專利名稱:畢赤酵母壁蛋白Gcw49及其表面展示系統(tǒng)和構(gòu)建方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種巴斯德畢赤酵母壁蛋白Gcw49及其構(gòu)建的表面展示系統(tǒng)和構(gòu)建方法。
背景技術(shù):
微生物細(xì)胞表面展示技術(shù)是一種通過錨定蛋白將蛋白質(zhì)或多肽固定在細(xì)胞表面的技術(shù)。微生物細(xì)胞表面展示系統(tǒng)包括宿主菌、錨定蛋白和靶蛋白,有時(shí)在錨定蛋白和靶蛋白之間也添加一段連接(linker)序列。微生物細(xì)胞表面展示在多肽分離、全細(xì)胞催化劑、 全細(xì)胞吸附劑、疫苗和抗體生產(chǎn)、蛋白文庫(kù)篩選、生物傳感器、生物修復(fù)等方面都有廣闊的應(yīng)用前景。目前在微生物表面展示系統(tǒng)中應(yīng)用比較多的宿主菌主要有噬菌體、細(xì)菌(如大腸桿菌Esctwrichis. coli、奇異變形菌Proteus mirabilis 等)、釀酒酵母 QSaccharomyces cerevisiae)和巴斯德畢赤酵母QPichia pastor is)。表面展示使用的錨定蛋白一般具有以下特征(1)較牢固地錨定在細(xì)胞表面,不會(huì)輕易地從細(xì)胞表面脫落;(2)可以與靶蛋白序列有效融合而不影響靶蛋白的結(jié)構(gòu)和功能;(3)對(duì)蛋白酶有一定的抗性。細(xì)菌表面展示系統(tǒng)的錨定蛋白主要有細(xì)菌菌毛蛋白、S層蛋白、冰核蛋白(INP)和一些外膜蛋白。釀酒酵母表面展示系統(tǒng)的錨定蛋白主要有凝集素系統(tǒng)、絮凝素系統(tǒng)和其它GPI錨定 (glycosylphosphatidylinositol anchored)蛋白系統(tǒng)和一些Pir蛋白系統(tǒng)。巴斯德畢赤酵母具有可以實(shí)現(xiàn)高密度發(fā)酵(細(xì)胞密度可高達(dá)140g/L)、蛋白適度糖基化和發(fā)酵培養(yǎng)基組成簡(jiǎn)單等優(yōu)點(diǎn),在微生物細(xì)胞表面展示方面的應(yīng)用具有非常廣闊的前景,目前已有許多種蛋白,如解脂耶氏酵母脂肪酶、乳酸克魯維酵母黃酶、米根霉脂肪酶等已經(jīng)成功地展示在巴斯德畢赤酵母表面。目前巴斯德畢赤酵母表面展示系統(tǒng)中使用的錨定蛋白主要來(lái)自釀酒酵母的凝集素系統(tǒng)、絮凝素系統(tǒng)和kdlp蛋白等。但是,這些錨定蛋白不是畢赤酵母的組成成分,而是通過人為手段外源引進(jìn)的。因此用外源壁蛋白作為畢赤酵母表面展示系統(tǒng)的錨定蛋白,可能會(huì)與內(nèi)源壁蛋白競(jìng)爭(zhēng)壁蛋白結(jié)合位點(diǎn),導(dǎo)致展示效率不高。Khasa YP (Khasa YP, et al. Isolation of Pichia pastoris PIR genes and their utilization for cell surface display and recombinant protein secretion. Yeast. 2010. (published online).)等報(bào)道了利用畢赤酵母Pir蛋白作為錨定蛋白進(jìn)行外源蛋白的細(xì)胞表面展示。但發(fā)明人發(fā)現(xiàn)Pir蛋白本身的表達(dá)量較低,作為畢赤酵母表面展示系統(tǒng)的錨定蛋白效果一般。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明要解決的技術(shù)問題是提高用于巴斯德畢赤酵母表面展示系統(tǒng)的內(nèi)源錨定蛋白的表達(dá)效率。本發(fā)明解決上述問題的技術(shù)方案是一種巴斯德畢赤酵母壁蛋白Gcw49,該蛋白的氨基酸序列為SEQ NO :1。本發(fā)明所述的巴斯德畢赤酵母壁蛋白由310個(gè)氨基酸組成,大小約為32. SKDa0 本發(fā)明所述的巴斯德畢赤酵母壁蛋白以共價(jià)鍵的形式結(jié)合在巴斯德畢赤酵母細(xì)胞壁上,用十二烷基硫酸鈉法不能提取,可以用β -1,3-葡聚糖酶法提取。本發(fā)明所述的巴斯德畢赤酵母壁蛋白Gcw49可用于構(gòu)建畢赤酵母細(xì)胞表面展示系統(tǒng),所述的巴斯德畢赤酵母細(xì)胞表面展示系統(tǒng)是以所述壁蛋白為錨定蛋白將靶蛋白固定在畢赤酵母細(xì)胞表面構(gòu)成的。編碼所述巴斯德畢赤酵母壁蛋白GCW49的基因,核苷酸序列如SEQ NO 4所示。一種巴斯德畢赤酵母細(xì)胞表面展示系統(tǒng),是以所述的巴斯德畢赤酵母壁蛋白 Gcw49為錨定蛋白,將靶蛋白固定在巴斯德畢赤酵母細(xì)胞表面構(gòu)成的。上述巴斯德畢赤酵母細(xì)胞表面展示系統(tǒng)可通過以下步驟構(gòu)建
(1)將權(quán)利要求2所述的基因克隆到表達(dá)載體的表達(dá)盒中,得到以權(quán)利要求1所述巴斯德畢赤酵母壁蛋白為錨定蛋白的表面展示表達(dá)載體;
(2)將靶蛋白的基因序列克隆到所述表面展示表達(dá)載體的巴斯德畢赤酵母壁蛋白基因序列的上游,與所述巴斯德畢赤酵母壁蛋白基因形成融合基因;
(3)轉(zhuǎn)化巴斯德畢赤酵母,根據(jù)所述表達(dá)載體上的篩選標(biāo)記篩選陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子,即得到表面展示系統(tǒng)。所述靶蛋白為堿性木聚糖酶、米黑根毛霉脂肪酶或南極假絲酵母脂肪酶B。所述巴斯德畢赤酵母為巴斯德畢赤酵母GSl 15。上述方法中,所述的表達(dá)載體是常用的帶有分泌信號(hào)肽序列的巴斯德畢赤酵母表達(dá)載體,如 PPIC9K、pPICZ α A、pPICZ α B、pPICZ α C、pGAPZ α A、pGAPZ α B、pGAPZ α C 等;如果是無(wú)信號(hào)肽的表達(dá)載體,可在靶蛋白基因序列的上游添加分泌信號(hào)肽序列。表達(dá)載體為pPIC9K時(shí),構(gòu)建表面展示表達(dá)載體后,將靶蛋白的基因序列克隆連接到所述表面展示表達(dá)載體的巴斯德畢赤酵母壁蛋白基因序列上游的限制性內(nèi)切酶酶切位存、EcoR 1與Mlu I之間。本發(fā)明相對(duì)于現(xiàn)有技術(shù)所具有的優(yōu)點(diǎn)及有益效果。本發(fā)明所述的壁蛋白Gcw49是巴斯德畢赤酵母內(nèi)源壁蛋白,且在畢赤酵母中表達(dá)量十分高,與現(xiàn)已用于巴斯德畢赤酵母表面展示系統(tǒng)的內(nèi)源錨定蛋白Pirl蛋白和Pir2蛋白相比,分別高8倍和19倍。因此,本發(fā)明所述巴斯德畢赤酵母可用于構(gòu)建高表達(dá)效率的巴斯德畢赤酵母表面展示系統(tǒng)。
圖1.用SDS法和β-1,3-葡聚糖酶法提取巴斯德畢赤酵母壁蛋白Gcw49的 Wfestern blot結(jié)果。a. SDS法提取壁蛋白Gcw49 ;b. β _1,3-葡聚糖酶法提取壁蛋白 Gcw49。圖2 重組菌GS115/GCW49和對(duì)照菌GS115的流式細(xì)胞儀檢測(cè)結(jié)果。虛線對(duì)照菌 GS115 ;實(shí)線重組菌 GS115/GCW49。圖3 三丁酸甘油酯乳化平板水解圈法檢測(cè)GS115/GCW49-CALB陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子。a.對(duì)照菌 GS115 ;b.陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子 GS115/GCW49-CALB。
圖4 熒光顯微鏡驗(yàn)證融合蛋白GCW49-CALB在畢赤酵母細(xì)胞壁表面展示結(jié)果。a. GS115/GCW49-CALB的普通光學(xué)顯微b.GS115/GCW49-CALB 的熒光顯微c.對(duì)照菌GS115的普通光學(xué)顯微d.對(duì)照菌GS115的熒光顯微圖。圖5 菌體酶活曲線圖。其中,令表示重組菌GS115/GCW49-CALB的菌體酶活曲線; ■ "表示對(duì)照菌GSl 15的菌體酶活曲線。圖6 采用Gcw49、Pirl和Pir2作為錨定蛋白展示CALB的酶活比較。術(shù)語(yǔ)解釋
MD平板13. 4g/L酵母氮源,4X 10_4 g/L生物素,20g/L葡萄糖和20g/L瓊脂 BMGY培養(yǎng)基20g/L蛋白胨,10g/L酵母提取物,100 mM磷酸鉀緩沖液(pH6. 0),13. 4g/ L酵母氮源,4X10_4 g/L生物素,10g/L甘油。BMMY培養(yǎng)基20g/L蛋白胨,10g/L酵母提取物,100 mM磷酸鉀緩沖液(pH6. 0), 13.4g/L酵母氮源,4X10_4 g/L生物素,5g/L甲醇。三丁酸甘油酯乳化平板13. 4g/L酵母氮源,10g/L三丁酸甘油酯,5g/L聚乙烯醇,20g/L瓊脂,IOOmM磷酸鹽緩沖液(pH6. 0)。
具體實(shí)施例方式實(shí)施例1 巴斯德畢赤酵母壁蛋白GCW49基因的克隆、表達(dá)和鑒定 (1)巴斯德畢赤酵母壁蛋白GCW49基因的克隆
根據(jù)巴斯德畢赤酵母壁蛋白GCW49的基因序列SEQ NO. 4以及巴斯德畢赤酵母質(zhì)粒 PPIC9K上的多克隆位點(diǎn)特征,設(shè)計(jì)合成引物
權(quán)利要求
1.一種巴斯德畢赤酵母壁蛋白GCW49,其特征在于,該蛋白的氨基酸序列如SEQ NO=I 所示。
2.編碼權(quán)利要求1所述巴斯德畢赤酵母壁蛋白GCW49的基因,其特征在于,核苷酸序列如SEQ NO :4所示。
3.—種巴斯德畢赤酵母細(xì)胞表面展示系統(tǒng),其特征在于,是以權(quán)利要求1所述的巴斯德畢赤酵母壁蛋白Gcw49為錨定蛋白,將靶蛋白固定在巴斯德畢赤酵母細(xì)胞表面構(gòu)成的。
4.權(quán)利要求3所述的巴斯德畢赤酵母表面展示系統(tǒng)的構(gòu)建方法,該方法由以下步驟組成(1)將權(quán)利要求2所述的基因克隆到表達(dá)載體的表達(dá)盒中,得到以權(quán)利要求1所述巴斯德畢赤酵母壁蛋白為錨定蛋白的表面展示表達(dá)載體;(2)將靶蛋白的基因序列克隆到所述表面展示表達(dá)載體的巴斯德畢赤酵母壁蛋白基因序列的上游,與所述巴斯德畢赤酵母壁蛋白基因形成融合基因;(3)轉(zhuǎn)化巴斯德畢赤酵母,根據(jù)所述表達(dá)載體上的篩選標(biāo)記篩選陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子,即得到表面展示系統(tǒng)。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的構(gòu)建方法,其特征在于,所述表達(dá)載體包括帶有分泌信號(hào)肽序列的巴斯德畢赤酵母表達(dá)載體。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的構(gòu)建方法,其特征在于,所述表達(dá)載體為pPIC9K、pPICZα A、 pPICZ α B、pPICZ α C、pGAPZ α A、pGAPZ α B 或 pGAPZ α C。
7.根據(jù)權(quán)利要求4 6之一所述的構(gòu)建方法,其特征在于,所述靶蛋白為堿性木聚糖酶、米黑根毛霉脂肪酶或南極假絲酵母脂肪酶B。
8.根據(jù)權(quán)利要求4 6之一所述的構(gòu)建方法,其特征在于,所述巴斯德畢赤酵母為巴斯德畢赤酵母GSl 15。
全文摘要
本發(fā)明公開了一種畢赤酵母壁蛋白及其構(gòu)建的表面展示系統(tǒng)和構(gòu)建方法。所述巴斯德畢赤酵母壁蛋白的氨基酸序列為SEQNO1;所述巴斯德畢赤酵母細(xì)胞表面展示系統(tǒng)是以所述的巴斯德畢赤酵母壁蛋白Gcw49為錨定蛋白,將靶蛋白固定在巴斯德畢赤酵母細(xì)胞表面構(gòu)成的。本發(fā)明的壁蛋白Gcw49在畢赤酵母中表達(dá)量十分高,與現(xiàn)已用于巴斯德畢赤酵母表面展示系統(tǒng)的內(nèi)源錨定蛋白Pir1蛋白和Pir2蛋白相比,分別高8倍和19倍。
文檔編號(hào)C07K14/39GK102260332SQ20111021581
公開日2011年11月30日 申請(qǐng)日期2011年7月29日 優(yōu)先權(quán)日2011年7月29日
發(fā)明者葉燕銳, 周新瑩, 張莉, 林影, 鄭穗平, 韓雙艷 申請(qǐng)人:華南理工大學(xué)