專利名稱：：涉及數(shù)據(jù)模式例如譜生物標(biāo)志的系統(tǒng)和方法
技術(shù)領(lǐng)域：
：本發(fā)明一般地涉及由樣品的至少一種成分或物質(zhì)的分析來(lái)表征物理樣品。在一些特定的實(shí)施方案中，本發(fā)明涉及樣品中物質(zhì)的分級(jí)和對(duì)不同的級(jí)分進(jìn)行比較分析來(lái)限定比較數(shù)據(jù)，所述比較數(shù)據(jù)可與其它的類似數(shù)據(jù)進(jìn)行比較以提供與樣品和/或樣品中的物質(zhì)相關(guān)的信息。
背景技術(shù)：
：許多疾病和/或其它病變或病癥是由于特定蛋白質(zhì)的功能障礙和/或失調(diào)引起的。這些與疾病相關(guān)的蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)可能相對(duì)于其"正常的"或"野生型(wild-type)"對(duì)應(yīng)物發(fā)生變化，和/或可能在給定的疾病狀態(tài)下相對(duì)于"正常的"生理狀態(tài)表達(dá)更大(表達(dá)上調(diào))或更小(表達(dá)下調(diào))的量。在一些情況下，結(jié)構(gòu)和/或功能發(fā)生變化的蛋白質(zhì)可以用作與特定的人或動(dòng)物疾病相關(guān)的標(biāo)志，例如作為用于疾病早期檢測(cè)的診斷等。在許多情況下，與疾病的給定病變或其它病癥相關(guān)的特定蛋白質(zhì)是未知的。對(duì)于這些蛋白質(zhì)的鑒定會(huì)有助于開(kāi)發(fā)新的診斷檢驗(yàn)等。鑒定和表征蛋白質(zhì)標(biāo)志的一般方法是基于利用高分辨分離技術(shù)對(duì)生物材料樣品(生物流體，例如血液、血清、血漿、腦脊液、組織、細(xì)胞等)的蛋白質(zhì)組成進(jìn)行的分析。例如，可以對(duì)從對(duì)照物和實(shí)驗(yàn)樣品或種群中分離出來(lái)的蛋白質(zhì)進(jìn)行蛋白酶裂解，并且使用液相色譜(LC)偶聯(lián)串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS-MS)對(duì)其裂解產(chǎn)物進(jìn)行鑒定。許多蛋白質(zhì)分離技術(shù)基于蛋白質(zhì)從樣品中的多維分離，這通常通過(guò)二維凝膠電泳(2-DE)或二維高效液相色鐠(2D-HPLC)來(lái)進(jìn)行。可以得到病理樣品的二維(2-D)蛋白質(zhì)圖鐠并且可將其與參考樣品的二維蛋白質(zhì)圖譜進(jìn)行比較；可以比較作為(2-DE)圖鐠上的"點(diǎn)，，或2D-HPLC圖譜上的"峰"所觀察到的蛋白質(zhì)的位置，并且那些在得自病理樣品的圖鐠中存在(或不存在)但是在得自參考樣品的圖譜中不存在(或存在)的蛋白質(zhì)可被判斷為可能對(duì)應(yīng)于與病理相關(guān)的蛋白質(zhì)。此外，可以估算以點(diǎn)(或峰)的強(qiáng)度來(lái)估計(jì)的蛋白質(zhì)的量并且在病理樣品和參考樣品之間進(jìn)行比較。在一些情況下，明顯不同的那些可以被視為與病理相關(guān)。最近還認(rèn)為，存在/不存在模式和/或多種蛋白質(zhì)的相對(duì)量("特征")也可以與診斷相關(guān)，此時(shí)通過(guò)肽圖和/或質(zhì)鐠來(lái)鑒定被判斷為具有相關(guān)性的蛋白質(zhì)?？梢允褂脭?shù)學(xué)或統(tǒng)計(jì)技術(shù)例如模式識(shí)別技術(shù)來(lái)分析這些實(shí)驗(yàn)技術(shù)所產(chǎn)生的模式，并且產(chǎn)生診斷分類。然而，這種方法經(jīng)常是效率非常低下的，其原因在于例如分析給定樣品中全部蛋白質(zhì)的固有必要性，但是可能只有一小部分的蛋白質(zhì)具有任意的病理相關(guān)性。已經(jīng)開(kāi)發(fā)了幾種不同的方法用以降低蛋白質(zhì)混合物的分析復(fù)雜性。這些方法通?；谠谟媚z電泳或2D-HPLC進(jìn)行2D分析之前對(duì)原始混合物進(jìn)行分級(jí)。該方法之一是通過(guò)自由流電泳的技術(shù)來(lái)分離蛋白質(zhì)。然而，這種技術(shù)雖然對(duì)原始的蛋白質(zhì)混合物進(jìn)行了分級(jí)，但是可能導(dǎo)致對(duì)簡(jiǎn)化級(jí)分的多次2D分析，亦即雖然降低了分析的復(fù)雜性并提高了分辨力，但是它固有地大幅增加了需要進(jìn)一步分析的樣品數(shù)。另一種方法是基于蛋白質(zhì)對(duì)不同的天然配體和/或藥學(xué)化合物的親和力；然而，這種方法雖然允許根據(jù)蛋白質(zhì)的功能來(lái)分離蛋白質(zhì)，但是這種方法可能導(dǎo)致用于進(jìn)一步分析的樣品數(shù)顯著增加，并且經(jīng)常需要與樣品間的差異相關(guān)的額外知識(shí)或假設(shè)。大多數(shù)分級(jí)技術(shù)的一個(gè)缺點(diǎn)在于它們一般不能保持蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)-配體的相互作用。生物學(xué)相互作用之間的差異對(duì)于解釋和檢測(cè)樣品間的變化經(jīng)常是很重要的。此外，大多數(shù)分級(jí)技術(shù)依賴于由固定物理屬性例如分子大小或凈電荷導(dǎo)致的分離。雖然這些屬性對(duì)于區(qū)分復(fù)雜混合物中的生物分子可能非常重要，但是它們一般不涵蓋生物分子之間代表例如正常與疾病狀態(tài)的所有可能的差異，例如構(gòu)型的差異等?，F(xiàn)有的分級(jí)技術(shù)的另一重要缺點(diǎn)在于它們不能基于在例如糖基化作用模式中的結(jié)構(gòu)變化和/或構(gòu)象變化之間的差異來(lái)分離混合物。這些變化對(duì)于鑒定參與疾病狀態(tài)和/或由疾病狀態(tài)所產(chǎn)生的蛋白質(zhì)經(jīng)常是重要的。例如，如果由于遺傳變異導(dǎo)致蛋白質(zhì)錯(cuò)折疊，則蛋白質(zhì)的凈電荷和大小可能不會(huì)顯著變化，更為重要的是，蛋白質(zhì)的表達(dá)水平對(duì)于基本正常與疾病狀態(tài)而言可能是相同的。最后，個(gè)體之間的天然遺傳變異性可對(duì)生物樣品中生物分子表達(dá)水平(濃度)的極大分散度具有顯著貢獻(xiàn)。這種變異性一般需要使用統(tǒng)計(jì)學(xué)意義上的大量樣品來(lái)可靠地檢測(cè)特定的病理狀況所固有的差異，而不是遺傳變異性所固有的差異。由于診斷試驗(yàn)的敏感性和/或特異性降低，所以天然的遺傳變異性經(jīng)常成為實(shí)施基于蛋白質(zhì)標(biāo)志的診斷的明顯阻礙。雖然在分子和/或樣品表征的領(lǐng)域已經(jīng)取得了顯著的進(jìn)展，但是仍然需要改進(jìn)以增加特異性、多能性、便捷性和/或提高效率。
發(fā)明內(nèi)容本發(fā)明一般地涉及分子和/或生物分子或其它物質(zhì)的混合物的分離、分級(jí)和/或表征。例如，在一些實(shí)施方案中，本發(fā)明提供用于分析和表征生物分子混合物、包含生物分子的復(fù)合體、與生物分子相互作用的分子、和/或其類似物的系統(tǒng)和方法。例如，生物分子混合物的整體分析模式中的差異可以表示活生物體的疾病和/或生理狀態(tài)的蛋白質(zhì)標(biāo)志。在一些情況下，本申請(qǐng)的主題可以涉及相關(guān)的產(chǎn)品、對(duì)具體問(wèn)題的替代解決方案和/或單個(gè)體系或制品的多種不同用途。本發(fā)明的一個(gè)方面涉及一種確定多種物質(zhì)的特征的方法。根據(jù)一組實(shí)施方案，所述方法包括如下步驟使多種物質(zhì)接觸包括至少兩相的第一體系中分別限定至少第一相和第二相的至少第一和第二相互作用成分；獲得包括得自接觸之后所述體系的第一相的多種物質(zhì)的累積語(yǔ)信息的第一鐠數(shù)據(jù)模式；獲得包括得自所述體系的第二相的多種物質(zhì)在接觸之后的累積諳信息和/或得自多個(gè)所述多種物質(zhì)在接觸所述體系之前的累積鐠信息的第二譜數(shù)據(jù)模式；以及從第一譜數(shù)據(jù)模式的至少一部分和第二鐠數(shù)據(jù)模式的至少一部分的比較中獲得比較鐠信息以確定多種物質(zhì)的特征。在一個(gè)實(shí)施方案中，本發(fā)明涉及開(kāi)發(fā)和使用利用在物質(zhì)與多相體系的不同相之間相互作用的相對(duì)量度中差異的作用的方法，例如通過(guò)多相分配對(duì)兩種、三種或更多種混合物的例如分級(jí)或分離，其可以反映出涉及混合物間分子和/或與所述分子相互作用之分子的混合物的結(jié)構(gòu)和/或功能特征的差異。這些技術(shù)例如可用于利用質(zhì)譜或其它分析法來(lái)鑒定樣品中的這些標(biāo)志的獨(dú)特模式，和/或使用這種標(biāo)志模式用于診斷和其它相關(guān)的應(yīng)用。在一個(gè)方面中，本發(fā)明是一種確定多種物質(zhì)的特征的方法。在一組實(shí)施方案中，所述方法包括如下步驟使多種物質(zhì)接觸包括至少兩相的第一體系中分別限定至少第一相和第二相的至少第一和第二相互作用獲得包括得自所述體系的第一相的多種物質(zhì)在接觸之后的累積譜信息的第一鐠數(shù)據(jù)模式，該鐠數(shù)據(jù)模式代表所述物質(zhì)與不同相的相互作用的這種相對(duì)量度的作用；獲得包括得自所述體系的第二相的多種物質(zhì)在接觸之后的累積鐠信息和/或得自多個(gè)最初的所述多種物質(zhì)的累積語(yǔ)信息的第二謙數(shù)據(jù)模式；以及從第一鐠數(shù)據(jù)模式的至少一部分和第二語(yǔ)數(shù)據(jù)模式的至少一部分的比較中獲得比較鐠信息以確定多種物質(zhì)的特征。在另一組實(shí)施方案中，所述方法包括如下步驟在包括至少兩相的分配體系中的第一相和第二相之間分配多種物質(zhì)；獲得包括得自所述體系的第一相的多種物質(zhì)在分配之后的累積謙信息的第一譜數(shù)據(jù)模式；獲得包括得自所述體系的第二相的多種物質(zhì)在分配之后的累積譜信息和/或得自多個(gè)最初的所述多種物質(zhì)的累積鐠信息的第二譜數(shù)據(jù)模式；以及從第一鐠數(shù)據(jù)模式的至少一部分和第二譜數(shù)據(jù)模式的至少一部分中獲得比較鐠信息以確定多種物質(zhì)的特征。在另一方面中，本發(fā)明涉及確定生物系統(tǒng)的生理狀態(tài)。在一個(gè)實(shí)施方案中，一種用于確定生物系統(tǒng)的生理狀態(tài)的方法涉及確定得自生物系統(tǒng)的樣品中物質(zhì)混合物的比較模式，其中從通過(guò)對(duì)第一分配體系的分別限定至少第一相和第二相的至少第一和第二相互作用成分進(jìn)行分析得到的數(shù)據(jù)模式中得到所述比較模式。從確定所述物質(zhì)混合物和所述第一分配體系的第一和第二相互作用成分之間的比較模式的步驟，可以確定所述生物系統(tǒng)的生理狀態(tài)。在另一實(shí)施方案中，所述方法涉及通過(guò)確定本文所述的從生物系統(tǒng)獲得的比較模式和代表所述生物系統(tǒng)參考狀態(tài)的對(duì)應(yīng)比較模式之間的差異來(lái)確定生物系統(tǒng)的生理狀態(tài)，而無(wú)須知道產(chǎn)生這種模式的所述物質(zhì)混合物中單個(gè)物質(zhì)的化學(xué)或生物學(xué)特性。在另一實(shí)施方案中，一種方法涉及通過(guò)確定在與從生物系統(tǒng)獲得的比較模式和從具有至少一種參考狀態(tài)的至少一個(gè)樣品獲得的比較模式相關(guān)的第一性質(zhì)和/或性質(zhì)值之間的差異和/或相似性來(lái)確定生物系統(tǒng)的生理狀態(tài)。在又一實(shí)施方案中，所述方法涉及通過(guò)確定從生物系統(tǒng)獲得的數(shù)學(xué)或統(tǒng)計(jì)學(xué)處理的分析模式和從具有至少一個(gè)參考狀態(tài)的至少一個(gè)樣品獲得的相互作用的相對(duì)量度的類似數(shù)學(xué)或統(tǒng)計(jì)學(xué)處理的比較模式之間的差異和/或相似性來(lái)確定生物系統(tǒng)的生理狀態(tài)。在另一方面中，本發(fā)明涉及一種識(shí)別一種或多種用于生理分析的工具的方法。在一個(gè)實(shí)施方案中，所述方法涉及確定從包括第一物質(zhì)混合物的物質(zhì)和第一分配體系的分別限定至少第一相和第二相的至少第一和第二相互作用成分的分析中獲得的數(shù)據(jù)模式之間的比較模式。同樣，還可以確定在與所述第一物質(zhì)混合物的物質(zhì)對(duì)應(yīng)的包括第二物質(zhì)混合物的物質(zhì)和笫一體系之間的比較模式。利用第一體系，確定第一混合物中物質(zhì)的比較模式相對(duì)于第二混合物中物質(zhì)的比較模式之間的差異。基于這種差異，選擇第一體系作為確定生物系統(tǒng)的生理狀態(tài)的工具。作為替代方案，或者在此之外，選擇包括第一混合物的物質(zhì)的比較模式和包括第二混合物的物質(zhì)的比較模式用于確定生物系統(tǒng)的生理狀態(tài)。在又一方面中，本發(fā)明涉及一種確定多種物質(zhì)的至少一個(gè)特征的方法。根據(jù)一組實(shí)施方案，所述方法包括如下步驟使多種物質(zhì)接觸包括至少第一和第二相的含水分配體系；利用質(zhì)譜獲得包括來(lái)自與所述含水分配體系的第一相相關(guān)的一種或多種物質(zhì)的第一樣品的累積鐠信息的第一鐠數(shù)據(jù)模式；利用質(zhì)譜，獲得來(lái)自一種或多種以下物質(zhì)的第二鐠數(shù)據(jù)模式(1)與所述含水分配體系的第二相相關(guān)的一種或多種物質(zhì)的第二樣品、或(2)所述接觸步驟之前的所述多種物質(zhì)的一部分；以及比較所述第一語(yǔ)數(shù)據(jù)模式的至少一部分和所述第二譜數(shù)據(jù)模式的至少一部分以確定多種物質(zhì)的至少一個(gè)特征。在另一組實(shí)施方案中，所述方法包括如下步驟使多種物質(zhì)接觸至少第一和第二相互作用成分以至少部分分離所述多種物質(zhì)；利用質(zhì)譜處理所述至少部分分離的多種物質(zhì)的第一樣品以產(chǎn)生笫一譜數(shù)據(jù)模式；利用質(zhì)譜處理以下的一個(gè)或多個(gè)以產(chǎn)生第二譜數(shù)據(jù)模式(1)與所述第一樣品不同的所述至少部分分離的多種物質(zhì)的第二樣品、或(2)所述接觸步驟之前的所述多種物質(zhì)的一部分；以及比較所述第一譜數(shù)據(jù)模式的至少一部分和所述第二鐠數(shù)據(jù)模式的至少一部分，以確定多種物質(zhì)的至少一個(gè)特征。在又一組實(shí)施方案中，所述方法包括使多種物質(zhì)接觸包括至少第一和第二相的含水分配體系；獲得包括來(lái)自與所述含水分配體系的第一相相關(guān)的一種或多種物質(zhì)的第一樣品的累積信息的第一數(shù)據(jù)模式；通過(guò)處理以下的一個(gè)或多個(gè)來(lái)獲得包括累積信息的第二數(shù)據(jù)模式(1)與所述含水分配體系的第二相相關(guān)的一種或多種物質(zhì)的第二樣品、或(2)在所述接觸步驟之前的所述多種物質(zhì)的一部分；以及比較所述第一i普數(shù)據(jù)模式的至少一部分和所述第二語(yǔ)數(shù)據(jù)模式的至少一部分，以確定多種物質(zhì)的至少一個(gè)特征。結(jié)合附圖，從以下詳述的本發(fā)明各個(gè)非限制性實(shí)施方案的描述中，本發(fā)明的其它優(yōu)點(diǎn)和新特征會(huì)變得顯而易見(jiàn)。在本說(shuō)明書(shū)和通過(guò)引用并入的文獻(xiàn)包含相互矛盾和/或不一致的公開(kāi)內(nèi)容的情況下，以本說(shuō)明書(shū)為準(zhǔn)。如果通過(guò)引用并入的兩個(gè)或更多文獻(xiàn)包含相互矛盾和/或不一致的公開(kāi)內(nèi)容，則以有效日期較近的文獻(xiàn)為準(zhǔn)。參照附圖，將以舉例的方式描述本發(fā)明的非限制實(shí)施方案，附圖是示意性的并且無(wú)意于按比例繪制。在附圖中，所示出的每個(gè)相同或近似相同的要素通常用單一附圖標(biāo)記表示。為了清楚起見(jiàn)，在不必示出而使所屬領(lǐng)域的普通技術(shù)人員理解本發(fā)明的情況下，沒(méi)有標(biāo)出所有要素，也沒(méi)有標(biāo)出所示的本發(fā)明每個(gè)實(shí)施方案的每種要素。在附圖中圖1是根據(jù)本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于確定和使用相互作用相對(duì)量度模式的方法的方框示意圖2是根據(jù)本發(fā)明的比較來(lái)自分配體系的比較質(zhì)譜信息以給使用者提供信息的方框示意圖3是通過(guò)比較來(lái)自在健康(對(duì)照物)血漿樣品分級(jí)之后兩相分配體系的不同相的等分試樣2D-HPLC色譜圖得到的比較譜圖4是如圖3—樣獲得的比較鐠圖，只是來(lái)自于先前診斷患有外傷后應(yīng)激障礙的患者；圖5顯示根據(jù)本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的兩個(gè)樣品的i普K向量的比較；圖6示出根據(jù)本發(fā)明另一實(shí)施方案的可用于區(qū)分早期和晚期卵巢癌的某些生物標(biāo)志；以及圖7顯示本發(fā)明又一實(shí)施方案中示出正常和癌癥患者之間對(duì)于相互作用的相對(duì)量度的差異的數(shù)據(jù)。具體實(shí)施例方式本發(fā)明一般地涉及多種分子或其它物質(zhì)與能夠使至少一些所述分子或物質(zhì)相互分離的介質(zhì)之間的相互作用，以及對(duì)由分離獲得的至少一部分分子/物質(zhì)進(jìn)行處理以限定模式?？梢员容^該模式和來(lái)自由分離得到的另一部分分子/物質(zhì)的模式，和/或從來(lái)自分離之前的最初的多種分子或其它物質(zhì)的模式得到的模式，從而表征所述多種分子和/或生物分子或其它物質(zhì)，和/或表征與所述分子/物質(zhì)相關(guān)性實(shí)體相關(guān)的狀態(tài)等，其中進(jìn)行或不進(jìn)行任意分子或生物分子的任意特定表征。所述分離介質(zhì)可以包括下文所述的多相分配體系或其它分離材料?？梢圆糠只蛉糠蛛x混合物。在一些實(shí)施方案中，本發(fā)明提供用于檢測(cè)、鑒定和/或表征各相應(yīng)數(shù)據(jù)模式的性質(zhì)或行為(例如混合物中物質(zhì)的相互作用的量度)之間差異的體系和方法?？梢允褂萌我饧夹g(shù)來(lái)產(chǎn)生所^式，例如譜分析技術(shù)，如質(zhì)譜術(shù)、NMR譜術(shù)、UV和/或可見(jiàn)光鐠術(shù)等。所述多種分子可以包括能夠與生物分子相互作用的生物分子和/或分子。可以根據(jù)所要進(jìn)行的比較，利用混合物樣品(分離之前或之后)來(lái)產(chǎn)生所述模式。本發(fā)明的一個(gè)方面涉及使用從例如質(zhì)鐠儀獲得的來(lái)自樣品或部分樣品如生物來(lái)源樣品的鐠數(shù)據(jù)(作為模式)，其中所述樣品首先與相互作用體系相互作用。所勤目互作用體系優(yōu)先與樣品中的一些物質(zhì)相互作用以產(chǎn)生與原始樣品不同的至少一個(gè)級(jí)分(有時(shí)多于一個(gè)級(jí)分)的樣品。然后，將鐠數(shù)據(jù)與從與同一相互作用體系相互作用的相同樣品的第二級(jí)分獲得的或從所述樣品自身的i普數(shù)據(jù)獲得的另一譜數(shù)據(jù)進(jìn)行比較。然而，應(yīng)該理解，本發(fā)明不限于僅使用鐠數(shù)據(jù)。一般地，可以使用可用于產(chǎn)生數(shù)據(jù)模式的任意樣品處理方法。例如，可以利用任意合適的技術(shù)來(lái)處理樣品的一部分或樣品的一個(gè)級(jí)分來(lái)產(chǎn)生數(shù)據(jù)模式，所述合適的技術(shù)例如為NMR鐠術(shù)、UV和/或可見(jiàn)光語(yǔ)術(shù)、IR光鐠術(shù)、拉曼光鐠術(shù)、熒光光鐠術(shù)、質(zhì)譜術(shù)、色譜術(shù)(例如液相色譜、HPLC、色譜洗脫曲線分析等)、GPC、ELIZA、閃爍計(jì)數(shù)法等。在一些情況下，可以處理數(shù)據(jù)本身來(lái)產(chǎn)生數(shù)據(jù)模式，例如通過(guò)數(shù)學(xué)處理、數(shù)據(jù)變換、數(shù)據(jù)平滑化、噪聲過(guò)濾等來(lái)處理。因此，應(yīng)該注意，當(dāng)本文的討論提及"鐠數(shù)據(jù)"或"比較i普"時(shí)，這僅是以舉例的方式提及，并且在本發(fā)明的其它實(shí)施方案中還可以4吏用本文所述的其它數(shù)據(jù)模式或比較數(shù)據(jù)模式。在一方面中，本發(fā)明涉及分配，在一些情況下，在分配之后可以對(duì)分配成分實(shí)施諸如質(zhì)語(yǔ)分析等的#^析或者用于產(chǎn)生數(shù)據(jù)模式的其它方法，而不需要分析不同成分的i普，并且在某些實(shí)施方案中不需要嘗試鑒定那些成分的特征(盡管在一些實(shí)施方案中可以這樣做)。在一些實(shí)施方案中，可以比較不同成分或相和/或其中的物質(zhì)的鐠數(shù)據(jù)或其它數(shù)據(jù)模式以限定比較鐠或模式，其中或其自身可以是與物質(zhì)混合物相關(guān)的標(biāo)志和/或可以揭示與物質(zhì)混合物有關(guān)的信息。當(dāng)將所述比較i普或模式與限定對(duì)照物的參考比較鐠或模式進(jìn)行比較時(shí)，該信息可以包括與物質(zhì)來(lái)源的實(shí)體的狀態(tài)相關(guān)的信息，例如患者的醫(yī)療狀態(tài)和/或生理狀態(tài)。在一些情況下，可以利用一種或多種數(shù)學(xué)運(yùn)算如減法、除法、乘法或其它變換從成分或相的譜或其它數(shù)據(jù)模式來(lái)獲得比較譜或模式。在一個(gè)實(shí)施方案中，由于除法也是歸一化運(yùn)算，所以通過(guò)成分或相的數(shù)據(jù)模式的點(diǎn)對(duì)點(diǎn)除法來(lái)獲得比較謙或模式。本文中的歸一化運(yùn)算指消去或除去在進(jìn)行比較的兩個(gè)或更多模式中產(chǎn)生特殊峰或其它特殊信息的可歸因于^ftij蛋白質(zhì)(underlyingprotein)、蛋白質(zhì)片段或肽的數(shù)據(jù)模式的絕對(duì)值。因此，通過(guò)利用點(diǎn)對(duì)點(diǎn)除法來(lái)除以成分或相的數(shù)據(jù)模式而獲得的比較鐠或模式僅表現(xiàn)出基礎(chǔ)蛋白質(zhì)對(duì)每一相的親和力之間的相對(duì)變化而不表現(xiàn)出它們?cè)谠紭悠分械慕^對(duì)量。可以使用其它的信號(hào)處理技術(shù)和變換，在構(gòu)建比較模式之前或之后對(duì)數(shù)據(jù)模式進(jìn)行預(yù)處理或后處理。這些技術(shù)包括但不限于譜的數(shù)據(jù)平滑化、噪聲過(guò)濾、內(nèi)插法等，進(jìn)行或不進(jìn)行諸如傅立葉或小波變換等的變化，以及使用或不使用數(shù)字濾波或其它濾波。例如，可以從參考實(shí)體提取樣品來(lái)建立對(duì)照物，例如從健康患者獲取的血液樣品(可以使用任意其它樣品例如尿、血漿和本領(lǐng)域公知的那些樣品，和/或根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)在使用之前進(jìn)一步處理)。樣品可以在多相分配體系(或本文中公開(kāi)的任意其它技術(shù))中進(jìn)行分級(jí)。在使用兩相分配體系的情況下，可以對(duì)第一和第二相(或任選更多的相，如果存在更多相的話)的至少一部分或多個(gè)部分進(jìn)行鐠分析(或本文公開(kāi)的其它數(shù)據(jù)模式化技術(shù))，并且比較它們的鐠(或其它數(shù)據(jù)模式)以產(chǎn)生比較鐠。作為替代方案或在此之外，可以對(duì)分配之前的原始樣品進(jìn)行i普分析，并且將其謙數(shù)據(jù)與來(lái)自第一和/或第二相的鐠數(shù)據(jù)的一項(xiàng)或更多項(xiàng)進(jìn)行比較以產(chǎn)生比較鐠。在部分這些配置中，可以獲得任意數(shù)量的分配前混合物的鐠和任意數(shù)量的分配后的相。在一些情況下，比較至少兩個(gè)鐠數(shù)據(jù)以獲得限定對(duì)照物的信息(任選與例如溫度、血壓等其它信息相結(jié)合)。任選地，可以存儲(chǔ)比較鐠用于后續(xù)使用，例如存儲(chǔ)為譜比較的紙質(zhì)打印件，電子存儲(chǔ)在計(jì)算機(jī)中或任意其它已知的存儲(chǔ)介質(zhì)上。在存在關(guān)于特定實(shí)體是否表現(xiàn)出特殊狀態(tài)(例如患者是否具有特定的生理狀態(tài))的問(wèn)題的情況下，可以從所述實(shí)體提取樣品(例如與對(duì)照樣品類似、相似或相同的樣品)，并且對(duì)其施加可以至少部分分離樣品的體系(例如分配體系)?？梢岳脕?lái)自分配相或多個(gè)分配相的數(shù)據(jù)和/或原始的分配前混合物的數(shù)據(jù)模式來(lái)分析數(shù)據(jù)，然后進(jìn)行比較(例如，通過(guò)形成比較鐠來(lái)比較)?？梢詫⑽粗谋容^鐠與對(duì)照物的比較鐠進(jìn)行比較來(lái)確定樣品是否與對(duì)照物基本不同，或者是否與對(duì)照物基^f目同，這可以給出關(guān)于樣品是否指示患者體內(nèi)的疾病的信息。當(dāng)然，對(duì)照物可以是健康患者的對(duì)照物或具有任意的多種生理功能障礙或疾病的患者的對(duì)照物。作為替代方案，可以使用兩種或更多種對(duì)照物來(lái)限定健康狀態(tài)和/或任意的多種功能障礙狀態(tài)，并且可以將來(lái)自未知樣品分配的比較鐠或模式與任意或全部這些對(duì)照物進(jìn)行比較以確定樣品來(lái)源的實(shí)體的狀態(tài)。在實(shí)踐中，可以對(duì)源自表現(xiàn)出相同的功能障礙狀態(tài)的不同實(shí)體的多個(gè)比較譜或模式計(jì)算平均值以形成復(fù)合比較譜或模式。在一些實(shí)施方案中，所述方法可用于發(fā)現(xiàn)和/或鑒定物質(zhì)混合物中的模式和/或第二混合物中的物質(zhì)的對(duì)應(yīng)模式，其中物質(zhì)的每種混合物源自具有不同生理狀態(tài)的生物系統(tǒng)作為與特定診斷相關(guān)的標(biāo)志，并且可以用于在診斷篩選過(guò)程中發(fā)現(xiàn)和鑒定后對(duì)這些標(biāo)志進(jìn)行篩選。以下文獻(xiàn)通過(guò)引用全文并入本文2000年10月24日授予Chait等人的發(fā)明名稱為"MethodforEvaluationoftheRatioofAmountsofBiomoleculesorTheirSub-populationsinaMixture，，的美國(guó)專利第6,136,960號(hào)；2003年5月22日公布的Chait等人的發(fā)明名稱為"CharacterizationofMolecules"的PCT7>開(kāi)WO03/042694;2003年6月13日提交的A.Chait等人的發(fā)明名稱為"SystemsandMethodsforCharacterizationofMolecules"的美國(guó)專利申請(qǐng)朵60/478645號(hào)；2004年4月14日提交的Chait等人的發(fā)明名稱為"SystemsandMethodsforCharacterizationofMolecules"的美國(guó)專利申請(qǐng)糸60/561945號(hào)；2004年6月14日提交的A.Chait等人的發(fā)明名稱為"SystemsandMethodsforCharacterizationofMolecules"的國(guó)際專利申請(qǐng)PCT/US04/19343;2004年12月9日提交的A.Chait等人的發(fā)明名稱為"SpectralandOtherAnalysisofPartitionedSamples"的美國(guó)專利申請(qǐng)第60/634586號(hào)；以及2005年12月19日提交的A.Chait等人的發(fā)明名稱為"SystemsandMethodsInvolvingSpectralBiomarkers"的美國(guó)專利申請(qǐng)第60/751715號(hào)。定義本申請(qǐng)和所附權(quán)利要求中所使用的單數(shù)形式包括多個(gè)對(duì)象，除非上下文中另有明確的說(shuō)明。因此，例如，"生物分子"一詞可以包括生物分子的混合物，等等。本文的范圍可以表示為從"約"一個(gè)具體值和/或到"約"另一具體值的形式。當(dāng)表示這種范圍時(shí)，另一實(shí)施方案包括從一個(gè)具體值和/或到另一具體值。同樣，當(dāng)通過(guò)使用在前的"約，，字將值表示為近似值時(shí)，應(yīng)該理解該具體值形成另一實(shí)施方案。還應(yīng)理解，每個(gè)范圍的端點(diǎn)值相對(duì)于另一端點(diǎn)值既相關(guān)，又與另一端點(diǎn)值無(wú)關(guān)。"任選的，，或"任選地，，是指隨后所述的事件或情形可以發(fā)生或可以不發(fā)生，并且該描述包括所述事件或情形發(fā)生的情況或所述事件或情形不發(fā)生的情況。"分析物"、"分析物分子"、或"分析物質(zhì)"指的是其存在、量和/或特征待確定的分子，例如大分子，例如多核苷酸或多肽。本文所用的"抗體，，是指多克隆或單克隆抗體。此外，術(shù)語(yǔ)"抗體，，包括但不限于完整的免疫球蛋白分子、嵌合的免疫球蛋白分子或Fab或F(ab，)2片段。這些抗體和抗體片段可以通過(guò)本領(lǐng)域公知的技術(shù)來(lái)生產(chǎn)，這些技術(shù)包括例如HarlowandLane(Antibodies:ALaboratoryManual,ColdSpringHarborLaboratory,ColdSpringHarbor,NY(1989))和Kohler等人(Nature256:495-97(1975))+描述的那些，所述文獻(xiàn)均通過(guò)引用并入本文。相應(yīng)地，本文所定義的抗體還包括單鏈抗體(ScFv),其可以包含連接的Vh和Vl域，并且可以保持抗體天然獨(dú)特型的構(gòu)象和特異性結(jié)合活性。這些單鏈抗體是本領(lǐng)域公知的，并且可以通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)方法來(lái)生產(chǎn)。例如，參見(jiàn)Alvarez等人,Ge"e77^r.8:229-242(1997)。本發(fā)明的抗體可以具有任意同種型，例如lgG、IgA、IgD、IgE或IgM。本文所用的"含水的"指的是溶劑/溶質(zhì)體系的特征性質(zhì)，其中溶解的物質(zhì)具有主要親水的特性。含水的溶劑/溶質(zhì)體系的實(shí)例包括其中7JC或含水組合物是主要溶劑的那些體系。在一個(gè)實(shí)施方案中，含水材料可以混溶于水，并且在環(huán)境條件(例如1個(gè)大氣壓和約25'C的室溫)下靜置1天后不形成與7JC分離的單獨(dú)的可識(shí)別相。(注意，水可以與自身混溶。)本文使用的"分配體系"是指具有至少兩相、部分、區(qū)域、成分等的任意材料，其中所述至少兩相、部分、區(qū)域、成分等可以與所接觸的至少一種物質(zhì)不同地相互作用。例如，分配體系可以包括固體表面的不同區(qū)域，其可以與接觸不同部分(例如，如在液相色鐠或HPLC等中一樣)的特定分子、可以接觸并任選溶解一種或多種物質(zhì)的多相體系如多相液體體系例如含7jC/不含水體系或含水多相體系(如下文所定義的)不同i^f目互作用，其中至少一些所述物質(zhì)可以與不同的相不同i^目互作用。例如，特定物質(zhì)可以對(duì)一相具有比對(duì)另一相更大的親和力，其程度達(dá)到多相分配體系可以將物質(zhì)從混合物中分離出來(lái)，或者使物質(zhì)至少以一些不同的方式在相之間分開(kāi)。在本文描述兩相體系的情況下，應(yīng)當(dāng)理解，可以使用更多的相。本文所用的"含水多相體系，，指的是包括在其中可以存在分析物質(zhì)的多于一個(gè)水相的含7jC體系，并且所述含7JC體系可以用于根據(jù)本文所述方法來(lái)表征所述分析物質(zhì)的結(jié)構(gòu)狀態(tài)。例如，含水多相體系可以在平衡狀態(tài)下分離成兩個(gè)、三個(gè)或更多個(gè)不混溶相。含水多相體系是本領(lǐng)域公知的，并且本文使用的這個(gè)術(shù)語(yǔ)無(wú)意于與所屬領(lǐng)域所接受的意思不一致。各種含水多相體系的例子和它們的組成將在下文中詳細(xì)描述。"累積鐠信息"是指包括來(lái)自多種物質(zhì)的輸入的鐠信息，例如代表物質(zhì)混合物的鐠(其可以M鐠報(bào)告)。"相互作用成分"是指能夠與物質(zhì)相互作用并提供與該物質(zhì)有關(guān)的信息(例如對(duì)該物質(zhì)的親和力)的成分，例如多相體系的相或者色鐠柱的成分或其它能夠?qū)е路蛛x的成分。與物質(zhì)接觸的多個(gè)相互作用成分可以限定能夠提供每個(gè)成分和物質(zhì)之間的"相互作用的相對(duì)量度"的體系。相互作用成分可以是固體或液體，含水或不含水，可以是聚合物、有機(jī)物(例如蛋白質(zhì)、小分子等)、無(wú)機(jī)物(例如鹽)、表面活性劑等，或其任意組合。一組相互作用成分可以形成用于并部分限定用于根據(jù)本文所述的方法來(lái)表征物質(zhì)例如分析物質(zhì)的結(jié)構(gòu)狀態(tài)的任意實(shí)驗(yàn)方法的體系。通常地，相互作用成分的體系可以測(cè)量物質(zhì)和至少兩種相互作用成分之間的相對(duì)的相互作用。含水多相體系是相互作用成分的體系的例子，并且應(yīng)該理解，本文使用"含水體系"或"含水多相體系"只是作為舉例，并且可以使用相互作用成分的任意合適體系。在本文中描述含水兩相或含水多相體系的情況下，應(yīng)當(dāng)理解可以使用如本文使用的其它體系、與只包括水溶液或懸浮體的那些體系類似的體系。例如，含水兩相體系可以包括在性質(zhì)上非液體的一個(gè)或更多個(gè)相中的不含水成分。在這方面中，多相體系還指依賴于生物分子對(duì)一種介質(zhì)相對(duì)于另一種介質(zhì)的不同親和力的相關(guān)技術(shù)，其中生物分子在一種介質(zhì)和任選的另一種介質(zhì)之間的轉(zhuǎn)運(yùn)在含水或不含水的環(huán)境中進(jìn)行。這種多相體系的例子包括但不限于用于液-液分配色謙或其它形式的色鐠的HPLC柱或系統(tǒng)，如本領(lǐng)域普通技術(shù)人員所知的，其中一個(gè)相可以是固相，另一相可以是所攜帶的物質(zhì)接近所述固相的液體，并且各種物質(zhì)對(duì)固相和/或;M目的不同親和力可以引起分離。應(yīng)該理解，本發(fā)明不限于含水多相體系；在一些情況下，可以使用具有非分配單相的體系；例如，兩種或更多種相互作用成分可以限定包含多種物質(zhì)的溶劑，并且所述成分可以是至少部分分離的(盡管可能不必在分離的成分之間形成清楚的分界，例如相對(duì)于濃度等)。本文中針對(duì)特定物質(zhì)使用的"相互作用的相對(duì)量度"是指在相對(duì)意義上一種物質(zhì)與另一物質(zhì)或與多相體系中的相相互作用的程度。例如，特定物質(zhì)對(duì)于多相體系中的一相的親和力可以大于對(duì)多相體系中的另一相或其它相的親和力，并且所述物質(zhì)與該相的相互反應(yīng)的程度或保持在該相中的程度(與其它的相相反)限定其相互作用的相對(duì)量度。本發(fā)明中，相互作用的相對(duì)量度一般以比例測(cè)量(ratiometric)的方式而不是絕對(duì)的方式來(lái)確定，盡管在一些情況下可以使用絕對(duì)的方式。作為非限制的例子，在物質(zhì)可以與兩相體系中的每個(gè)相相互作用但是更優(yōu)選保持在一相而非另一相中的情況下，本發(fā)明通常使用在兩相中的每一相或其中一相與原始樣品中的物質(zhì)濃度比率相關(guān)的信息，但是不必是各相中的物質(zhì)的絕對(duì)濃度。在另一些情況下，相互作用可以不基于特定物質(zhì)在特定溶劑或流體載體中的停留，而是基于與固體表面的相互作用，例如色鐠柱的固相，此時(shí)相對(duì)量度自身表現(xiàn)為洗脫時(shí)間，和/或可涉及幾何或空間相互作用，例如特定物質(zhì)與多孔基質(zhì)的相互作用，這與不同的物質(zhì)或不同的基質(zhì)的相互作用不同。在一些情況下，相互作用的相對(duì)量度包括多于一種類型的相互作用。本文使用的"分配系數(shù)，，是指通過(guò)在平衡狀態(tài)下多相體系中兩個(gè)、三個(gè)或更多個(gè)相內(nèi)物質(zhì)的化學(xué)活性或濃度的比率，或者平衡狀態(tài)下多相體系中一個(gè)相內(nèi)的物質(zhì)與原始樣品中對(duì)應(yīng)物質(zhì)的化學(xué)活性或濃度的比率所限定的系數(shù)。例如，兩相體系中分析物的分配系數(shù)("K")定義為第一相相對(duì)于第二相中的分析物的濃度之比。對(duì)于多相體系，可以具有多個(gè)分配系數(shù)，其中每個(gè)分配系數(shù)限定第一選定相和第二選定相中的物質(zhì)之比。將會(huì)認(rèn)識(shí)到，任何多相體系中分配系數(shù)的總數(shù)通常等于總相數(shù)減一。本文使用的術(shù)語(yǔ)"分配系數(shù)"還可以指得自兩相體系中第一相內(nèi)物質(zhì)混合物分析的特定m/z(質(zhì)荷比)位置處的峰高度相對(duì)于得自同一兩相體系中第二相內(nèi)物質(zhì)混合物分析的相同特定m/z位置的對(duì)應(yīng)高度之比，或指在色i普分析中該體系中兩個(gè)、三個(gè)或更多個(gè)不同相的樣品之間的特定洗脫時(shí)間處的峰高比。對(duì)于非均相體系而言，本文所用的"表觀分配系數(shù)"是指描述從與相之間的相對(duì)分配相關(guān)的備選技術(shù)所獲得的信息的系數(shù)。作為非限制性例子，如果所用的非均相兩相體系是HPLC柱或其它色譜柱，則該"扇J見(jiàn)分配系數(shù)"可以是分析物的相對(duì)保留時(shí)間。所屬領(lǐng)域的普通技術(shù)人員將認(rèn)識(shí)到，在許多情況下，分析物在色鐠柱中的保留時(shí)間反映出分析物在第一流動(dòng)相和第二固定相之間的平均分配。而且，還^^人識(shí)到，分析物的類似可確定性質(zhì)還可以用來(lái)定量分析物的物理性質(zhì)的差異(例如，利用其它技術(shù))，并且因此適合用作表觀分配系數(shù)。本文使用的"結(jié)合"是指為人所熟知的受體/配體結(jié)合，以及生物分子和其結(jié)合對(duì)應(yīng)物之間的其它非隨機(jī)的締合。本文使用的"特異性結(jié)合"描述了基本不與除指定生物分子或多個(gè)生物分子之外的任何生物分子交叉反應(yīng)的結(jié)合對(duì)應(yīng)物或其它配體。一般地，優(yōu)先相互結(jié)合的分子被稱為"特異性結(jié)合對(duì)"。這些對(duì)包括但不限于抗體和其抗原、凝集素和其結(jié)合的碳7K化合物、酶和其底物、以及激素和其細(xì)胞受體。結(jié)合機(jī)理的例子包括但不限于共價(jià)鍵、離子鍵、范德華力、氫鍵等。如一般所用的，術(shù)語(yǔ)"受體"和"配體"用于定義一對(duì)結(jié)合分子。通常，術(shù)語(yǔ)"受體"用于指特異性結(jié)合對(duì)的如下成員，它屬于因其結(jié)合活性而為人知曉的分子類別，例如抗體。術(shù)語(yǔ)"受體"還優(yōu)選指一個(gè)對(duì)中尺寸較大的那個(gè)成員，例如在凝集素-糖對(duì)的情況下指凝集素。然而，本領(lǐng)域技術(shù)人員將會(huì)認(rèn)識(shí)到，受體和配體的區(qū)分在一定程度上是任意的，可以使用術(shù)語(yǔ)"配體"來(lái)指其它人稱為"受體"的分子，有時(shí)使用術(shù)語(yǔ)"抗-配體(anti-ligand)"來(lái)代替"受體"。"分子-分子相互作用"，例如生物分子-生物分子相互作用，蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用等，是指通常弱于"結(jié)合，，的相互作用，即基于氬鍵、范德華力、倫敦力的相互作用或其它有助于一個(gè)分子對(duì)另一分子的親和力的非共價(jià)相互作用，該親和力可以通過(guò)例如一個(gè)分子M另一分子或另一分子的一部分的能力而增強(qiáng)。分子-分子相互作用可能但不一定涉及結(jié)合。本文使用的"生物分子"是指通常來(lái)自生物的分子，其通常包括結(jié)構(gòu)單元，所述結(jié)構(gòu)單元包括核苷酸等。非限制性例子包括肽、多肽、蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)復(fù)合物、核苷酸、寡核苷酸、多核苷酸、核酸復(fù)合物、糖、低聚糖、碳水化合物、脂質(zhì)以及它們的組合、對(duì)映體、同系物、類似物、衍生物和/或模擬物。本文所用的"物質(zhì)"是指分子或分子的集合。例如，無(wú)機(jī)化學(xué)物質(zhì)、有機(jī)化學(xué)物質(zhì)、生物分子等可以是物質(zhì)。在本發(fā)明中，物質(zhì)一般為生物分子。本文使用的"對(duì)應(yīng)物質(zhì)"是指在化學(xué)上相同或者在化學(xué)上和/或分子量上僅稍微不同的至少兩種不同的物質(zhì)。對(duì)應(yīng)物質(zhì)的非限制性例子包括蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)性同工型、蛋白質(zhì)、或基4^目同但是相對(duì)于另一物質(zhì)或多個(gè)物質(zhì)的結(jié)合親和力不同，具有不同的高階結(jié)構(gòu)(例如二階或三階結(jié)構(gòu)不同，但是在化學(xué)序列上沒(méi)有不同或沒(méi)有明顯不同)的其它分子。一般地，對(duì)應(yīng)物質(zhì)是可以排列不同(亞型、同分異構(gòu)體等)但由相同或基^目同的化學(xué)結(jié)構(gòu)單元構(gòu)成的物質(zhì)。本文使用的"可檢測(cè)的，，是指物質(zhì)和/或物質(zhì)的性質(zhì)被辨別的能力。使物質(zhì)變得可檢測(cè)的一個(gè)示例方法是提供與第一物質(zhì)結(jié)合或相互作用的另一物質(zhì)，其中該物質(zhì)包含可檢測(cè)的標(biāo)記物?？蓹z測(cè)的標(biāo)記物的實(shí)例包括但不限于核酸標(biāo)記物、化學(xué)反應(yīng)標(biāo)記物、熒光標(biāo)記物、酶標(biāo)記物和放射性標(biāo)記物。本文使用的術(shù)語(yǔ)"確定"一般是指物質(zhì)分析，例如定量或定性分析，和/或檢測(cè)物質(zhì)的存在或不存在。"確定"還可以指分析兩種或更多種物質(zhì)之間的相互作用，例如定量或定性分析，和/或檢測(cè)相互作用的存在或不存在。本文使用的"模擬物"包括化合物、有機(jī)分子或任何其它模擬物，其結(jié)構(gòu)基于或來(lái)自抗體或抗原的結(jié)合區(qū)。例如，人們可以建立預(yù)測(cè)的化學(xué)結(jié)構(gòu)的模型來(lái)模擬結(jié)合區(qū)的結(jié)構(gòu)，例如肽的結(jié)合環(huán)。可以利用標(biāo)準(zhǔn)方法來(lái)實(shí)施這種建機(jī)例如，參見(jiàn)Zhao等人的7V"t5^"".歷o/.2:1131-1137(1995))。根據(jù)本文所述的結(jié)合試驗(yàn)，通過(guò)諸如此類的方法鑒定的模擬物還可以表征為具有與初始鑒定的目標(biāo)分子相同的結(jié)合功能。作為替代方案，模擬物還可以以與似目同的方式選自組合化學(xué)庫(kù)。例如，參見(jiàn)Ostresh等，Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.91:11138-11142(1994);Dorner等，Bioorg.Med.Chem.4:709-715(1996);Eichler等，Med.Res.Rev.15:481-96(1995);Blondelle等，Biochem.J.313:141-147(1996);或Perez畫(huà)Paya等,J.Biol.Chem.271:4120-6(1996)。本文使用的"固體載體"是指本發(fā)明的各種成分所物理附著并由此固定本發(fā)明成分的熟知的固體材料。本文使用的術(shù)語(yǔ)"固體載體"指非液體物質(zhì)。固體載體可以是但不限于膜、薄片、凝膠、玻璃、塑料或金屬。本發(fā)明的被固定成分可以通過(guò)共價(jià)鍵和/或經(jīng)由非共價(jià)吸引力如氫鍵相互作用、疏7jC吸引力和離子力與固體載體相結(jié)合。本文使用的"結(jié)構(gòu)"、"結(jié)構(gòu)狀態(tài)"、"構(gòu)型，，或"構(gòu)象"全部是指相應(yīng)術(shù)語(yǔ)的普遍理解的含義，例如當(dāng)它們應(yīng)用于例如蛋白質(zhì)和核酸的生物分子以及藥學(xué)活性小分子那樣。如本領(lǐng)域的技術(shù)人員所理解的，在不同的上下文中，這些術(shù)語(yǔ)的含義會(huì)不同。分子的結(jié)構(gòu)或結(jié)構(gòu)狀態(tài)一般不是指限定分子的結(jié)構(gòu)單元，而是指這些結(jié)構(gòu)單元的空間排列。構(gòu)型或構(gòu)象通常限定這種排列。例如，關(guān)于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的術(shù)語(yǔ)一級(jí)、二級(jí)、三級(jí)或四級(jí)的使用具有本領(lǐng)域內(nèi)接受的含義，其與針對(duì)核酸結(jié)構(gòu)使用時(shí)的含義在一些方面不同(例如,參見(jiàn)CantorandSchimmel，BiophysicalChemistry,PartsI-III)。除非另有規(guī)定，否則這些術(shù)語(yǔ)的含義將是本領(lǐng)域的技術(shù)人員一般接受的含義。本文^f吏用的"生理狀態(tài)"是指生物的物理、化學(xué)或生物物理狀態(tài)。如在本發(fā)明的上下文中所最常使用的，生理狀態(tài)是指正常狀態(tài)(例如，在人或其它生物情形下為健康狀態(tài))或異常狀態(tài)(例如，在人或其它生物情形下為患病狀態(tài))。本文^f吏用的"模式"是指物質(zhì)的物理性質(zhì)的序列或物理性質(zhì)與其它性質(zhì)的組合。本文^f吏用的"對(duì)應(yīng)模式"；U旨通常從生物系統(tǒng)或多個(gè)生物系統(tǒng)的不同樣品獲得的第二模式，并且由相同的物理或其它性質(zhì)的序列組成，使得序列中的每個(gè)位置擁有相同的描述符的值，無(wú)論性質(zhì)上是數(shù)字的或分類的(categorical)。本文使用的"標(biāo)志"是物質(zhì)的物理性質(zhì)的模式(例如從物質(zhì)混合物的質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)中獲得的m/z值的譜)，其可以是與物質(zhì)所處的生物環(huán)境的結(jié)構(gòu)或生理狀態(tài)有關(guān)的信息載體。這種物理性質(zhì)的模式還可以進(jìn)行數(shù)學(xué)或統(tǒng)計(jì)學(xué)處理、壓縮、變換或其它方式表示。本文使用的"經(jīng)處理的標(biāo)志"是這種經(jīng)處理的模式，但是如本文使用的，標(biāo)志用于作為替代方式來(lái)指代物理性質(zhì)模式或該性質(zhì)的經(jīng)處理模式，視具體的上下文而定。標(biāo)志可以表現(xiàn)出至少兩種不同的性質(zhì)或特定的一種或多種性質(zhì)的值(例如，結(jié)構(gòu)構(gòu)象、對(duì)另一物質(zhì)的結(jié)合親和力等，但并不僅是物質(zhì)的量的不同)，其對(duì)應(yīng)于并代表與其所處環(huán)境的兩種或更多種生理狀態(tài)相關(guān)的信息。例如，標(biāo)志可以是從一系列蛋白質(zhì)獲得的模式，所述一系列蛋白質(zhì)中的一些在代表其所處的健康系統(tǒng)的第一狀態(tài)和代表其所處的疾病系統(tǒng)的第二結(jié)構(gòu)狀態(tài)(例如不同的構(gòu)象)之間發(fā)生結(jié)構(gòu)變化。如本文使用的，標(biāo)志還是比較模式，其可以是與標(biāo)志所處的生物環(huán)境的生理狀態(tài)相關(guān)的信息的載體和/或這些模式和與其它性質(zhì)相關(guān)的其它信息的組合。'H普數(shù)據(jù)"是指與應(yīng)用于樣品的一種或更多種譜技術(shù)相關(guān)的可見(jiàn)的、紙上記錄的、電子記錄的等任何信息，例如質(zhì)鐠研究報(bào)告、紅外光i普研究報(bào)告、UV和/或可見(jiàn)光鐠圖、NMR譜圖或從樣品分析獲得的任何其它數(shù)據(jù)序列，其中獨(dú)立變量可以包括波長(zhǎng)、洗脫時(shí)間等。本領(lǐng)域的技術(shù)人員僅利用常規(guī)技能就可以實(shí)施這種鐠分析。i普數(shù)據(jù)是數(shù)據(jù)模式的一個(gè)例子，其不限于通過(guò)電磁波長(zhǎng)對(duì)樣品進(jìn)行研究的技術(shù)。數(shù)據(jù)模式包括通過(guò)其它技術(shù)(例如通過(guò)NMR等產(chǎn)生相對(duì)于洗脫時(shí)間而不是相對(duì)于波長(zhǎng)的數(shù)據(jù)流的色鐠技術(shù))獲得的任意分析數(shù)據(jù)序列。鐠或鐠數(shù)據(jù)(或其它數(shù)據(jù)模式)中的"比較"是指鐠數(shù)據(jù)(或其它數(shù)據(jù)模式)中任意一個(gè)或多個(gè)部分的任意類型的比較。例如，可以并列比較兩份典型的質(zhì)鐠打印輸出，人們可以觀察到每個(gè)譜的一個(gè)或更多質(zhì)鐠峰的高度，并且可以對(duì)這些峰之間的比較進(jìn)行標(biāo)記，或者可以觀察與代表關(guān)于這類峰的質(zhì)荷比的計(jì)算機(jī)分析相關(guān)的數(shù)字并且比較這些數(shù)字。作為替代方案，可以對(duì)計(jì)算機(jī)進(jìn)行編程iM目互比較各種質(zhì)鐠的各種質(zhì)荷峰，從而產(chǎn)生代表這種比較的比較鐠或比較i脊信息。因此，比較if^息可以限定代表兩個(gè)鐠或其它數(shù)據(jù)模式中的差異的數(shù)字，和/或該數(shù)字可以限定特定質(zhì)荷比位置(對(duì)于質(zhì)語(yǔ)數(shù)據(jù)的實(shí)例)處的兩個(gè)不同譜的峰高或峰寬之比。作為替代方案，比較i普可以記錄多個(gè)鐠數(shù)據(jù)點(diǎn)處的兩個(gè)或更多數(shù)據(jù)模式的差異，也就是說(shuō)，在質(zhì)鐠的情況下，作為兩個(gè)譜圖之間的差異或比率記錄的特定質(zhì)荷比處的多個(gè)峰的差異。作為另一例子，可以比較兩個(gè)質(zhì)鐠的所有數(shù)據(jù)點(diǎn)，作為每個(gè)譜的特定質(zhì)荷比處峰之間的差異或各自之間的比率，并且表示為一系列的數(shù)或新的鐠打印輸出，或以任何其它方式表示，其中觀察人員或機(jī)器(例如處理器)可以觀察和/或分析該數(shù)據(jù)，并由此觀察和/或記錄獲取每個(gè)譜的不同樣品之間的差異。所有這些鐠數(shù)據(jù)和比較譜都可以在分析或不分析會(huì)導(dǎo)致從中獲得鐠數(shù)據(jù)的樣品中鑒定任何一種或多種物質(zhì)的類型數(shù)據(jù)的情況下獲得。還可以首先對(duì)該數(shù)據(jù)模式進(jìn)行數(shù)學(xué)處理，例如利用傅立葉變換或小波變換轉(zhuǎn)換至另一域，并且可以利用本領(lǐng)域技術(shù)人員的技術(shù)來(lái)將經(jīng)過(guò)處理或轉(zhuǎn)換的數(shù)據(jù)和其它鐠進(jìn)行比較，這些技術(shù)包括筒單的數(shù)學(xué)運(yùn)算、諸如特征值分析的數(shù)據(jù)筒化技術(shù)等。鐠的比較和術(shù)語(yǔ)"比較譜"的使用一般涉及相同樣品的至少兩個(gè)數(shù)據(jù)模式，其中至少一個(gè)數(shù)據(jù)模式通過(guò)樣品與多相體系的相互作用獲得。比較的過(guò)程一般不涉M數(shù)據(jù)模式簡(jiǎn)單歸一化，例如以獲得基線，這與光i普或色鐠分析中的常規(guī)做法不同。比較鐠還可以釆取不依賴于包括原始樣品的物質(zhì)濃度的方式獲得，并且可以不必?cái)y帶與原始樣品中該物質(zhì)的濃度或豐度水平相關(guān)的信息。同樣，"比較鐠數(shù)據(jù)"可以從ir光鐠、uv/可見(jiàn)光鐠等獲得，以;s^例如從色鐠洗脫曲線獲得的一系列時(shí)間數(shù)據(jù)點(diǎn)獲得。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員熟悉至少與UV/可見(jiàn)光和ir光i普相關(guān)的比較i普數(shù)據(jù)和用于記錄和/或顯示這些數(shù)據(jù)的各種技術(shù)。需要強(qiáng)調(diào)的是，關(guān)于本發(fā)明，針對(duì)具體的樣品或多個(gè)樣品而言，可以在與鐠相關(guān)的任意一個(gè)或許多數(shù)據(jù)點(diǎn)(任意數(shù)量的質(zhì)荷比、波長(zhǎng)、洗脫時(shí)間等)處獲得和/或推導(dǎo)出語(yǔ)數(shù)據(jù)和/或比較鐠數(shù)據(jù)。實(shí)施方案譜分析研究方面的最新選艮，例如從血清或其它生物流體獲得的蛋白質(zhì)和混合物的質(zhì)鐠模式，已經(jīng)證實(shí)人們不需要明確地鑒定在兩個(gè)樣品之間不同的蛋白質(zhì)，即能夠區(qū)分它們。(應(yīng)該理解，在本申請(qǐng)中描述具體的鐠技術(shù)如質(zhì)譜的任何地方，可以利用任何其它鐠或色鐠技術(shù)(例如本文中公開(kāi)的)來(lái)代替所述的具體譜技術(shù)。在本發(fā)明的一組特定的實(shí)施方案中，采用質(zhì)鐠)。因此，在一些方面中，利用信號(hào)模式技術(shù)，可以用記錄混合物的模式("數(shù)據(jù)模式")的數(shù)學(xué)術(shù)語(yǔ)來(lái)表達(dá)出譜中的差異，而無(wú)需對(duì)所述差異進(jìn)行鑒定。與通過(guò)檢測(cè)特定蛋白質(zhì)(生物標(biāo)志)或其它物質(zhì)的濃度水平變化來(lái)鑒定樣品之間的差異不同，對(duì)代表樣品中蛋白質(zhì)或其它物質(zhì)的全部混合物的模式進(jìn)行比較，并且隨后將其用于對(duì)樣品分類。這些技術(shù)對(duì)于與對(duì)應(yīng)于待分析樣品的例如病理或生理變化不相關(guān)的濃度水平變化特別敏感。對(duì)于某些應(yīng)用，例如一^A^中相對(duì)罕見(jiàn)的疾病的診斷，所期望的特異性和靈敏度水平可以非常高。可以利用本發(fā)明的某些體系和方法來(lái)實(shí)現(xiàn)這種高的性能水平以及模式識(shí)別技術(shù)對(duì)樣品中濃度水平的無(wú)關(guān)變化的內(nèi)在敏感性。本發(fā)明所述的基于模式識(shí)別的方法對(duì)表達(dá)的絕對(duì)水平內(nèi)在不敏感，并且可以產(chǎn)生可靠得多的模式。而且，這些模式與樣品之間的潛在差異可能更為相關(guān)。如上所述，這些比較技術(shù)不僅限于質(zhì)鐠數(shù)據(jù)，而且可以應(yīng)用于關(guān)于樣品的一種或多種物質(zhì)所產(chǎn)生的任意數(shù)據(jù)模式，例如NMR鐠、UV和/或可見(jiàn)光鐠、色鐠(例如，液相色鐠或HPLC)、GPC、ELIZA等。分子或其它物質(zhì)(例如分子聚集體、多亞基蛋白質(zhì)等)例如生物分子的狀態(tài)，可受到許多因素影響，所述因素包括但不限于化學(xué)結(jié)構(gòu)變化(例如蛋白質(zhì)中氨基酸的添加、缺失或替換、用化學(xué)試劑進(jìn)行共價(jià)修飾或者通過(guò)化學(xué)或熱降解進(jìn)行裂解、對(duì)結(jié)構(gòu)添加或去除碳7jC化合物等)、與一種或多種其它物質(zhì)如生物分子或配體等的相互作用等。對(duì)不同狀態(tài)的評(píng)估可以用作一種確定不同分子(或其它物質(zhì))的潛在有效性、分子的狀況、分子或物質(zhì)所處環(huán)境(例如物質(zhì)混合物)的狀況或狀態(tài)等的方法。在一些實(shí)施方案中，本發(fā)明包括研究分子的狀態(tài)。在涉及生物分子和/或能夠與生物分子相互作用之分子的研究范圍內(nèi)描述了本發(fā)明，但是本發(fā)明可以應(yīng)用于基本上任何分子物質(zhì)和/或相互作用，無(wú)論是生物物質(zhì)、生化物質(zhì)、化學(xué)物質(zhì)或其它物質(zhì)，并且本領(lǐng)域普通技術(shù)人員會(huì)理解本發(fā)明可以如何用于非生物分子的范圍。應(yīng)當(dāng)理解，本發(fā)明的i兌明書(shū)中4吏用"生物分子"的任何時(shí)候，也可以使用或研究任何非生物分子。在一方面中，本發(fā)明涉及用于確定與生物分子(或其它物質(zhì))和/或與生物分子相互作用的分子的混合物的組成相關(guān)的信息的技術(shù)。該混合物可以源自生物材料，例如人體臨床樣品或其它生物學(xué)流體、組織、細(xì)胞、對(duì)象等，和/或所述混合物可以是合成混合物。所述混合物可以來(lái)自生物系統(tǒng)，如本文使用的那樣，生物系統(tǒng)指的是人或非人類的哺乳動(dòng)物(包括但不限于狗、貓、馬、牛、豬、綿羊、山羊、雞、靈長(zhǎng)類動(dòng)物、大鼠和小鼠)、其它動(dòng)物(例如青蛙)或細(xì)菌、病毒、真菌或植物源。所述混合物可以從人體或其它動(dòng)物體內(nèi)的任意合適的源采集，例如從組織活檢、全血、血清或其它血液級(jí)分、尿液、眼流體、唾液、腦脊液、來(lái)自扁桃體、淋巴結(jié)、穿刺活檢的流體或其它樣品等中采集。在一些情況下，本發(fā)明還涉及開(kāi)發(fā)和確定例如經(jīng)利用本文所述的多相分配或其它分離技術(shù)(例如色鐠術(shù))處理獲得的混合物的特征(定量和/或定性)，其可以反映與原混合物中的生物分子相互作用的生物分子或分子的某些結(jié)構(gòu)和/或功能特征。這些特征可以用于例如建立混合物的組成和混合物生物來(lái)源的生理狀態(tài)如對(duì)象的健康或患病狀態(tài)之間的關(guān)系。這些特征還可以用于為隨后將混合物分級(jí)成富集目標(biāo)分子的用于分析的亞組該:計(jì)實(shí)驗(yàn)4Hf，而且同時(shí)在一些情況下減少不同分子的總數(shù)。該分離可以是全部分離或部分分離，即在亞組中以相對(duì)于總樣品而言更高的濃度存在，但是亞組中仍然可以存在其它物質(zhì)。本發(fā)明的系統(tǒng)和方法還可以用于檢測(cè)、分類和/或預(yù)測(cè)生物分子或與生物分子相互作用的分子的混合物中的變化。例如，所述混合物可以是合成混合物，或者是與活生物、細(xì)胞、組織或生物流體的特定疾病或生理狀態(tài)相關(guān)的混合物。本發(fā)明的系統(tǒng)和方法還可以用于檢測(cè)生物混合物中一種或多種分子或生物分子的變化，并且在一些實(shí)施方案中這些變化還可以用于檢測(cè)和分類與這些變化相關(guān)的診斷。然而，在一個(gè)實(shí)施方案中，盡管可以在以本發(fā)明所述的方式使混合物與多相體系反應(yīng)并獲得比較鐠之前(或之后)作為混合物的預(yù)(或后)處理步驟來(lái)進(jìn)行這種分級(jí)，但是本發(fā)明的系統(tǒng)和方法不用于在分析之前簡(jiǎn)單地除去分析原始混合物的物質(zhì)亞組。混合物中的這種變化的例子可以是混合物中物質(zhì)模式的性質(zhì)差異，例如與物質(zhì)構(gòu)象、結(jié)構(gòu)和/或相對(duì)于另一種或多種分子的相互作用趨勢(shì)(例如其針對(duì)另一種或多種分子或其它物質(zhì)的結(jié)合親和力或其它相互作用特性)的差異相關(guān)的那些。例如，如果混合物包括蛋白質(zhì)或其它生物分子，則可以通過(guò)化學(xué)、熱或其它降解機(jī)理降解蛋白質(zhì)或其它生物分子，通過(guò)與其它分子和/或生物分子相互作用，通過(guò)與低分子量化合物(例如激素、肽、維生素、輔因子等)相互作用，通過(guò)混合物成分的相對(duì)含量或濃度變化，通過(guò)諸如SI^反應(yīng)的反應(yīng)，通過(guò)諸如磷酸化或糖基化作用的特異性變化等，經(jīng)由一級(jí)序列的修飾來(lái)誘發(fā)這種變化。在一些情況下，本發(fā)明的系統(tǒng)和方法可用來(lái)檢測(cè)、分析和/或表征生物物質(zhì)，包括但不限于多肽、蛋白質(zhì)、碳水化合物、核酸、多核苷酸、脂質(zhì)和/或固醇及其混合物或衍生物，例如，用于特定疾病或生理狀態(tài)的檢測(cè)或發(fā)作、監(jiān)測(cè)其選艮、治療等。本發(fā)明涉及的比較和分類的步驟可以使用與本發(fā)明的分析方法不必相關(guān)(不是直接獲自本發(fā)明的分析方法)的額外信息。例如，可以與本發(fā)明的技術(shù)結(jié)合使用血壓、溫度、血糖水平和/或基本上任何其它可測(cè)量的生理狀態(tài)來(lái)分4斤一種或多種生理狀態(tài)。在本發(fā)明的一些實(shí)施方案中，多種物質(zhì)(分子、生物分子等)接觸至少第一和第二相互作用成分，所述第一和第二相互作用成分可以將所述多種物質(zhì)至少部分分離或分配成例如第一部分和與第一部分的組成不同的第二部分。例如，第一部分可以富集第一物質(zhì)(或第一物質(zhì)的第一構(gòu)象)，而第二部分可以是缺失第一物質(zhì)或構(gòu)象。在一些情況下，這種分離可以是部分分離或4^P分離。在一些情況下，該體系是分配體系，如本文所公開(kāi)的。非限制性例子包括含7K/非水分配體系、含水多相分配體系、液相色譜、HPLC、柱液-液分配色i普(LLPC)、兩相非均勻體系、多相非均勻體系等。在本發(fā)明的一些實(shí)施方案中，可以進(jìn)行多分配和/或其它分離步驟，從而獲得額外的信息和/或靈敏度。例如，在確定兩種或更多不同混合物的各個(gè)混合物中的物質(zhì)比較模式之前和在對(duì)在組成相同(或近似相同)的兩個(gè)、三個(gè)或更多分配體系中對(duì)兩種混合物進(jìn)行分配之后，還可以將含有混合物的兩個(gè)體系中的一些第一和/或第二相互作用成分引入第二組的具有至少兩種相互作用成分的兩個(gè)相同(或近似相同)的體系中。然后，可以用兩個(gè)第二組體系對(duì)兩種混合物進(jìn)行分配，并且可以如本文所述的那樣確定和使用每個(gè)混合物中的物質(zhì)的比較模式。對(duì)于另一非限制性例子，可以首先對(duì)混合物進(jìn)行色i普分析，然后進(jìn)行分配(反之亦然)。本領(lǐng)域的技術(shù)人員將會(huì)認(rèn)識(shí)到，這些生物物質(zhì)可以以任意合適的形式存在，例如天然來(lái)源的提取物、生物液體、細(xì)胞和組織樣品、細(xì)菌、病毒或真菌，組合的化學(xué)或生物技術(shù)及其聯(lián)合所產(chǎn)生的分子集合，合成產(chǎn)生的分子集合等形式。在一個(gè)實(shí)施方案中，本發(fā)明提供一種確定可以檢測(cè)代表不同組成(或物質(zhì)混合物)的樣品中變化的某些條件的方法，即確定一組標(biāo)準(zhǔn)和/或體系成分作為"工具"或工具的一部分來(lái)確定信息。例如，多相體系確定物質(zhì)比較模式的能力可以用作重要的工具或該工具的一部分。特別地，作為一個(gè)非限制性例子，具有不同的化學(xué)或生物化學(xué)親和力或其它特性例如溶劑結(jié)構(gòu)的兩相之間的樣品成分的分配可以通過(guò)它們對(duì)于不同性質(zhì)或組成的介質(zhì)的相對(duì)親和力來(lái)分離成分。因此，該分離技術(shù)可以包括例如2D■電泳，其中電荷和尺寸差異是用于分離樣品成分的兩維，或者可以與蛋白質(zhì)組學(xué)(proteomics)或類似技術(shù)中通常所用的那些不同。在一些情況下，例如對(duì)于蛋白質(zhì)組學(xué)中的許多應(yīng)用，本發(fā)明提供了用于在可能導(dǎo)致分級(jí)樣品中的額外放大或差異的相同或不同的條件下進(jìn)行順序和/或連續(xù)分配的能力。在一些情況下，還可以利用諸如質(zhì)鐠的技術(shù)來(lái)分析包括這些級(jí)分的物質(zhì)的物理性質(zhì)的這些模式。然而，在本發(fā)明的上下文中，這些操作的意圖不必是簡(jiǎn)單地分級(jí)或除去混合物中的一些物質(zhì)，而是提供方法來(lái)獲得與混合物中原始物質(zhì)的濃度或豐度水平的信息無(wú)關(guān)的比較i普。如本文所述，含水多相(例如兩相)分配體系非常適用于本發(fā)明的許多實(shí)施方案，但是根據(jù)另一些實(shí)施方案，也可以使用另一些分配體系。因此，在使用"含水兩相分配"或"含水多相分配"的地方，應(yīng)當(dāng)理解也可以使用其它體系，例如，含7jc/非水兩相分配、非7K/非水兩相分配、液相色鐠等。含水兩相體系中生物聚合物的分配可以取決于例如其電荷、尺寸、三維結(jié)構(gòu)、類型、接觸溶劑的化學(xué)基團(tuán)的形態(tài)等因素。例如，由一些作用如配體結(jié)合的結(jié)合和/或結(jié)構(gòu)降解所引發(fā)的受體3D結(jié)構(gòu)的變化也可以改變生物分子中溶劑可接觸的化學(xué)基團(tuán)的形態(tài)，或者改變可接觸溶劑的基團(tuán)的形態(tài)和類型。才艮據(jù)本發(fā)明的某些實(shí)施方案，這些變化的一個(gè)結(jié)果可以是改變生物分子和/或配體結(jié)合的受體的分配行為。在一些情況下，生物樣品中的生物分子的濃度水平取決于基因型或除了與進(jìn)行研究的生理狀態(tài)相關(guān)的那些原因之外的原因。因此，在本發(fā)明的一些實(shí)施方案中，鑒定可歸因于患病相對(duì)正常狀態(tài)的生物分子中的差異可能需要使用統(tǒng)計(jì)顯著量的樣品來(lái)消除天然遺傳變異或其它變異的影響。在一些情況下，可以將導(dǎo)致表達(dá)不足或過(guò)度表達(dá)的遺傳變異或其它變異的影響與追溯到其患病相對(duì)正常狀態(tài)的生物分子的差異分開(kāi)(例如，分級(jí))。根據(jù)各個(gè)實(shí)施方案，這種分開(kāi)可以通it^含有生物分子或其它分子的樣品或其它物質(zhì)混合物在一個(gè)或不同體系中進(jìn)行分配或分離以及利用該體系的各種成分來(lái)確定樣品/混合物中物質(zhì)的比較模式來(lái)獲得。這可以通過(guò)例如以下方式來(lái)實(shí)現(xiàn)利用常規(guī)技術(shù)來(lái)分離和/或分級(jí)每個(gè)樣品的兩種相互作用成分，計(jì)算在患病和正常樣品中每種物質(zhì)的分配系數(shù)的模式，以及利用該模式進(jìn)行進(jìn)一步分析。作為特定的非限制性例子，獲得比較模式可涉及分級(jí)或分離體系的第一部分和第二部分的至少一部分(和/或更多部分)。這種分級(jí)或分離可能涉及包括電泳(例如一維電泳、二維電泳)、液相色i普或其它色鐠、對(duì)體系的第一、第二(和/或更多部分)的至少一部分進(jìn)行直接或后續(xù)的質(zhì)譜分析等技術(shù)，并且在一些情況下可能涉及基于點(diǎn)對(duì)點(diǎn)的比較。其它技術(shù)包括其它的光鐠技術(shù)(例如UV、可見(jiàn)光、IR、拉曼等)等。不同的分配技術(shù)可以不與每種物質(zhì)的絕對(duì)表達(dá)水平相關(guān)，但是可以與結(jié)構(gòu)變化、與其它分子的結(jié)合或與其生物作用等相關(guān)的其它變化相關(guān)。因此，在一組實(shí)施方案中，本發(fā)明提供用于鑒定生物混合物中生物分子的變化的方法，該變化可以是結(jié)構(gòu)的內(nèi)在變化，因此更接近于其功能而不是絕對(duì)水平，在一些情況下，不必需要大的統(tǒng)計(jì)量的樣品來(lái)消除表達(dá)水平個(gè)體差異性的影響。使用獲自多個(gè)體系("特征")的分配系數(shù)的模式可以用于增強(qiáng)本發(fā)明的某些方法的特異性。在另一些實(shí)施方案中，在多個(gè)體系中分配樣品并進(jìn)行上述步驟、然后觀察一個(gè)或更多生物分子的值的模式可以提供另一種構(gòu)建敏感和特異性診斷方法的方式。在一些實(shí)施方案中，可以利用對(duì)可^溶劑的基團(tuán)的形態(tài)和/或類型有潛在依賴性的其它體系和方法來(lái)檢測(cè)這種變化。這些其它方法的實(shí)例包括但不限于柱液-液分配色鐠(LLPC)、兩相非均勻體系、多相非均勻體系等。在一些情況下，可以產(chǎn)生表示第一和第二相之間的平均分配的相對(duì)變化的^Jf見(jiàn)分配系數(shù)。例如，在LLPC中，可以使用受體的保留體積作為表觀分配系數(shù)。含水兩相體系是本領(lǐng)域普通技術(shù)人員所熟知的，并且可以出現(xiàn)在不同水溶性聚合物或單個(gè)聚合物和特定鹽的含水混合物中。當(dāng)兩種或更多種某些聚合物例如葡聚糖("Dex，，)和聚乙二醇("PEG")或一種或更多種某些聚合物和一種或更多種無(wú)機(jī)鹽例如聚乙烯吡咯烷酮("PVP，，)和硫酸鈉以高于一定濃度在水中混合時(shí)，混合物可在某些條件下分離成兩個(gè)互不混溶的含水相。可能存在將兩相分開(kāi)的不連續(xù)的分界面，例如使得一相富集聚合物，另一相富集另一聚合物或無(wú)機(jī)鹽。一相或兩相中的含7jC溶劑可以提供適用于生物或其它物質(zhì)的介質(zhì)。兩相體系還可以通過(guò)利用不同的化學(xué)成分而普及到多相體系，具有一打或更多相的含7jC體系是本領(lǐng)域公知的，并且可以與本發(fā)明一起^吏用。當(dāng)將物質(zhì)引入這種兩相體系中時(shí)，其可以分布在兩相之間。在這個(gè)和其它體系(例如具有三個(gè)或更多個(gè)這種相的多相體系)中，物質(zhì)可以在每個(gè)相內(nèi)以不同濃度存在，或者可以在每個(gè)相內(nèi)以相同濃度存在。溶質(zhì)分配由分配系數(shù)"K，，表征，其定義為兩個(gè)互不混溶相在平衡時(shí)的溶質(zhì)濃度之比。前文已經(jīng)顯示，含水聚合物體系中的相分離可能是由于兩種聚合物(或單種聚合物和鹽)對(duì)水結(jié)構(gòu)的不同作用(例如參見(jiàn)B.Zavlavsky，AqueousTwo-PhasePartitioning:PhysicalChemistryandBioanalyticalApplications,MarcelDekker,NewYork,1995)所造成。由于對(duì)水結(jié)構(gòu)的不同作用，共存相中含7jC介質(zhì)的溶劑特征可能互相不同。相之間的差異可以通過(guò)例如電介質(zhì)、溶劑變色、電勢(shì)計(jì)、分配測(cè)量等技術(shù)得到證實(shí)。已經(jīng)證明在含水兩相體系中溶質(zhì)分配的基本規(guī)律類似于水-有機(jī)溶劑體系中的那些規(guī)律(其也可以用作本發(fā)明的體系)。然而，含水聚合物體系中的兩相性質(zhì)中確實(shí)存在的差異相對(duì)于水-有機(jī)溶劑體系中觀察到的那些而言經(jīng)常是非常小的，如對(duì)于一對(duì)具有相同(含水)性質(zhì)的溶劑所期望的那樣。含水兩相或多相體系中相的溶劑特征之間的細(xì)微差異可以被改變以放大在存在某些結(jié)構(gòu)特征時(shí)所觀察到的分配。各個(gè)相的聚合物和/或鹽的組成可以取決于含水兩相體系的總的聚合物和/或鹽組成。而給定相的聚合物和/或鹽組成可以調(diào)節(jié)該相中含水介質(zhì)的溶劑特征。這些特征包括但不限于介電性質(zhì)、溶劑極性、溶劑參與和溶質(zhì)的疏水性水合相互作用的能力、溶劑參與和溶質(zhì)的靜電相互作用的能力以及溶劑的氫鍵脧變和威變?？梢酝ㄟ^(guò)選擇含水兩相體系的聚合物和鹽組成來(lái)控制共存相中含7JC介質(zhì)的所有這些和其它溶劑特征。介質(zhì)的這些溶劑特征可能控制了指定的含水兩相體系對(duì)受體中可進(jìn)入溶劑的具體類型化學(xué)基團(tuán)的敏感性。兩種不同蛋白質(zhì)中可i^溶劑的基團(tuán)的這種敏感性、類型和形態(tài)例如可以確定在指定的含水兩相體系中分離蛋白質(zhì)的可能性。在一些情況下，可能需要特別靈敏的體系，例如對(duì)兩種非常類似的物質(zhì)非常靈敏的體系，或能夠檢測(cè)出同一物質(zhì)的構(gòu)象差異的體系等。例如，在檢測(cè)由密切相關(guān)化合物的結(jié)合引發(fā)的受體構(gòu)象變化之間的細(xì)微差異時(shí)，這種靈敏度可能是重要的。在一些實(shí)施方案中，本發(fā)明提供用于篩選組成以鑒定和/或放大兩種混合物的組成之間差異的有效且結(jié)果良好的體系和方法。如本文所述，通過(guò)使用各種不同的條件來(lái)篩選每種分子，可以可靠地獲得不同的分配或分離性能，而不需要充分理解含水兩相分配的潛在理論，或者任何其它相關(guān)的或可替代的分離技術(shù)。諸如蛋白質(zhì)、核酸等生物分子在i0v這種體系中時(shí)可以分布在兩個(gè)或更多相之間。例如，在使用形成相的聚合物的情況下，可以將包含生物分子和兩種聚合物中的一種或多種的溶液混合在一起，使得形成相的聚合物和生物分子都混合。分拆所得溶液，形成兩相體系。任選地，可以使用離心來(lái)提高相的分離。在又一實(shí)施方案中，可以在微流控裝置中進(jìn)行該分配，在微流控裝置中，使兩個(gè)液體流在狹窄的通道中密切接觸，由此有助于物質(zhì)的分配，而不需要攪拌和離心。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員將會(huì)認(rèn)識(shí)到，生物分子的分配性能可受許多變量影響，例如pH、所用的聚合物、所用的鹽、與體系組成相關(guān)的因素以及其它因素例如溫度、體積等。所屬相關(guān)領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可以通過(guò)常規(guī)實(shí)踐并結(jié)合本公開(kāi)來(lái)優(yōu)化這些因素以獲得期望的效果。在一些實(shí)施方案中，得自生物分子或其它物質(zhì)的分配的數(shù)據(jù)的評(píng)估可能涉及使用分配系數(shù)。例如，可以將xM目體系中第一相中的蛋白質(zhì)與第二相中的蛋白質(zhì)之比作為蛋白質(zhì)的分配系數(shù)。在形成多相體系時(shí)，可以存在多個(gè)獨(dú)立的分配系數(shù)，每個(gè)分配系數(shù)可以在任意兩相之間定義。將^i人識(shí)到，如果所經(jīng)歷的兩相體系的條件和組成保持恒定，則指定的生物分子或具有指定構(gòu)象的其它物質(zhì)的分配系數(shù)也會(huì)是恒定的。因此，例如，如果在加入可能的結(jié)合對(duì)應(yīng)物之后觀察到蛋白質(zhì)的分配系數(shù)發(fā)生變化，則可以推定這些變化是由形成蛋白質(zhì)一結(jié)合配偶體復(fù)合物所引起的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)變化造成的。在該情況下，分配系ltA特定的數(shù)學(xué)定義量，并且該術(shù)語(yǔ)包括代表物質(zhì)和至少兩種相互作用成分之間的相互作用相對(duì)量度的系數(shù)。還應(yīng)該認(rèn)識(shí)到，兩種或更多種混合物中對(duì)應(yīng)物質(zhì)的分配系數(shù)之間的差異可表示可能的結(jié)構(gòu)變化以及該物質(zhì)與混合物中的其它物質(zhì)發(fā)生結(jié)合或沒(méi)有結(jié)合。為了本文所述的目的，本發(fā)明特別利用分配系數(shù)的模式，但不必是它們各自的對(duì)應(yīng)物。在一個(gè)分配體系的非限制性例子中，已知含水多相體系可由多種物質(zhì)形成。例如，為了確定待分析蛋白質(zhì)(或蛋白質(zhì)與另一化合物的混合物)的分配系數(shù)，可以分別配制所有成分(聚合物l,例如葡聚糖；聚合物2，例如PEG，聚乙烯吡咯烷酮，鹽等)在水中的濃縮原液。相聚合物、鹽和蛋白質(zhì)混合物的原液可以以適合于使體系達(dá)到期望組成的量和條件(例如，pH為約3.0~約9.0,溫度為約4X:到60"C，鹽濃度為0.001mol/kg至5mol/kg)混合并進(jìn)行強(qiáng)力振搖。然后，可以使該體系達(dá)到平衡(相分拆)?？梢酝ㄟ^(guò)使溶液保持靜止來(lái)達(dá)到平衡，或者可以通過(guò)離心來(lái)加速平衡，例如在約1000g到約4000g或一些情況下更高離心力下離心約2~30分鐘來(lái)加速平衡?？梢詮纳喜亢?或下部的相(或者如果存在多個(gè)相的話，從一個(gè)或多個(gè)相中)取每個(gè)分開(kāi)的相的等分試樣。然后可以確定每個(gè)相的分子或其它物質(zhì)的濃度。在各個(gè)實(shí)施方案中，可以使用不同的分析方法來(lái)確定物質(zhì)和相互作用成分之間的相互作用的相對(duì)量度，例如以多相體系的每個(gè)相中的生物分子的濃度的形式。該分析經(jīng)常會(huì)取決于所存在的生物分子或其它分子的特性和類型。合適的分析技術(shù)的實(shí)例包括但不限于光i普分析、免疫化學(xué)分析、化學(xué)分析、熒光分析、放射性分析和酶分析。當(dāng)生物分子是肽或蛋白質(zhì)時(shí)，可以使用常用的肽或蛋白質(zhì)檢測(cè)技術(shù)。這些技術(shù)包括但不限于直接分光光度法(例如監(jiān)測(cè)280納米處的吸光度)和利用考馬斯藍(lán)G-250或熒光胺、鄰^Ji甲醛或其它染料和/或試劑的染料結(jié)合反應(yīng)。作為替代方案，如果蛋白質(zhì)是抗體或抗原，則在一些情況下可以使用某些免疫化學(xué)分析。在質(zhì)鐠的情況下，特定m/z鐠位置處的峰高在一些情況下可與特定蛋白質(zhì)的濃度成比例，或者在特定洗脫時(shí)間處的峰高可以與其成比例。在本發(fā)明的一些實(shí)施方案中，在每個(gè)相或在一個(gè)相和原始樣品中的生物分子或其它物質(zhì)的濃度可用于確定樣品在特定體系條件下的分配系數(shù)。由于分配系數(shù)僅反映兩個(gè)濃度的比值，因此可以不需要絕對(duì)值。將會(huì)認(rèn)識(shí)到，這可以使某些分析程序簡(jiǎn)化，例如在一些情況下可以取消校正。在比較兩個(gè)或更多樣品時(shí)，其還對(duì)于消除從例如生物系統(tǒng)中獲得的樣品中蛋白質(zhì)絕對(duì)濃度中天然變異性的影響具有顯著優(yōu)點(diǎn)，由此集中在作為與樣品中個(gè)體物質(zhì)的結(jié)構(gòu)變化相關(guān)的分配系數(shù)的差異而檢測(cè)的這些變化上。本領(lǐng)域的技術(shù)人員應(yīng)該認(rèn)識(shí)到，上述說(shuō)明中獲得分配系數(shù)的步驟可以用其它步驟代替。根據(jù)生物分子的尺寸、體積和量、檢測(cè)體系，可以使用利用液-液或液-固分配的間歇或連續(xù)操作、色鐠或有效產(chǎn)生本發(fā)明所述結(jié)果的其它方法。這些^"改和不同的方法不限制4^發(fā)明的范圍。在本發(fā)明的一些實(shí)施方案中，還可以將所述分配系數(shù)和其它分配系數(shù)相比較。例如，可以比較物質(zhì)的分配系數(shù)與該物質(zhì)在不同條件下的分配配系數(shù)，可以比較物質(zhì)的一組分配系數(shù)與其它組分配系數(shù)等?？梢员容^從例如相對(duì)于利用質(zhì)鐠的m/z位置或HPLC或其它色譜的洗脫時(shí)間等的一系列分配系數(shù)獲得的模式與在不同*下獲得的其它模式，諸如此類。在質(zhì)譜分析的情況下，例如分配體系的上部相的各個(gè)m/z處的信號(hào)值可以在某些情況下除以來(lái)自同一分配體系的下部相的相同m/z處的信號(hào)值來(lái)產(chǎn)生相同特定m/z處的分配系數(shù)值。作為另一非限制性例子，在一些情況下，上部相的HPLC色譜中每個(gè)期望時(shí)間處的吸光度值除以對(duì)應(yīng)于相同時(shí)間的其對(duì)應(yīng)的下部值來(lái)產(chǎn)生分配系數(shù)的色譜圖。在本發(fā)明中，這些語(yǔ)或色譜還可以被稱為模式或數(shù)據(jù)模式。在一些情況下，該比較信息可以同時(shí)或幾獲得，或者可以作為曲線圖、表或電子存儲(chǔ)信息(在因特網(wǎng)上可用的、磁盤(pán)等)形式的預(yù)先準(zhǔn)備的數(shù)據(jù)來(lái)提供。在本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案中，可以使來(lái)自實(shí)驗(yàn)樣品和參考樣品的蛋白質(zhì)或其它生物分子的混合物(同時(shí)、之前或隨后確定的，如上文所述一樣)分配在多種不同的含水兩相體系中，所述不同的含水兩相體系例如由不同類型的聚合物如葡聚糖和PEG或葡聚糖和Ficoll形成，由具有不同分子量的相同類型的聚合物如Dextran-70和PEG-600或Dextran-70和PEG-8000形成，由相同的但含有濃度和/或類型不同的鹽添加劑、pH和濃度不同的不同緩沖液的聚合物形成，等等。在一些情況下，利用特定分析程序(兩種樣品的程序相同)確定的混合物的總分配系數(shù)可以在全部體系中確定。在一個(gè)實(shí)施方案中，可以選擇對(duì)所比較的混合物表現(xiàn)出不同分配系數(shù)的體系作為分離介質(zhì)，例如用于進(jìn)一步分級(jí)和/或表征混合物。在另一實(shí)施方案中，利用具有已知性質(zhì)的一種或多種標(biāo)準(zhǔn)體系(例如對(duì)疏水性或離子相互作用提供更高敏感度的那些體系)來(lái)分配或以其它方式分離混合物。在這些情況下，可以在分離所i^t目中的混合物之后確定包含所述物質(zhì)的混合物的單個(gè)分配系數(shù)的模式，和/或比較兩種或更多種混合物的模式。無(wú)須在科學(xué)上闡明在兩個(gè)樣品的分配行為中觀察到的差異的原因，這些差異即可用于許多應(yīng)用例如用于診斷。導(dǎo)致分配性能的這些差異可由多種原因引起，包括在接觸不同溶劑結(jié)構(gòu)的含水介質(zhì)時(shí)樣品中的相對(duì)組成、結(jié)構(gòu)或構(gòu)象的差異。也無(wú)需知道兩個(gè)樣品的分配行為的模式中所包含的物質(zhì)的身份，這樣兩種模式之間的差異即可用于某些應(yīng)用中。在一組實(shí)施方案中，本文提出的體系和方法^供用于分離和分級(jí)蛋白質(zhì)并同時(shí)保留可能在區(qū)分樣品時(shí)受到關(guān)注的復(fù)合物和生物分子相互作用的技術(shù)?？梢赃x擇含水分配中的溶劑介質(zhì)以與生物分子的混合物相容。還可以選擇溶劑介質(zhì)以保留高級(jí)結(jié)構(gòu)，以及保留在生物分子例如蛋白質(zhì)、小分子量配體等之間的非共價(jià)結(jié)合。例如，通過(guò)本發(fā)明方法的復(fù)合物的出現(xiàn)或消失可以用于診斷和其它應(yīng)用。因此，在這些實(shí)施方案中，在4壬何特定m/z或洗脫時(shí)間處的分配系數(shù)可以反映這類生物分子相互作用的存在或不存在。本發(fā)明的一個(gè)方面提供能夠在不嚴(yán)格地依賴于諸如電荷和/或尺寸的幾個(gè)分離尺度或變量的情況下區(qū)分不同樣品的體系和方法。本發(fā)明的一個(gè)非限制性的應(yīng)用實(shí)例是提供一種可調(diào)節(jié)的分離尺度，其中可以通過(guò)確定單個(gè)物質(zhì)的單個(gè)分配系數(shù)模式或數(shù)據(jù)模式來(lái)找出其模式的變化，從而能夠檢測(cè)并鑒定利用常規(guī)分離方法如分子尺度或電荷所不能檢測(cè)的變化，并且其中在模式中并不反映這些單個(gè)物質(zhì)的濃度的絕對(duì)水平本身。本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案提供用于發(fā)現(xiàn)生物樣品中的生物分子的模式的體系和方法，在一些情況下，該模式可以在基礎(chǔ)生物的正常和患病狀態(tài)之間變化。在一些情況下，可以利用相同的樣品來(lái)測(cè)試一組典型的多重體系，已知每個(gè)體系對(duì)導(dǎo)致其與相互作用成分的疏水性、離子性等相互作用產(chǎn)生差異的結(jié)構(gòu)變化提^感性。在某些實(shí)施方案中，利用本文所述技術(shù)，可以在一個(gè)或更多體系中將一個(gè)或更多模式確定為標(biāo)志。該一個(gè)或更多標(biāo)志隨后還可以用于診斷應(yīng)用。在又一實(shí)施方案中，一組標(biāo)志和其中發(fā)現(xiàn)了這類標(biāo)志的相關(guān)體系可用于診斷篩選。例如，診斷試驗(yàn)可以包括以下步驟中的一步或更多步，所述步驟可以以適合于這種篩選的任意順序進(jìn)行(1)在標(biāo)志發(fā)現(xiàn)研究過(guò)程中使用的一個(gè)或更多體系中分配或以其它方式分離樣品；(2)處理所分配的樣品以獲得物質(zhì)濃度相對(duì)于m/z或洗脫時(shí)間的兩個(gè)或更多模式；(3)從每?jī)蓚€(gè)對(duì)應(yīng)的模式中，計(jì)算分配系數(shù)相對(duì)于m/z或洗脫時(shí)間的比較模式；(4)利用數(shù)學(xué)或統(tǒng)計(jì)學(xué)技術(shù)的任意組合，對(duì)該比較模式和代表在標(biāo)志發(fā)現(xiàn)研究過(guò)程中獲得的正常或患病狀態(tài)的那些模式進(jìn)行比較；和(5)基于該比較本身或與其它信息相結(jié)合來(lái)指示診斷。作為特定的非限制性例子，但不喪失一般性，對(duì)從分配體系的至少兩相或從一相和原始體系獲得的數(shù)據(jù)的模式進(jìn)行比較可以產(chǎn)生至少兩種典型的情況。在一些情況下，在用于描g式的相同(或?qū)嶋H相同)縱坐標(biāo)參數(shù)例如特定的m/z值或洗脫時(shí)間下，在兩相中可以得到所測(cè)量的物理性質(zhì)(例如濃度)的兩個(gè)有限值。在一些情況下，特異性對(duì)應(yīng)于縱坐標(biāo)位置的分配系數(shù)在數(shù)學(xué)上可以定義為這些性質(zhì)的比值。在另一些情況下，在相同(或?qū)嶋H相同)的縱坐標(biāo)位置處，來(lái)自所勤目之一的樣品可能表現(xiàn)出所測(cè)量的物理性質(zhì)的有限值，而來(lái)自另外相的樣品則不是如此。該情況可能意味著對(duì)應(yīng)于縱坐標(biāo)位置的單個(gè)物質(zhì)全部或?qū)嶋H上全部分離到了所^目之一中。在某些情況下，可以將特異于縱坐標(biāo)位置的分配系數(shù)在數(shù)學(xué)上規(guī)定為零、無(wú)窮大或數(shù)值以外的其它類別。作為第一種情況的特定非限制實(shí)例，所測(cè)量的性質(zhì)的模式和分配系數(shù)的經(jīng)處理模式可以如下<table>tableseeoriginaldocumentpage39</column></row><table>作為第二種情況的特殊非限制實(shí)例，所測(cè)量性質(zhì)的模式和分配系數(shù)的經(jīng)處理的模式可以如下<table>tableseeoriginaldocumentpage39</column></row><table>在不失去一般性的情況下，根據(jù)該實(shí)施方案，可以通過(guò)以下四種情況來(lái)描述這些模式1.分配系數(shù)相對(duì)于縱坐標(biāo)位置的模式。2.特定縱坐標(biāo)位置處該性質(zhì)值的差異相對(duì)于縱坐標(biāo)位置的模式。3.對(duì)應(yīng)于零或無(wú)窮大分配系數(shù)值的分類值相對(duì)于縱坐標(biāo)的模式。4.上述幾種情況中任意一些的混合。在該情況下，模式由一系列數(shù)字和分類值相對(duì)于縱坐標(biāo)值以及在相同縱坐標(biāo)值處提供模式中特定條目的含義注釋的一系列對(duì)應(yīng)的符號(hào)指示符構(gòu)成。作為另一非限制實(shí)例，模式可以為如下<table>tableseeoriginaldocumentpage39</column></row><table>在不失去一般性的情況下，根據(jù)一些實(shí)施方案，對(duì)于生物標(biāo)志或一組生物標(biāo)志(例如，為了增加臨床特異性)的搜索和指示疾病可能涉及以任意合適的順序進(jìn)行的以下一個(gè)或多個(gè)步驟1.制備一個(gè)或更多含水兩相分配體系。2.添加對(duì)應(yīng)于正常和患病狀態(tài)來(lái)源的血漿(勻漿的組織、尿液、唾液等)的樣品。3.將樣品分配在含水兩相體系中。4.對(duì)每個(gè)樣品從含水兩相體系的兩個(gè)相(或從一個(gè)相和原始樣品)中移取等分試樣。在該步驟之后，每個(gè)樣品會(huì)有兩個(gè)等分試樣。5.任選地，執(zhí)行額外的分離步驟(例如，HPLC或?qū)τ欣谀承╊悇e之蛋白質(zhì)的固體載體的吸附)來(lái)根據(jù)特定物理性質(zhì)如尺寸或電荷來(lái)分離每個(gè)等分試樣中的蛋白質(zhì)組。6.利用質(zhì)剩義，相對(duì)于其m/z值，對(duì)每個(gè)等分試樣中的樣品產(chǎn)生質(zhì)譜模式。7.計(jì)算來(lái)自同一樣品的每組等分試樣中點(diǎn)點(diǎn)對(duì)應(yīng)鐠數(shù)據(jù)的比值，利用分類值來(lái)表示在兩相中的任一相中一定m/z值處該性質(zhì)值的缺失。8.利用數(shù)學(xué)或統(tǒng)計(jì)學(xué)技術(shù)來(lái)比較正常相對(duì)于患病狀態(tài)的比值和/或分類值的比較模式。9.選擇一個(gè)或更多模式以及用于確定該模式的分配體系和其它分離步驟，根據(jù)對(duì)于該兩種類型的樣品使用數(shù)學(xué)或統(tǒng)計(jì)學(xué)技術(shù)被指定為不同而作為潛在生物標(biāo)志。應(yīng)該注意，如上所述，發(fā)現(xiàn)和選擇標(biāo)志不必要鑒定該蛋白質(zhì)。在一些情況下，標(biāo)志可以包括以本文所述的方式選擇的物質(zhì)的模式。在一個(gè)實(shí)施方案中，可以使用含水兩相分配體系或其它體系的具體組成來(lái)確定比值作為分配系數(shù)。不同組成的多分配體系也可以用于與上述方法類似的方法中。用于隨后診斷的一組標(biāo)志的選擇也可以取決于諸如提高特異性的竟?fàn)幪匦浴⒃谧罱K的組中包含額外生物標(biāo)志時(shí)的成本等因素。根據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施方案，一旦利用與上述技術(shù)類似的技術(shù)發(fā)現(xiàn)了一組生物標(biāo)志，則可以設(shè)計(jì)診斷篩選試驗(yàn)。作為非限制性例子，在不失一般性的情況下，可以進(jìn)行以下試驗(yàn)1.獲得與未知狀態(tài)(正?；蚧疾?相對(duì)應(yīng)的血漿(均漿組織、尿液、唾液等)樣品。2.將樣品的等分試樣添加到在發(fā)現(xiàn)生物標(biāo)志期間所用的分配體系中。如果使用多于一個(gè)體系，則對(duì)每個(gè)不同的分配體系重復(fù)相同的步驟。3.在每個(gè)體系中進(jìn)行樣品的分配。4.根據(jù)用于限定和選擇對(duì)應(yīng)于樣品不同狀態(tài)的模式的步驟來(lái)進(jìn)行任意額外的分離步驟。4.獲得每個(gè)已分配相的質(zhì)鐠。5.計(jì)算每個(gè)已分配相的分配系數(shù)的模式(如上所述必要時(shí)使用分類值)。6.利用合適的數(shù)學(xué)或統(tǒng)計(jì)學(xué)技術(shù)，將由分配系數(shù)和/或來(lái)自未知來(lái)源的樣品的分類值與對(duì)應(yīng)于正常和患病狀態(tài)的那些進(jìn)行比較。7.將未知樣品歸類為在診斷學(xué)上類似于已知樣品之一。在一些實(shí)施方案中，生物標(biāo)志可以代表同一蛋白質(zhì)各種形式的混合物，和/或正常和患病狀態(tài)之間可能出現(xiàn)或消失的在生物分子之間或在生物分子和其它分子之間相復(fù)合(complex)的混合物。同一蛋白質(zhì)不同形式的分布或相對(duì)量的變化在一些情況下可導(dǎo)致所述同一蛋白質(zhì)的不同分配行為，并且復(fù)合物的出現(xiàn)或不出現(xiàn)可能導(dǎo)致例如*的出現(xiàn)或不出現(xiàn)。本發(fā)明的一些方面提供在確定用于生理分析和/或進(jìn)行生理分析的工具水平上的各種研究。例如，用于確定分析程序的工具可涉及從單個(gè)個(gè)體或多個(gè)個(gè)體獲取樣品。在一個(gè)實(shí)施方案中，可以從單個(gè)個(gè)體獲取陽(yáng)性樣品和對(duì)照樣品。例如，個(gè)體可以具有腫瘤，而陽(yáng)性樣品可以是肺瘤的一部分，此時(shí)對(duì)照樣品得自該個(gè)體的非腫瘤部分。可以同時(shí)或在不同的時(shí)間從個(gè)體獲取陽(yáng)性和對(duì)照樣品。例如，可以在不同的時(shí)間從生物體的腫瘤部分獲取樣品，并將樣品的模式中的差異確定為用于分析腫瘤iL艮的工具。在一些情況下，可以使用單個(gè)模式或多個(gè)模式作為標(biāo)志?？梢詫?lái)自單個(gè)樣品的多個(gè)模式識(shí)別為用于特定狀態(tài)的單獨(dú)標(biāo)志，并且在分析過(guò)程中，可以在某些情況下研究分開(kāi)的模式。作為一個(gè)例子，單個(gè)模式可以限定由單個(gè)分配體系所識(shí)別和/或涉及單個(gè)分配體系所研究的標(biāo)志。在另一實(shí)施方案中，可以將來(lái)自單個(gè)樣品的多個(gè)模式識(shí)別為利用多個(gè)分配體系的用于特定狀態(tài)的單獨(dú)標(biāo)志，并且可以在分析過(guò)程中研究分開(kāi)的模式。用于評(píng)估分配系數(shù)或分類值的模式的分析工具可以是例如質(zhì)鐠儀、液相色鐠如HPLC或其它波鐠技術(shù)例如UV、IR、拉曼或其它吸光度和/或散射技術(shù)。每種情況中用于模式的縱坐標(biāo)取決于所述技術(shù)，例如質(zhì)譜的m/z,HPLC的時(shí)間，大多數(shù)波鐠技術(shù)的波長(zhǎng)等。本方法的技術(shù)方面可以產(chǎn)生作為在每個(gè)特定波長(zhǎng)處來(lái)自許多分子的響應(yīng)之和獲得的一個(gè)或更多峰的模式(例如在特定m/z處的值)或散布模式(例如，HPLV色譜圖或UV-可見(jiàn)光吸收光鐠圖)。如本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員所理解的，用于分析這些模式的數(shù)學(xué)技術(shù)可以隨所用的技術(shù)而變化，并且對(duì)于每種分析工具的相對(duì)選擇將主要取決于其靈lt度、分辨率和其它運(yùn)行特性，但不失本發(fā)明的一般性。在一些情況下，可以使用數(shù)學(xué)和統(tǒng)計(jì)學(xué)模式識(shí)別技術(shù)來(lái)分析數(shù)據(jù)，包括線性和非線性技術(shù)，例如主成分分析、偏最小二乘法、人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、遺傳算法、傅立葉或小波變換等。在一些情況下，可以使用一種或多種這樣的算法來(lái)加工、變換、壓縮或處理一系列的分配系數(shù)和/或分類值?？梢岳眠@樣的技術(shù)來(lái)比較對(duì)應(yīng)于給定物質(zhì)混合物(例如，來(lái)自陽(yáng)性病例的血清樣品)的原始值或其經(jīng)加工的數(shù)據(jù)與以類似方式獲得和加工的對(duì)應(yīng)于不同物質(zhì)混合物(例如，來(lái)自陰性病例)的數(shù)據(jù)。在模式發(fā)現(xiàn)過(guò)程中，這樣的技術(shù)可以配備有不同類別的樣品的多個(gè)例子，并且以數(shù)學(xué)或統(tǒng)計(jì)學(xué)的方式發(fā)現(xiàn)和展示數(shù)據(jù)的分析差異方面。在某些情況下，這樣的技術(shù)可以利用先前發(fā)現(xiàn)的所述差異方面來(lái)研究從類似進(jìn)行的實(shí)驗(yàn)獲得的新數(shù)據(jù)，并且隨后精密地比較這些數(shù)據(jù)與之前已知的情況以進(jìn)行鑒定。根據(jù)本發(fā)明的一個(gè)方面，提供能夠自動(dòng)和/或重復(fù)進(jìn)行本文所述任意方法的計(jì)算機(jī)和/或自動(dòng)化的系統(tǒng)。如本文所用，"自動(dòng)化的"裝置是指能夠在無(wú)人指導(dǎo)下運(yùn)行的裝置，即自動(dòng)化的裝置可以在任何人結(jié)束采^l促進(jìn)功能的任何行動(dòng)(例如將指令輸入計(jì)算機(jī))之后的一段時(shí)間內(nèi)執(zhí)行該功能。通常地，自動(dòng)化的設(shè)備可以在該時(shí)間點(diǎn)之后執(zhí)行重復(fù)的功能。可利用計(jì)算機(jī)或其它自動(dòng)化系統(tǒng)的技術(shù)的一個(gè)特定的非限制性例子是在如通過(guò)確定來(lái)自系統(tǒng)的樣品中一種或更多物質(zhì)和分配體系的各種相互作用成分之間的相互作用的相對(duì)量度來(lái)確定該系統(tǒng)的生理狀態(tài)的過(guò)程中。在臨床環(huán)境下，這可以通過(guò)例如抽^Uk液樣品(微升量或非常少的樣品，例如一滴或更少)并且使血液樣品或其子樣品(例如血漿)經(jīng)歷多相分配過(guò)程來(lái)完成。然后可以將該過(guò)程的結(jié)果與類似系統(tǒng)中的標(biāo)志的類似行為進(jìn)行比較，該結(jié)果可以釆取電子存儲(chǔ)數(shù)據(jù)的形式。圖1是根據(jù)本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的實(shí)例系統(tǒng)的方框示意圖。在圖1示出的實(shí)施方案中，在常規(guī)的個(gè)人計(jì)算機(jī)250上配置控制器200，所述個(gè)人計(jì)算機(jī)250包括處理器251、存儲(chǔ)器252、輸入裝置253、任選的可移動(dòng)存儲(chǔ)裝置254、點(diǎn)擊裝置255、顯示器256和通信裝置257，它們?nèi)纪ㄟ^(guò)總線258連接在一起。通常，存儲(chǔ)器252可以包括多種存儲(chǔ)裝置，例如硬盤(pán)驅(qū)動(dòng)器或光盤(pán)驅(qū)動(dòng)器、RAM、ROM或其它存儲(chǔ)裝置及其組合，輸入裝置253可以包括鍵盤(pán)、麥克風(fēng)或能夠接收來(lái)自控制器200的使用者的一個(gè)或更多輸入210的任何其它形式的輸入裝置?？梢苿?dòng)存儲(chǔ)裝置254可以包括CD-ROM驅(qū)動(dòng)器、磁帶驅(qū)動(dòng)器、軟盤(pán)驅(qū)動(dòng)器等，并且可以用于上載應(yīng)用軟件，包括用于實(shí)施本文所述的本發(fā)明各實(shí)施方案的軟件。顯示器256可以包括常規(guī)的CRT顯示屏、平板顯示屏或允許將文本信息顯示給使用者的任何其它類型的顯示裝置。點(diǎn)擊裝置255可以包括手持游標(biāo)器、操縱桿、軌跡球、鼠標(biāo)或允許4吏用者選擇顯示器256上顯示的各種文本信息的任何其它類型的點(diǎn)擊裝置或滾動(dòng)裝置。通信裝置257可以包括能夠接收來(lái)自流體處理設(shè)備30的一個(gè)或更多輸出220并向流體處理設(shè)備30提供一個(gè)或更多輸出的任意形式的通信收發(fā)器。例如，通信裝置257可以包括RS232/485通信iMC器、4-20mA模擬M器、以太網(wǎng)M器等。包括實(shí)施本發(fā)明實(shí)施方案的代碼的軟件可以存儲(chǔ)在一些類型的可移動(dòng)存儲(chǔ)介質(zhì)中，例如CD-ROM、磁帶、或軟盤(pán)或適用于已配置的存儲(chǔ)器252和可移動(dòng)存儲(chǔ)裝置254的其它計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)?？梢詫④浖截惖接?jì)算機(jī)250上的永久形式的存儲(chǔ)介質(zhì)(例如硬盤(pán))上以保存可移動(dòng)存儲(chǔ)介質(zhì)用于備份。應(yīng)該理解，在使用中，軟件一般并且至少部分存儲(chǔ)在RAM中，并且在處理器251上執(zhí)行。本發(fā)明的各個(gè)實(shí)施方案還可以只在硬件內(nèi)實(shí)施或在軟件和硬件的組合中實(shí)施。例如，在一個(gè)實(shí)施方案中，使用可編程邏輯控制器(PLC)，而不是常規(guī)的個(gè)人計(jì)算機(jī)。如本領(lǐng)域技術(shù)人員公知的，PLC經(jīng)常用于不必耗費(fèi)通用計(jì)算機(jī)的多種過(guò)程控制應(yīng)用中。PLC可以以已知的方式配置用以執(zhí)行一個(gè)或多個(gè)控制程序，并且能夠以類似于個(gè)人計(jì)算機(jī)的方式接收來(lái)自使用者或另一裝置的輸入和/或^f吏用者或另一裝置提供輸出。因此，盡管依據(jù)通用計(jì)算機(jī)描述了本發(fā)明的實(shí)施方案，但是應(yīng)該理解，通用計(jì)算機(jī)的使用只是示例性的，也可以使用其它的配置。如圖1所示，控制器200被配置成連接至流體處理設(shè)備30以控制流體處理設(shè)備的運(yùn)行。控制器200包括輸入端210以接收來(lái)自控制器200的使用者的與待實(shí)施的期望操作相關(guān)的一個(gè)或多個(gè)M。控制器200還包括多個(gè)輸入220以接收與流體處理設(shè)備的運(yùn)行狀態(tài)相關(guān)的信號(hào)和多個(gè)輸出230、240以設(shè)置和控制所述流體處理設(shè)備。通過(guò)輸入210接收的使用者輸?shù)念愋秃土俊⒘黧w處理i殳備用于例如液-液分配所用的液體的k成等。本發(fā)明的一些實(shí)施方案允許使用者規(guī)定一個(gè)或許多與流體處理i殳備的運(yùn)行相關(guān)的輸入?yún)?shù)，然后，基于該輸入^lt來(lái)設(shè)置和控制流體處理設(shè)備。根據(jù)使用者所規(guī)定的輸入?yún)?shù)的數(shù)目，控制器可以在設(shè)置流體處理設(shè)備之前提示使用者額外的^lt?？刂破?00的輸入220被設(shè)置成接收與流體處理設(shè)備的運(yùn)行狀態(tài)相關(guān)的多個(gè)信號(hào)?？梢酝ㄟ^(guò)輸入220接收的信號(hào)一般對(duì)應(yīng)于流體處理設(shè)備中的物理?xiàng)l件，并且可以包括例如流體處理設(shè)備中蛋白質(zhì)或其它分子的濃度、接觸時(shí)間、沉降發(fā)生時(shí)間、攪拌程度、工作溫度或壓力等。控制器200的輸出230、240被設(shè)置成基于輸入210所接收的使用者M(jìn)和任選的通過(guò)輸入220接收的一個(gè)或更多信號(hào)來(lái)設(shè)置和控制流體處理設(shè)備。輸出230可以提供多種單獨(dú)的信號(hào)，例如將蛋白質(zhì)或其它分子引入液體中的信號(hào)、控制工作溫度的信號(hào)等。才艮據(jù)本發(fā)明的另一實(shí)施方案，控制器200可以包括處理器251可以存取的數(shù)據(jù)庫(kù)和/或知識(shí)庫(kù)。根據(jù)本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案，數(shù)據(jù)庫(kù)可以包括多個(gè)記錄，每個(gè)記錄對(duì)應(yīng)于一組可供流體處理設(shè)備用于確定相互作用的相對(duì)量度的特定參數(shù)。除非另有特定說(shuō)明，下文所用的術(shù)語(yǔ)"參數(shù)"指的是過(guò)程參數(shù)(例如待添加的蛋白質(zhì)或其它生物分子的量、工作溫度等)以及指定一組特定過(guò)程參數(shù)的實(shí)驗(yàn)的特性(例如，濃度、分離時(shí)間等)。一般地，存儲(chǔ)在數(shù)據(jù)庫(kù)中的每個(gè)記錄反映基于在限定條件下使用流體處理設(shè)備或者在限定條件下使用類似的流體處理設(shè)備的經(jīng)驗(yàn)數(shù)據(jù)。因此，可以將控制器200和lt據(jù)庫(kù)視為形成"專家"系統(tǒng)?？梢詫?shù)據(jù)庫(kù)存儲(chǔ)在可移動(dòng)存儲(chǔ)介質(zhì)上并且拷貝到存儲(chǔ)器252中供處理器251使用，或者可以將控制器預(yù)先配置為包括數(shù)據(jù)庫(kù)。在一些情況下，可以將數(shù)據(jù)庫(kù)(或知識(shí)庫(kù))i殳置為用于特定類型的流體處理設(shè)備(例如來(lái)自流體處理設(shè)備特定生產(chǎn)商的特定型號(hào))，或者可以將其設(shè)置為與多種類型的流體處理設(shè)備一起使用。在一些情況下，可以將數(shù)據(jù)庫(kù)設(shè)置為用于特定類型的蛋白質(zhì)和/或其它生物分子?；蛘撸梢?吏用多種不同的流體處理設(shè)備都可以使用的包括多種不同的蛋白質(zhì)、生物分子、水溶液等的更為通用的數(shù)據(jù)庫(kù)。在4吏用中，由控制器200執(zhí)行的流體處理設(shè)備的設(shè)置和控制程序可以訪問(wèn)該數(shù)據(jù)庫(kù)，從而設(shè)置和控制與控制器200有效相連的流體處理設(shè)備30。應(yīng)該理解，雖然數(shù)據(jù)庫(kù)或知識(shí)庫(kù)起初是基于利用類似設(shè)備獲得的經(jīng)驗(yàn)數(shù)據(jù)，但是可以對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行周期性更新(例如可以添加新紀(jì)錄和/或可以修改現(xiàn)有記錄)來(lái)反映使用中或通過(guò)使用類似設(shè)備所獲得的額外數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)庫(kù)的另一方面涉及存儲(chǔ)和檢索與來(lái)自分析儀器的原始或加工數(shù)據(jù)相關(guān)的模式信息的能力。這些數(shù)據(jù)可以包括值序列、分類信息、數(shù)學(xué)系數(shù)和可用于發(fā)現(xiàn)和使用用于本文所述應(yīng)用的這些模式的特定方法和特定樣品的其它信息。本文所述的技術(shù)和設(shè)備可用于發(fā)現(xiàn)標(biāo)志或執(zhí)行診斷試驗(yàn)?？梢詫⒃撛O(shè)備通過(guò)接口連接到本領(lǐng)域技術(shù)人員公知的其它裝置和儀器上，包括自動(dòng)樣品制備仗、液相色譜柱、HPLC系統(tǒng)、質(zhì)鐠儀、吸光度儀等。可以將從這些裝置和儀器獲得的數(shù)據(jù)電子傳送到用于進(jìn)行數(shù)據(jù)簡(jiǎn)化和分析以及用于詳細(xì)診斷的軟件。以下實(shí)施例舉例說(shuō)明了從不同實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)獲得的用于診斷應(yīng)用的數(shù)據(jù)分析。這些實(shí)施例意圖舉例說(shuō)明本發(fā)明的某些實(shí)施方案，而不是例舉本發(fā)明的全部范圍。實(shí)施例1:使用2D-HPLC數(shù)據(jù)來(lái)發(fā)現(xiàn)洗脫曲線中的模式，當(dāng)與它們的診斷一起考慮時(shí)，所i^式可以提供確定未知樣品中的后者的手段。提供該實(shí)施例來(lái)舉例說(shuō)明本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案用于診斷目的的用途，并且描述本發(fā)明提供的一種技術(shù)和用于分析醫(yī)學(xué)病癥的方法，但是無(wú)意于提供用于分析特定醫(yī)學(xué)病癥的特定標(biāo)志或鑒定物。從健康^^(對(duì)照物)和患有創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙(PTSD)的患者抽取含有4.5mL的血液樣品。將該血液樣品收集到含有0.5mL3.2%檸檬酸鈉的玻璃BDVacutainer試管中，并且在8。C下以1000rpm離心45分鐘。小心的移除血漿、分成等份并在-80'C下冷凍。解凍樣品，并將其分配到含水聚(乙二醇)-硫酸鈉-磷酸鈉/鉀緩沖液(pH7.4)的兩相體系中。這些實(shí)驗(yàn)中使用的含水兩相體系包含15.70wt。/。的聚乙二醇-600(分子量為約600)、9.47wt。/o的硫酸鈉和2.30wtY。磷酸鈉/鉀緩沖液(pH為7.4)。通過(guò)在100x75mm的試管中混合合適重量的貯備聚合物(stockpolymer)、鹽和緩沖溶液直至體系總重為4.00g來(lái)制備該體系。每個(gè)體系的兩相的體積比(上部相體積比下部相體積)為約1:1。將固定量的600微升血漿加入體系中。激烈振搖該體系并在具有桶式轉(zhuǎn)子的離心機(jī)中以約3500rpm離心30分鐘以加速相沉降。從離心機(jī)中取出試管，并且從上部相和下部相中抽取樣品。從上部相抽取含有約0.3ml的等分試樣，從下部相中抽取含有1.7ml的等分試樣，并且利用起始緩沖液(Beckman-Coulter,Fullerton,CA，USA)將每個(gè)等分試樣稀釋到2.50mL的總體積。使每個(gè)樣品旋轉(zhuǎn)并按如下步驟利用PD-10柱(AmershamPharmaciaBiotech)4吏其進(jìn)行緩沖液交換。利用25mL起始緩沖液來(lái)平衡PD-10柱。M個(gè)樣品(2.5mLPD-10柱中，用起始緩沖液洗滌柱，并且收集初始的2.5mL級(jí)分。j吏用Beckman-Coulter(Fullerton,CA)的ProteomeLabPF2D系統(tǒng)用于2D-HPLC分析。在上述程序之后，注入2.00mL樣品，利用標(biāo)準(zhǔn)程序以0.2mL/min的流量進(jìn)行第一維分離，并且監(jiān)測(cè)280nm處的柱流出物的吸光度。在從8.0pH到4.0pH的pH梯度運(yùn)行部分中，在利用控制級(jí)分收集器的？11檢測(cè)器檢測(cè)下收集每0.3卞11間隔的級(jí)分。利用生產(chǎn)商提供的標(biāo)準(zhǔn)程序通過(guò)反相HPLC(RP-HPLC)對(duì)每次收集的級(jí)分進(jìn)行第二維分離。在50'C下以0.75mL/min的流量進(jìn)行使用200微升體積的每種注入級(jí)分的RP-HPLC實(shí)驗(yàn)，并且在214nm處監(jiān)測(cè)柱洗出物的吸光度。將從上部相和下部相獲得的樣品的對(duì)應(yīng)血漿級(jí)分(在相同pH間隔下收集的)在第二維RP-HPLC下獲得的色鐠圖以數(shù)字化形式存儲(chǔ)在系統(tǒng)計(jì)算機(jī)中。在固定的pH間隔下的第二維分離之后，比較來(lái)自健康供體和PTSD患者的樣品的色譜圖。在每種情況下，通過(guò)將從每個(gè)樣品的上部和下部獲得的數(shù)據(jù)相除來(lái)建立逐點(diǎn)分配系數(shù)的比較鐠(在本文中，為比較色鐠)。用于移位、平滑、裁剪或變換任意數(shù)據(jù)模式的額外數(shù)學(xué)運(yùn)算是完全任意的，只要以相同方式對(duì)每個(gè)樣品進(jìn)行運(yùn)算即可。圖3示出源自健康供體(對(duì)照物)的比較鐠，圖4中示出源自PTSD患者的對(duì)應(yīng)比較鐠，兩者均從pH為6.0~6.4的級(jí)分獲得。這兩個(gè)比較鐠在視覺(jué)上是不同的。利用學(xué)技術(shù)，從而將未知診斷的附加樣品分類為類似于本文所分析的樣品中的任意一種?？梢允褂眠@樣的技術(shù)來(lái)利用這樣的比較(或者更通常地，結(jié)合其它數(shù)據(jù)和信息)實(shí)現(xiàn)診斷。應(yīng)該注意，在一些應(yīng)用中，將通過(guò)本領(lǐng)域技術(shù)人員公知的技術(shù)來(lái)處理和組合屬于陰性和陽(yáng)性診斷狀態(tài)的許多樣品，以限定在靈敏度和特異性水平方面在統(tǒng)計(jì)學(xué)上有效的診斷工具。實(shí)施例2.質(zhì)鐠模式可用于分析從健康對(duì)象和卵巢癌患者獲得的血清樣品。提供該實(shí)施例以舉例說(shuō)明本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案用于診斷目的的用途，并且描述本發(fā)明提供的一種技術(shù)和用于分析醫(yī)學(xué)病癥的方法，但是無(wú)意于提供用于特定醫(yī)學(xué)病癥的特定標(biāo)志或鑒定物。來(lái)自健康對(duì)象(樣品號(hào)0651)和卵巢癌患者(樣品號(hào)4580)的合并血清樣品是從臨床蛋白質(zhì)組學(xué)參考實(shí)驗(yàn)室(ClinicalProteomicsReferenceLaboratory,Gai仇ersburgh，MD)獲得的。這些實(shí)驗(yàn)中使用的含水兩相體系含有15.70wt。/。的聚乙二醇-600(分子量為約600)、9.5wt。/o的硫酸鈉、4.8wt。/o的NaCl和0.64wt。/o磷酸鈉/鉀緩沖液(pH7.4)。通站微管中混合合適用量的貯備聚合物、鹽和緩沖溶液直至每個(gè)體系總重為0.425g來(lái)制備幾個(gè)這樣的體系。每個(gè)體系的兩相的體積比(上部相體積比下部相體積)為約l:l。將固定量的75微升血漿加入體系中。激烈振搖該體系并在具有桶式轉(zhuǎn)子的離心機(jī)中以約3500rpm離心30分鐘以加速相沉降。從離心機(jī)取出微管，并且從上部相和下部相中抽取樣品。從上部相抽取60微升的等分試樣，從下部相中抽取60微升的等分試樣，并且分配到分開(kāi)的微管中，然后向每個(gè)微管中加入240微升的水。將等分試樣送到臨床蛋白質(zhì)組學(xué)參考實(shí)驗(yàn)室，利用表面增強(qiáng)激光解吸附電離質(zhì)鐠儀(SurfaceEnhancedLaserDesorptionIonizationmassspectrometer,Ciphergen，F(xiàn)remont,CA)并才艮據(jù)以下程序進(jìn)^ff質(zhì)^普分才斤(1)兩次用磷酸緩沖液處理Q10芯片(Ciphergen)5分鐘；(2)#^個(gè)等分試樣加入芯片的每個(gè)孔中，并在室溫下孵育60分鐘；(3)用150微升磷酸緩沖液利用IO個(gè)混合周期將芯片洗滌三次，然后用水洗滌芯片一次；(4)空氣干燥芯片IO分鐘；(5)向芯片加入在50%乙腈/水(含有0.5%TFA)中的1微升SPA基質(zhì)，然后空氣干燥芯片15分鐘；(6)重復(fù)步驟(5)。然后將芯片放到質(zhì)鐠儀中。對(duì)每個(gè)樣品重復(fù)上述程序一次(總共重復(fù)2次)。將每個(gè)樣品的原始鐠強(qiáng)度數(shù)據(jù)和總離子流送回ANALIZA公司(Cleveland,Ohio)用于進(jìn)一步分析。將具有成對(duì)的質(zhì)荷比(m/z)和強(qiáng)度值的每個(gè)鐠數(shù)據(jù)向量相對(duì)于其總離子流進(jìn)行歸一化，然后與對(duì)應(yīng)于相同樣品的第二次重復(fù)的第二向量計(jì)算平均值。在逐點(diǎn)m/z基礎(chǔ)上將對(duì)應(yīng)于相同樣品的上部和下部的7jC相的平均譜數(shù)據(jù)向量相除，從而得到相互作用相對(duì)于m/z的相對(duì)量度的數(shù)據(jù)向量K。對(duì)健康和癌癥合并樣品重復(fù)該程序。圖5示出兩個(gè)樣品的鐠K向量相對(duì)于選定m/z值范圍的比較。一定m/z范圍內(nèi)的癌癥和正常合并樣品之間的一致差異可以表示用于早期篩選和/或其它診斷應(yīng)用的潛在標(biāo)志。可以從這樣的數(shù)據(jù)t艮出相互作用相對(duì)量度相對(duì)于m/z的模式，并且隨后利用本領(lǐng)域公知的技術(shù)用于診斷應(yīng)用。利用質(zhì)譜和其它技術(shù)還可以鑒定特異性生物標(biāo)志，然后用于開(kāi)發(fā)利用免疫測(cè)試和本領(lǐng)域公知的其它技術(shù)來(lái)測(cè)量生物標(biāo)志特異性的相互作用相對(duì)量度的直接分析。利用本發(fā)明所述技術(shù)開(kāi)發(fā)的生物標(biāo)志還可以用于區(qū)分早期和晚期卵巢癌，如圖6所示。所用的實(shí)g序與實(shí)施例2中所述的程序相同。兩個(gè)正常樣品包含不同的合并物，并且表現(xiàn)出一定的變異性。然而，兩個(gè)正常樣品之間的變異性明顯低于早期和晚期癌癥樣品之間的變異性?？梢葬槍?duì)不同應(yīng)用開(kāi)發(fā)本發(fā)明所述的生物標(biāo)志的其它用途。實(shí)施例3.利用本發(fā)明發(fā)現(xiàn)的質(zhì)鐠模式可具有超過(guò)基于表達(dá)的諳的某些優(yōu)點(diǎn)。提供該實(shí)施例以舉例說(shuō)明本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案用于診斷目的的用途，并且描述本發(fā)明提供的一種技術(shù)和用于分析醫(yī)學(xué)病癥的方法，但是無(wú)意于提供用于特定醫(yī)學(xué)病癥的特定標(biāo)志或鑒定物。該實(shí)施例進(jìn)一步舉例說(shuō)明利用本發(fā)明技術(shù)發(fā)現(xiàn)的生物標(biāo)志超過(guò)利用常規(guī)的蛋白質(zhì)表達(dá)蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)所發(fā)現(xiàn)的生物標(biāo)志的某些優(yōu)點(diǎn)。本實(shí)施例中所用的實(shí)驗(yàn)技術(shù)在實(shí)施例2中得到充分描述，除了使用具有不同組成的含水兩相體系以夕卜。含水兩相體系包含18.0wt%Ficoll-70(分子量為約70000)、13.0wty。葡聚糖-75(分子量為約75000)、0.15MNaCl和O.OlM磷酸鈉/鉀緩沖液(pH為7.4)。從本文中針對(duì)總蛋白質(zhì)表達(dá)所述的相互作用相對(duì)量度的數(shù)據(jù)計(jì)算歸一化差異，定義為100(正常值-癌癥值)/正常值。圖7中的數(shù)據(jù)示出，正常和癌癥之間的相互作用相對(duì)量度的歸一化差異遠(yuǎn)比在相同的m/z處利用蛋白質(zhì)表達(dá)獲得的那些更為顯著。這種觀察在實(shí)踐上是重要的，因?yàn)楣J(rèn)的是與潛在疾病過(guò)程不相關(guān)的表達(dá)天然變異性是開(kāi)發(fā)和臨床使用表達(dá)水平生物標(biāo)志(包括其m/z模式)的主要障礙。在實(shí)踐中，50%的表達(dá)水平差異有時(shí)也完全在天然變異性范圍內(nèi)，表達(dá)模式如圖7所示。在利用相互作用的相對(duì)量度和其m/z模式來(lái)分析時(shí)，相同的樣品在正常和癌癥樣品之間產(chǎn)生了明顯更為顯著的差異，其可用于通過(guò)其與本文所示模式的相似性來(lái)描述未知樣品的臨床來(lái)源。雖然本文已經(jīng)描述并舉例說(shuō)明了本發(fā)明的幾個(gè)實(shí)施方案，但是本領(lǐng)域普通技術(shù)人員將會(huì)容易地設(shè)想用于執(zhí)行功能和/或獲得本發(fā)明所述的結(jié)果和/或一個(gè)或更多優(yōu)點(diǎn)的多種其它裝置和/或結(jié)構(gòu)，并且這些變化和/或修改中的每一種都視為在本發(fā)明的范圍內(nèi)。更一般地，本領(lǐng)域沖支術(shù)人員將容易理解，本文所述的4^M、尺寸、材料和構(gòu)造是示意性的，實(shí)際的參數(shù)、尺寸、材料和/或構(gòu)造將取決于使用本發(fā)明教導(dǎo)的特定的一個(gè)或更多應(yīng)用。本領(lǐng)域的技術(shù)人員將認(rèn)識(shí)到或者能夠確定，僅利用常規(guī)試驗(yàn)可得到本文所述的本發(fā)明的特定實(shí)施方案的許多等同方案。因此，應(yīng)當(dāng)理解，只是以舉例的方式提出前述實(shí)施方案，在所附權(quán)利要求和其等效物的范圍內(nèi)，可以以除特殊規(guī)定和要求之Jt的方式來(lái)實(shí)施本發(fā)明。本發(fā)明涉及本文所述的每個(gè)單獨(dú)的特征、系統(tǒng)、制品、材料、試劑盒和/或方法。此外，兩個(gè)或更多特征、系統(tǒng)、制品、材料、試劑盒和/或方法(如果這些特征、系統(tǒng)、制品、材料、試劑盒和/或方法不相互矛盾)也包括在本發(fā)明的范圍內(nèi)。本文所使用和定義的全部定義應(yīng)該理解為相對(duì)于字典定義、通過(guò)引用并入的文獻(xiàn)中的定義和/或所定義術(shù)語(yǔ)的常用含義的對(duì)照物。本文的說(shuō)明書(shū)和權(quán)利要求中使用的術(shù)語(yǔ)"和/或"應(yīng)該理解為指如此聯(lián)合的要素的"其中之一或兩者，，，即在一些情況下聯(lián)合存在而其它情況下分開(kāi)存在的要素。用"和/或"列出的多個(gè)要素應(yīng)該以同樣的方式來(lái)理解，即如此聯(lián)合的要素的"一個(gè)或更多個(gè)"。除了"和/或"術(shù)語(yǔ)特別指出的要素之外的其它要素可以任選存在，無(wú)論是否與具體指出的那些要素相關(guān)或不相關(guān)。因此，作為非限制性例子，在與開(kāi)放式表述如"包括，，聯(lián)^H"吏用的"A和/或B"可以在一個(gè)實(shí)施方案中指僅有A(任選包括除B之外的要素)；在另一實(shí)施方案中指僅有B(任選包括除A之外的要素)；在又一實(shí)施方案中指A和B(任選包括其它要素)；等等。在說(shuō)明書(shū)和權(quán)利要求中使用的"或，，應(yīng)該理解為具有與上述定義的"和/或"相同的意思。例如，在在列表中分列項(xiàng)目時(shí)，"或"或"和/或，，應(yīng)該解釋為總括性的，即包括許多要素或要素列表中的至少一個(gè)，但是也包括多于一個(gè)，并且任選地包括其它未列出的項(xiàng)目。與此相反，其它清楚指出的項(xiàng)目如"僅有其一，，或"恰好其一"或在權(quán)利要求中使用的"由…構(gòu)成"會(huì)指包括許多要素或要素列表中的',一個(gè)要素。一般地，當(dāng)前面有排它性術(shù)語(yǔ)如"兩者之一"、"其一"、"僅有其一"或"',其一"時(shí)，本文使用的術(shù)語(yǔ)"或"應(yīng)該理解為表示排它的供選方案(即"一個(gè)或另一，但非兩者")。在權(quán)利要求中使用的"基本由...構(gòu)成"應(yīng)該具有如在專利法領(lǐng)域內(nèi)所用一樣的常用含義。在說(shuō)明書(shū)和權(quán)利要求書(shū)中在引用一個(gè)或更多要素的列表時(shí)使用的術(shù)語(yǔ)"至少一個(gè)，，應(yīng)該理解為指選自要素列表中任意一個(gè)或更多個(gè)要素中的至少一個(gè)要素，但是不一定包括要素列表內(nèi)具體列出的各個(gè)和每個(gè)要素中的至少一個(gè)，并且不排除要素列表中的要素的任意組合。該定義也允許除術(shù)語(yǔ)"至少一個(gè)"所指要素列表中具體指出的要素之外的要素任選存在，無(wú)論是否與具體指出的這些要素相關(guān)或不相關(guān)。因此，作為非限制性例子，"A和B中的至少一個(gè)，，(或等效的"A或B中的至少一個(gè)"，或等效的"A和/或B中的至少一個(gè)")可以在一個(gè)實(shí)施方案中指至少一個(gè)、任選包括多于一個(gè)A,不存在B(和任選包括除B之外的要素)；在另一個(gè)實(shí)施方案中指至少一個(gè)、任選包括多于一個(gè)B,不存在A(和任選包括除A之外的要素)；在又一實(shí)施方案中指至少一個(gè)、任選包括多于一個(gè)A,和至少一個(gè)、任選包括多于一個(gè)B(和任選包括其它要素)；等等。還應(yīng)該理解，除非另有相反的清楚規(guī)定，在本文所要求保護(hù)的包括多于一個(gè)步驟或動(dòng)作的任何方法中，該方法的步驟或動(dòng)作的順序不一定限于所列舉的方法的步驟或動(dòng)作中的順序。在權(quán)利要求以及上述說(shuō)明書(shū)中，全部過(guò)渡術(shù)語(yǔ)如"包含"、"攜帶'，、"具有"、"含有"、"涉及"、"容納"、"包括"等應(yīng)理解為開(kāi)放式的，即意思是包括但不限于。只有過(guò)渡術(shù)語(yǔ)"由…構(gòu)成"和"基本由…構(gòu)成"才分別為封閉或半封閉式過(guò)渡短語(yǔ)，如美國(guó)專利局審查指南2111.03部分所指出的那才羊。權(quán)利要求1.一種確定多種物質(zhì)的至少一個(gè)特征的方法，包括使多種物質(zhì)接觸包括至少第一和第二相的含水分配體系；利用質(zhì)譜法獲得第一譜數(shù)據(jù)模式，所述第一譜數(shù)據(jù)模式包括來(lái)自與所述含水分配體系的所述第一相相關(guān)的一種或更多種物質(zhì)之第一樣品的累積譜信息；利用質(zhì)譜法從以下一個(gè)或多個(gè)中獲得第二譜數(shù)據(jù)模式(1)與所述含水分配體系的所述第二相相關(guān)的一種或更多種物質(zhì)之第二樣品或(2)所述接觸步驟之前所述多種物質(zhì)的一部分；以及比較所述第一譜數(shù)據(jù)模式的至少一部分和所述第二譜數(shù)據(jù)模式的至少一部分，以確定多種物質(zhì)的至少一個(gè)特征。2.如權(quán)利要求l所述的方法，包括在將至少一種所述物質(zhì)接觸所述含水分配體系之后，在不確定所述多種物質(zhì)中的所述至少一種物質(zhì)的身份的情況下實(shí)施所述方法。3.如權(quán)利要求l所述的方法，包括在將所述多種物質(zhì)接觸所述含水分配體系之后，在不確定所述多種物質(zhì)中任意物質(zhì)的水平、豐度、濃度和/或特性的情況下實(shí)施所述方法。4.如權(quán)利要求l所述的方法，包括在將所述多種物質(zhì)接觸所述含水分配體系之后，在不使用與所述多種物質(zhì)中任意物質(zhì)的水平、豐度、濃度和/或特性相關(guān)的信息的情況下實(shí)施所述方法。5.如權(quán)利要求l所述的方法，包括在將所述至少一種物質(zhì)接觸所述含水分配體系之前，在不確定所述多種物質(zhì)中的至少一種所述物質(zhì)的特性的情況下實(shí)施所述方法。6.如權(quán)利要求l所述的方法，包括在將所述多種物質(zhì)接觸所述含水分配體系之前，在不確定所述多種物質(zhì)中任意物質(zhì)的水平、豐度、濃度和/或特性的情況下實(shí)施所述方法。7.如權(quán)利要求l所述的方法，包括在接觸所述含水分配體系之前，在不使用與所述多種物質(zhì)中任意物質(zhì)的水平、豐度、濃度和/或特性相關(guān)的信息的情況下實(shí)施所述方法。8.如權(quán)利要求l所述的方法，包括在將所述至少一種物質(zhì)接觸所述含水分配體系之前或之后，在不確定所述多種物質(zhì)中至少一種所述物質(zhì)的特性的情況下實(shí)施所述方法。9.如權(quán)利要求l所述的方法，包括在將所述多種物質(zhì)接觸所述含水分配體系之前或之后，在不確定所述多種物質(zhì)中任意物質(zhì)的水平、豐度、濃度和/或特性的情況下實(shí)施所述方法。10.如權(quán)利要求l所述的方法，包括在將所述多種物質(zhì)接觸所述含水分配體系之前或之后，在不使用與所述多種物質(zhì)中任意物質(zhì)的水平、豐度、濃度和/或特性相關(guān)的信息的情況下實(shí)施所述方法。11.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述含水多相分配體系包含至少三相。12.如權(quán)利要求l所述的方法，包括比較所述第一鐠數(shù)據(jù)模式和所述第二譜數(shù)據(jù)模式以限定比較模式；和比較所述比較模式和參考模式，以確定所述至少一種特征。13.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述比較步驟包括通過(guò)逐點(diǎn)比較所述至少兩個(gè)數(shù)據(jù)模式，來(lái)比較所述第一鐠數(shù)據(jù)模式的至少一部分和所述第二鐠數(shù)據(jù)模式的至少一部分。14.如權(quán)利要求l所述的方法，其中在將所述多種物質(zhì)接觸所述含水分配體系的步驟之前，首先對(duì)所述多種物質(zhì)進(jìn)行分級(jí)。15.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述多種物質(zhì)來(lái)自患者。16.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述第二數(shù)據(jù)模式為對(duì)照。17.如權(quán)利要求16所述的方法，其中在獲得所述第一鐠數(shù)據(jù)模式的步驟之前，將所述第二數(shù)據(jù)模式以電子方式存儲(chǔ)一段時(shí)間。18.如權(quán)利要求l所述的方法，其中在不確定所述多種物質(zhì)中物質(zhì)在所述第一和第二相之間的分配系數(shù)的情況下比較所述第一和第二數(shù)據(jù)模式。19.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述多種物質(zhì)包括具有不同化學(xué)組成的多種物質(zhì)。20.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述多種物質(zhì)包括具有相同化學(xué)組成的多種物質(zhì)。21.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述多種物質(zhì)基于結(jié)構(gòu)差異而分配在所述第一和第二相之間。22.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述比較步驟包括比較所述第一譜數(shù)據(jù)模式的至少一部分和所述第二譜數(shù)據(jù)模式的至少一部分以確定生物體系的狀態(tài)。23.如權(quán)利要求22所述的方法，其中所述狀態(tài)是生理狀態(tài)。24.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述第二數(shù)據(jù)模式代表指示生物體的未知狀態(tài)的樣品，并且所述第二數(shù)據(jù)模式得自指示所述生物體的正常和非正常狀態(tài)的樣品。25.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述第一樣品和所述第二樣品同時(shí)從生物體獲得。26.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述第一樣品和所述第二樣品在不同的時(shí)間從生物體獲得。27.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述第一樣品和所述第二樣品從同一個(gè)生物有機(jī)體獲得。28.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述第一樣品和所述第二樣品從具有生理狀態(tài)的相同個(gè)體獲得。29.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述第一樣品和所述第二樣品從具有生理狀態(tài)的不同個(gè)體獲得。30.如權(quán)利要求l所述的方法，其中在不確定所述多種物質(zhì)中任意物質(zhì)的化學(xué)或生物學(xué)特性的情況下實(shí)施所述方法。31.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述含水分配體系的至少一相是含水的。32.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述含水分配體系的每一相都是含水的。33.如權(quán)利要求l所述的方法，其中至少一個(gè)相包含聚合物。34.如權(quán)利要求l所述的方法，其中至少一個(gè)相包含鹽。35.如權(quán)利要求l所述的方法，其中至少一個(gè)相包含表面活性劑。36.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述多種物質(zhì)中至少一種物質(zhì)是生物分子。37.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述多種物質(zhì)中至少一種物質(zhì)是蛋白質(zhì)。38.如權(quán)利要求l所述的方法，其中所述多種物質(zhì)中至少一種物質(zhì)是用于醫(yī)學(xué)病癥的疑似標(biāo)志。39.—種確定多種物質(zhì)的至少一個(gè)特征的方法，包括使多種物質(zhì)接觸至少第一和第二相互作用成分以至少部分分離所述多種物質(zhì)；利用質(zhì)譜法處理所述至少部分分離的多種物質(zhì)的第一樣品以產(chǎn)生第一鐠數(shù)據(jù)模式；利用質(zhì)譜法處理以下的一個(gè)或多個(gè)以產(chǎn)生第二譜數(shù)據(jù)模式(1)與所述第一樣品不同的所述至少部分分離的多種物質(zhì)的第二樣品，或(2)所述接觸步驟之前所述多種物質(zhì)的一部分；以及比較所述第一鐠數(shù)據(jù)模式的至少一部分和所述第二諉數(shù)據(jù)模式的至少一部分，以確定多種物質(zhì)的至少一個(gè)特征。40.如權(quán)利要求39所述的方法，包括在所述至少一種物質(zhì)接觸所述至少第一和第二相互作用成分之前或之后沒(méi)有確定所述多種物質(zhì)中至少一種所述物質(zhì)的特性的情況下實(shí)施所述方法。41.如權(quán)利要求39所述的方法，包括在所述多種物質(zhì)接觸所述至少第一和第二相互作用成分之前或之后沒(méi)有確定所述多種物質(zhì)中任意物質(zhì)的水平、豐度、濃度和/或特性的情況下實(shí)施所述方法。42.如權(quán)利要求39所述的方法，包括在所述多種物質(zhì)接觸所述至少第一和第二相互作用成分之前或之后沒(méi)有使用與所述多種物質(zhì)中任意物質(zhì)的水平、豐度、濃度和/或特性相關(guān)的信息的情況下實(shí)施所述方法。43.如權(quán)利要求39所述的方法，包括比較所述第一鐠數(shù)據(jù)模式和所述第二鐠數(shù)據(jù)模式，以確定比較模式；和比較所述比較模式和參考模式，以確定所述至少一種特征。44.如權(quán)利要求39所述的方法，其中所述比較步驟包括通過(guò)逐點(diǎn)比較所述至少兩個(gè)數(shù)據(jù)模式來(lái)比較所述第一i普數(shù)據(jù)模式的至少一部分和所述第二譜數(shù)據(jù)模式的至少一部分。45.如權(quán)利要求39所述的方法，其中所述第一相互作用成分不可混溶在所述第二相互作用成分中。46.如權(quán)利要求39所述的方法，其中所述第一相互作用成分是液體，所述第二相互作用成分是液體。47.如權(quán)利要求39所述的方法，其中所述第一相互作用成分是液體，所述第二相互作用成分是固體。48.如權(quán)利要求39所述的方法，其中所述第一和第二相互作用成分限定色鐠系統(tǒng)的成分。49.一種確定多種物質(zhì)的至少一個(gè)特征的方法，包括使多種物質(zhì)接觸包括至少第一和第二相的含水分配體系；獲得第一數(shù)據(jù)模式，所述第一數(shù)據(jù)模式包括來(lái)自與所述含水分配體系的所述第一相相關(guān)的一種或更多種物質(zhì)之第一樣品的累積信息；通過(guò)處理以下的一個(gè)或更多個(gè)來(lái)獲得包含累積信息的第二數(shù)據(jù)模式(1)與所述含水分配體系的所述第二相相關(guān)的一種或更多種物質(zhì)之第二樣品，或(2)所述接觸步驟之前所述多種物質(zhì)的一部分；以及比較所述第一數(shù)據(jù)模式的至少一部分和所述第二數(shù)據(jù)模式的至少一部分，以確定多種物質(zhì)的至少一個(gè)特征。50.如權(quán)利要求49所述的方法，其中獲得第一數(shù)據(jù)模式的所述步驟包括數(shù)學(xué)處理與所述第一樣品相關(guān)的數(shù)據(jù)以獲得所述第一數(shù)據(jù)模式。51.如權(quán)利要求49所述的方法，其中比較所述第一數(shù)據(jù)模式的至少一部分和所述第二數(shù)據(jù)模式的至少一部分的所述步驟包括數(shù)學(xué)處理與所述第一和第二樣品相關(guān)的數(shù)據(jù)。52.如權(quán)利要求49所述的方法，其中在確定所述至少一種特征之前數(shù)學(xué)處理所述第一數(shù)據(jù)模式和所述第二數(shù)據(jù)模式中的至少其一。53.如權(quán)利要求49所述的方法，其中獲得所述第一數(shù)據(jù)模式的所述步驟利用質(zhì)譜處理所述第一樣品。54.如權(quán)利要求49所述的方法，其中獲得所述第二數(shù)據(jù)模式的所述步驟利用質(zhì)譜處理所述第一樣品。55.如權(quán)利要求49所述的方法，其中獲得所述第一數(shù)據(jù)模式的所述步驟利用色鐠處理所述第一樣品。56.權(quán)利要求49所述的方法，其中獲得所述第二數(shù)據(jù)模式的所述步驟利用色鐠處理所述第一樣品。57.—種確定多種物質(zhì)的至少一個(gè)特征的方法，包括使多種物質(zhì)接觸包括至少兩相的第一體系中分別限定至少第一相和第二相的至少第一和第二相互作用成分；獲得第一譜數(shù)據(jù)模式，所述第一譜數(shù)據(jù)模式包括來(lái)自與接觸后所述體系的所述第一相相關(guān)的多種物質(zhì)的累積i普信息；獲得第二鐠數(shù)據(jù)模式，所述第二語(yǔ)數(shù)據(jù)模式包括來(lái)自與接觸后所述體系的所述第二相相關(guān)的多種物質(zhì)的累積i普信息；和/或來(lái)自接觸所述體系之前的多種物質(zhì)的累積鐠信息，和從所述第一鐠數(shù)據(jù)模式的至少一部分和所述第二譜數(shù)據(jù)模式的至少一部分的比較中獲得比較i普信息，從而確定多種物質(zhì)的特征。58.如權(quán)利要求57所述的方法，包括在將所述物質(zhì)接觸所述體系之后沒(méi)有確定所述第一或第二相中所述多種物質(zhì)中至少一種所述物質(zhì)的特性的情況下實(shí)施所述方法。59.如權(quán)利要求57所述的方法，包括在將所述物質(zhì)接觸所述體系之后，在不確定所述第一或第二相中所述多種物質(zhì)中任意物質(zhì)的水平、豐度、濃度和/或特性的情況下實(shí)施所述方法。60.如權(quán)利要求57所述的方法，包括在將所述物質(zhì)接觸用于確定所述多種物質(zhì)的特性的所述體系之后，在不使用與所述第一或第二相中所述多種物質(zhì)中的任意物質(zhì)的水平、豐度、濃度和/或特性相關(guān)的信息的情況下實(shí)施所述方法。61.如權(quán)利要求57所述的方法，包括在將所述物質(zhì)接觸所述體系之前，在不確定所述多種物質(zhì)中至少一種所述物質(zhì)的特性的情況下實(shí)施所述方法。62.如權(quán)利要求57所述的方法，包括在將所述物質(zhì)接觸所述體系之前，在不確定所述多種物質(zhì)中的任意物質(zhì)的水平、豐度、濃度或特性的情況下實(shí)施所述方法。63.如權(quán)利要求57所述的方法，包括在將所述物質(zhì)接觸用于確定所述多種物質(zhì)的特征的所述體系之前，在不使用與所述第一或第二相中所述多種物質(zhì)中的任意物質(zhì)的水平、豐度、濃度或特性相關(guān)的信息的情況下實(shí)施所述方法。64.如權(quán)利要求57所述的方法，包括在將所述物質(zhì)接觸所述體系之前或之后，在不確定所述多種物質(zhì)中至少一種所述物質(zhì)的特性的情況下實(shí)施所述方法。65.如權(quán)利要求57所述的方法，包括在將所述物質(zhì)接觸所述體系之前或之后，在不確定所述多種物質(zhì)中的任意物質(zhì)的水平、豐度、濃度或特性的情況下實(shí)施所述方法。66.如權(quán)利要求57所述的方法，包括在將所述物質(zhì)暴露于用于確定所述多種物質(zhì)的特征的所述體系之前或之后，在不使用與所述第一或第二相中所述多種物質(zhì)中任意物質(zhì)的水平、豐度、濃度或特性相關(guān)的信息的情況下實(shí)施所述方法。67.如權(quán)利要求57所述的方法，其中使所述多種物質(zhì)接觸所述第一體系包括將所述多種物質(zhì)在包括至少兩相的分配體系的第一相和第二相之間分配。68.如權(quán)利要求57所述的方法，其中所述分配體系還包括至少第三相。69.如權(quán)利要求57所述的方法，包括比較所述第一鐠數(shù)據(jù)模式和所述第二鐠數(shù)據(jù)模式，以確定比較模式；和比較所述比較模式和參考模式，以確定所述特征。70.如權(quán)利要求57所述的方法，其中所述比較譜包括所述兩個(gè)鐠的逐點(diǎn)相除，因此包括分配系數(shù)語(yǔ)。71.如權(quán)利要求57所述的方法，其中在獲得比較鐠之前首先數(shù)學(xué)處理所述鐠數(shù)據(jù)。72.如權(quán)利要求57所述的方法，其中在確定多種物質(zhì)的特征之前數(shù)學(xué)處理所述比較鐠數(shù)據(jù)。73.如權(quán)利要求57所述的方法，其中在接觸所述分配體系之前首先對(duì)所述多種物質(zhì)進(jìn)行分級(jí)。74.如權(quán)利要求57所述的方法，其中在譜分析之前，還對(duì)將通過(guò)接觸所述分配體系而獲得的所述多種物質(zhì)進(jìn)行分級(jí)。75.如權(quán)利要求69所述的方法，其中所述比較鐠數(shù)據(jù)與來(lái)自患者的樣品相關(guān)，所述參考比較謙是對(duì)照。76.如權(quán)利要求69所述的方法，其中根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法獲得所述參考比較鐠。77.如權(quán)利要求76所述的方法，其中在如權(quán)利要求13所述的比較過(guò)程之前，將所述參考比較鐠以電子方式存儲(chǔ)一段時(shí)間。78.如權(quán)利要求57所述的方法，其中所述第一鐠數(shù)據(jù)模式包括質(zhì)譜。79.如權(quán)利要求57所述的方法，其中所述第二語(yǔ)數(shù)據(jù)模式包括質(zhì)鐠。80.如權(quán)利要求57所述的方法，其中所述第一和第二譜數(shù)據(jù)模式包括色i普洗脫曲線。81.如權(quán)利要求57所述的方法，其中在不確定所述物質(zhì)在所述第一相和所述第二相之間的分配系數(shù)的情況下比較所述第一和第二鐠數(shù)據(jù)模式。82.如權(quán)利要求57所述的方法，其中所述多種物質(zhì)包括具有不同化學(xué)組成的多種物質(zhì)。83.如權(quán)利要求57所述的方法，其中所述多種物質(zhì)包括具有相同化學(xué)組成的多種物質(zhì)。84.如權(quán)利要求83所述的方法，其中所述多種物質(zhì)基于結(jié)構(gòu)差異而在不同的相之間不同地分配。85.如權(quán)利要求57所述的方法，包括比較所述第一鐠數(shù)據(jù)模式和所述第二譜數(shù)據(jù)模式，以確定生物系統(tǒng)的狀態(tài)。86.如權(quán)利要求85所述的方法，其中所述狀態(tài)是生理狀態(tài)。87.如權(quán)利要求69所述的方法，其中所述比較鐠代表指示生物體的未知狀態(tài)的樣品，并且所述參考比較譜得自指示所述生物體的正常和非正常狀態(tài)的樣品。88.如權(quán)利要求87所述的方法，其中從中獲得所述比較鐠的所述多種物質(zhì)和樣品同時(shí)從生物體獲得。89.如權(quán)利要求87所述的方法，其中從中獲得所述比較語(yǔ)的所述多種物質(zhì)和樣品在不同的時(shí)間從生物體獲得。90.如權(quán)利要求87所述的方法，其中從中獲得所述比較旙的所述多種物質(zhì)和樣品從同一個(gè)生物有機(jī)體獲得。91.如權(quán)利要求87所述的方法，其中所述比較鐠是從具有生理狀態(tài)的相同個(gè)體獲得的比較鐠的平均值。92.如權(quán)利要求87所述的方法，其中所述比較i普是從具有生理狀態(tài)的不同個(gè)體獲得的比較鐠的平均值。93.如權(quán)利要求87所述的方法，其中在沒(méi)有確定所述多種物質(zhì)中任意物質(zhì)的化學(xué)或生物學(xué)特性的情況下實(shí)施所述方法。94.如權(quán)利要求57所述的方法，其中所述分配體系的所述笫一相和所述第二相中至少一相是含水的。95.如權(quán)利要求94所述的方法，其中所述第一分配體系的所述第一相和所述第二相中每一相都是含水的。96.如權(quán)利要求57所述的方法，其中所述分配體系是含水的多相體系。97.如權(quán)利要求57所述的方法，其中所述分配體系的所述第一相和所述第二相中至少一相包含聚合物。98.如權(quán)利要求57所述的方法，其中所述分配體系的所述第一相和所述第二相中至少一相包含鹽。99.如權(quán)利要求57所述的方法，其中所述分配體系的所述第一相和所述第二相中至少一相包含表面活性劑。100.如權(quán)利要求57所述的方法，其中所述多種物質(zhì)的至少一種物質(zhì)是生物分子。101.如權(quán)利要求100所述的方法，其中所述多種物質(zhì)的至少一種物質(zhì)是蛋白質(zhì)。102.如權(quán)利要求57所述的方法，其中所述多種物質(zhì)的至少一種物質(zhì)是醫(yī)學(xué)病癥的疑似標(biāo)志。全文摘要本發(fā)明一般地涉及一種或更多種混合物中的分子/或生物分子的分離、分級(jí)和/或表征。分級(jí)之后，可以經(jīng)由諸如光譜分析、色譜等分析技術(shù)來(lái)分析分配體系的不同相，從而產(chǎn)生分級(jí)之后的物質(zhì)的譜或其它符號(hào)表征，并且比較各種級(jí)分/相的譜以限定比較譜為標(biāo)志或以其它方式提供關(guān)于樣品的信息，包括與混合物中的分子的初始豐度水平無(wú)關(guān)的那些信息。可以將各種樣品的比較譜相互比較或與對(duì)照物或參考譜和/或比較譜進(jìn)行比較以確定各種信息。在一些實(shí)施方案中，可以使用該方法來(lái)發(fā)現(xiàn)和/或鑒定物質(zhì)混合物中的模式和/或第二混合物中的物質(zhì)的對(duì)應(yīng)模式，其中物質(zhì)的每種混合物源自具有不同的生理狀態(tài)的生物系統(tǒng)作為與特定診斷相關(guān)的標(biāo)志，并且可以用于篩選在診斷篩選過(guò)程中發(fā)現(xiàn)和鑒定的這些標(biāo)志。文檔編號(hào)G01N33/68GK101371143SQ200680052677公開(kāi)日2009年2月18日申請(qǐng)日期2006年12月19日優(yōu)先權(quán)日2005年12月19日發(fā)明者博里斯·Y·扎斯拉夫斯基,阿爾農(nóng)·蔡特申請(qǐng)人:安納利扎有限公司