(jù)集響應(yīng)于用戶輸入而生成。
2.如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其中所述蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)包括作為最終用戶所選分析組的溫度的函數(shù)的檢測(cè)器響應(yīng)值。
3.如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其中所述第一數(shù)據(jù)集和所述第二數(shù)據(jù)集的顯示為所述數(shù)據(jù)的Boltzmann擬合的顯示。
4.如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其中所述第一數(shù)據(jù)集和所述第二數(shù)據(jù)集的顯示為所述數(shù)據(jù)的η階導(dǎo)數(shù)圖的顯示。
5.如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其中所述第一數(shù)據(jù)集和所述第二數(shù)據(jù)集的顯示為顯示重復(fù)組集中趨勢(shì)和方差的菱形圖。
6.計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)，其由處理器可執(zhí)行的用于分析蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的指令編碼，所述指令包括以下指令:` 接收多個(gè)樣品的一組蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)； 從初始熔解曲線數(shù)據(jù)生成并顯示已處理的熔解曲線數(shù)據(jù)的第一數(shù)據(jù)集；和 向最終用戶呈遞用于交互式分析所述已處理的蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的第一數(shù)據(jù)集的界面，其中所述交互式分析包括生成已處理的蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的第二數(shù)據(jù)集的顯示，其中所述已處理的蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的第二數(shù)據(jù)集響應(yīng)于用戶輸入而生成。
7.如權(quán)利要求6所述的計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)，其中所述蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)包括作為最終用戶所選分析組的溫度的函數(shù)的檢測(cè)器響應(yīng)值。
8.如權(quán)利要求6所述的計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)，其中所述第一數(shù)據(jù)集和所述第二數(shù)據(jù)集的顯示為所述數(shù)據(jù)的Boltzmann擬合的顯示。
9.如權(quán)利要求6所述的計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)，其中所述第一數(shù)據(jù)集和所述第二數(shù)據(jù)集的顯示為所述數(shù)據(jù)的η階導(dǎo)數(shù)圖的顯示。
10.如權(quán)利要求6所述的計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)，其中所述第一數(shù)據(jù)集和所述第二數(shù)據(jù)集的顯示為顯示重復(fù)組集中趨勢(shì)和方差的菱形圖。
11.計(jì)算機(jī)執(zhí)行的方法，所述方法用于確定生物樣品中基因組基因座的基因型，所述方法包括: 通過(guò)處理器接收一組蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)； 在計(jì)算機(jī)上處理該組蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)，所述處理包括: 從初始熔解曲線數(shù)據(jù)生成并顯示已處理的熔解曲線數(shù)據(jù)的第一數(shù)據(jù)集；和向最終用戶呈遞用于交互式分析所述已處理的蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的第一數(shù)據(jù)集的界面，其中所述交互式分析包括生成已處理的蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的第二數(shù)據(jù)集的顯示，其中所述已處理的蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)的第二數(shù)據(jù)集響應(yīng)于用戶輸入而生成。
12.如權(quán)利要求11所述的計(jì)算機(jī)執(zhí)行的方法，其中所述蛋白熔解曲線數(shù)據(jù)包括作為最終用戶所選分析組的溫度的函數(shù)的檢測(cè)器響應(yīng)值。
13.如權(quán)利要求11所述的計(jì)算機(jī)執(zhí)行的方法，其中所述第一數(shù)據(jù)集和所述第二數(shù)據(jù)集的顯示為所述數(shù)據(jù)的Boltzmann擬合的顯示。
14.如權(quán)利要求11所述的計(jì)算機(jī)執(zhí)行的方法，其中所述第一數(shù)據(jù)集和所述第二數(shù)據(jù)集的顯示為所述數(shù)據(jù)的η階導(dǎo)數(shù)圖的顯示。
15.如權(quán)利要求11所述的計(jì)算機(jī)執(zhí)行的方法，其中所述第一數(shù)據(jù)集和所述第二數(shù)據(jù)集的顯示為顯示重復(fù)組集中趨勢(shì)和方差的菱形圖。
【文檔編號(hào)】G06F19/26GK103688264SQ201280015278
【公開日】2014年3月26日 申請(qǐng)日期:2012年2月1日 優(yōu)先權(quán)日:2011年2月1日
【發(fā)明者】奈弗蒂塔·馬朱木達(dá)爾, 哈里森·梁, 吳若云 申請(qǐng)人:生命技術(shù)公司